Heatmap: Cluster_225 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.52 0.43 0.36 0.68 4.63 9.18 7.65 5.35 4.0 3.31 3.75 2.23 3.54 10.73 11.87 8.13 6.88 2.77 8.98 6.34 5.73 6.03 2.87 4.48 5.46 6.28 5.57 4.12 6.64 5.59 5.92
87.09 90.11 82.18 95.5 89.95 139.31 146.55 142.81 121.58 108.45 119.33 82.84 130.58 298.79 239.21 157.98 127.93 172.0 157.03 128.03 142.6 138.46 154.11 118.67 130.68 150.03 142.35 120.49 174.54 153.45 127.28
4.93 6.19 4.14 4.58 8.73 13.58 10.79 11.69 7.94 7.36 7.75 7.29 8.03 18.87 14.99 10.5 9.29 4.99 12.32 8.98 8.82 9.01 6.83 9.98 8.99 9.85 10.86 6.67 8.53 8.96 10.05
7.21 11.44 4.49 3.72 12.63 18.5 16.48 17.14 9.83 8.54 11.28 8.36 11.61 27.66 26.24 15.24 10.81 16.57 16.78 12.22 12.85 12.67 11.71 11.62 11.17 13.5 13.83 9.37 15.91 14.94 14.02
3.39 2.92 1.74 2.26 3.94 4.9 3.79 3.84 3.69 2.98 3.87 2.78 3.55 8.59 7.76 3.79 3.31 2.1 4.15 3.4 3.22 3.59 3.01 3.3 2.91 3.52 3.84 3.58 4.14 3.75 3.6
7.54 7.97 6.13 4.62 6.61 10.82 9.57 8.62 6.86 5.79 6.12 5.06 5.35 19.25 10.79 8.3 6.08 3.79 6.81 5.44 6.29 5.91 1.64 8.16 6.93 8.07 8.2 6.68 9.99 9.59 9.77
3.95 5.42 3.85 5.52 7.09 9.22 8.4 8.02 7.35 7.35 8.46 8.0 11.19 15.91 14.31 8.47 8.39 6.44 10.52 7.92 7.46 8.86 10.27 8.32 8.77 8.94 8.96 7.45 8.16 7.46 10.18
11.19 15.93 11.7 16.43 33.44 36.22 34.09 34.65 27.15 26.36 28.8 24.96 26.54 34.12 35.02 30.05 28.27 12.07 31.27 26.02 27.9 29.02 18.67 25.86 26.85 28.16 26.49 21.14 35.79 32.44 29.77
6.35 5.41 3.29 2.54 8.42 12.66 13.97 15.22 7.57 7.18 7.28 6.53 7.87 18.96 19.38 11.16 9.46 8.66 13.45 9.39 9.55 9.37 12.36 9.95 9.85 9.92 9.47 9.19 11.62 11.05 9.24
13.5 13.56 11.86 10.63 20.61 25.3 34.26 33.49 17.15 21.27 18.55 21.45 27.18 66.33 58.59 27.86 28.13 29.59 49.96 28.99 24.07 24.38 24.11 26.73 24.89 26.75 22.72 19.27 28.22 26.25 32.3
24.61 27.42 15.38 17.65 23.55 41.4 40.03 42.25 26.12 26.32 28.79 23.62 35.05 74.97 57.66 35.56 32.39 12.45 41.53 32.57 26.93 30.09 14.46 29.07 30.85 33.61 32.13 29.61 31.31 30.33 28.2
4.15 4.26 2.37 1.5 5.52 9.19 7.84 5.22 5.26 3.22 4.02 3.24 2.94 15.04 12.53 6.62 5.59 9.54 7.01 5.16 6.56 5.46 4.34 5.38 5.02 5.06 5.56 4.31 7.48 6.03 6.4
1.48 2.06 1.48 1.9 5.76 6.73 6.37 7.55 2.93 2.71 2.54 2.6 3.4 14.14 9.99 4.69 4.17 4.02 3.59 3.1 3.38 2.86 7.06 3.84 3.46 3.27 3.28 2.76 6.29 6.96 6.21
28.88 11.44 8.38 6.33 10.32 7.8 49.75 52.18 37.17 31.5 30.2 39.98 33.6 162.48 202.05 43.0 57.85 62.45 115.6 78.04 45.13 41.53 1.42 46.15 36.86 43.33 42.81 38.02 24.81 31.04 38.11
34.36 35.49 38.02 42.34 51.41 64.2 58.78 53.84 38.65 40.82 42.27 38.22 73.46 94.63 81.89 66.46 57.32 46.02 57.56 46.85 48.8 52.06 51.93 42.07 48.05 50.8 52.29 52.88 60.71 49.67 49.27
