Heatmap: Cluster_179 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_15420.1	-1.03	-0.98	-1.04	-0.66	0.12	0.35	0.06	0.29	-0.36	-0.17	-0.02	0.1	0.87	0.57	0.21	0.08	0.08	0.06	-0.6	-0.23	-0.07	0.1	-0.18	0.2	0.03	0.07	0.02	0.12	-0.06	-0.2	0.42
Lsat_1_v5_gn_0_39541.1	-0.63	-0.79	-0.82	-0.63	-0.32	0.08	0.2	0.68	-0.39	-0.33	-0.29	-0.02	0.92	0.1	-0.24	-0.02	0.13	-0.09	-0.65	-0.08	0.05	0.06	0.12	0.28	0.15	0.11	-0.01	0.25	-0.19	-0.09	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_28960.1	-0.66	-0.33	-0.87	-0.78	0.39	0.24	0.16	0.9	-0.74	-0.44	-0.42	-0.23	0.46	0.3	0.14	-0.08	0.01	0.3	-0.45	-0.26	-0.18	-0.01	0.71	-0.0	-0.2	-0.06	-0.27	-0.08	-0.13	0.08	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_3341.1 (RPS6B)	-1.4	-1.26	-1.62	-1.03	-0.41	0.07	0.32	0.87	-0.62	-0.41	-0.38	0.07	0.86	0.03	-0.34	-0.07	0.31	0.26	-0.69	0.01	-0.0	0.21	0.37	0.4	0.24	0.23	0.07	0.28	-0.4	-0.29	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_33521.1 (PCP1)	-1.7	-1.19	-2.67	-1.47	-0.47	-0.02	0.01	1.11	-1.18	-1.01	-0.51	-0.29	1.24	0.17	0.05	-0.07	-0.02	0.36	-0.41	-0.25	0.13	-0.07	0.55	0.45	0.19	-0.13	-0.32	0.17	0.14	-0.03	1.08
Lsat_1_v5_gn_1_35621.1 (NFA2)	-0.8	-0.52	-1.08	-1.19	-0.06	0.2	0.31	0.8	-0.74	-0.61	-0.45	-0.33	0.5	0.3	0.17	-0.03	0.06	0.72	-0.1	-0.12	-0.08	0.05	0.79	0.0	-0.05	-0.01	-0.17	-0.01	-0.14	-0.13	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_39161.1	-1.45	-0.96	-1.18	-1.44	-0.27	-0.09	0.39	0.96	-0.52	-0.38	-0.42	0.1	0.99	0.19	0.07	-0.07	0.23	0.15	0.04	0.06	-0.06	-0.0	-0.34	0.19	-0.03	0.04	-0.06	0.08	-0.39	-0.06	0.92
Lsat_1_v5_gn_1_50361.1 (HD2)	-1.47	-1.11	-1.53	-1.48	-0.32	-0.01	0.39	1.16	-0.79	-0.65	-0.5	-0.34	1.04	0.47	0.09	-0.03	0.12	0.73	-0.29	-0.25	-0.24	-0.05	-0.24	0.1	-0.05	-0.1	-0.25	-0.25	0.01	-0.01	1.14
Lsat_1_v5_gn_2_100021.1	-1.24	-0.95	-1.93	-1.49	-0.16	0.23	-0.01	0.6	-0.7	-0.6	-0.46	0.1	0.94	0.56	0.16	0.05	0.22	0.23	-0.85	-0.26	-0.03	0.02	0.08	0.43	0.23	-0.05	-0.22	0.15	0.16	0.13	0.85
Lsat_1_v5_gn_2_102781.1	-0.93	-1.06	-1.41	-1.11	-0.15	-0.05	0.33	0.84	-0.69	-0.56	-0.52	-0.11	1.05	0.15	0.12	0.04	0.3	0.31	-0.46	-0.02	-0.06	0.12	0.82	0.14	-0.08	0.05	-0.15	0.32	-0.42	-0.41	0.37
Lsat_1_v5_gn_2_115601.1	-0.85	-1.01	-1.1	-0.8	-0.14	0.29	0.03	0.46	-0.55	-0.37	-0.35	0.01	0.74	0.54	0.17	0.11	0.03	0.45	-0.31	-0.14	0.03	0.05	0.26	0.21	0.05	0.11	0.02	0.05	-0.06	-0.27	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_117041.1 (RPS6)	-1.29	-1.16	-1.54	-0.98	-0.35	-0.05	0.24	0.96	-0.69	-0.64	-0.44	0.17	1.02	0.27	0.09	0.14	0.27	-0.05	-0.78	-0.08	-0.07	0.03	0.41	0.42	0.26	0.15	-0.2	0.23	-0.39	-0.29	0.71
