Heatmap: Cluster_132 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10541.1 (HYP7)	-0.49	-0.51	-0.63	-0.61	0.63	0.49	-0.43	-0.26	-0.42	-0.52	-0.29	-0.71	0.18	1.09	0.59	-0.26	-0.29	0.47	-0.19	-0.52	-0.23	-0.15	0.88	-0.28	-0.46	-0.22	-0.06	-0.1	0.25	0.09	0.44
Lsat_1_v5_gn_0_10560.1 (BTL08)	-0.44	-0.33	-0.63	-0.54	0.17	0.19	-0.09	-0.07	-0.4	-0.44	-0.28	-0.44	0.29	0.48	0.38	-0.09	-0.07	0.74	-0.2	-0.23	-0.21	-0.16	1.01	-0.11	-0.11	-0.12	-0.07	-0.28	0.04	0.04	0.4
Lsat_1_v5_gn_0_37821.1 (RPT5A)	-0.61	-0.63	-0.56	-0.3	0.21	0.08	-0.16	-0.04	-0.41	-0.35	-0.32	-0.36	0.4	0.67	0.35	-0.21	-0.13	0.91	-0.35	-0.35	-0.26	-0.25	0.71	-0.38	-0.26	-0.24	-0.29	-0.18	0.23	0.23	0.84
Lsat_1_v5_gn_0_39260.1	-0.83	-0.67	-0.6	-0.56	0.16	0.14	0.02	0.5	-0.6	-0.37	-0.28	-0.27	0.45	0.75	0.39	-0.04	-0.13	0.9	-0.23	-0.42	-0.27	-0.19	0.75	-0.23	-0.28	-0.15	-0.23	-0.09	-0.16	-0.11	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_101701.1 (SEC31B)	-0.42	-0.28	-0.67	-0.64	0.23	0.25	-0.14	-0.18	-0.4	-0.35	-0.16	-0.32	0.34	0.57	0.44	0.12	-0.04	0.59	-0.14	-0.31	-0.13	-0.11	0.56	-0.36	-0.17	-0.1	-0.12	-0.15	0.22	0.15	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_106940.1	-0.57	-0.37	-0.78	-0.28	0.34	0.39	-0.14	0.02	-0.45	-0.56	-0.14	-0.21	0.15	0.55	0.53	-0.07	-0.19	0.4	0.16	-0.44	-0.15	-0.12	0.7	-0.32	-0.29	-0.07	-0.29	-0.24	0.19	0.27	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_11001.1	-0.89	-1.04	-1.22	-0.89	0.21	0.42	-0.06	0.24	-0.58	-0.46	-0.49	-0.5	0.31	0.89	0.7	-0.08	-0.26	0.31	0.21	-0.01	-0.26	-0.07	0.74	-0.42	-0.36	0.03	-0.2	-0.27	0.18	0.14	0.79
Lsat_1_v5_gn_1_117781.1 (SFPS)	-0.59	-0.61	-0.92	-0.75	0.08	0.22	-0.12	0.16	-0.35	-0.28	-0.09	-0.14	0.34	0.85	0.44	0.08	-0.19	0.41	0.02	-0.18	-0.1	-0.04	0.5	-0.08	-0.02	-0.2	-0.07	-0.4	0.11	-0.02	0.47
Lsat_1_v5_gn_1_126300.1 (BRF3)	-0.48	-0.32	-0.81	-0.4	0.36	0.32	0.05	0.15	-0.35	-0.36	-0.17	-0.29	0.04	0.82	0.61	0.01	-0.25	0.32	-0.04	-0.39	-0.38	-0.22	0.62	-0.39	-0.34	-0.3	-0.23	-0.57	0.34	0.21	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_22460.1	-0.52	-0.5	-0.51	-0.46	0.15	0.23	-0.21	-0.17	-0.31	-0.23	-0.13	-0.22	0.11	0.76	0.57	0.1	-0.15	0.13	-0.05	-0.26	-0.04	-0.01	0.67	-0.22	-0.16	0.0	-0.13	-0.21	0.2	0.13	0.31
Lsat_1_v5_gn_1_29241.1 (EF1Bb)	-0.79	-0.7	-0.83	-0.72	0.14	0.45	0.0	0.13	-0.38	-0.36	-0.29	-0.37	0.21	0.75	0.36	-0.07	-0.14	0.21	0.1	-0.16	-0.19	0.0	0.64	-0.08	-0.03	-0.03	-0.06	-0.28	0.21	0.11	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_34841.1	-0.78	-0.59	-0.91	-0.8	0.01	0.3	0.07	0.29	-0.53	-0.64	-0.31	-0.41	0.38	0.81	0.5	0.03	-0.07	0.81	-0.16	-0.3	-0.35	-0.23	1.0	-0.19	-0.19	-0.11	-0.21	-0.37	0.0	0.04	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_38060.1 (EER4)	-0.45	-0.42	-0.59	-0.66	0.24	0.31	-0.45	-0.31	-0.43	-0.49	-0.19	-0.35	0.15	0.9	0.65	0.19	-0.21	-0.08	0.01	-0.21	-0.24	-0.06	0.91	-0.24	-0.26	-0.09	-0.08	-0.18	0.33	0.13	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_43821.1	-0.82	-0.42	-1.16	-0.63	0.45	0.35	-0.65	-0.27	-0.39	-0.28	-0.4	-0.34	0.4	0.97	0.63	-0.22	-0.65	0.3	0.15	-0.58	-0.2	-0.19	0.88	-0.29	-0.36	-0.48	-0.05	-0.26	0.3	0.25	0.92
Lsat_1_v5_gn_1_54761.1 (RSZ32)	-0.63	-0.47	-0.36	-0.27	0.12	0.05	-0.11	0.13	-0.32	-0.22	-0.18	-0.23	0.06	0.67	0.55	0.02	-0.16	0.88	-0.23	-0.29	-0.34	-0.33	0.79	-0.27	-0.42	-0.24	-0.24	-0.83	0.16	0.13	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_55260.1 (Nemp_A)	-0.42	-0.72	-0.49	-0.33	0.44	0.47	-0.25	-0.26	-0.4	-0.31	-0.17	-0.38	-0.06	1.0	0.71	-0.14	-0.51	0.35	-0.0	-0.32	-0.23	-0.3	1.06	-0.38	-0.25	-0.17	-0.39	-0.35	0.09	0.0	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_56341.1	-0.9	-1.01	-1.46	-1.22	0.08	0.17	-0.19	0.18	-0.67	-0.74	-0.51	-0.39	0.72	1.15	0.72	0.08	0.03	0.73	-0.33	-0.21	-0.34	-0.0	0.63	-0.05	-0.24	-0.23	-0.17	-0.17	0.14	0.1	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_64201.1 (MON1)	-0.19	-0.24	-0.53	-0.41	0.47	0.24	-0.15	-0.22	-0.29	-0.21	-0.16	-0.11	0.17	0.51	0.4	-0.07	-0.2	0.23	-0.1	-0.25	-0.26	-0.11	0.69	-0.21	-0.19	-0.18	-0.15	-0.09	0.09	0.15	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_6680.1 (TASH3)	-0.5	-0.34	-0.48	-0.44	0.42	0.23	-0.29	-0.36	-0.28	-0.12	-0.17	-0.18	0.34	0.52	0.34	0.09	-0.1	0.36	-0.04	-0.32	-0.28	-0.19	0.61	-0.32	-0.24	-0.14	-0.2	-0.24	0.35	0.24	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_81660.1 (PYRD)	-0.46	-0.39	-0.92	-1.03	-0.2	-0.11	0.14	0.51	-0.49	-0.58	-0.33	-0.2	0.64	0.53	0.32	-0.04	-0.04	0.84	-0.19	-0.1	-0.26	-0.34	0.81	0.14	-0.12	-0.03	-0.4	-0.02	-0.26	-0.03	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_100500.1	-3.35	-3.69	-6.91	-2.97	-0.66	-1.77	-2.59	-2.53	-0.39	-0.45	-0.27	-0.38	-1.8	1.06	0.61	-0.78	-0.38	2.46	-0.85	-0.84	-1.22	-1.78	2.25	-0.63	-0.84	-0.72	-0.89	-1.74	0.11	0.89	1.77
Lsat_1_v5_gn_2_103580.1 (RRP6L2)	-0.54	-0.55	-0.85	-0.56	0.22	0.17	-0.02	0.35	-0.53	-0.42	-0.45	-0.38	0.41	0.81	0.56	0.01	-0.15	0.47	-0.08	-0.3	-0.21	-0.16	0.54	-0.28	-0.12	-0.18	-0.22	-0.19	0.23	0.18	0.49
Lsat_1_v5_gn_2_105960.1 (J2)	-0.53	-0.21	-0.07	-0.23	0.49	0.3	0.16	0.53	-0.6	-0.52	-0.43	-0.61	-0.5	0.93	0.56	-0.15	-0.36	0.92	-0.31	-0.62	-0.34	-0.26	0.97	-0.63	-0.46	-0.35	-0.41	-0.71	0.09	0.06	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_115481.1 (TON1)	-0.4	-0.5	-0.73	-0.68	0.31	0.33	0.06	-0.02	-0.39	-0.37	-0.25	-0.31	0.38	0.52	0.42	-0.17	-0.2	0.66	-0.2	-0.1	-0.22	-0.12	0.93	-0.13	-0.3	-0.25	-0.18	-0.36	0.08	0.07	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_12320.1 (STT3B)	-0.95	-0.61	-1.29	-1.27	0.48	0.26	-0.5	-0.32	-0.62	-0.45	-0.42	-0.28	0.72	0.78	0.66	0.09	-0.06	0.44	-0.08	-0.41	-0.22	-0.13	0.97	-0.25	-0.19	-0.16	-0.21	-0.27	0.17	0.08	0.77
