1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_234 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.32 0.36 0.38 0.42 0.82 0.81 0.35 0.36 0.49 0.47 0.54 0.47 0.47 1.0 0.84 0.67 0.55 0.54 0.68 0.5 0.5 0.56 0.8 0.5 0.54 0.55 0.6 0.47 0.57 0.55 0.56
0.2 0.17 0.16 0.2 0.86 0.79 0.15 0.21 0.28 0.29 0.36 0.3 0.23 1.0 0.56 0.39 0.23 0.2 0.45 0.24 0.32 0.36 0.88 0.33 0.34 0.34 0.36 0.2 0.53 0.57 0.45
0.17 0.16 0.17 0.16 1.0 0.75 0.07 0.07 0.17 0.15 0.22 0.14 0.14 0.78 0.53 0.26 0.12 0.37 0.36 0.13 0.18 0.2 0.78 0.21 0.19 0.18 0.22 0.14 0.33 0.28 0.33
0.44 0.46 0.39 0.34 0.8 0.62 0.41 0.41 0.36 0.35 0.41 0.36 0.59 1.0 0.78 0.52 0.44 0.39 0.43 0.36 0.37 0.36 0.79 0.36 0.34 0.36 0.37 0.35 0.56 0.51 0.67
0.32 0.3 0.3 0.28 0.97 0.82 0.26 0.23 0.34 0.34 0.39 0.33 0.36 1.0 0.93 0.44 0.33 0.75 0.49 0.27 0.36 0.37 0.9 0.37 0.37 0.42 0.39 0.32 0.53 0.44 0.5
0.53 0.53 0.47 0.44 0.87 0.88 0.49 0.48 0.55 0.54 0.62 0.51 0.65 0.87 0.74 0.65 0.57 0.45 0.63 0.53 0.59 0.63 1.0 0.6 0.6 0.61 0.61 0.6 0.69 0.71 0.76
0.38 0.4 0.34 0.34 0.87 0.64 0.42 0.52 0.39 0.38 0.38 0.35 0.32 1.0 0.8 0.38 0.29 0.17 0.25 0.27 0.31 0.29 0.51 0.28 0.3 0.32 0.34 0.29 0.48 0.42 0.45
0.65 0.58 0.46 0.39 0.68 0.87 0.52 0.61 0.46 0.39 0.44 0.45 0.41 1.0 0.73 0.55 0.5 0.6 0.62 0.47 0.61 0.6 0.82 0.53 0.55 0.58 0.57 0.51 0.66 0.57 0.51
0.72 0.64 0.6 0.55 0.79 0.68 0.54 0.65 0.55 0.5 0.53 0.5 0.5 1.0 0.79 0.52 0.51 0.2 0.62 0.48 0.49 0.53 0.58 0.49 0.49 0.52 0.5 0.52 0.65 0.58 0.55
0.46 0.46 0.42 0.41 0.66 0.61 0.51 0.61 0.53 0.54 0.49 0.47 0.44 1.0 0.81 0.5 0.44 0.27 0.46 0.46 0.45 0.44 0.6 0.44 0.41 0.42 0.49 0.33 0.62 0.66 0.71
0.37 0.44 0.31 0.39 1.0 0.85 0.26 0.35 0.3 0.29 0.36 0.31 0.28 0.98 0.65 0.35 0.21 0.3 0.39 0.23 0.27 0.32 0.68 0.26 0.29 0.26 0.32 0.29 0.52 0.44 0.42
0.62 0.55 0.61 0.56 0.96 0.91 0.58 0.59 0.53 0.52 0.54 0.5 0.62 0.88 0.77 0.6 0.56 0.68 0.53 0.49 0.53 0.53 1.0 0.54 0.54 0.58 0.58 0.6 0.64 0.61 0.56
0.25 0.22 0.2 0.28 0.65 0.86 0.4 0.4 0.35 0.42 0.46 0.38 0.44 0.79 0.6 0.46 0.39 0.48 0.46 0.37 0.47 0.48 1.0 0.53 0.54 0.59 0.52 0.36 0.58 0.6 0.76
