1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_180 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.24 0.13 1.04 1.24 0.08 0.1 0.21 0.13 0.19 0.11 0.08 0.11 0.24 0.12 0.18 0.15 0.17 0.04 0.01 0.02 0.07 0.06 16.21 0.05 0.02 0.05 0.09 0.05 0.12 0.22 0.46
0.91 1.65 0.94 1.07 1.34 1.33 1.4 0.97 1.09 1.16 1.17 1.08 1.09 2.16 1.58 1.27 1.19 3.55 1.16 1.18 0.97 0.91 15.04 1.56 1.06 1.31 1.41 0.75 1.28 1.67 2.92
9.35 13.27 6.23 2.42 26.8 25.54 9.8 7.56 8.88 6.17 8.45 5.8 15.38 55.34 26.08 8.92 7.35 53.38 18.05 6.98 10.76 12.09 431.13 12.11 10.72 10.37 9.31 4.03 24.09 24.69 46.36
0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.1 0.0 0.03 0.0 0.01 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 1.6 0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.65 1.36 2.63 1.99 2.11 1.49 1.7 1.83 1.48 1.06 0.88 1.69 5.11 6.99 3.07 1.29 1.31 34.13 2.92 1.43 1.69 1.2 169.87 2.07 1.56 1.36 1.15 0.77 2.26 1.98 4.56
3.45 1.65 1.21 1.14 3.16 3.91 4.2 3.13 3.0 3.31 3.29 3.45 5.24 2.87 4.61 4.38 4.09 20.96 3.82 3.99 4.37 4.73 124.18 3.49 3.77 4.43 4.14 6.32 2.83 1.7 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 3.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.18 0.19 0.07 0.07 0.0 0.0 1.41 0.0 0.03 0.0 0.0 7.3 0.12 0.03 0.13 0.03 0.0 0.0 0.06 0.63
0.17 0.15 0.35 0.25 0.38 0.71 0.58 0.31 0.44 0.24 0.43 0.33 3.73 1.44 0.67 0.42 0.2 22.43 0.42 0.12 0.31 0.2 74.6 0.24 0.43 0.3 0.31 0.18 0.98 0.75 2.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.39 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.11 0.09 0.23 0.42 0.31 0.25 0.18 0.26 0.37 0.14 0.45 0.23 0.4 0.74 0.41 0.45 0.29 1.34 0.47 0.33 0.22 0.26 7.61 0.19 0.17 0.2 0.16 0.2 0.21 0.37 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 20.87 0.0 0.0 0.0 0.0 242.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.05 0.08 0.02 0.0 0.0 0.05 0.08 0.08 0.09 0.0 2.01 0.02 0.0 0.0 0.0 22.87 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.09 0.24 0.23
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04
0.11 0.15 0.1 0.17 0.29 0.24 0.13 0.16 0.19 0.17 0.15 0.16 0.37 0.36 0.32 0.3 0.27 0.78 0.06 0.24 0.11 0.17 4.72 0.27 0.23 0.16 0.18 0.1 0.2 0.47 0.72
0.02 0.0 0.03 0.01 0.43 0.15 0.32 0.14 0.27 0.36 0.33 0.35 0.14 0.62 0.36 0.33 0.55 0.67 0.43 0.52 0.21 0.45 13.03 0.56 0.76 0.29 0.38 0.12 0.53 0.51 0.21
0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.01 0.04 0.01 0.09 0.15 0.1 0.27 0.32 0.06 0.12 0.08 0.11 0.15 0.06 0.16 0.11 0.06 8.0 0.09 0.1 0.13 0.01 0.07 0.15 0.2 0.47
4.61 6.55 1.06 3.76 2.68 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.07 0.13 3.79 0.0 0.05 0.07 0.0 78.58 0.0 0.28 0.02 0.11 0.0 0.02 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
25.55 65.21 75.19 41.05 26.2 24.07 23.9 16.76 40.04 51.13 32.89 53.73 116.01 15.21 32.91 76.17 96.14 249.79 29.01 50.84 51.92 47.91 1224.53 54.86 63.56 55.83 64.33 33.57 102.37 116.77 174.12
0.53 0.41 0.15 0.05 0.4 0.39 0.54 0.35 0.65 0.34 0.46 0.6 0.35 1.42 1.22 0.61 0.65 1.34 0.63 0.68 0.55 0.67 12.76 0.54 0.54 0.78 0.28 0.5 0.57 0.66 0.55
1.01 1.06 0.56 0.28 8.21 5.39 0.72 0.39 1.67 0.94 1.46 0.62 2.86 8.43 4.17 1.63 2.26 9.82 3.02 1.09 1.64 2.96 65.5 0.64 1.61 1.91 2.86 0.93 1.08 1.4 4.5
0.09 0.0 0.0 0.03 0.38 0.24 0.1 0.23 0.2 0.1 0.1 0.22 0.17 0.17 0.2 0.2 0.19 0.77 0.27 0.16 0.17 0.09 7.28 0.12 0.15 0.2 0.39 0.12 0.15 0.23 0.18
