1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_217 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.04 0.05 0.06 0.08 0.07 0.06 0.09 0.11 0.08 0.08 0.09 0.09 0.22 0.12 0.14 0.1 0.11 1.0 0.16 0.11 0.09 0.07 0.09 0.12 0.08 0.08 0.08 0.05 0.12 0.19 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.09 0.11 0.11 0.17 0.13 0.08 0.08 0.13 0.15 0.13 0.12 0.38 0.14 0.15 0.16 0.09 1.0 0.05 0.03 0.03 0.05 0.23 0.07 0.09 0.08 0.11 0.04 0.12 0.16 0.41
0.04 0.02 0.02 0.01 0.12 0.04 0.01 0.02 0.05 0.06 0.08 0.05 0.06 0.16 0.16 0.06 0.09 1.0 0.08 0.06 0.07 0.04 0.58 0.02 0.06 0.06 0.08 0.03 0.07 0.06 0.09
0.08 0.08 0.08 0.09 0.16 0.13 0.07 0.09 0.08 0.07 0.08 0.06 0.09 0.12 0.12 0.08 0.05 1.0 0.21 0.09 0.12 0.12 0.01 0.06 0.09 0.15 0.16 0.08 0.16 0.14 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44
0.06 0.03 0.06 0.02 0.07 0.05 0.1 0.09 0.12 0.09 0.12 0.21 0.59 0.14 0.31 0.15 0.23 1.0 0.11 0.21 0.17 0.13 0.05 0.16 0.18 0.14 0.11 0.12 0.08 0.11 0.24
0.01 0.01 0.01 0.04 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.25 0.11 0.11 0.02 0.04 1.0 0.04 0.03 0.03 0.03 0.2 0.01 0.06 0.03 0.03 0.0 0.01 0.04 0.32
0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.37 0.01 0.02 0.03 0.03 1.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.05 0.11 0.01 0.02 0.01 0.04 0.04 0.29
0.1 0.17 0.09 0.06 0.11 0.11 0.16 0.17 0.07 0.09 0.08 0.07 0.26 0.16 0.15 0.12 0.12 1.0 0.11 0.09 0.1 0.11 0.12 0.09 0.1 0.1 0.14 0.07 0.22 0.22 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.36 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.19 0.03 0.04 0.01 0.03 1.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.32 0.07 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03 0.09
0.01 0.01 0.04 0.03 0.25 0.09 0.02 0.04 0.09 0.07 0.13 0.12 0.15 0.06 0.15 0.08 0.1 1.0 0.13 0.09 0.08 0.1 0.25 0.15 0.15 0.1 0.13 0.06 0.13 0.17 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.2 0.06 0.03 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.08 0.06 0.05 0.02 0.01 1.0 0.05 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.04 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.05 0.0 0.07 0.3 0.0 0.02 0.0 0.04 1.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.25 0.06 0.07 0.03 0.06 1.0 0.03 0.04 0.03 0.01 0.13 0.04 0.05 0.03 0.02 0.01 0.02 0.05 0.34
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.41 0.03 0.04 0.03 0.03 1.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.22 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.39
0.16 0.19 0.13 0.15 0.12 0.06 0.08 0.07 0.07 0.08 0.09 0.07 0.5 0.29 0.14 0.09 0.11 1.0 0.1 0.12 0.08 0.08 0.44 0.07 0.08 0.09 0.09 0.09 0.09 0.1 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.38 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.3 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.25
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.01 0.07 0.31
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.46
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.06 0.01 0.02 0.01 0.03 0.49 0.01 0.03 0.04 0.06 1.0 0.02 0.06 0.02 0.03 0.19 0.06 0.06 0.03 0.01 0.03 0.03 0.05 0.15
0.04 0.03 0.08 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.19 0.04 0.01 0.0 0.04 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.02 0.17
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.46 0.02 0.01 0.0 0.01 1.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.3 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.02 0.02 0.02 0.03 0.05 0.1 0.06 0.08 0.07 0.08 0.06 0.05 0.22 0.09 0.07 0.06 0.05 1.0 0.06 0.05 0.06 0.05 0.22 0.04 0.05 0.05 0.06 0.04 0.07 0.06 0.26