0.13 0.15 0.05 0.06 1.0 0.88 0.19 0.14 0.16 0.13 0.18 0.13 0.16 0.63 0.58 0.25 0.14 0.31 0.32 0.17 0.19 0.27 0.45 0.22 0.23 0.23 0.29 0.2 0.42 0.29 0.17
0.54 0.61 0.54 0.46 0.9 0.83 0.61 0.53 0.58 0.58 0.55 0.56 0.66 1.0 0.88 0.7 0.62 0.64 0.6 0.52 0.57 0.61 0.99 0.49 0.57 0.6 0.62 0.61 0.72 0.65 0.78
0.33 0.28 0.37 0.42 0.78 0.88 0.24 0.33 0.34 0.32 0.42 0.42 0.56 0.88 0.64 0.52 0.37 0.35 0.55 0.33 0.43 0.49 1.0 0.47 0.51 0.49 0.46 0.43 0.52 0.58 0.77
0.45 0.62 0.47 0.48 0.9 0.99 0.7 0.7 0.52 0.45 0.55 0.53 0.68 1.0 0.86 0.67 0.59 0.48 0.68 0.59 0.62 0.61 0.8 0.58 0.61 0.67 0.66 0.56 0.77 0.69 0.9
0.33 0.2 0.27 0.27 0.95 0.75 0.25 0.21 0.28 0.24 0.26 0.18 0.23 0.72 0.53 0.27 0.2 0.33 0.32 0.21 0.25 0.32 1.0 0.31 0.26 0.27 0.3 0.32 0.46 0.35 0.32
0.56 0.59 0.54 0.52 0.94 0.93 0.63 0.63 0.63 0.62 0.71 0.65 0.64 0.93 0.8 0.67 0.61 0.5 0.72 0.54 0.6 0.67 1.0 0.55 0.59 0.66 0.64 0.64 0.67 0.73 0.82
0.6 0.58 0.55 0.61 0.89 0.94 0.59 0.6 0.55 0.57 0.6 0.55 0.62 0.96 0.8 0.59 0.53 0.55 0.62 0.51 0.57 0.58 1.0 0.55 0.58 0.61 0.61 0.58 0.68 0.6 0.59
0.4 0.34 0.37 0.45 0.95 0.8 0.46 0.45 0.58 0.54 0.55 0.45 0.46 1.0 0.97 0.66 0.55 0.78 0.75 0.53 0.6 0.55 0.88 0.5 0.55 0.61 0.55 0.52 0.66 0.64 0.59
0.64 0.65 0.61 0.47 0.95 1.0 0.73 0.69 0.61 0.62 0.68 0.64 0.68 0.92 0.8 0.73 0.66 0.65 0.72 0.64 0.67 0.72 0.92 0.67 0.69 0.66 0.71 0.69 0.77 0.81 0.89
0.48 0.44 0.33 0.41 1.0 0.9 0.34 0.43 0.45 0.41 0.53 0.43 0.38 0.92 0.84 0.5 0.34 0.52 0.59 0.39 0.48 0.52 0.71 0.47 0.39 0.48 0.48 0.36 0.63 0.57 0.76
0.53 0.69 0.43 0.35 1.0 0.92 0.52 0.48 0.42 0.44 0.52 0.5 0.3 0.8 0.79 0.43 0.47 0.26 0.67 0.54 0.59 0.67 0.9 0.59 0.6 0.58 0.62 0.59 0.74 0.58 0.56
0.55 0.65 0.54 0.59 0.98 0.88 0.55 0.55 0.48 0.48 0.51 0.48 0.61 1.0 0.86 0.64 0.55 0.59 0.57 0.46 0.5 0.54 1.0 0.49 0.51 0.54 0.59 0.49 0.77 0.72 0.79
0.52 0.4 0.18 0.11 0.39 0.65 0.11 0.1 0.1 0.08 0.15 0.08 0.22 1.0 0.22 0.13 0.07 0.35 0.26 0.12 0.2 0.19 0.72 0.1 0.15 0.15 0.16 0.29 0.34 0.14 0.3
0.65 0.62 0.61 0.66 0.78 0.77 0.53 0.54 0.54 0.51 0.6 0.57 0.58 1.0 0.85 0.63 0.56 0.42 0.63 0.55 0.54 0.53 0.8 0.58 0.56 0.58 0.58 0.52 0.6 0.66 0.68