Lsat_1_v5_gn_2_117740.1 (ALY1)	-1.0	-1.01	-1.86	-1.36	-0.53	0.08	0.44	0.78	-0.77	-0.57	-0.14	-0.28	0.72	0.5	0.07	-0.1	0.16	0.65	-0.12	-0.14	0.1	0.14	0.44	-0.15	0.1	-0.12	-0.18	-0.22	-0.01	0.02	0.84
Lsat_1_v5_gn_2_125961.1 (SMO4)	-0.68	-0.54	-0.89	-0.76	-0.07	0.14	0.06	0.72	-0.73	-0.76	-0.33	-0.27	0.89	0.74	0.39	0.01	0.03	0.53	-0.46	-0.21	-0.22	-0.26	0.7	-0.02	-0.18	-0.11	-0.17	-0.01	-0.3	-0.26	0.53
Lsat_1_v5_gn_2_134881.1 (NACA2)	-0.67	-0.74	-0.97	-0.7	-0.11	0.29	-0.01	0.48	-0.5	-0.49	-0.2	0.02	0.91	0.36	0.11	0.22	-0.0	-0.21	-0.49	-0.08	0.01	0.11	-0.14	0.35	0.19	0.16	-0.09	0.21	-0.08	-0.23	0.53
Lsat_1_v5_gn_2_40760.1 (LSP)	-0.63	-0.71	-1.02	-0.86	-0.16	0.11	0.01	0.26	-0.46	-0.3	-0.3	0.0	0.77	0.21	-0.07	0.02	0.08	0.47	-0.27	-0.13	-0.14	0.09	0.43	0.23	0.16	0.0	-0.05	0.22	-0.12	-0.03	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_86720.1 (MEE21)	-1.13	-0.76	-1.54	-1.32	-0.27	-0.16	0.34	1.03	-0.89	-0.63	-0.52	-0.01	0.88	0.33	0.07	0.06	0.24	0.52	-0.18	-0.07	-0.03	0.08	0.32	0.13	-0.05	0.12	-0.18	-0.0	-0.32	-0.35	0.84
Lsat_1_v5_gn_2_89540.1	-0.93	-0.8	-1.14	-1.13	-0.31	0.03	0.29	0.96	-0.53	-0.44	-0.42	-0.05	0.92	-0.01	-0.05	0.07	0.31	-0.05	-0.57	0.04	-0.05	0.1	0.23	0.27	0.01	0.06	-0.16	0.27	-0.16	-0.12	0.73
Lsat_1_v5_gn_2_9140.1	-0.65	-0.74	-0.99	-1.34	-0.07	0.25	0.17	0.77	-0.86	-0.56	-0.63	-0.64	0.39	0.81	0.46	-0.15	-0.14	0.91	0.09	-0.25	-0.13	-0.01	0.58	-0.25	-0.1	-0.13	-0.29	-0.1	0.21	0.02	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_94961.1	-0.69	-0.87	-1.24	-1.22	0.22	0.08	0.29	1.2	-1.05	-0.9	-0.76	-0.42	0.85	0.19	0.13	-0.04	0.05	0.9	-0.46	-0.32	-0.24	-0.11	0.86	0.09	-0.01	-0.06	-0.27	-0.01	-0.19	-0.37	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_95040.1	-1.03	-0.9	-1.11	-0.93	0.06	0.32	0.06	0.43	-0.52	-0.43	-0.43	-0.04	0.82	0.69	0.27	-0.1	0.09	0.03	-0.61	-0.19	-0.16	0.0	-0.09	0.31	0.09	-0.04	-0.13	0.28	0.2	0.02	0.7
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Lsat_1_v5_gn_3_37780.1	-1.03	-0.77	-0.93	-0.68	-0.14	0.19	0.19	0.75	-0.62	-0.58	-0.43	-0.17	0.94	0.46	0.18	-0.05	-0.02	0.84	-0.46	-0.18	-0.06	-0.17	0.43	0.09	-0.06	-0.13	-0.22	0.15	-0.1	-0.16	0.33
Lsat_1_v5_gn_3_43920.1	-1.33	-0.78	-1.45	-1.24	-0.32	-0.02	-0.1	0.44	-0.53	-0.45	-0.42	0.04	0.97	0.54	0.28	0.08	0.2	0.5	-0.75	-0.3	-0.07	0.09	0.57	0.22	0.24	0.1	-0.02	-0.13	-0.21	-0.09	0.74
