Heatmap: Cluster_221 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_105600.1	0.42	0.35	-0.4	-1.26	0.13	-0.14	0.85	1.3	0.07	-0.14	-0.12	-0.15	-0.02	0.43	0.91	0.16	0.24	-4.51	-0.67	0.07	0.01	-0.05	-4.17	-0.08	-0.21	-0.03	-0.11	0.22	-0.54	-0.58	-0.58
Lsat_1_v5_gn_1_111141.1 (WL4)	-0.15	0.16	-0.85	-0.86	0.53	0.36	0.72	1.25	-0.02	-0.19	-0.11	-0.15	-0.34	0.65	0.15	-0.55	-0.56	-0.09	-0.11	-0.39	-0.19	-0.08	-1.42	-0.02	-0.12	-0.11	-0.12	0.0	0.32	-0.05	-0.31
Lsat_1_v5_gn_1_122360.1 (CRK34)	0.16	0.29	-0.65	-1.13	0.75	0.76	0.87	1.11	-0.34	-0.53	-0.21	-0.4	-0.54	0.82	0.74	0.15	-0.16	-3.44	-0.04	-0.2	0.05	0.16	-2.11	-0.13	-0.21	-0.04	0.13	0.22	-0.33	-0.79	-1.92
Lsat_1_v5_gn_1_14381.1 (IAP1)	-0.63	-0.19	-1.92	-2.03	-0.62	0.02	0.76	1.11	-0.5	-0.53	-0.42	-0.43	0.53	1.11	0.71	0.1	0.05	-0.43	0.23	-0.0	-0.02	-0.04	0.19	-0.07	-0.07	0.04	0.04	0.11	-0.33	-0.4	-0.71
Lsat_1_v5_gn_1_15100.1 (DOF2)	-1.26	-0.15	-0.5	-0.92	0.93	0.83	0.22	1.17	-0.76	-1.13	-0.45	-0.48	-0.32	1.43	0.26	-0.23	-0.73	-3.28	0.04	-0.6	-0.34	0.05	-2.16	-0.01	0.05	0.1	-0.17	-0.35	0.62	0.4	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_2401.1 (PPOX)	0.04	-0.23	-0.41	-0.73	-0.08	0.19	0.4	0.32	-0.15	-0.16	-0.17	-0.34	-0.07	0.96	0.84	0.19	0.12	-1.14	0.09	-0.07	-0.13	-0.05	0.12	-0.2	-0.15	-0.03	-0.11	-0.04	-0.17	-0.19	-0.26
Lsat_1_v5_gn_1_7420.1 (GAL1)	0.1	-0.12	-1.59	-2.11	0.11	1.23	1.03	1.37	-0.92	-1.09	-0.74	-1.18	-0.22	1.13	0.39	-0.23	-0.31	-2.62	0.08	-0.17	-0.01	0.16	-1.83	0.09	0.03	0.11	0.23	0.15	-0.07	-0.34	-0.65
Lsat_1_v5_gn_1_77880.1 (STH)	-0.34	-0.15	-0.16	0.2	-0.39	-0.26	0.11	-0.03	0.05	0.06	0.04	-0.09	-0.18	0.38	0.69	0.28	0.21	-1.11	0.19	0.12	0.03	-0.01	-0.19	-0.29	-0.21	0.07	0.02	-0.03	0.14	0.07	-0.08
Lsat_1_v5_gn_1_83120.1	-1.2	-1.0	-1.41	-2.0	-1.88	-0.61	1.04	1.39	-0.48	-0.54	-0.69	-0.49	1.25	0.4	0.29	0.34	0.45	0.11	-0.09	-0.01	-0.15	-0.17	0.42	0.08	-0.02	-0.02	-0.01	-0.3	-0.49	-0.33	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_117281.1 (DAR2)	-0.51	-0.3	-0.88	-0.66	-0.26	0.34	0.56	0.71	-0.54	-0.75	-0.51	-0.83	-0.19	1.02	1.34	0.59	0.79	-1.73	0.08	-0.24	-0.19	-0.39	-1.19	-0.35	-0.16	-0.18	-0.17	0.1	0.26	0.14	-0.36
Lsat_1_v5_gn_2_122581.1	-0.88	-0.26	0.2	-0.37	0.51	0.13	0.62	0.84	-0.33	-0.44	-0.14	0.04	-0.84	1.2	1.06	0.19	0.22	-1.1	0.09	-0.17	-0.29	-0.17	-3.05	-0.29	-0.2	-0.2	-0.13	-0.08	-0.17	-0.35	-0.33
Lsat_1_v5_gn_2_131981.1 (ACYB-2)	-0.11	-0.31	-0.41	-0.55	0.22	0.43	0.36	0.55	-0.2	-0.33	-0.22	-0.39	-0.33	0.83	0.71	0.1	-0.04	-0.77	0.3	-0.23	-0.12	-0.13	0.04	-0.07	-0.17	-0.2	-0.01	-0.18	0.17	-0.1	-0.21
