Heatmap: Cluster_229 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_460.1 (TFCB)	0.39	0.3	0.32	0.36	0.75	0.84	0.38	0.39	0.41	0.46	0.45	0.55	0.82	0.9	0.85	0.58	0.49	0.9	0.61	0.52	0.51	0.55	1.0	0.55	0.61	0.55	0.57	0.48	0.7	0.66	0.91
Lsat_1_v5_gn_1_129701.1 (SDH4)	0.47	0.41	0.41	0.39	0.63	0.64	0.42	0.46	0.51	0.47	0.47	0.51	0.79	0.91	0.8	0.54	0.52	0.89	0.48	0.47	0.49	0.52	1.0	0.55	0.48	0.48	0.44	0.53	0.61	0.57	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_25020.1	0.23	0.31	0.22	0.18	0.54	0.72	0.3	0.25	0.36	0.32	0.41	0.36	0.51	0.64	0.62	0.5	0.39	0.41	0.41	0.39	0.36	0.37	1.0	0.41	0.44	0.43	0.46	0.29	0.54	0.58	0.82
Lsat_1_v5_gn_1_39781.1 (RPT1A)	0.38	0.37	0.33	0.37	0.7	0.67	0.42	0.42	0.36	0.39	0.41	0.38	0.59	0.74	0.66	0.48	0.44	0.81	0.48	0.39	0.41	0.48	1.0	0.41	0.42	0.45	0.44	0.42	0.55	0.53	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_71440.1 (EPS3)	0.3	0.27	0.31	0.33	0.62	0.55	0.27	0.22	0.39	0.41	0.42	0.39	0.46	0.82	0.72	0.48	0.44	1.0	0.49	0.43	0.42	0.44	0.83	0.37	0.43	0.47	0.45	0.38	0.51	0.51	0.6
Lsat_1_v5_gn_1_77261.1 (GDI1)	0.38	0.38	0.38	0.39	0.63	0.61	0.36	0.35	0.33	0.35	0.35	0.35	0.53	0.76	0.63	0.46	0.42	0.74	0.41	0.36	0.39	0.42	1.0	0.34	0.38	0.4	0.38	0.41	0.54	0.48	0.5
Lsat_1_v5_gn_2_112401.1 (OST1a)	0.43	0.4	0.35	0.38	0.91	0.85	0.39	0.38	0.44	0.44	0.48	0.49	0.85	0.8	0.81	0.6	0.57	0.97	0.59	0.48	0.53	0.52	1.0	0.51	0.55	0.49	0.54	0.67	0.66	0.58	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_113261.1	0.23	0.26	0.13	0.12	0.69	0.68	0.3	0.27	0.26	0.24	0.28	0.2	0.22	0.89	0.89	0.4	0.24	0.57	0.46	0.26	0.33	0.33	1.0	0.28	0.28	0.34	0.38	0.29	0.39	0.29	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_123440.1 (EBI)	0.21	0.27	0.2	0.24	0.58	0.55	0.24	0.22	0.33	0.37	0.33	0.36	0.49	0.78	0.67	0.36	0.37	1.0	0.39	0.33	0.35	0.38	0.91	0.29	0.29	0.35	0.36	0.29	0.54	0.49	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_24640.1	0.33	0.41	0.39	0.47	0.73	0.7	0.43	0.51	0.39	0.41	0.46	0.49	0.71	0.79	0.63	0.6	0.54	1.0	0.49	0.42	0.43	0.45	0.96	0.4	0.42	0.43	0.46	0.39	0.6	0.52	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_36940.1	0.38	0.34	0.36	0.43	0.91	0.74	0.45	0.42	0.45	0.45	0.49	0.41	0.45	1.0	0.96	0.55	0.48	0.75	0.56	0.43	0.46	0.45	0.92	0.42	0.46	0.45	0.48	0.4	0.64	0.57	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_51700.1 (MAZ)	0.34	0.35	0.38	0.41	0.71	0.75	0.4	0.36	0.39	0.43	0.45	0.42	0.51	0.85	0.73	0.6	0.48	0.76	0.55	0.44	0.47	0.49	1.0	0.43	0.43	0.51	0.56	0.48	0.58	0.61	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_87840.1 (MUB2)	0.42	0.39	0.31	0.33	0.84	0.86	0.47	0.46	0.44	0.38	0.46	0.36	0.44	0.99	0.88	0.53	0.46	0.78	0.62	0.4	0.46	0.53	1.0	0.42	0.47	0.5	0.52	0.44	0.55	0.5	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_91641.1 (SK13)	0.4	0.45	0.45	0.45	0.67	0.61	0.44	0.42	0.41	0.41	0.45	0.42	0.57	0.81	0.75	0.56	0.49	0.84	0.54	0.44	0.47	0.47	1.0	0.41	0.47	0.47	0.48	0.46	0.62	0.58	0.65