0.06 0.03 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.06 0.03 0.0 0.01 1.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.36 0.05 0.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03
0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 0.02 0.06 0.03 0.04 0.03 0.57 0.04 0.07 0.05 0.04 1.0 0.07 0.02 0.03 0.03 0.01 0.03 0.04 0.03 0.07 0.02 0.08 0.06 0.46
0.02 0.01 0.02 0.02 0.11 0.06 0.08 0.08 0.08 0.03 0.06 0.08 0.28 0.11 0.12 0.07 0.07 1.0 0.08 0.05 0.05 0.04 0.01 0.08 0.06 0.03 0.06 0.03 0.04 0.08 0.48
0.02 0.01 0.04 0.02 0.05 0.04 0.01 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.22 0.03 0.03 0.02 0.02 1.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.06 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.05 0.04 0.18
0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.35 0.0 0.02 0.01 0.02 1.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.17 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.22
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.06 0.06 0.02 0.67 0.0 0.06 0.03 0.07 1.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.38 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.03 0.01 0.01 0.14 0.11 0.08 0.05 0.1 0.06 0.1 0.09 0.28 0.13 0.16 0.14 0.13 1.0 0.12 0.09 0.1 0.13 0.31 0.09 0.13 0.13 0.23 0.1 0.11 0.13 0.38
0.01 0.03 0.01 0.04 0.06 0.08 0.03 0.02 0.04 0.05 0.05 0.05 0.44 0.07 0.05 0.05 0.04 1.0 0.04 0.04 0.04 0.03 0.05 0.02 0.04 0.02 0.03 0.03 0.05 0.09 0.45
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.05 0.0 0.01 0.02 0.03 0.26 0.09 0.06 0.0 0.03 1.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.25 0.05 0.02 0.0 0.02 0.01 0.05 0.06 0.2
0.03 0.05 0.09 0.14 0.13 0.11 0.1 0.16 0.12 0.14 0.11 0.15 0.31 0.06 0.14 0.11 0.13 1.0 0.14 0.11 0.09 0.08 0.27 0.13 0.13 0.14 0.14 0.07 0.24 0.31 0.28
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01
0.07 0.04 0.01 0.04 0.08 0.11 0.06 0.04 0.07 0.09 0.09 0.13 0.33 0.06 0.13 0.1 0.1 1.0 0.13 0.12 0.18 0.15 0.28 0.08 0.08 0.1 0.08 0.08 0.1 0.13 0.52
0.07 0.08 0.09 0.07 0.2 0.17 0.07 0.04 0.12 0.11 0.12 0.12 0.17 0.2 0.24 0.11 0.12 1.0 0.21 0.11 0.13 0.1 0.18 0.1 0.14 0.13 0.14 0.1 0.24 0.31 0.43
0.04 0.03 0.02 0.04 0.05 0.04 0.04 0.06 0.03 0.04 0.02 0.04 0.71 0.06 0.02 0.04 0.05 1.0 0.02 0.03 0.03 0.03 0.61 0.08 0.11 0.05 0.04 0.05 0.04 0.05 0.47
0.05 0.03 0.17 0.16 0.03 0.03 0.03 0.01 0.01 0.04 0.05 0.04 0.5 0.09 0.06 0.03 0.04 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.24 0.01 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.07 0.1 0.04 0.06 0.02 0.03 0.19 0.03 0.13 0.05 0.07 1.0 0.07 0.03 0.03 0.03 0.0 0.06 0.08 0.05 0.03 0.02 0.05 0.1 0.37
0.0 0.01 0.02 0.04 0.08 0.05 0.06 0.07 0.04 0.07 0.06 0.06 0.18 0.02 0.06 0.07 0.06 1.0 0.05 0.09 0.05 0.07 0.02 0.06 0.08 0.07 0.07 0.05 0.23 0.18 0.39
0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.05 0.36 0.08 0.08 0.04 0.05 1.0 0.04 0.04 0.03 0.04 0.14 0.06 0.06 0.04 0.06 0.02 0.05 0.05 0.4
0.0 0.06 0.04 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.01 0.03 0.04 0.04 0.11 0.04 0.04 0.06 0.05 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.14 0.04 0.02 0.06 0.01 0.01 0.07 0.11 0.35
0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.05 0.03 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.03 0.02 0.02 0.02 1.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.59 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 0.03 0.02 0.0 1.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)