13.84 30.06 10.93 14.27 19.79 29.09 38.89 53.81 14.04 14.36 15.45 12.44 16.58 91.03 94.77 33.95 29.05 27.32 57.38 24.51 21.12 21.4 2.02 24.08 22.01 21.78 22.42 17.97 36.17 28.0 31.65
55.02 54.05 33.88 32.66 93.37 106.67 77.66 75.7 50.27 52.71 51.93 47.74 45.96 149.33 127.77 73.52 66.75 25.81 74.31 56.58 61.49 65.54 43.21 56.7 58.26 70.01 66.83 61.35 80.28 72.19 51.33
2.49 2.44 1.76 0.9 2.65 3.73 4.29 3.65 2.99 2.44 2.66 2.54 2.41 6.58 6.05 3.53 3.64 1.64 4.31 3.54 2.9 3.14 1.16 3.04 2.65 3.22 3.49 3.56 4.12 3.63 4.55
4.01 2.45 1.02 1.43 6.21 7.18 25.41 32.69 7.14 6.21 7.03 7.84 22.96 89.37 71.26 14.97 19.21 37.51 47.03 18.83 14.81 13.78 5.31 23.21 15.55 13.89 14.77 10.88 18.14 15.67 13.39
7.11 5.24 3.76 3.61 6.33 10.03 9.22 7.15 6.4 5.77 5.75 5.93 6.61 18.02 14.62 8.48 7.64 11.43 9.24 7.83 7.02 7.32 3.2 7.18 6.35 5.38 6.54 8.35 8.3 7.35 6.94
43.81 37.44 37.37 29.16 53.71 70.63 89.86 88.08 50.22 49.8 54.33 48.87 65.14 172.26 127.68 68.77 78.3 32.41 86.39 66.22 63.71 63.81 10.69 59.47 56.28 64.37 65.98 66.94 72.64 69.92 70.25
18.36 28.69 13.21 14.59 28.28 35.44 44.23 52.21 31.94 30.86 33.99 28.95 33.45 67.59 59.61 39.6 38.5 21.53 45.7 35.75 37.66 36.97 6.44 38.42 37.98 39.48 41.4 25.13 43.22 47.16 46.28
3.44 5.01 4.65 4.43 10.25 14.44 11.19 11.98 8.71 8.39 9.41 8.3 9.74 20.05 18.37 12.27 11.42 5.95 13.11 9.31 9.04 9.41 6.0 9.03 9.45 8.78 9.01 8.38 11.65 12.03 13.32
3.3 7.27 2.66 3.85 11.71 18.43 16.02 16.35 8.69 8.45 10.1 8.36 4.82 42.77 27.96 12.15 10.99 3.61 18.99 9.32 9.0 10.43 13.4 9.99 10.25 8.98 10.89 5.2 14.65 14.48 18.42
2.92 5.04 3.13 4.0 9.2 12.15 9.61 8.88 8.79 8.35 8.83 6.77 8.19 20.5 16.47 10.66 8.5 8.02 11.34 7.97 8.68 8.86 5.84 8.06 8.89 8.65 9.34 8.15 12.03 11.18 13.94
15.16 13.38 9.41 11.0 28.08 33.86 36.94 38.4 20.9 20.73 21.4 19.05 24.55 64.04 52.48 27.01 26.5 22.77 37.17 25.67 25.64 24.57 36.34 26.15 26.63 26.14 27.65 25.75 30.86 30.39 29.69
14.75 16.7 11.95 11.64 25.71 31.36 28.76 32.16 19.67 21.36 23.28 21.44 30.95 47.78 40.0 28.26 25.32 23.45 28.64 24.11 23.6 26.0 24.6 22.22 25.46 25.64 23.91 25.59 24.29 24.22 25.81
16.56 20.17 9.43 9.76 22.76 42.36 42.18 44.64 29.18 27.17 28.68 24.26 29.91 59.86 57.69 39.03 35.38 37.24 39.43 31.76 34.89 33.88 27.36 33.66 33.29 37.43 33.47 29.98 34.29 32.25 30.42
3.93 4.5 2.76 4.03 8.43 14.45 10.37 9.82 7.13 7.45 6.95 8.36 8.31 16.48 17.38 11.99 10.8 9.79 13.31 12.79 11.31 10.64 1.39 8.33 10.32 10.79 12.31 9.25 10.17 10.68 13.74
2.81 6.28 5.82 6.05 9.86 14.98 15.98 18.92 8.33 9.07 9.32 9.08 18.23 31.36 24.24 12.25 11.83 6.2 15.64 11.52 9.86 9.72 22.42 11.42 10.83 10.53 10.65 8.66 15.03 13.11 14.95