Lsat_1_v5_gn_4_108300.1	-1.34	-1.63	-1.38	-1.74	-0.55	-0.09	0.11	0.56	-0.76	-0.67	-0.46	-0.23	0.99	0.32	0.02	0.06	0.15	0.72	-0.8	0.02	-0.08	0.03	0.9	0.47	0.11	0.14	-0.23	0.35	-0.54	-0.2	0.92
Lsat_1_v5_gn_4_158421.1	-1.26	-0.45	-1.57	-1.12	-0.33	0.07	0.3	1.01	-0.48	-0.39	-0.5	-0.29	0.74	0.29	0.04	-0.03	0.03	0.34	-0.24	-0.16	0.01	0.12	0.6	0.18	-0.05	0.04	-0.02	0.04	-0.15	-0.13	0.56
Lsat_1_v5_gn_4_173160.1	-0.45	-0.12	-0.38	-0.59	0.05	0.07	0.05	0.63	-0.84	-0.45	-0.7	-0.31	0.51	0.36	0.31	-0.0	-0.18	0.34	-0.35	-0.16	-0.06	0.1	0.71	0.08	0.05	-0.17	-0.05	-0.05	-0.1	-0.19	0.45
Lsat_1_v5_gn_4_183080.1	-0.43	-0.49	-0.73	-0.75	0.16	0.19	0.34	0.64	-0.53	-0.37	-0.29	-0.14	0.56	0.22	0.07	-0.16	-0.05	0.22	-0.21	-0.12	-0.14	0.02	0.31	0.09	-0.02	-0.05	-0.14	0.11	0.08	0.09	0.35
Lsat_1_v5_gn_4_48420.1	-0.88	-1.03	-1.03	-0.81	-0.27	0.21	0.18	0.47	-0.79	-0.53	-0.65	-0.13	0.83	0.31	-0.0	-0.0	0.25	0.28	-0.66	-0.09	0.11	0.14	0.33	0.32	0.25	0.19	-0.08	0.33	-0.05	-0.15	0.6
Lsat_1_v5_gn_4_63901.1 (TRM10)	-0.73	-1.11	-0.82	-0.24	0.39	0.48	0.0	0.49	-0.46	-0.48	-0.09	-0.11	0.9	0.47	0.37	0.06	-0.11	-0.25	-0.39	-0.22	-0.21	-0.2	0.27	-0.05	-0.12	-0.12	-0.23	-0.07	-0.03	-0.06	0.72
Lsat_1_v5_gn_4_74740.1	-0.6	-0.32	-1.22	-1.41	-0.04	0.19	0.66	1.18	-0.72	-0.72	-0.48	-0.39	0.52	0.18	-0.17	-0.07	0.06	0.28	-0.24	-0.22	-0.21	0.02	0.91	0.12	0.08	0.08	0.03	-0.06	-0.38	-0.23	0.2
Lsat_1_v5_gn_4_76880.1	-0.66	-0.8	-0.93	-0.58	0.18	0.38	0.17	0.47	-0.43	-0.3	-0.44	-0.07	0.85	0.39	0.02	-0.04	0.14	0.22	-0.62	-0.21	-0.2	0.0	0.17	0.17	0.04	-0.06	-0.13	0.19	-0.02	-0.11	0.55
Lsat_1_v5_gn_4_88760.1	-0.89	-0.82	-0.99	-0.79	0.1	0.28	0.14	0.59	-0.74	-0.74	-0.67	-0.32	0.71	0.49	0.16	0.05	-0.06	0.74	-0.28	-0.07	-0.12	0.03	0.42	0.06	-0.01	-0.05	-0.08	0.18	0.08	-0.14	0.46
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Lsat_1_v5_gn_5_142921.1	-0.81	-1.11	-1.51	-1.24	-0.48	0.21	0.38	1.16	-0.82	-0.86	-0.65	-0.49	0.61	0.77	0.21	0.07	0.05	0.85	-0.22	-0.18	-0.08	-0.08	0.02	0.08	0.04	0.07	0.04	-0.25	0.15	-0.06	0.41
Lsat_1_v5_gn_5_143521.1	-1.42	-1.16	-2.22	-1.85	-0.48	-0.09	0.38	1.17	-0.89	-0.47	-0.31	-0.29	1.03	0.11	-0.02	-0.29	0.23	0.48	-0.37	-0.12	0.01	0.01	0.55	0.43	0.09	0.15	-0.27	-0.01	-0.37	-0.19	0.96
Lsat_1_v5_gn_5_146080.1	-0.94	-1.1	-1.03	-0.5	-0.13	0.28	0.1	0.55	-0.43	-0.19	-0.28	-0.16	0.71	0.37	-0.07	0.05	-0.02	0.42	-0.34	0.01	-0.04	-0.1	0.36	0.18	0.13	0.06	-0.01	-0.04	-0.17	-0.11	0.63
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.