Heatmap: Cluster_225 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_21060.1	-3.32	-3.59	-3.84	-2.92	-0.16	0.83	0.57	0.05	-0.37	-0.64	-0.46	-1.21	-0.55	1.06	1.2	0.66	0.41	-0.9	0.8	0.3	0.15	0.22	-0.84	-0.2	0.08	0.28	0.11	-0.33	0.36	0.12	0.2
Lsat_1_v5_gn_0_7521.1 (SAP9)	-0.66	-0.61	-0.75	-0.53	-0.61	0.02	0.09	0.05	-0.18	-0.34	-0.21	-0.73	-0.08	1.12	0.8	0.2	-0.11	0.32	0.19	-0.11	0.05	0.01	0.16	-0.22	-0.08	0.12	0.05	-0.19	0.34	0.16	-0.11
Lsat_1_v5_gn_1_24621.1 (MO1)	-0.88	-0.55	-1.13	-0.99	-0.06	0.58	0.25	0.36	-0.19	-0.3	-0.23	-0.32	-0.18	1.06	0.72	0.21	0.03	-0.86	0.44	-0.02	-0.04	-0.01	-0.41	0.14	-0.01	0.12	0.26	-0.45	-0.09	-0.02	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_31661.1	-0.87	-0.2	-1.55	-1.83	-0.06	0.49	0.32	0.38	-0.42	-0.63	-0.22	-0.66	-0.18	1.07	0.99	0.21	-0.29	0.33	0.35	-0.11	-0.04	-0.06	-0.17	-0.18	-0.24	0.04	0.07	-0.49	0.27	0.18	0.09
Lsat_1_v5_gn_1_35361.1 (TED3)	-0.13	-0.35	-1.09	-0.72	0.09	0.4	0.03	0.05	-0.01	-0.32	0.06	-0.42	-0.07	1.21	1.06	0.03	-0.17	-0.82	0.16	-0.13	-0.21	-0.05	-0.3	-0.17	-0.35	-0.08	0.05	-0.05	0.16	0.01	-0.05
Lsat_1_v5_gn_2_105900.1 (SRE1)	0.01	0.09	-0.29	-0.7	-0.18	0.53	0.35	0.2	-0.13	-0.37	-0.29	-0.57	-0.49	1.36	0.52	0.14	-0.3	-0.98	-0.14	-0.46	-0.26	-0.34	-2.19	0.12	-0.11	0.1	0.13	-0.17	0.41	0.35	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_115401.1 (CDL1)	-1.09	-0.63	-1.13	-0.61	-0.25	0.13	-0.0	-0.07	-0.19	-0.19	0.01	-0.07	0.41	0.92	0.77	0.01	-0.0	-0.39	0.32	-0.09	-0.17	0.08	0.29	-0.02	0.06	0.09	0.09	-0.17	-0.04	-0.17	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_124440.1	-1.25	-0.74	-1.19	-0.7	0.33	0.44	0.36	0.38	0.03	-0.02	0.11	-0.09	-0.01	0.36	0.39	0.17	0.08	-1.14	0.23	-0.04	0.07	0.12	-0.51	-0.04	0.01	0.08	-0.01	-0.33	0.43	0.28	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_130100.1 (FRK7)	-0.64	-0.87	-1.59	-1.96	-0.23	0.36	0.5	0.62	-0.38	-0.46	-0.44	-0.6	-0.33	0.94	0.97	0.18	-0.06	-0.19	0.44	-0.07	-0.05	-0.08	0.32	0.01	-0.0	0.01	-0.06	-0.1	0.23	0.16	-0.1