6.78 11.95 5.89 6.32 53.32 80.38 53.81 49.48 33.72 33.15 37.71 34.37 31.92 69.36 73.04 53.98 46.21 44.06 54.86 39.9 43.15 50.07 18.33 33.51 36.71 48.2 45.99 29.8 45.63 41.33 44.47
21.16 11.36 5.58 3.15 12.1 17.44 81.84 135.09 18.84 17.03 20.82 22.76 40.95 218.0 152.21 32.47 42.4 111.61 111.04 54.54 38.47 32.52 13.62 51.97 35.9 33.66 34.33 36.44 35.13 28.69 17.13
7.61 8.94 7.25 8.7 16.09 16.46 16.68 16.05 13.19 12.15 13.19 13.35 14.19 25.6 22.46 15.65 14.02 9.83 15.77 14.07 13.98 14.48 15.27 14.43 14.04 15.17 13.92 13.07 17.76 17.09 19.46
7.92 8.84 7.07 5.85 9.62 17.06 14.1 14.51 10.15 10.29 11.01 10.9 15.1 34.61 19.69 14.5 13.88 7.33 15.77 10.86 10.83 12.38 10.32 12.34 13.17 13.28 11.72 12.95 17.93 14.61 13.41
13.75 16.87 11.99 12.63 28.85 38.15 35.69 33.56 23.44 23.89 26.53 22.93 28.89 55.69 50.69 35.28 33.5 23.9 40.93 30.45 30.87 28.28 21.26 25.85 27.75 31.38 33.12 25.02 31.39 30.83 29.67
4.08 3.31 3.66 3.36 10.67 10.41 8.57 9.94 5.73 6.29 6.71 6.12 6.85 13.14 13.77 9.45 9.14 5.1 8.97 6.66 7.32 7.82 6.42 6.86 6.91 7.29 8.61 7.74 7.44 6.53 6.18
11.35 10.71 9.78 10.05 12.27 11.79 15.21 17.03 14.4 13.76 13.12 14.6 17.44 25.95 21.25 15.73 14.69 5.87 15.36 12.04 13.07 11.81 7.4 12.45 12.54 12.62 12.63 13.03 12.81 13.62 14.26
4.43 4.68 3.21 3.76 7.79 10.0 11.0 14.33 5.73 5.57 6.87 5.28 7.47 17.95 13.98 7.76 6.45 5.7 7.77 6.21 6.56 6.25 11.17 6.88 6.17 7.48 6.76 5.2 9.28 7.78 7.0
7.69 11.59 8.74 11.64 17.73 21.3 23.56 21.69 22.21 22.85 24.16 23.3 19.24 29.13 27.77 24.81 23.18 10.51 23.81 20.99 21.25 22.68 11.46 20.76 20.49 21.61 21.94 21.56 26.06 24.3 22.31
30.39 34.88 36.16 39.69 60.96 62.03 52.48 46.31 43.81 44.81 43.52 44.68 76.84 107.15 81.97 55.83 61.69 42.83 42.36 46.39 43.09 45.17 41.75 40.86 46.45 46.53 46.81 50.37 44.42 43.45 56.88
23.95 25.27 20.68 26.5 32.06 36.65 35.08 27.75 29.75 28.9 30.58 26.7 35.97 60.38 56.96 39.04 36.62 20.81 38.04 32.78 33.94 34.16 40.86 29.34 32.51 35.78 35.16 36.87 36.7 33.01 29.91
10.8 11.51 13.89 14.97 16.52 16.18 20.9 21.61 13.18 15.54 18.0 17.82 16.11 31.82 28.01 18.98 18.97 9.65 17.57 16.58 16.35 15.45 6.71 15.34 15.19 15.01 14.53 13.46 14.89 15.58 17.17
0.93 2.16 1.52 1.32 2.63 4.06 2.36 2.35 2.17 1.95 1.74 1.92 1.92 8.53 5.57 2.22 3.04 0.93 2.58 1.91 2.3 2.6 0.1 2.65 2.03 2.72 2.05 1.86 3.9 2.93 3.1
9.55 8.0 7.14 8.11 13.72 14.79 13.99 11.96 12.67 11.36 11.67 9.3 9.38 29.51 25.06 12.5 9.85 9.92 17.13 11.02 12.05 11.07 17.21 11.47 11.37 10.84 10.6 11.07 16.91 14.6 15.09
13.66 19.67 9.64 7.05 21.16 19.55 19.86 18.27 10.8 9.96 10.86 9.3 9.87 30.85 25.57 16.51 14.51 11.96 18.62 12.14 12.68 13.3 13.62 12.99 12.55 12.33 13.43 9.97 20.17 19.7 19.54
