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Heatmap: Cluster_234 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.78 -0.64 -0.55 -0.4 0.56 0.55 -0.67 -0.63 -0.17 -0.24 -0.05 -0.26 -0.24 0.85 0.6 0.27 -0.03 -0.03 0.29 -0.16 -0.16 0.01 0.53 -0.17 -0.03 -0.01 0.11 -0.24 0.04 -0.02 0.0
-0.92 -1.22 -1.23 -0.92 1.15 1.02 -1.34 -0.88 -0.48 -0.44 -0.11 -0.35 -0.75 1.37 0.55 0.0 -0.72 -0.96 0.22 -0.69 -0.26 -0.08 1.18 -0.21 -0.18 -0.16 -0.09 -0.95 0.47 0.56 0.23
-0.79 -0.84 -0.79 -0.84 1.79 1.38 -2.07 -2.05 -0.74 -0.93 -0.38 -1.09 -1.07 1.43 0.87 -0.16 -1.31 0.36 0.3 -1.16 -0.69 -0.54 1.43 -0.47 -0.59 -0.66 -0.4 -1.04 0.2 -0.04 0.19
-0.13 -0.07 -0.3 -0.48 0.74 0.37 -0.22 -0.22 -0.41 -0.47 -0.23 -0.4 0.3 1.06 0.69 0.12 -0.11 -0.32 -0.16 -0.43 -0.39 -0.43 0.72 -0.43 -0.5 -0.41 -0.39 -0.45 0.21 0.07 0.49
-0.53 -0.63 -0.62 -0.75 1.07 0.82 -0.84 -1.03 -0.47 -0.46 -0.26 -0.48 -0.37 1.11 1.0 -0.08 -0.51 0.69 0.07 -0.8 -0.38 -0.33 0.96 -0.33 -0.33 -0.16 -0.24 -0.52 0.18 -0.09 0.11
-0.25 -0.25 -0.4 -0.5 0.47 0.49 -0.35 -0.38 -0.2 -0.2 -0.0 -0.29 0.05 0.47 0.23 0.05 -0.13 -0.48 0.01 -0.23 -0.08 0.0 0.68 -0.07 -0.06 -0.04 -0.03 -0.05 0.14 0.18 0.27
-0.12 -0.05 -0.29 -0.27 1.06 0.63 0.01 0.32 -0.08 -0.14 -0.14 -0.26 -0.4 1.26 0.94 -0.11 -0.53 -1.3 -0.75 -0.6 -0.41 -0.53 0.31 -0.56 -0.48 -0.36 -0.29 -0.5 0.22 0.02 0.1
0.17 0.01 -0.33 -0.56 0.25 0.59 -0.14 0.07 -0.33 -0.57 -0.39 -0.35 -0.49 0.79 0.34 -0.08 -0.2 0.05 0.11 -0.28 0.07 0.06 0.51 -0.12 -0.08 0.0 -0.03 -0.17 0.19 -0.01 -0.17
0.32 0.16 0.07 -0.05 0.46 0.24 -0.07 0.18 -0.06 -0.21 -0.11 -0.19 -0.19 0.8 0.46 -0.15 -0.18 -1.52 0.12 -0.27 -0.22 -0.11 0.01 -0.23 -0.22 -0.13 -0.21 -0.14 0.18 0.02 -0.07
-0.19 -0.18 -0.29 -0.34 0.33 0.24 -0.04 0.24 0.02 0.05 -0.09 -0.15 -0.22 0.94 0.64 -0.05 -0.24 -0.92 -0.19 -0.19 -0.22 -0.25 0.21 -0.25 -0.35 -0.3 -0.1 -0.66 0.27 0.36 0.45
-0.16 0.11 -0.42 -0.07 1.29 1.05 -0.63 -0.24 -0.46 -0.48 -0.19 -0.41 -0.52 1.27 0.67 -0.23 -0.99 -0.46 -0.08 -0.82 -0.62 -0.37 0.74 -0.67 -0.5 -0.67 -0.36 -0.51 0.36 0.11 0.04
-0.01 -0.19 -0.03 -0.14 0.62 0.54 -0.1 -0.08 -0.23 -0.26 -0.21 -0.31 -0.02 0.5 0.31 -0.06 -0.15 0.13 -0.23 -0.34 -0.24 -0.24 0.68 -0.19 -0.19 -0.11 -0.11 -0.05 0.03 -0.03 -0.15
-0.97 -1.13 -1.33 -0.83 0.41 0.8 -0.31 -0.29 -0.51 -0.23 -0.1 -0.38 -0.17 0.68 0.29 -0.1 -0.34 -0.03 -0.1 -0.4 -0.06 -0.05 1.02 0.1 0.12 0.26 0.08 -0.46 0.23 0.29 0.61