Lsat_1_v5_gn_2_34301.1 (SSL3)	-1.0	-1.0	-1.19	-1.35	-0.39	-0.1	0.34	0.31	-0.66	-0.35	-0.54	-0.33	0.01	1.29	1.12	0.04	0.06	0.13	0.89	0.1	-0.17	-0.15	-0.16	-0.02	-0.12	-0.02	-0.25	-0.49	0.06	-0.04	0.26
Lsat_1_v5_gn_2_74441.1 (SAT-106)	-0.36	-0.2	-1.03	-0.83	-0.42	0.4	0.35	0.42	-0.27	-0.26	-0.13	-0.41	0.15	1.25	0.87	0.18	0.04	-1.34	0.4	0.05	-0.23	-0.07	-1.12	-0.11	-0.03	0.09	0.03	-0.09	-0.01	-0.05	-0.16
Lsat_1_v5_gn_2_75500.1 (NIP2)	-0.5	-0.46	-1.31	-1.97	-0.09	0.65	0.42	-0.17	-0.16	-0.86	-0.54	-0.85	-1.0	1.36	1.09	0.17	-0.07	0.7	0.26	-0.19	0.16	-0.1	-0.43	-0.12	-0.22	-0.21	-0.08	-0.45	0.35	0.04	0.13
Lsat_1_v5_gn_2_76860.1 (HAM4)	-1.62	-1.14	-1.61	-1.25	0.34	0.57	0.49	0.74	-0.63	-0.75	-0.83	-0.8	-0.42	1.64	1.14	0.05	-0.12	-0.17	-0.34	-0.55	-0.42	-0.67	0.64	-0.24	-0.39	-0.47	-0.47	-0.72	0.47	0.62	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_76880.1 (CHS)	-0.7	-2.04	-2.49	-2.89	-2.19	-2.59	0.08	0.15	-0.34	-0.58	-0.64	-0.23	-0.49	1.79	2.1	-0.13	0.3	0.41	1.3	0.73	-0.06	-0.18	-5.05	-0.03	-0.35	-0.12	-0.14	-0.31	-0.92	-0.6	-0.3
Lsat_1_v5_gn_2_86281.1 (UBC22)	-0.61	-0.56	-0.46	-0.3	-0.02	0.3	0.17	0.04	-0.44	-0.36	-0.31	-0.45	0.49	0.86	0.65	0.35	0.13	-0.18	0.14	-0.16	-0.1	-0.01	-0.01	-0.31	-0.12	-0.04	-0.0	0.02	0.22	-0.07	-0.09
Lsat_1_v5_gn_3_12501.1 (PFG3)	-1.05	0.07	-1.39	-1.01	-0.54	0.02	0.44	0.91	-1.03	-1.0	-0.89	-1.21	-0.79	1.66	1.72	0.24	0.02	-0.07	1.0	-0.23	-0.44	-0.42	-3.83	-0.25	-0.38	-0.4	-0.36	-0.68	0.33	-0.04	0.14
Lsat_1_v5_gn_3_14120.1 (YSL3)	-0.26	-0.28	-0.96	-1.01	0.51	0.7	0.24	0.2	-0.39	-0.32	-0.34	-0.46	-0.52	1.18	0.96	0.16	0.02	-1.35	0.18	-0.22	-0.1	-0.01	-0.61	-0.21	-0.17	0.09	0.02	-0.1	0.29	0.13	-0.36
Lsat_1_v5_gn_3_26040.1 (NHX1)	-0.37	-0.4	-0.87	-1.83	-0.28	0.21	0.42	0.18	-0.1	-0.4	-0.28	-0.34	-0.41	1.03	0.91	0.13	0.18	-0.97	0.42	0.14	-0.15	-0.03	-1.47	-0.08	-0.28	0.0	0.12	0.15	0.36	0.18	0.5
Lsat_1_v5_gn_3_40600.1 (PMAT2)	-2.25	-2.96	-4.22	-3.73	-1.61	-1.4	0.42	0.78	-1.41	-1.61	-1.44	-1.28	0.27	2.23	1.91	-0.34	0.02	0.98	1.31	-0.01	-0.36	-0.46	-1.84	0.29	-0.29	-0.45	-0.36	-0.81	-0.07	-0.28	-0.51