13.19 14.37 12.53 11.25 22.95 23.2 20.79 21.32 17.28 15.66 18.63 14.54 19.84 33.07 27.08 18.54 16.7 16.42 19.68 17.57 16.82 18.27 23.77 16.14 17.08 18.55 18.7 18.44 19.78 18.9 21.79
6.71 10.19 4.46 5.56 19.05 23.29 21.89 20.65 15.72 15.25 15.47 14.96 18.39 29.14 26.27 17.58 17.25 9.64 22.71 18.3 17.44 18.48 9.34 16.59 18.68 19.42 17.96 17.63 19.65 18.02 19.17
5.92 7.03 5.99 6.42 8.03 12.08 10.62 10.03 8.8 8.62 9.33 8.74 9.78 19.66 19.83 13.19 12.12 10.5 14.47 10.62 10.27 9.68 9.57 8.96 8.7 10.53 10.04 8.73 11.06 10.71 9.65
21.18 14.73 27.45 30.77 43.89 63.45 82.12 80.77 54.39 50.96 56.73 44.56 40.98 109.43 117.53 77.17 74.27 30.82 69.28 59.73 59.1 58.04 24.3 55.98 58.58 68.28 68.28 48.27 68.48 64.37 57.77
1.26 1.04 0.7 0.82 2.78 3.63 2.68 1.86 2.72 2.56 2.87 2.48 1.92 6.88 5.57 2.8 3.38 6.3 3.69 3.27 2.93 3.02 0.59 2.87 2.83 2.15 2.77 3.32 3.66 2.97 1.81
2.31 1.85 2.09 1.95 1.07 1.06 4.34 4.9 2.14 2.21 2.04 2.2 2.56 3.02 3.59 1.69 2.24 2.52 2.54 2.82 1.93 1.78 0.75 1.84 2.16 2.05 2.12 2.36 1.14 1.09 0.58
8.74 10.64 7.39 9.33 16.23 17.53 16.82 16.07 15.52 14.57 15.37 13.4 15.23 20.2 23.81 17.21 16.11 9.11 16.41 15.49 15.22 13.83 11.61 14.22 14.35 15.25 15.41 15.23 17.48 16.94 14.66
10.73 10.39 10.36 9.96 22.76 29.5 24.44 27.64 16.76 17.42 16.96 17.37 18.92 31.84 32.9 23.35 20.3 17.63 22.27 20.19 20.63 20.91 19.74 19.75 19.29 20.04 19.99 21.51 21.7 19.74 22.29
3.33 4.85 3.67 3.36 7.56 7.45 7.08 6.49 6.63 7.35 7.16 7.86 5.26 13.27 10.93 7.59 7.48 0.75 7.14 5.67 5.96 5.16 1.14 5.49 3.75 5.2 5.28 3.93 4.63 4.92 7.48
0.31 0.78 0.56 1.32 2.27 3.66 4.36 5.69 3.08 2.88 2.85 2.4 3.58 10.31 9.6 3.8 2.83 2.94 4.56 3.82 4.17 3.08 8.02 3.2 3.0 3.96 3.47 2.42 5.22 3.9 1.96
19.39 21.44 14.7 11.37 35.4 47.78 28.21 31.63 18.23 18.45 18.83 17.48 16.81 61.29 46.09 32.41 25.5 15.6 28.36 20.13 22.67 24.76 11.33 20.66 20.83 22.64 25.18 24.28 26.18 22.35 15.21
34.01 7.15 5.32 4.54 8.78 4.51 62.03 74.99 23.56 21.91 20.16 26.87 20.6 82.28 126.33 24.63 35.37 38.48 93.52 72.4 39.39 32.7 1.22 46.86 34.25 35.73 31.68 35.24 25.81 21.63 15.96
30.56 11.97 11.3 7.79 17.84 24.21 73.42 118.89 25.36 26.06 25.22 34.83 26.54 234.47 161.42 36.87 44.44 24.49 105.91 66.04 40.19 38.09 2.61 52.0 39.12 35.51 33.95 44.17 33.86 30.13 23.74
38.82 27.18 19.18 12.95 42.67 91.88 78.98 84.11 45.01 39.23 43.75 32.78 55.64 99.8 98.45 61.32 55.32 28.67 70.46 59.8 58.95 59.78 54.67 60.53 64.99 57.28 61.12 57.86 63.25 73.11 67.99
24.68 20.71 20.83 17.42 24.98 33.62 30.01 29.23 22.96 21.89 22.51 21.78 24.08 36.2 36.83 27.85 25.13 25.1 26.25 24.83 22.56 22.45 13.12 21.99 21.21 20.18 22.03 23.16 30.75 27.33 24.6
