1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_217 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
1.1 1.44 1.73 2.25 1.95 1.7 2.45 3.16 2.35 2.24 2.51 2.65 6.25 3.37 4.0 2.77 3.09 28.57 4.58 3.23 2.46 2.03 2.51 3.31 2.28 2.27 2.17 1.5 3.44 5.34 12.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.43 0.0 0.0 0.0 0.0 6.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.2 0.27 0.27 0.41 0.3 0.18 0.19 0.3 0.36 0.32 0.28 0.88 0.32 0.35 0.37 0.22 2.34 0.11 0.08 0.07 0.12 0.53 0.17 0.21 0.19 0.26 0.1 0.28 0.39 0.96
0.08 0.04 0.03 0.03 0.28 0.1 0.03 0.05 0.11 0.13 0.19 0.12 0.13 0.37 0.37 0.13 0.19 2.26 0.18 0.14 0.16 0.09 1.32 0.05 0.14 0.14 0.19 0.06 0.16 0.14 0.19
378.23 389.18 375.68 420.1 734.39 591.38 331.32 398.07 362.78 321.15 386.41 275.63 410.54 560.83 552.17 384.79 250.25 4609.96 973.53 425.5 546.24 551.57 39.2 265.48 397.36 673.5 734.54 385.03 715.98 637.09 1496.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.02 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.49 0.23 0.56 0.18 0.61 0.43 0.92 0.82 1.06 0.77 1.08 1.89 5.23 1.26 2.74 1.29 2.02 8.81 1.01 1.84 1.48 1.12 0.48 1.39 1.56 1.27 1.0 1.05 0.75 0.96 2.08
0.03 0.03 0.02 0.16 0.28 0.05 0.09 0.06 0.06 0.03 0.03 0.09 1.07 0.47 0.48 0.07 0.16 4.2 0.15 0.15 0.13 0.11 0.82 0.04 0.24 0.14 0.12 0.02 0.04 0.15 1.34
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.01 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.44 0.01 0.03 0.03 0.04 1.2 0.0 0.01 0.01 0.06 0.03 0.06 0.13 0.01 0.02 0.01 0.05 0.04 0.35
2.92 5.11 2.77 1.73 3.47 3.46 4.87 5.14 2.11 2.67 2.3 2.09 8.0 4.78 4.66 3.77 3.66 30.52 3.23 2.69 3.06 3.33 3.66 2.81 3.18 3.16 4.16 2.06 6.77 6.58 13.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 1.1 0.02 0.01 0.02 0.0 3.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 1.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.06 0.17 0.92 0.13 0.17 0.07 0.13 4.81 0.04 0.05 0.1 0.01 1.55 0.33 0.0 0.03 0.02 0.12 0.04 0.13 0.45
0.08 0.06 0.25 0.21 1.74 0.64 0.17 0.29 0.65 0.47 0.95 0.86 1.06 0.46 1.07 0.55 0.71 7.05 0.93 0.6 0.53 0.73 1.79 1.07 1.09 0.74 0.9 0.46 0.95 1.23 2.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.37 0.1 0.06 0.0 0.04 1.88 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.07
0.05 0.21 0.16 0.05 2.45 1.56 0.39 0.31 0.88 0.66 1.49 1.06 5.24 3.98 3.26 1.21 0.76 62.01 2.94 1.35 1.08 1.57 0.0 0.51 1.04 1.21 1.94 0.56 1.26 2.61 24.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 1.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.02 4.73 0.02 0.0 0.0 0.0 1.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.03 0.13 0.0 0.01 0.0 0.02 0.44 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.15 0.05 0.13 0.16 0.01 0.22 0.15 0.22 0.22 0.31 0.55 3.57 0.81 0.95 0.41 0.79 14.16 0.42 0.55 0.37 0.2 1.78 0.57 0.67 0.37 0.3 0.12 0.33 0.76 4.86