0.22 0.22 0.03 0.02 0.63 0.67 0.09 0.05 0.09 0.06 0.14 0.03 0.15 1.0 0.47 0.12 0.11 0.29 0.21 0.06 0.18 0.14 0.43 0.11 0.16 0.12 0.06 0.11 0.21 0.13 0.09
0.38 0.4 0.38 0.38 0.7 0.77 0.41 0.36 0.42 0.36 0.43 0.39 0.53 1.0 0.69 0.51 0.45 0.46 0.55 0.42 0.41 0.53 0.77 0.46 0.43 0.53 0.5 0.44 0.57 0.49 0.52
0.43 0.48 0.37 0.37 0.92 0.91 0.42 0.34 0.39 0.41 0.41 0.38 0.5 0.98 0.89 0.5 0.37 0.5 0.41 0.37 0.41 0.37 1.0 0.39 0.35 0.41 0.47 0.34 0.53 0.5 0.54
0.28 0.27 0.25 0.28 0.74 0.89 0.22 0.34 0.24 0.2 0.26 0.22 0.3 1.0 0.58 0.38 0.24 0.26 0.38 0.23 0.31 0.33 0.78 0.34 0.33 0.31 0.33 0.33 0.55 0.42 0.4
0.73 0.7 0.56 0.46 0.94 1.0 0.6 0.62 0.44 0.45 0.46 0.41 0.52 0.97 0.76 0.49 0.43 0.6 0.69 0.48 0.55 0.6 0.84 0.52 0.53 0.55 0.57 0.52 0.67 0.59 0.62
0.53 0.44 0.43 0.4 0.67 0.83 0.35 0.31 0.37 0.31 0.42 0.34 0.42 1.0 0.58 0.42 0.36 0.45 0.5 0.33 0.42 0.46 0.74 0.42 0.43 0.47 0.49 0.42 0.54 0.45 0.5
0.72 0.64 0.58 0.56 0.77 0.75 0.55 0.55 0.56 0.55 0.59 0.58 0.64 1.0 0.75 0.58 0.58 0.3 0.66 0.54 0.57 0.6 0.71 0.6 0.58 0.57 0.58 0.64 0.64 0.57 0.54
0.57 0.42 0.44 0.51 0.74 0.72 0.54 0.62 0.58 0.56 0.55 0.53 0.5 1.0 0.83 0.57 0.55 0.26 0.57 0.51 0.48 0.51 0.56 0.59 0.5 0.49 0.56 0.53 0.51 0.51 0.5
0.55 0.57 0.37 0.4 0.8 0.89 0.42 0.36 0.38 0.3 0.38 0.26 0.38 1.0 0.67 0.4 0.26 0.46 0.45 0.24 0.38 0.38 0.4 0.32 0.35 0.37 0.36 0.38 0.58 0.42 0.53
0.52 0.46 0.35 0.42 0.84 0.76 0.41 0.53 0.44 0.36 0.45 0.4 0.42 1.0 0.7 0.43 0.35 0.2 0.48 0.35 0.42 0.41 0.82 0.41 0.41 0.39 0.4 0.45 0.52 0.48 0.5
0.25 0.31 0.23 0.24 0.81 0.5 0.27 0.28 0.23 0.23 0.28 0.26 0.32 1.0 0.49 0.33 0.28 0.21 0.31 0.21 0.22 0.25 0.6 0.24 0.25 0.27 0.27 0.28 0.39 0.36 0.43
0.51 0.53 0.41 0.38 0.72 0.46 0.31 0.25 0.39 0.39 0.46 0.44 0.4 1.0 0.71 0.42 0.37 0.13 0.46 0.36 0.37 0.41 0.46 0.45 0.36 0.36 0.4 0.47 0.35 0.38 0.33
0.66 0.67 0.59 0.55 0.98 1.0 0.71 0.7 0.61 0.56 0.66 0.55 0.6 1.0 0.78 0.64 0.55 0.54 0.75 0.64 0.63 0.69 0.92 0.69 0.7 0.71 0.77 0.67 0.78 0.72 0.75
0.55 0.55 0.49 0.51 1.0 0.95 0.6 0.61 0.51 0.54 0.55 0.48 0.56 0.94 0.84 0.61 0.52 0.59 0.68 0.58 0.6 0.66 0.78 0.57 0.59 0.6 0.64 0.65 0.76 0.66 0.67

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)