4.45 4.9 3.48 3.53 6.92 7.96 7.09 6.49 5.01 4.85 5.23 4.41 4.98 11.71 10.31 7.75 6.29 7.54 8.48 5.56 6.16 5.78 8.08 5.05 5.52 5.85 5.82 5.64 7.66 7.62 6.4
554.52 514.26 401.07 490.61 682.51 651.01 928.84 1462.6 595.0 807.86 753.55 868.9 803.42 3267.78 2531.57 778.45 962.91 1126.98 1609.03 852.84 943.99 909.49 383.84 867.72 739.94 789.56 745.21 873.63 1203.84 1036.86 938.43
4.5 5.42 3.11 1.51 4.67 6.95 5.33 3.27 4.25 3.17 3.92 3.2 4.03 18.55 10.13 4.19 4.02 1.79 6.45 3.24 4.11 4.31 1.68 4.29 4.05 3.79 3.74 3.36 8.06 7.14 7.44
15.59 20.04 8.55 5.97 22.01 32.79 26.53 34.03 12.25 11.56 13.94 12.21 17.4 41.8 33.53 19.47 18.48 27.11 29.18 17.34 16.19 17.23 13.23 19.71 17.48 17.71 19.17 16.26 20.92 22.11 21.72
20.87 24.64 17.74 18.88 40.39 51.33 73.31 66.33 33.91 36.72 38.13 32.91 47.71 96.8 100.57 53.3 56.27 35.74 66.77 49.55 47.41 49.73 10.59 47.06 46.16 48.64 48.11 43.9 61.85 51.05 52.04
6.49 5.64 4.6 4.29 9.58 13.73 11.49 13.07 7.26 6.58 7.82 6.81 6.81 22.58 16.72 9.67 7.61 2.47 8.25 6.93 8.07 8.5 0.83 8.67 8.11 8.2 9.14 7.94 9.47 8.96 9.47
10.43 8.84 6.99 3.52 3.3 2.93 21.6 24.51 7.99 7.58 6.17 8.53 7.25 10.84 21.4 8.05 10.84 8.32 23.34 15.37 9.13 8.42 3.19 9.87 7.73 8.01 8.07 10.09 9.32 8.1 6.04
15.01 13.97 9.96 7.57 17.67 21.69 21.53 27.02 13.37 13.2 13.72 12.9 18.46 41.77 28.53 19.06 17.96 12.16 18.54 14.94 16.36 17.64 30.78 18.18 16.98 16.9 15.77 14.93 21.22 20.25 22.41
0.84 1.26 1.8 2.59 6.45 8.69 12.37 17.14 6.39 5.19 5.69 4.92 2.19 26.91 17.98 7.25 6.87 0.21 14.76 7.37 7.68 8.41 1.69 6.72 6.53 6.6 6.92 6.4 7.84 6.26 9.0
5.94 11.26 5.99 3.79 9.2 12.48 16.73 18.01 9.18 9.08 10.28 9.07 8.69 21.13 21.37 15.27 14.22 8.72 15.22 10.51 11.83 12.63 5.35 9.91 11.06 12.25 12.42 10.17 15.33 13.63 12.98
6.78 9.13 5.81 15.47 35.32 51.52 53.65 71.08 32.54 35.16 36.68 32.62 26.29 132.54 109.28 43.39 33.17 17.63 76.86 41.3 35.64 33.61 44.32 41.0 34.15 29.31 35.03 25.1 60.83 49.45 46.97
19.8 11.8 9.47 6.5 16.82 12.75 38.91 41.57 21.97 18.42 22.86 25.87 28.62 80.01 89.2 30.67 37.86 52.49 87.64 47.38 34.03 31.01 5.26 40.15 33.01 32.7 29.79 28.63 38.47 31.96 34.48
15.2 16.37 10.96 10.6 21.45 24.68 22.92 24.7 15.09 15.35 17.89 16.74 18.55 29.97 27.03 21.49 19.78 25.98 20.13 17.08 16.52 17.36 20.56 16.35 18.4 19.33 20.05 18.03 18.54 17.77 17.74
15.94 19.55 10.43 9.28 23.87 29.91 36.47 36.28 28.56 25.48 29.64 21.9 26.88 53.1 49.22 31.67 30.94 22.4 33.15 27.88 26.43 28.11 17.19 28.64 25.68 28.42 29.22 25.36 31.41 31.15 28.58

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)