0.59 0.77 1.04 1.63 1.11 1.68 0.94 0.66 1.62 2.47 2.07 2.55 47.6 3.27 4.29 3.12 3.57 115.46 2.88 2.91 2.25 1.84 25.77 2.36 2.85 3.08 3.41 2.69 3.13 4.19 44.81
0.75 0.85 0.62 0.68 0.56 0.29 0.39 0.3 0.34 0.39 0.4 0.32 2.31 1.34 0.62 0.41 0.5 4.6 0.45 0.55 0.39 0.36 2.04 0.33 0.36 0.4 0.43 0.42 0.43 0.45 2.09
0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.05 0.03 0.01 0.05 0.03 0.06 0.07 3.65 0.03 0.01 0.05 0.08 9.61 0.01 0.12 0.04 0.03 2.85 0.06 0.05 0.03 0.09 0.05 0.02 0.09 2.44
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.07 0.11 0.0 0.0 2.58 0.0 0.06 0.0 0.2 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.03 0.19 0.81
0.03 0.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.07 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 1.9 0.02 0.0 0.0 0.0 5.05 0.01 0.02 0.02 0.06 1.06 0.01 0.01 0.03 0.03 0.2 0.0 0.03 2.32
0.36 0.09 0.1 0.66 0.12 0.66 2.79 2.96 0.51 1.08 0.46 1.17 22.77 0.59 1.46 1.92 2.72 46.1 1.13 2.71 0.93 1.38 8.91 2.57 2.67 1.39 0.67 1.42 1.34 2.19 7.01
0.06 0.04 0.11 0.1 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.25 0.05 0.01 0.0 0.05 1.37 0.0 0.01 0.01 0.0 0.24 0.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.03 0.23
0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 1.36 0.07 0.03 0.0 0.03 2.96 0.06 0.02 0.05 0.0 0.9 0.0 0.01 0.04 0.0 0.05 0.01 0.03 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 4.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22
0.35 0.26 0.28 0.53 0.87 1.56 0.91 1.24 1.12 1.25 0.94 0.81 3.68 1.45 1.19 0.98 0.77 16.41 1.0 0.85 0.92 0.79 3.53 0.69 0.75 0.9 1.05 0.6 1.15 1.03 4.32
0.04 0.02 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.05 0.02 0.0 0.01 0.78 0.0 0.02 0.03 0.0 0.28 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02
0.0 0.02 0.05 0.12 0.25 0.1 0.08 0.1 0.31 0.14 0.21 0.17 2.99 0.21 0.35 0.25 0.23 5.23 0.36 0.09 0.13 0.15 0.03 0.18 0.2 0.18 0.36 0.1 0.41 0.33 2.43
0.09 0.04 0.07 0.1 0.47 0.24 0.35 0.32 0.32 0.15 0.23 0.33 1.16 0.44 0.48 0.27 0.3 4.19 0.34 0.19 0.22 0.18 0.03 0.31 0.24 0.13 0.27 0.11 0.18 0.35 2.03
0.1 0.06 0.18 0.09 0.2 0.17 0.05 0.11 0.09 0.12 0.04 0.03 0.9 0.13 0.11 0.08 0.07 4.17 0.02 0.02 0.15 0.08 0.26 0.04 0.04 0.05 0.2 0.09 0.2 0.15 0.74
0.08 0.04 0.11 0.05 0.03 0.02 0.04 0.05 0.07 0.09 0.04 0.06 2.39 0.01 0.12 0.06 0.13 6.87 0.07 0.12 0.17 0.05 1.14 0.12 0.1 0.18 0.03 0.02 0.05 0.24 1.53
