Heatmap: Cluster_180 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_15481.1 (SVL1)	0.02	0.01	0.06	0.08	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_30741.1	0.06	0.11	0.06	0.07	0.09	0.09	0.09	0.06	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.14	0.11	0.08	0.08	0.24	0.08	0.08	0.06	0.06	1.0	0.1	0.07	0.09	0.09	0.05	0.09	0.11	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_73601.1 (PXG3)	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.06	0.02	0.02	0.12	0.04	0.02	0.02	0.03	1.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.06	0.11
Lsat_1_v5_gn_1_86101.1 (NCRK)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.06	0.0	0.02	0.0	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_106861.1 (AtHMP43)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.2	0.02	0.01	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_113101.1 (CYP71B34)	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.04	0.03	0.17	0.03	0.03	0.04	0.04	1.0	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_124301.1 (PRPL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_131840.1 (IRP9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.09
Lsat_1_v5_gn_2_39740.1 (FAO3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.05	0.02	0.01	0.01	0.0	0.3	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_40740.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_65120.1 (FLAP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Lsat_1_v5_gn_3_3340.1 (AHL1)	0.01	0.01	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.06	0.03	0.05	0.1	0.05	0.06	0.04	0.18	0.06	0.04	0.03	0.03	1.0	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.09
Lsat_1_v5_gn_3_47000.1 (YUC7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_47620.1 (UIP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Lsat_1_v5_gn_3_60520.1	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.02	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_3_73601.1	0.02	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.08	0.08	0.07	0.06	0.06	0.17	0.01	0.05	0.02	0.04	1.0	0.06	0.05	0.03	0.04	0.02	0.04	0.1	0.15
Lsat_1_v5_gn_3_78340.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.03	1.0	0.04	0.06	0.02	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_122621.1 (AOS)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.03	0.06
Lsat_1_v5_gn_4_138540.1 (ABR1)	0.06	0.08	0.01	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_139600.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_162200.1 (GASA8)	0.02	0.05	0.06	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.09	0.01	0.03	0.06	0.08	0.2	0.02	0.04	0.04	0.04	1.0	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03	0.08	0.1	0.14
Lsat_1_v5_gn_4_175720.1	0.04	0.03	0.01	0.0	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.03	0.11	0.1	0.05	0.05	0.11	0.05	0.05	0.04	0.05	1.0	0.04	0.04	0.06	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04
Lsat_1_v5_gn_4_179900.1 (ORP1D)	0.02	0.02	0.01	0.0	0.13	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.06	0.02	0.03	0.15	0.05	0.02	0.03	0.05	1.0	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.07
Lsat_1_v5_gn_4_25140.1 (BAS1)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.11	0.04	0.02	0.02	0.01	1.0	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_58600.1 (FUR1)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.03	0.03	0.04	0.06	1.0	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.06	0.11
Lsat_1_v5_gn_4_68320.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_720.1	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.14	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.06	0.03	0.01	0.03	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	1.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02
Lsat_1_v5_gn_5_116201.1 (BRT1)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.24	0.02	0.01	0.02	0.02	1.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01
Lsat_1_v5_gn_5_138341.1 (SDH)	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.17	0.02	0.01	0.02	0.02	1.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.05
Lsat_1_v5_gn_5_150900.1 (PRX52)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_151340.1 (MadA4)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.0	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.0	0.0	0.17	0.02	0.02	0.0	0.01	1.0	0.06	0.02	0.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05
Lsat_1_v5_gn_5_86680.1 (LSB1)	0.02	0.01	0.04	0.05	0.14	0.09	0.01	0.01	0.06	0.06	0.06	0.11	0.06	0.06	0.11	0.05	0.06	0.16	0.05	0.05	0.08	0.06	1.0	0.02	0.06	0.09	0.06	0.05	0.05	0.06	0.1
Lsat_1_v5_gn_6_40621.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.08	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_44520.1 (pEARLI4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_24861.1 (FBD1)	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.11	0.09	0.04	0.03	0.19	0.07	0.03	0.04	0.03	1.0	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.09	0.05	0.06
Lsat_1_v5_gn_7_35921.1 (CALS3)	0.06	0.05	0.06	0.06	0.08	0.07	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.14	0.11	0.07	0.07	0.17	0.06	0.05	0.04	0.04	1.0	0.06	0.06	0.06	0.06	0.04	0.07	0.08	0.12
Lsat_1_v5_gn_7_49720.1 (EIF5A)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_78460.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.06	0.02	0.02	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_90281.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_98060.1 (XID)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_100441.1 (TN4)	0.04	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.07	0.05	0.08	0.05	0.06	0.09	0.05	0.04	0.16	0.04	0.06	0.07	0.06	1.0	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.05
Lsat_1_v5_gn_8_101161.1	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.03	0.02	0.06	0.06	0.04	0.0	0.01	0.06	0.11	0.0	0.02	0.03	0.01	1.0	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.0	0.01	0.04
Lsat_1_v5_gn_8_128420.1 (ICL)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_1861.1 (BURNOUT1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.17	0.01	0.0	0.01	0.02	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_8_45240.1	0.05	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04
Lsat_1_v5_gn_8_50621.1 (DM10)	0.03	0.04	0.03	0.04	0.09	0.07	0.04	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.06	0.09	0.06	0.04	0.04	0.23	0.04	0.04	0.05	0.05	1.0	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05	0.1
Lsat_1_v5_gn_9_115140.1 (GCH)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_18960.1 (MAPKKK14)	0.04	0.02	0.06	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.02	0.14	0.04	0.01	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Lsat_1_v5_gn_9_37400.1	0.01	0.02	0.03	0.04	0.1	0.12	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.07	0.1	0.08	0.05	0.05	0.16	0.03	0.02	0.03	0.04	1.0	0.05	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.06	0.09
Lsat_1_v5_gn_9_79401.1 (UMAMIT24)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.0	0.01	0.03	0.0	0.1	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	1.0	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04
Lsat_1_v5_gn_9_79421.1	0.0	0.03	0.04	0.02	0.02	0.04	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.13	0.08	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	1.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.01	0.0	0.04	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)