-1.09 -0.88 -2.49 -2.33 1.83 1.64 -0.56 -0.99 -0.8 -1.09 -0.68 -1.12 -0.78 1.16 1.04 -0.18 -0.98 0.14 0.18 -0.72 -0.56 -0.06 0.69 -0.36 -0.26 -0.31 0.05 -0.52 0.57 0.03 -0.7
-0.27 -0.1 -0.27 -0.5 0.47 0.36 -0.08 -0.3 -0.17 -0.16 -0.24 -0.21 0.02 0.62 0.44 0.11 -0.06 -0.03 -0.11 -0.31 -0.2 -0.1 0.61 -0.4 -0.18 -0.11 -0.07 -0.09 0.15 0.01 0.27
-0.59 -0.81 -0.45 -0.24 0.64 0.82 -1.05 -0.59 -0.57 -0.65 -0.24 -0.25 0.15 0.82 0.35 0.07 -0.45 -0.5 0.13 -0.58 -0.22 -0.04 1.0 -0.1 0.04 -0.04 -0.13 -0.22 0.07 0.21 0.63
-0.54 -0.08 -0.5 -0.46 0.45 0.6 0.09 0.09 -0.33 -0.55 -0.26 -0.31 0.04 0.61 0.39 0.03 -0.16 -0.45 0.04 -0.17 -0.1 -0.1 0.29 -0.17 -0.1 0.04 0.01 -0.24 0.22 0.07 0.45
-0.12 -0.87 -0.42 -0.44 1.39 1.07 -0.53 -0.81 -0.38 -0.56 -0.45 -1.0 -0.65 1.0 0.55 -0.41 -0.84 -0.12 -0.16 -0.75 -0.51 -0.17 1.47 -0.21 -0.45 -0.42 -0.29 -0.16 0.35 -0.04 -0.16
-0.28 -0.2 -0.31 -0.38 0.48 0.47 -0.11 -0.11 -0.11 -0.11 0.08 -0.05 -0.07 0.47 0.25 -0.01 -0.15 -0.43 0.08 -0.32 -0.16 -0.02 0.57 -0.29 -0.19 -0.04 -0.09 -0.09 -0.0 0.11 0.28
-0.09 -0.15 -0.21 -0.05 0.48 0.56 -0.12 -0.09 -0.21 -0.16 -0.08 -0.2 -0.05 0.59 0.32 -0.12 -0.25 -0.22 -0.04 -0.32 -0.16 -0.14 0.65 -0.21 -0.14 -0.07 -0.05 -0.15 0.08 -0.08 -0.1
-0.59 -0.81 -0.69 -0.42 0.66 0.41 -0.4 -0.44 -0.05 -0.16 -0.13 -0.43 -0.41 0.73 0.68 0.13 -0.12 0.38 0.31 -0.17 -0.0 -0.15 0.54 -0.27 -0.13 0.03 -0.12 -0.21 0.12 0.08 -0.03
-0.17 -0.15 -0.24 -0.6 0.4 0.48 0.01 -0.05 -0.25 -0.22 -0.09 -0.16 -0.07 0.35 0.15 0.03 -0.13 -0.14 -0.0 -0.17 -0.09 0.0 0.35 -0.1 -0.07 -0.12 -0.02 -0.06 0.11 0.18 0.31
-0.14 -0.29 -0.67 -0.39 0.91 0.76 -0.65 -0.32 -0.25 -0.36 -0.01 -0.29 -0.49 0.8 0.67 -0.1 -0.64 -0.02 0.16 -0.45 -0.14 -0.04 0.42 -0.18 -0.45 -0.14 -0.14 -0.56 0.24 0.09 0.51
-0.15 0.25 -0.45 -0.73 0.78 0.66 -0.16 -0.29 -0.47 -0.42 -0.15 -0.23 -0.96 0.45 0.43 -0.44 -0.32 -1.18 0.19 -0.11 0.02 0.21 0.63 0.01 0.05 -0.0 0.09 0.03 0.34 -0.02 -0.06
-0.19 0.06 -0.21 -0.09 0.64 0.49 -0.19 -0.2 -0.38 -0.39 -0.29 -0.39 -0.04 0.67 0.45 0.04 -0.18 -0.08 -0.15 -0.45 -0.32 -0.23 0.67 -0.36 -0.3 -0.21 -0.1 -0.35 0.3 0.19 0.33
1.01 0.62 -0.53 -1.24 0.6 1.34 -1.22 -1.34 -1.38 -1.74 -0.73 -1.72 -0.23 1.96 -0.21 -0.97 -1.84 0.46 0.03 -1.11 -0.37 -0.42 1.49 -1.33 -0.8 -0.83 -0.72 0.15 0.39 -0.91 0.24
0.07 0.01 -0.03 0.1 0.33 0.32 -0.24 -0.19 -0.21 -0.27 -0.05 -0.13 -0.09 0.69 0.45 0.03 -0.16 -0.55 0.01 -0.18 -0.2 -0.22 0.36 -0.1 -0.14 -0.1 -0.09 -0.26 -0.05 0.08 0.13