Lsat_1_v5_gn_2_134260.1 (PDV1)	0.01	-0.12	-0.3	-0.44	0.01	0.42	0.23	0.29	-0.14	-0.32	-0.32	-0.41	0.12	0.61	0.41	0.22	0.06	-0.47	0.05	-0.04	0.04	0.07	-0.84	-0.13	-0.02	0.09	0.16	0.21	-0.04	-0.15	-0.16
Lsat_1_v5_gn_2_18420.1	0.0	-0.25	-0.37	-0.41	0.05	0.35	0.29	0.45	-0.27	-0.47	-0.47	-0.64	0.17	0.63	0.32	-0.03	-0.07	0.27	0.01	-0.27	-0.08	-0.07	0.48	-0.02	-0.25	-0.01	-0.08	-0.27	0.21	-0.06	-0.1
Lsat_1_v5_gn_2_22640.1 (RLPH2)	0.18	-0.16	-1.04	-0.98	0.45	0.44	0.32	1.15	-0.26	-0.26	-0.19	-0.03	0.14	0.69	0.55	-0.08	-0.18	-0.1	-0.28	-0.57	-0.55	-0.37	0.44	-0.04	-0.39	-0.24	-0.14	-0.19	-0.17	-0.2	-0.23
Lsat_1_v5_gn_2_64341.1 (GSH2)	0.01	-0.12	-0.34	-0.41	0.11	0.43	0.32	0.53	-0.25	-0.17	-0.24	-0.08	0.02	0.59	0.46	0.01	-0.13	-0.94	0.08	-0.2	-0.06	-0.02	-0.43	0.03	-0.08	-0.07	0.02	0.1	-0.09	-0.16	0.13
Lsat_1_v5_gn_2_64821.1 (PES1)	0.53	0.18	-0.2	-0.59	-0.14	0.0	0.51	1.1	-0.58	-0.67	-0.54	-0.68	0.09	1.39	0.61	-0.38	-0.43	-1.01	-0.01	-0.48	-0.4	-0.26	0.51	-0.28	-0.31	-0.4	-0.34	-0.22	0.17	-0.19	-0.27
Lsat_1_v5_gn_2_73001.1 (PILS1)	-0.01	0.2	-0.36	-0.88	-0.5	-0.36	0.7	1.26	-0.53	-0.7	-0.32	-0.65	-0.45	1.12	0.66	-0.08	0.18	-1.14	0.34	-0.27	-0.2	-0.01	0.16	-0.27	-0.17	-0.09	-0.08	-0.3	0.01	-0.14	-0.23
Lsat_1_v5_gn_2_73301.1 (GBSS1)	-0.5	0.06	-0.08	-0.39	-0.78	-0.74	0.8	0.55	0.17	0.16	0.1	-0.03	-0.37	0.66	0.91	0.12	0.26	-2.07	0.34	0.21	-0.17	-0.21	-4.12	-0.13	-0.14	0.01	-0.08	-0.61	0.17	0.2	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_99900.1	-0.43	0.4	-0.72	-1.68	-0.57	0.3	0.59	0.12	0.06	-0.48	-0.38	-0.31	-0.15	0.49	0.42	0.59	0.71	-3.33	0.28	0.33	0.04	0.37	-4.11	0.22	0.26	0.28	0.53	0.43	-0.57	-0.48	-0.57
Lsat_1_v5_gn_3_15540.1 (CKB1)	0.0	-0.04	0.05	0.04	0.01	0.14	0.35	0.74	-0.55	-0.32	-0.46	-0.34	0.23	0.36	0.2	-0.26	-0.31	0.26	-0.29	-0.27	-0.27	-0.3	0.77	-0.32	-0.25	-0.28	-0.35	-0.41	0.08	0.07	0.44
Lsat_1_v5_gn_3_28120.1	-0.01	-0.24	-0.74	-0.84	0.03	0.3	0.45	0.72	-0.45	-0.48	-0.4	-0.43	0.09	0.53	0.38	0.12	0.06	0.43	0.03	-0.16	-0.02	0.06	0.51	-0.16	-0.07	-0.05	0.03	0.19	-0.24	-0.33	-0.98
Lsat_1_v5_gn_3_38921.1	-0.06	-0.07	-0.6	-0.65	0.31	0.61	0.57	0.8	-0.11	-0.25	-0.06	-0.13	0.01	0.51	0.46	0.01	-0.17	-1.97	-0.11	-0.31	-0.13	-0.13	-0.25	-0.08	-0.21	-0.05	0.08	0.08	0.18	0.16	-0.6
Lsat_1_v5_gn_3_57021.1 (GABP)	-0.21	0.0	-1.13	-1.49	0.25	0.36	0.58	0.73	-0.72	-0.82	-0.81	-0.79	0.52	1.02	0.69	0.17	0.14	0.08	-0.08	-0.23	-0.2	-0.26	0.67	-0.22	-0.17	-0.31	0.02	-0.09	-0.04	-0.3	-0.61