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.02 0.06 0.01 0.12 0.11 0.04 1.3 0.0 0.11 0.05 0.14 1.93 0.04 0.04 0.05 0.01 0.74 0.04 0.08 0.03 0.04 0.01 0.02 0.04 1.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.05 0.0 0.0 0.0 0.55 0.28 0.0 0.0 0.12 0.07 0.08 0.25 1.15 0.38 0.34 0.17 0.18 276.68 0.19 0.08 0.21 0.09 77.54 0.58 1.03 0.15 0.22 0.05 0.01 0.08 2.33
0.33 0.72 0.4 0.22 4.12 3.15 2.23 1.51 2.84 1.74 2.95 2.48 7.89 3.74 4.43 3.86 3.65 28.53 3.38 2.64 2.97 3.68 8.91 2.6 3.64 3.6 6.44 2.93 3.24 3.69 10.71
0.48 0.93 0.42 1.3 1.98 2.64 0.91 0.67 1.37 1.61 1.56 1.62 14.25 2.13 1.68 1.75 1.34 32.48 1.27 1.19 1.45 0.95 1.72 0.69 1.24 0.8 0.93 1.06 1.75 2.94 14.73
0.02 0.0 0.13 0.02 0.08 0.08 0.12 0.24 0.01 0.03 0.1 0.15 1.3 0.43 0.28 0.02 0.18 5.09 0.13 0.12 0.04 0.04 1.28 0.25 0.09 0.02 0.09 0.03 0.25 0.29 1.02
4.08 6.72 11.87 19.59 17.63 15.09 14.09 21.55 16.85 18.47 14.8 20.64 42.76 8.3 19.56 14.9 18.04 135.88 19.54 14.71 12.4 10.28 36.47 18.27 18.31 18.61 18.39 9.43 32.8 41.46 37.61
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.04 0.01 0.0 0.01 0.93 0.01 0.0 0.01 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01
0.25 0.15 0.04 0.14 0.28 0.38 0.21 0.13 0.26 0.29 0.31 0.44 1.14 0.2 0.46 0.35 0.35 3.44 0.45 0.41 0.6 0.5 0.97 0.29 0.28 0.34 0.28 0.26 0.33 0.45 1.79
14.92 19.21 20.83 16.06 45.11 38.75 15.73 10.03 28.2 24.48 27.79 26.38 37.52 45.56 54.1 24.64 26.53 226.5 48.16 24.57 29.6 22.23 40.16 23.6 30.97 30.25 32.0 21.94 54.58 70.77 98.45
1.37 0.95 0.86 1.34 1.77 1.3 1.57 2.22 0.99 1.46 0.88 1.61 25.9 2.18 0.83 1.64 1.92 36.62 0.61 1.23 1.28 1.19 22.21 2.92 4.2 1.78 1.65 1.86 1.48 1.71 17.32
0.47 0.3 1.69 1.66 0.33 0.33 0.28 0.13 0.15 0.37 0.49 0.44 5.04 0.89 0.6 0.33 0.44 10.1 0.13 0.25 0.14 0.2 2.39 0.13 0.27 0.17 0.2 0.31 0.06 0.24 5.61
0.0 0.0 0.0 0.02 0.29 0.34 0.51 0.71 0.32 0.41 0.14 0.19 1.38 0.24 0.93 0.39 0.51 7.33 0.51 0.22 0.24 0.23 0.02 0.43 0.57 0.39 0.19 0.16 0.38 0.72 2.7
1.37 3.78 6.05 13.17 25.22 16.06 21.05 21.66 14.42 21.6 19.94 20.32 59.19 5.99 18.79 21.42 21.16 326.79 16.02 29.55 16.57 23.74 7.54 19.77 26.06 22.49 23.99 17.04 75.47 58.91 126.9
0.2 0.15 0.15 0.28 1.82 0.66 0.36 0.17 0.62 0.63 0.33 1.0 7.53 1.64 1.65 0.79 1.03 21.04 0.84 0.93 0.74 0.8 2.94 1.23 1.21 0.76 1.2 0.52 0.98 0.95 8.43
0.0 0.08 0.05 0.02 0.03 0.03 0.06 0.03 0.01 0.04 0.05 0.06 0.14 0.05 0.05 0.08 0.06 1.3 0.03 0.02 0.01 0.02 0.18 0.05 0.03 0.08 0.02 0.02 0.09 0.15 0.46
0.01 0.01 0.0 0.02 0.23 0.1 0.07 0.03 0.01 0.05 0.04 0.01 0.09 0.06 0.05 0.05 0.04 2.28 0.07 0.03 0.0 0.07 1.34 0.05 0.08 0.01 0.02 0.0 0.1 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.62 0.0 0.03 0.0 0.02 0.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 1.63 0.0 0.02 0.0 0.01 3.97 0.0 0.01 0.0 0.0 0.63 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.45

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)