Lsat_1_v5_gn_2_135460.1 (MID)	-0.51	-0.51	-0.7	-0.67	0.19	0.41	-0.05	0.33	-0.56	-0.44	-0.34	-0.45	0.46	0.64	0.44	-0.03	-0.13	0.53	-0.13	-0.23	-0.15	-0.06	0.42	-0.21	-0.08	-0.08	-0.03	-0.13	0.11	-0.02	0.5
Lsat_1_v5_gn_2_30721.1	-0.35	-0.47	-0.69	-0.2	0.1	0.01	-0.04	0.21	-0.23	-0.36	-0.19	-0.43	0.24	0.61	0.32	-0.24	-0.51	0.68	-0.25	-0.39	-0.41	-0.17	0.64	0.01	-0.23	-0.12	-0.07	-0.26	0.3	0.27	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_32160.1	-0.39	-0.51	-0.96	-0.79	0.07	0.25	-0.11	0.32	-0.42	-0.55	-0.37	-0.27	0.35	0.74	0.39	-0.07	-0.19	0.75	-0.01	-0.39	-0.28	-0.21	0.56	-0.13	-0.14	-0.12	-0.27	-0.36	0.29	0.23	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_36520.1 (SMG7)	-0.49	-0.25	-0.35	-0.16	0.45	0.21	-0.24	0.03	-0.31	-0.29	-0.19	-0.2	-0.03	0.78	0.59	-0.04	-0.22	0.3	-0.15	-0.39	-0.25	-0.19	0.74	-0.36	-0.24	-0.12	-0.08	-0.36	0.15	0.08	0.31
Lsat_1_v5_gn_2_56381.1 (S-RBP11)	-0.51	-0.51	-0.56	-0.92	0.11	0.38	-0.12	0.25	-0.82	-0.65	-0.3	-0.41	0.22	1.14	0.79	0.13	-0.14	0.11	-0.2	-0.35	-0.3	-0.15	0.94	-0.14	-0.16	-0.16	-0.26	-0.03	0.2	-0.2	0.18
Lsat_1_v5_gn_2_57861.1 (NOT3)	-0.32	-0.37	-0.51	-0.51	0.14	0.14	-0.15	-0.18	-0.29	-0.21	-0.12	-0.18	0.39	0.47	0.28	0.07	-0.02	0.31	-0.07	-0.16	-0.14	-0.08	0.77	-0.19	-0.13	-0.07	-0.21	-0.07	0.11	0.09	0.35
Lsat_1_v5_gn_2_5921.1	-0.33	-0.65	-0.85	-0.7	0.23	0.42	0.06	0.28	-0.44	-0.53	-0.49	-0.39	0.38	0.88	0.47	0.05	0.02	0.4	-0.27	-0.43	-0.13	-0.08	0.58	-0.21	-0.2	-0.1	-0.31	-0.05	0.18	0.11	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_71541.1	-0.6	-0.46	-0.71	-0.71	0.43	0.37	-0.35	-0.3	-0.38	-0.34	-0.18	-0.25	0.25	0.61	0.37	0.07	-0.06	0.46	-0.0	-0.2	-0.2	-0.16	0.75	-0.25	-0.2	-0.12	-0.07	-0.16	0.27	0.21	0.42
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Lsat_1_v5_gn_2_81300.1 (E1A1)	-0.64	-0.72	-0.8	-0.4	0.37	0.35	-0.05	-0.01	-0.32	-0.26	-0.21	-0.22	0.04	0.72	0.5	0.03	-0.14	0.05	-0.03	-0.21	-0.19	-0.07	0.61	-0.14	-0.05	-0.07	0.04	-0.09	0.17	0.07	0.39
Lsat_1_v5_gn_2_85561.1 (SYNC1)	-0.63	-0.71	-0.88	-0.73	0.16	0.42	-0.19	-0.01	-0.66	-0.62	-0.56	-0.43	0.44	0.89	0.41	0.07	-0.06	0.25	-0.3	-0.34	-0.21	-0.05	1.06	-0.05	-0.12	-0.07	-0.2	-0.03	0.25	0.02	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_95001.1 (NPY7)	-0.31	-0.7	-0.91	-0.64	-0.12	0.13	0.14	0.64	-0.67	-0.67	-0.65	-0.21	0.62	0.54	0.07	-0.07	-0.0	0.68	-0.57	-0.21	-0.44	-0.26	1.0	0.16	-0.18	-0.03	-0.09	-0.01	-0.08	-0.12	0.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.