Heatmap: Cluster_229 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.59 -0.97 -0.91 -0.71 0.35 0.5 -0.64 -0.6 -0.54 -0.35 -0.39 -0.1 0.48 0.6 0.52 -0.02 -0.27 0.61 0.03 -0.18 -0.2 -0.12 0.75 -0.12 0.04 -0.12 -0.05 -0.31 0.25 0.14 0.62
-0.26 -0.47 -0.46 -0.55 0.16 0.18 -0.44 -0.3 -0.15 -0.26 -0.28 -0.15 0.48 0.68 0.5 -0.07 -0.12 0.65 -0.22 -0.28 -0.22 -0.12 0.82 -0.05 -0.23 -0.24 -0.37 -0.11 0.11 0.01 0.31
-0.95 -0.52 -1.03 -1.28 0.27 0.69 -0.58 -0.82 -0.31 -0.48 -0.11 -0.29 0.2 0.54 0.48 0.16 -0.19 -0.1 -0.12 -0.2 -0.28 -0.27 1.17 -0.11 -0.02 -0.05 0.05 -0.63 0.28 0.39 0.89
-0.39 -0.46 -0.61 -0.43 0.47 0.42 -0.26 -0.24 -0.48 -0.36 -0.31 -0.4 0.25 0.57 0.4 -0.07 -0.18 0.7 -0.07 -0.38 -0.3 -0.08 1.0 -0.29 -0.24 -0.15 -0.19 -0.24 0.13 0.09 0.34
-0.68 -0.84 -0.6 -0.54 0.38 0.21 -0.79 -1.11 -0.3 -0.22 -0.18 -0.29 -0.05 0.78 0.61 0.03 -0.1 1.08 0.03 -0.15 -0.17 -0.12 0.81 -0.34 -0.14 -0.03 -0.08 -0.31 0.11 0.1 0.34
-0.3 -0.28 -0.3 -0.27 0.44 0.38 -0.35 -0.4 -0.48 -0.41 -0.42 -0.41 0.2 0.7 0.44 -0.02 -0.16 0.68 -0.19 -0.37 -0.25 -0.16 1.11 -0.44 -0.28 -0.21 -0.3 -0.17 0.21 0.04 0.12
-0.45 -0.57 -0.77 -0.63 0.63 0.53 -0.6 -0.64 -0.43 -0.41 -0.29 -0.26 0.53 0.44 0.47 0.02 -0.05 0.72 -0.0 -0.28 -0.15 -0.17 0.76 -0.22 -0.09 -0.26 -0.12 0.18 0.15 -0.03 0.05
-0.74 -0.55 -1.53 -1.72 0.87 0.83 -0.36 -0.5 -0.55 -0.65 -0.45 -0.94 -0.76 1.23 1.22 0.08 -0.66 0.57 0.28 -0.56 -0.19 -0.22 1.39 -0.43 -0.45 -0.15 -0.01 -0.37 0.04 -0.38 -0.39
-1.04 -0.65 -1.12 -0.86 0.44 0.36 -0.81 -0.97 -0.37 -0.2 -0.37 -0.23 0.19 0.86 0.65 -0.26 -0.22 1.22 -0.13 -0.38 -0.29 -0.18 1.09 -0.58 -0.55 -0.3 -0.24 -0.57 0.32 0.19 0.79
-0.7 -0.4 -0.47 -0.2 0.44 0.38 -0.32 -0.08 -0.47 -0.39 -0.22 -0.12 0.4 0.55 0.23 0.15 0.0 0.89 -0.13 -0.36 -0.33 -0.27 0.84 -0.43 -0.36 -0.34 -0.23 -0.48 0.17 -0.05 0.45
-0.53 -0.65 -0.61 -0.32 0.75 0.44 -0.28 -0.38 -0.28 -0.28 -0.16 -0.4 -0.27 0.88 0.82 0.02 -0.19 0.47 0.05 -0.35 -0.24 -0.27 0.77 -0.36 -0.25 -0.25 -0.18 -0.43 0.23 0.07 0.07
-0.62 -0.62 -0.46 -0.39 0.41 0.51 -0.4 -0.54 -0.45 -0.32 -0.23 -0.33 -0.07 0.69 0.47 0.17 -0.14 0.51 0.05 -0.26 -0.17 -0.11 0.91 -0.31 -0.31 -0.06 0.07 -0.16 0.14 0.2 0.11