0.08 0.09 -2.96 -3.15 1.61 1.71 -1.23 -1.97 -1.21 -1.82 -0.6 -2.89 -0.44 2.28 1.18 -0.74 -0.94 0.48 0.0 -1.79 -0.19 -0.57 1.07 -0.89 -0.39 -0.78 -1.72 -0.87 0.04 -0.69 -1.26
-0.4 -0.34 -0.42 -0.41 0.48 0.6 -0.28 -0.5 -0.28 -0.48 -0.23 -0.39 0.07 0.99 0.45 0.01 -0.15 -0.12 0.13 -0.26 -0.3 0.06 0.6 -0.13 -0.22 0.09 -0.02 -0.19 0.17 -0.03 0.03
-0.23 -0.08 -0.45 -0.46 0.86 0.85 -0.27 -0.57 -0.39 -0.28 -0.29 -0.39 -0.01 0.96 0.81 -0.02 -0.44 -0.03 -0.3 -0.46 -0.29 -0.46 0.99 -0.38 -0.54 -0.29 -0.11 -0.57 0.07 -0.01 0.1
-0.46 -0.51 -0.66 -0.48 0.93 1.2 -0.83 -0.17 -0.71 -0.92 -0.56 -0.78 -0.36 1.37 0.59 -0.04 -0.66 -0.59 -0.02 -0.73 -0.31 -0.23 1.0 -0.18 -0.24 -0.33 -0.22 -0.21 0.52 0.11 0.03
0.26 0.2 -0.13 -0.4 0.63 0.72 -0.03 0.02 -0.46 -0.44 -0.41 -0.55 -0.22 0.68 0.32 -0.32 -0.51 -0.02 0.19 -0.34 -0.14 -0.03 0.47 -0.22 -0.19 -0.16 -0.1 -0.23 0.15 -0.05 0.02
0.15 -0.12 -0.15 -0.26 0.49 0.8 -0.47 -0.6 -0.38 -0.62 -0.19 -0.5 -0.19 1.07 0.29 -0.18 -0.4 -0.09 0.07 -0.53 -0.2 -0.06 0.64 -0.2 -0.15 -0.01 0.03 -0.18 0.17 -0.07 0.08
0.23 0.05 -0.09 -0.13 0.33 0.29 -0.17 -0.16 -0.12 -0.15 -0.06 -0.08 0.06 0.7 0.29 -0.07 -0.09 -1.04 0.1 -0.19 -0.1 -0.03 0.21 -0.03 -0.08 -0.11 -0.09 0.06 0.05 -0.12 -0.19
0.03 -0.42 -0.34 -0.13 0.4 0.36 -0.04 0.14 0.06 0.01 -0.01 -0.07 -0.17 0.84 0.58 0.04 -0.03 -1.12 0.03 -0.14 -0.22 -0.12 0.01 0.09 -0.17 -0.18 0.0 -0.09 -0.13 -0.14 -0.15
0.28 0.33 -0.28 -0.18 0.83 0.98 -0.09 -0.32 -0.25 -0.57 -0.26 -0.78 -0.25 1.15 0.57 -0.19 -0.81 0.03 -0.01 -0.94 -0.25 -0.26 -0.16 -0.51 -0.35 -0.29 -0.32 -0.27 0.36 -0.11 0.23
0.1 -0.08 -0.47 -0.2 0.8 0.65 -0.26 0.13 -0.16 -0.43 -0.11 -0.28 -0.22 1.04 0.53 -0.17 -0.47 -1.3 -0.02 -0.48 -0.22 -0.23 0.75 -0.24 -0.25 -0.33 -0.28 -0.12 0.09 -0.03 0.03
-0.48 -0.16 -0.57 -0.51 1.25 0.56 -0.34 -0.3 -0.55 -0.55 -0.31 -0.39 -0.1 1.55 0.53 -0.05 -0.29 -0.68 -0.14 -0.71 -0.61 -0.43 0.8 -0.51 -0.44 -0.34 -0.35 -0.3 0.19 0.05 0.34
0.25 0.28 -0.09 -0.17 0.73 0.08 -0.49 -0.81 -0.16 -0.14 0.1 0.02 -0.13 1.21 0.71 -0.06 -0.21 -1.71 0.09 -0.28 -0.22 -0.1 0.09 0.06 -0.27 -0.29 -0.13 0.12 -0.31 -0.18 -0.39
-0.1 -0.07 -0.25 -0.35 0.49 0.51 0.01 0.0 -0.21 -0.32 -0.1 -0.34 -0.22 0.51 0.14 -0.14 -0.36 -0.37 0.09 -0.13 -0.16 -0.02 0.39 -0.02 -0.0 0.02 0.13 -0.06 0.15 0.04 0.09
-0.22 -0.21 -0.39 -0.33 0.64 0.58 -0.09 -0.06 -0.34 -0.25 -0.22 -0.4 -0.18 0.56 0.39 -0.07 -0.3 -0.13 0.08 -0.14 -0.1 0.04 0.29 -0.16 -0.12 -0.1 -0.0 0.03 0.24 0.03 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.