Lsat_1_v5_gn_3_4860.1 (CDI3)	-0.09	-0.53	-1.01	-1.06	-0.26	0.41	0.29	-0.08	-0.24	-0.39	-0.39	-0.35	-0.19	1.25	0.95	0.17	0.02	0.6	0.29	0.05	-0.11	-0.05	-1.24	-0.07	-0.25	-0.49	-0.21	0.14	0.14	-0.04	-0.12
Lsat_1_v5_gn_4_101960.1 (CC1)	-0.57	-0.8	-0.8	-1.16	-0.27	0.12	0.47	0.44	-0.37	-0.38	-0.26	-0.41	0.0	1.41	0.97	0.08	0.27	-1.0	0.41	0.03	-0.03	-0.03	-2.6	-0.13	-0.21	-0.01	0.02	0.04	0.16	0.11	0.11
Lsat_1_v5_gn_4_137721.1 (PRA1.B6)	-0.95	-0.31	-1.43	-1.29	-0.33	-0.01	0.31	0.55	-0.16	-0.2	-0.07	-0.3	-0.09	0.93	0.75	0.15	0.11	-0.72	0.36	0.01	0.08	0.06	-2.47	0.11	0.09	0.15	0.22	-0.5	0.28	0.41	0.38
Lsat_1_v5_gn_4_162000.1	-1.52	-0.98	-1.09	-1.16	0.05	0.55	0.18	0.28	-0.18	-0.24	-0.07	-0.25	-0.02	1.02	0.89	0.31	0.21	-0.73	0.41	-0.09	-0.13	-0.07	-0.72	-0.13	-0.07	-0.17	-0.13	-0.24	0.24	0.28	0.43
Lsat_1_v5_gn_4_171601.1	-1.86	-0.72	-2.17	-1.64	-0.03	0.62	0.42	0.45	-0.46	-0.5	-0.25	-0.52	-1.31	1.84	1.22	0.02	-0.13	-1.73	0.66	-0.36	-0.41	-0.2	0.16	-0.26	-0.23	-0.42	-0.14	-1.2	0.29	0.27	0.62
Lsat_1_v5_gn_4_181561.1 (ATL46)	-1.64	-0.86	-1.54	-1.19	0.01	0.41	0.07	-0.04	-0.05	-0.13	-0.05	-0.43	-0.16	1.17	0.85	0.22	-0.1	-0.19	0.31	-0.2	-0.07	-0.04	-0.64	-0.18	-0.04	-0.08	0.03	-0.16	0.4	0.29	0.61
Lsat_1_v5_gn_4_48640.1 (WL4)	-0.87	-1.05	-1.56	-1.33	0.02	0.29	0.42	0.47	-0.41	-0.42	-0.37	-0.54	-0.17	1.21	0.92	-0.04	-0.06	-0.28	0.43	-0.11	-0.11	-0.17	0.39	-0.08	-0.06	-0.08	-0.0	-0.1	0.16	0.13	0.1
Lsat_1_v5_gn_4_72861.1 (RAC10)	-0.77	-0.59	-1.07	-1.11	0.03	0.32	0.2	0.36	-0.35	-0.23	-0.11	-0.23	0.3	0.93	0.67	0.17	0.01	-0.1	0.19	-0.06	-0.09	0.05	-0.03	-0.18	0.02	0.03	-0.07	0.03	-0.05	-0.05	0.04
Lsat_1_v5_gn_4_8401.1 (MYBD)	-0.97	-0.69	-1.79	-1.74	-0.52	0.38	0.37	0.46	-0.16	-0.26	-0.18	-0.42	-0.12	0.88	0.83	0.26	0.12	0.19	0.28	-0.03	0.1	0.06	-0.25	0.05	0.03	0.2	0.04	-0.12	0.08	-0.01	-0.1