0.03 0.01 0.03 0.01 0.04 0.03 0.02 0.06 0.13 0.1 0.04 0.06 0.25 0.03 0.1 0.1 0.05 0.62 0.12 0.12 0.18 0.26 4.21 0.08 0.13 0.09 0.18 0.11 0.13 0.26 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.95 1.75 1.56 1.17 2.44 2.5 8.93 19.45 2.08 3.14 2.13 2.35 6.11 8.05 4.09 1.85 3.43 11.14 3.06 2.85 1.85 2.88 135.57 2.81 3.07 2.86 2.86 4.02 1.91 2.35 2.48
3.57 2.87 1.67 1.86 4.8 10.07 3.93 3.57 3.39 3.17 3.22 2.28 4.29 11.82 8.54 6.1 5.0 71.58 6.82 3.94 4.8 4.8 295.6 4.19 3.77 4.92 5.4 3.45 5.83 5.07 4.17
1.3 1.09 1.95 2.26 2.02 1.77 1.02 0.78 1.24 1.35 1.51 1.34 1.33 2.16 1.71 1.52 1.28 11.43 1.35 0.97 1.32 1.3 67.37 1.3 1.3 1.61 1.44 1.29 2.59 2.47 3.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 6.61 0.0 0.0 0.0 0.0 69.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.05 0.07 0.06 0.0 0.04 0.11 0.06 0.02 0.1 0.0 0.01 0.38 0.03 0.04 0.01 0.02 2.22 0.13 0.04 0.01 0.02 0.06 0.02 0.04 0.11
0.38 0.22 0.74 0.81 2.3 1.47 0.2 0.14 0.97 1.03 0.92 1.8 0.95 1.06 1.78 0.92 1.03 2.68 0.76 0.82 1.26 1.04 16.78 0.25 0.94 1.48 1.04 0.83 0.82 0.99 1.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.15 0.15 0.09 0.31 0.45 0.12 0.19 0.17 0.19 0.23 0.07 0.36 0.73 0.56 0.27 0.2 1.2 0.43 0.2 0.23 0.2 6.41 0.18 0.09 0.16 0.19 0.11 0.56 0.34 0.4
1.04 0.91 1.04 1.05 1.4 1.19 0.99 0.98 1.08 1.13 1.1 1.18 1.13 2.47 2.06 1.29 1.26 2.98 1.15 0.95 0.8 0.76 17.95 1.16 1.16 1.04 1.15 0.74 1.22 1.46 2.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 5.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.1 0.04 0.04 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.08 0.13 0.0 1.69 0.43 0.22 0.23 0.03 0.06 0.09 0.13 0.27 0.0 0.0 0.17 0.14 0.16 69.06 0.14 0.15 0.24 0.64 0.03 0.76 0.18 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.08 0.06 0.11 0.06 0.07 0.05 0.06 0.03 0.11 0.07 0.13 0.08 0.09 0.14 0.08 0.06 0.25 0.06 0.08 0.11 0.1 1.51 0.06 0.05 0.06 0.08 0.06 0.08 0.1 0.08
0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.05 0.06 0.03 0.0 0.01 0.05 0.09 0.0 0.02 0.02 0.01 0.86 0.04 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04
0.3 0.31 0.27 0.26 0.14 0.12 0.1 0.08 0.34 0.18 0.36 0.59 1.88 0.18 0.31 0.23 0.2 1.03 0.66 0.34 0.49 0.52 383.79 0.77 0.74 0.31 0.44 0.38 0.31 0.23 0.46
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.34 0.03 0.01 0.02 0.03 1.95 0.01 0.05 0.0 0.01 0.01 0.06 0.02 0.06
0.12 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.06 2.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1
0.14 0.23 0.14 0.24 0.52 0.38 0.21 0.18 0.14 0.24 0.26 0.2 0.35 0.53 0.34 0.24 0.22 1.29 0.22 0.2 0.26 0.27 5.66 0.19 0.17 0.24 0.18 0.14 0.37 0.29 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
1.58 0.99 2.4 1.41 0.72 1.44 0.52 0.43 0.57 0.55 0.5 0.55 2.25 1.12 1.16 1.28 0.97 5.83 1.54 0.51 0.59 0.34 41.44 0.47 0.55 0.43 0.56 0.43 0.28 0.39 0.28
0.14 0.19 0.28 0.44 1.05 1.28 0.52 0.47 0.32 0.44 0.51 0.52 0.73 1.1 0.9 0.58 0.5 1.8 0.38 0.21 0.36 0.43 11.07 0.5 0.47 0.53 0.81 0.44 0.58 0.65 1.03
0.0 0.07 0.07 0.05 0.09 0.05 0.04 0.0 0.2 0.0 0.04 0.18 0.0 0.64 0.22 0.13 0.14 0.19 0.11 0.03 0.17 0.14 6.65 0.24 0.04 0.04 0.08 0.14 0.06 0.11 0.3
0.0 0.5 0.6 0.29 0.23 0.6 0.0 0.0 0.11 0.27 0.18 0.0 0.0 1.95 1.24 0.23 0.22 0.24 0.32 0.59 0.08 0.11 14.62 0.0 0.47 0.0 0.3 0.07 0.0 0.54 0.18

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)