-0.36 -0.47 -0.79 -0.72 0.64 0.68 -0.18 -0.22 -0.27 -0.5 -0.23 -0.59 -0.29 0.88 0.71 -0.01 -0.22 0.54 0.2 -0.43 -0.22 -0.01 0.9 -0.36 -0.19 -0.11 -0.04 -0.3 0.04 -0.11 -0.26
-0.43 -0.24 -0.25 -0.27 0.31 0.19 -0.3 -0.35 -0.4 -0.4 -0.24 -0.36 0.08 0.6 0.48 0.07 -0.13 0.64 0.01 -0.3 -0.19 -0.2 0.9 -0.39 -0.2 -0.19 -0.16 -0.24 0.21 0.11 0.27
-1.08 -1.08 -1.17 -0.76 0.5 0.37 -0.3 -0.48 -0.57 -0.28 -0.25 -0.24 -0.02 0.92 0.75 -0.2 -0.3 1.29 -0.08 -0.44 -0.64 -0.42 1.02 -0.41 -0.15 -0.08 -0.41 -0.75 0.22 0.23 0.6
-0.69 -0.77 -0.95 -0.79 0.39 0.55 -0.39 -0.15 -0.09 -0.19 -0.14 -0.08 0.33 0.51 0.34 0.02 -0.06 -0.16 -0.1 -0.1 -0.37 -0.3 0.95 -0.15 -0.18 -0.02 -0.04 -0.16 0.18 0.16 0.57
-0.51 -0.39 -0.33 -0.42 0.23 0.23 -0.51 -0.62 -0.2 -0.27 -0.16 -0.31 -0.17 0.83 0.56 0.18 -0.07 0.43 0.28 -0.17 -0.02 0.0 0.62 -0.23 -0.12 0.0 0.06 -0.4 0.19 0.01 -0.04
-0.66 -0.65 -0.96 -0.7 0.3 0.37 -0.28 -0.35 -0.4 -0.27 -0.13 -0.47 0.19 0.48 0.43 -0.11 -0.24 1.06 -0.05 -0.28 -0.19 -0.12 0.8 -0.35 -0.22 -0.29 -0.11 -0.34 0.36 0.33 0.55
-0.5 -0.67 -0.76 -0.63 0.63 0.4 -0.59 -1.03 -0.36 -0.25 -0.19 -0.25 0.04 0.85 0.74 -0.01 -0.26 0.63 0.07 -0.32 -0.14 0.06 0.93 -0.47 -0.15 -0.12 -0.01 -0.26 0.14 0.04 -0.04
-0.48 -0.48 -0.58 -0.57 0.68 0.61 -0.25 -0.38 -0.27 -0.25 -0.14 -0.35 0.02 0.73 0.66 0.14 -0.08 0.15 0.16 -0.26 -0.2 -0.11 0.71 -0.31 -0.28 -0.2 -0.17 -0.11 0.11 -0.03 -0.07
-0.33 -0.47 -0.75 -0.58 0.6 0.59 -0.17 -0.28 -0.42 -0.39 -0.22 -0.32 0.24 0.8 0.64 0.06 -0.12 0.15 0.05 -0.26 -0.11 -0.05 0.49 -0.32 -0.09 -0.09 -0.06 0.1 0.18 -0.14 -0.22
-0.58 -0.71 -0.19 -0.39 0.57 0.52 -0.48 -0.32 -0.41 -0.49 -0.34 -0.33 0.12 0.85 0.58 -0.13 -0.29 0.68 0.01 -0.28 -0.24 -0.27 1.17 -0.57 -0.31 -0.19 -0.13 -0.38 0.04 -0.09 0.15
-0.88 -1.24 -1.27 -1.08 0.86 0.99 -0.95 -1.62 -0.63 -0.81 -0.6 -0.68 0.47 0.9 0.84 0.22 -0.15 0.65 0.06 -0.3 -0.1 -0.15 1.21 -0.3 -0.15 -0.04 -0.03 -0.1 -0.11 -0.29 -0.02
-0.9 -0.83 -0.89 -0.54 0.3 0.27 -0.87 -0.91 -0.34 -0.29 -0.05 -0.55 0.0 1.04 0.59 -0.31 -0.44 1.15 -0.03 -0.49 -0.25 -0.19 1.25 -0.36 -0.34 -0.19 -0.11 -0.5 0.33 0.04 0.51