Lsat_1_v5_gn_5_122020.1	-1.29	-1.09	-1.8	-1.25	-0.19	0.59	0.11	0.03	-0.43	-0.37	-0.47	-0.2	-0.21	0.78	0.85	0.32	0.17	0.03	0.47	0.41	0.24	0.15	-2.79	-0.21	0.1	0.17	0.36	-0.06	0.08	0.15	0.52
Lsat_1_v5_gn_5_145340.1 (GNC)	-2.14	-0.98	-1.09	-1.04	-0.33	0.27	0.36	0.61	-0.58	-0.45	-0.41	-0.45	0.55	1.34	0.96	-0.02	-0.07	-1.0	0.33	-0.11	-0.33	-0.35	0.85	-0.12	-0.2	-0.24	-0.22	-0.52	0.28	0.08	0.27
Lsat_1_v5_gn_5_145561.1 (TET2)	-2.58	-1.76	-2.78	-2.68	0.39	0.99	0.41	0.29	-0.27	-0.29	-0.11	-0.24	-0.35	0.77	0.85	0.41	0.19	0.12	0.44	-0.02	0.09	0.3	-1.15	-0.28	-0.14	0.25	0.18	-0.44	0.17	0.03	0.13
Lsat_1_v5_gn_5_23101.1 (TT7)	-1.18	-2.08	-3.1	-3.93	-1.99	-1.46	0.77	1.49	-1.35	-1.5	-1.21	-1.08	-0.23	2.18	1.66	-0.56	-0.18	1.22	1.21	0.18	-0.32	-0.56	-1.82	0.11	-0.42	-0.51	-0.48	-0.4	-0.45	-0.74	-1.49
Lsat_1_v5_gn_5_26240.1 (BPC6)	-0.93	-0.7	-1.0	-0.74	0.15	0.18	0.2	0.15	-0.14	-0.26	-0.14	-0.12	-0.03	0.82	0.63	0.11	-0.05	-0.56	0.12	-0.05	-0.05	-0.0	0.07	-0.01	-0.05	0.06	-0.06	-0.15	0.29	0.24	0.42
Lsat_1_v5_gn_5_27561.1 (ERDL6)	-0.71	-0.55	-0.87	-1.15	-0.43	0.4	0.12	0.16	-0.35	-0.33	-0.24	-0.25	0.22	1.42	0.6	0.16	0.1	-0.82	0.28	-0.26	-0.26	-0.07	-0.33	-0.07	0.02	0.03	-0.15	-0.0	0.47	0.17	0.05
Lsat_1_v5_gn_5_29201.1	-1.08	-0.79	-1.28	-1.21	-0.01	0.39	0.29	0.2	-0.31	-0.29	-0.13	-0.35	-0.01	0.93	0.8	0.28	0.2	-0.29	0.49	0.06	0.08	-0.04	-0.45	-0.17	-0.07	0.11	0.19	-0.22	0.11	0.08	0.03
Lsat_1_v5_gn_5_41401.1 (ACT7)	-0.87	-1.17	-1.02	-1.15	0.52	0.48	0.2	0.41	-0.38	-0.24	-0.15	-0.28	-0.12	0.82	0.89	0.34	0.29	-0.55	0.27	-0.16	-0.03	0.07	-0.21	-0.12	-0.11	-0.03	0.21	0.06	-0.0	-0.19	-0.27
Lsat_1_v5_gn_5_64961.1	-0.25	-0.33	-0.47	-0.43	-0.14	-0.2	0.17	0.33	0.09	0.03	-0.04	0.11	0.37	0.94	0.65	0.22	0.12	-1.2	0.19	-0.17	-0.05	-0.19	-0.87	-0.12	-0.11	-0.1	-0.1	-0.05	-0.08	0.01	0.08
Lsat_1_v5_gn_5_69300.1 (TKI1)	-0.78	-0.71	-1.25	-1.02	0.03	0.39	0.53	0.91	-0.41	-0.45	-0.15	-0.53	-0.03	1.23	0.87	0.02	-0.24	-0.42	0.03	-0.3	-0.22	-0.29	0.55	-0.15	-0.31	-0.03	-0.17	-0.55	0.28	0.03	-0.12
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.