Lsat_1_v5_gn_3_6560.1 (EGL1)	-0.91	-0.38	-0.72	-0.64	-0.54	-0.68	0.74	0.94	-0.08	-0.14	0.33	0.23	-0.34	0.23	0.72	0.3	0.21	-0.09	0.19	0.15	-0.4	-0.48	-2.63	0.21	-0.21	-0.19	-0.11	-0.7	0.22	0.53	0.48
Lsat_1_v5_gn_3_68040.1 (NFD2)	0.14	0.15	-0.11	-0.46	0.42	0.76	0.31	0.73	-0.64	-0.6	-0.4	-0.64	-0.18	0.68	0.81	0.19	-0.21	-0.89	0.32	-0.16	-0.16	-0.08	-0.16	-0.11	-0.23	-0.3	-0.05	-0.03	-0.11	-0.43	-0.64
Lsat_1_v5_gn_3_81561.1 (DOT1)	0.36	-0.36	-1.49	-2.39	-0.26	0.22	0.0	0.21	-0.54	-0.52	-0.39	-0.44	0.23	1.54	1.65	1.02	1.14	-2.53	-0.5	-0.36	-0.57	-0.46	-1.05	-0.39	-0.68	-0.39	-0.05	-0.02	-0.54	-0.16	-0.6
Lsat_1_v5_gn_4_104600.1 (Cyc1-1)	0.23	-0.28	-0.52	-0.82	-0.01	0.2	0.51	0.65	-0.4	-0.51	-0.38	-0.4	0.06	1.1	0.73	0.03	-0.03	-0.41	0.23	-0.01	-0.02	0.02	-0.48	-0.12	-0.1	-0.08	-0.05	0.23	-0.11	-0.46	-0.88
Lsat_1_v5_gn_4_106341.1	0.88	0.14	-0.98	-3.19	-0.14	0.87	0.52	0.6	-1.47	-1.86	-1.7	-1.61	-0.32	1.7	1.57	-0.01	0.05	-1.24	0.39	-0.87	-0.32	-0.15	-1.65	-0.26	-0.35	-0.33	-0.4	0.08	0.16	-0.35	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_130361.1 (UGT85A7)	-0.15	-0.4	-1.31	-2.65	-0.53	0.65	0.54	0.7	-0.37	-0.82	-0.4	-0.85	-0.36	1.69	1.01	-0.03	-0.17	-2.92	0.26	0.04	0.14	0.33	-0.77	0.07	0.15	0.07	0.21	0.04	-0.32	-0.67	-0.34
Lsat_1_v5_gn_4_131081.1	0.23	0.14	-0.08	-0.28	-0.08	-0.12	0.5	0.86	-0.5	-0.62	-0.45	-0.6	-0.05	0.65	0.42	-0.06	-0.19	0.19	0.02	-0.36	-0.23	-0.27	0.7	-0.23	-0.24	-0.27	-0.28	-0.36	0.08	-0.05	0.0
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Lsat_1_v5_gn_4_166281.1	0.2	-0.06	-0.12	-0.71	0.19	0.2	-0.52	-0.15	0.03	-0.01	0.06	-0.36	-0.72	0.97	0.93	0.36	0.43	-1.35	-0.11	-0.25	-0.12	-0.16	-0.6	-0.21	-0.5	-0.28	-0.01	-0.33	0.46	0.35	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_38920.1	0.22	-0.0	-1.16	-2.45	0.22	0.67	0.37	0.39	-0.36	-0.54	-0.29	-0.52	-0.39	1.16	0.98	0.13	0.13	-2.94	0.26	-0.03	-0.02	0.05	-0.61	-0.04	-0.11	0.01	-0.03	0.05	0.09	-0.14	-0.29
Lsat_1_v5_gn_4_64140.1 (OPT5)	0.19	0.27	-1.15	-1.78	0.57	0.2	0.63	1.53	-0.1	-0.02	0.04	0.06	-0.92	1.37	1.19	-0.04	-0.18	-6.6	0.17	-0.27	-0.28	-0.48	-2.97	-0.16	-0.33	-0.89	-0.49	-0.39	-0.21	-0.23	-0.91
Lsat_1_v5_gn_4_70620.1 (LHT7)	0.02	-0.37	-1.8	-2.88	0.21	0.56	0.53	0.73	0.09	-0.17	-0.06	-0.34	-0.89	0.52	1.24	0.5	0.39	-5.16	-0.12	0.18	0.22	0.29	-4.75	-0.0	-0.1	-0.09	0.26	0.28	-0.22	-0.21	-0.38
Lsat_1_v5_gn_4_74501.1	-0.11	0.02	-0.14	-0.29	0.03	0.03	-0.05	0.07	-0.48	-0.17	-0.2	-0.1	0.4	0.85	0.92	0.12	0.07	0.04	-0.12	0.08	-0.7	-0.22	0.53	-0.37	-0.39	-0.26	-0.51	-0.09	0.04	-0.38	-0.02
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.