-0.53 -0.61 -0.47 -0.43 0.39 0.36 -0.14 -0.32 -0.33 -0.33 -0.16 -0.27 0.13 0.49 0.34 -0.07 -0.1 0.68 -0.05 -0.25 -0.17 -0.16 0.7 -0.28 -0.09 -0.09 -0.03 -0.04 0.14 0.12 0.32
-0.41 -0.44 -0.5 -0.38 0.51 0.53 -0.35 -0.25 -0.47 -0.35 -0.21 -0.25 0.11 0.74 0.58 -0.07 -0.17 0.74 -0.16 -0.39 -0.26 -0.3 1.11 -0.37 -0.3 -0.45 -0.3 -0.15 0.08 -0.03 0.04
0.05 -0.16 -0.31 -0.24 0.36 0.32 -0.19 -0.11 -0.3 -0.31 -0.15 -0.27 0.14 0.63 0.55 -0.04 -0.19 0.04 0.01 -0.16 -0.06 -0.11 0.49 -0.21 -0.16 -0.06 -0.07 -0.02 0.04 -0.07 -0.16
-0.95 -0.69 -0.73 -0.49 0.4 0.26 -0.83 -0.85 -0.26 -0.34 -0.09 -0.28 0.09 0.79 0.54 -0.06 -0.35 0.92 -0.12 -0.41 -0.33 -0.34 1.27 -0.36 -0.25 -0.15 -0.11 -0.66 0.29 0.16 0.63
-0.42 -0.45 -0.57 -0.54 0.42 0.7 -0.11 -0.22 -0.29 -0.41 -0.22 -0.45 0.08 0.78 0.61 0.12 -0.17 0.06 0.09 -0.27 -0.13 -0.02 0.67 -0.17 -0.13 -0.2 -0.05 -0.23 0.11 -0.02 -0.01
-0.47 -0.33 -0.55 -0.43 0.49 0.39 -0.14 -0.01 -0.38 -0.23 -0.14 -0.26 0.05 0.26 0.17 0.0 0.0 0.49 0.01 -0.27 -0.23 -0.02 0.73 -0.2 -0.17 0.03 0.12 0.02 0.03 0.05 0.07
-0.86 -0.94 -0.74 -0.88 0.21 0.32 -0.41 -0.74 -0.31 -0.5 -0.14 -0.25 0.56 0.8 0.54 0.19 -0.14 0.21 -0.14 -0.17 -0.21 -0.07 0.95 -0.1 -0.02 -0.1 -0.11 -0.16 0.22 -0.06 0.63
-0.69 -0.82 -0.71 -0.51 0.45 0.53 -0.58 -0.8 -0.35 -0.23 -0.18 -0.17 0.37 0.58 0.38 0.03 -0.07 0.59 -0.04 -0.21 -0.18 -0.07 0.83 -0.24 -0.09 -0.04 -0.04 -0.11 0.21 0.02 0.24
-0.66 -1.03 -0.94 -0.67 0.6 0.68 -0.1 -0.14 -0.36 -0.47 -0.25 -0.51 -0.35 1.06 0.88 0.16 -0.46 0.3 -0.07 -0.29 -0.17 -0.14 0.9 -0.25 -0.28 -0.11 -0.04 -0.24 0.21 -0.03 -0.09
-0.76 -0.75 -1.18 -0.86 0.92 0.64 -0.52 -0.54 -0.68 -0.47 -0.28 -0.25 0.05 0.31 0.26 0.04 -0.13 0.82 0.21 -0.27 -0.19 -0.16 0.96 -0.26 -0.18 -0.2 -0.11 0.15 0.16 0.19 0.28
-0.16 -0.36 -0.48 -0.36 0.43 0.28 -0.53 -0.6 -0.36 -0.34 -0.26 -0.32 -0.11 0.69 0.43 -0.02 -0.28 0.89 -0.06 -0.51 -0.2 -0.16 1.23 -0.43 -0.4 -0.3 -0.34 -0.34 0.39 0.16 0.1
-0.51 -0.2 -0.52 -0.39 0.66 0.34 -0.2 -0.21 -0.41 -0.31 -0.34 -0.27 0.22 0.45 0.36 -0.01 -0.11 0.46 -0.1 -0.36 -0.34 -0.27 0.8 -0.33 -0.2 -0.13 -0.24 -0.18 0.22 0.27 0.41
-0.43 -0.36 -0.34 -0.22 0.42 0.55 -0.16 -0.38 -0.36 -0.2 -0.23 -0.32 0.28 0.72 0.5 -0.02 -0.19 0.22 0.14 -0.4 -0.24 -0.06 0.77 -0.23 -0.13 -0.23 -0.33 -0.04 0.02 -0.03 0.04
-0.53 -0.53 -0.68 -0.57 0.13 0.28 -0.35 -0.33 -0.37 -0.36 -0.19 -0.17 0.16 0.62 0.37 0.1 -0.0 0.69 -0.01 -0.16 -0.07 -0.05 0.46 -0.17 -0.06 0.03 0.02 -0.18 0.28 0.1 0.32
-0.58 -0.75 -0.54 -0.26 0.15 0.13 -0.51 -0.64 -0.38 -0.3 -0.25 -0.2 0.21 0.69 0.52 0.12 -0.09 0.78 -0.09 -0.2 -0.22 -0.04 0.84 -0.3 -0.06 0.08 0.01 -0.08 -0.02 0.01 0.28
-0.59 -0.98 -0.64 -1.14 0.43 0.57 -0.78 -1.3 -0.48 -0.59 -0.37 -0.52 0.56 0.53 0.58 0.24 -0.12 0.38 -0.05 -0.35 -0.13 -0.03 0.98 0.02 -0.1 -0.06 0.04 -0.5 0.15 0.14 0.83
-0.45 -0.43 -0.6 -0.45 0.51 0.39 -0.22 -0.24 -0.35 -0.2 -0.35 -0.25 0.23 0.29 0.35 0.0 -0.03 0.62 -0.07 -0.25 -0.27 -0.13 0.85 -0.29 -0.2 -0.21 -0.16 -0.18 0.18 0.12 0.43
-0.49 -0.52 -0.44 -0.58 0.32 0.35 -0.15 -0.17 -0.31 -0.38 -0.34 -0.33 0.06 0.47 0.42 0.02 -0.16 0.74 0.08 -0.19 -0.3 -0.07 0.78 -0.29 -0.09 -0.26 -0.13 -0.22 0.15 0.12 0.47
-0.48 -0.19 -0.36 -0.19 0.26 0.06 -0.47 -0.54 -0.28 -0.23 -0.08 -0.21 0.17 0.5 0.36 0.08 -0.07 0.73 -0.01 -0.28 -0.2 -0.14 0.75 -0.33 -0.21 -0.05 -0.1 -0.31 0.19 0.13 0.32
-0.62 -0.48 -0.64 -0.45 0.4 0.4 -0.1 -0.38 -0.28 -0.1 -0.28 -0.34 -0.2 0.58 0.41 0.02 -0.01 0.35 -0.11 -0.24 -0.12 0.12 0.75 -0.3 -0.04 0.03 -0.15 -0.13 0.21 0.13 0.31
-0.82 -0.45 -0.77 -0.56 0.59 0.37 -0.15 -0.38 -0.25 -0.25 -0.28 -0.12 0.12 0.29 0.12 -0.02 -0.16 0.4 0.05 -0.39 -0.05 0.12 0.93 -0.31 -0.18 -0.06 -0.06 -0.0 0.15 0.12 0.48
-0.61 -0.52 -0.8 -0.87 0.33 0.19 -0.65 -0.99 -0.34 -0.24 -0.1 -0.19 0.54 0.52 0.4 0.03 -0.03 0.57 0.02 -0.08 -0.25 -0.3 0.97 -0.09 -0.22 -0.13 -0.05 -0.17 0.09 0.26 0.54
-0.58 -0.62 -0.8 -0.8 0.52 0.34 -0.69 -1.03 -0.59 -0.55 -0.38 -0.41 0.82 0.77 0.5 -0.02 -0.04 0.75 0.0 -0.19 -0.32 -0.19 1.03 -0.1 -0.26 -0.38 -0.26 -0.17 -0.2 -0.19 0.79
-0.31 -0.35 -0.51 -0.26 0.11 0.25 -0.24 -0.13 -0.27 -0.28 -0.15 -0.09 0.37 0.24 0.27 -0.01 -0.05 0.35 -0.06 -0.18 -0.1 -0.09 0.56 -0.09 0.0 -0.1 -0.18 0.07 0.14 0.12 0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.