Lsat_1_v5_gn_3_36241.1 (MAPR4)	0.19	0.19	0.18	0.24	0.58	0.53	0.33	0.29	0.28	0.34	0.35	0.35	0.4	0.78	0.69	0.36	0.33	1.0	0.39	0.3	0.26	0.31	0.83	0.31	0.37	0.39	0.31	0.24	0.48	0.48	0.62
Lsat_1_v5_gn_3_44581.1 (PPRD2)	0.32	0.3	0.27	0.3	0.68	0.76	0.4	0.46	0.49	0.45	0.47	0.49	0.65	0.74	0.66	0.52	0.5	0.46	0.48	0.48	0.4	0.42	1.0	0.47	0.46	0.51	0.5	0.46	0.59	0.58	0.77
Lsat_1_v5_gn_3_68821.1 (NFA2)	0.4	0.43	0.45	0.42	0.66	0.66	0.39	0.37	0.49	0.47	0.51	0.45	0.5	1.0	0.83	0.64	0.54	0.76	0.68	0.5	0.55	0.56	0.87	0.48	0.52	0.57	0.59	0.43	0.64	0.57	0.55
Lsat_1_v5_gn_4_143641.1	0.31	0.31	0.25	0.3	0.59	0.62	0.4	0.38	0.37	0.4	0.44	0.35	0.55	0.67	0.65	0.44	0.41	1.0	0.46	0.39	0.42	0.44	0.84	0.38	0.41	0.39	0.45	0.38	0.62	0.61	0.71
Lsat_1_v5_gn_4_163620.1	0.37	0.33	0.31	0.34	0.82	0.69	0.35	0.26	0.41	0.44	0.46	0.44	0.54	0.95	0.88	0.52	0.44	0.82	0.55	0.42	0.48	0.55	1.0	0.38	0.48	0.48	0.52	0.44	0.58	0.54	0.51
Lsat_1_v5_gn_4_6121.1	0.43	0.43	0.4	0.41	0.97	0.92	0.51	0.46	0.5	0.51	0.55	0.47	0.61	1.0	0.95	0.66	0.57	0.67	0.67	0.5	0.52	0.56	0.99	0.48	0.5	0.52	0.54	0.56	0.65	0.59	0.57
Lsat_1_v5_gn_4_85780.1	0.46	0.41	0.34	0.38	0.87	0.87	0.51	0.47	0.43	0.44	0.49	0.46	0.68	1.0	0.9	0.6	0.53	0.64	0.6	0.48	0.53	0.55	0.81	0.46	0.54	0.54	0.55	0.62	0.65	0.52	0.49
Lsat_1_v5_gn_5_104741.1 (ATFP8)	0.3	0.27	0.39	0.34	0.66	0.64	0.32	0.36	0.33	0.32	0.35	0.35	0.48	0.8	0.66	0.41	0.36	0.71	0.45	0.36	0.38	0.37	1.0	0.3	0.36	0.39	0.41	0.34	0.46	0.42	0.49
Lsat_1_v5_gn_5_118640.1 (ELK4)	0.23	0.18	0.18	0.2	0.78	0.86	0.22	0.14	0.28	0.25	0.29	0.27	0.6	0.81	0.77	0.51	0.39	0.68	0.45	0.35	0.4	0.39	1.0	0.35	0.39	0.42	0.42	0.4	0.4	0.35	0.43
Lsat_1_v5_gn_5_130241.1 (VATG3)	0.23	0.24	0.23	0.29	0.52	0.5	0.23	0.22	0.33	0.34	0.41	0.29	0.42	0.87	0.63	0.34	0.31	0.93	0.41	0.3	0.35	0.37	1.0	0.33	0.33	0.37	0.39	0.3	0.53	0.43	0.6
Lsat_1_v5_gn_5_137500.1 (EXO84B)	0.42	0.4	0.44	0.46	0.8	0.79	0.56	0.49	0.49	0.49	0.55	0.51	0.67	0.86	0.78	0.58	0.57	0.98	0.59	0.52	0.54	0.55	1.0	0.51	0.58	0.58	0.6	0.6	0.68	0.67	0.77
Lsat_1_v5_gn_5_169740.1	0.35	0.34	0.33	0.36	0.66	0.67	0.36	0.39	0.33	0.36	0.4	0.39	0.5	0.77	0.69	0.44	0.41	0.77	0.41	0.35	0.39	0.38	1.0	0.36	0.38	0.34	0.38	0.42	0.49	0.45	0.48
Lsat_1_v5_gn_5_177320.1 (UBC9)	0.67	0.58	0.52	0.55	0.83	0.8	0.56	0.6	0.52	0.52	0.58	0.53	0.71	1.0	0.95	0.63	0.57	0.66	0.65	0.58	0.62	0.6	0.9	0.56	0.58	0.62	0.62	0.64	0.66	0.62	0.58
Lsat_1_v5_gn_5_24460.1 (PK3)	0.21	0.26	0.25	0.3	0.55	0.5	0.23	0.23	0.35	0.33	0.39	0.34	0.44	0.72	0.6	0.4	0.33	0.79	0.38	0.31	0.33	0.33	1.0	0.32	0.35	0.37	0.38	0.26	0.51	0.46	0.64
Lsat_1_v5_gn_5_33620.1	0.44	0.43	0.39	0.4	0.78	0.94	0.54	0.5	0.48	0.44	0.5	0.43	0.62	1.0	0.89	0.63	0.52	0.61	0.62	0.48	0.53	0.58	0.93	0.52	0.53	0.51	0.56	0.5	0.63	0.58	0.58
Lsat_1_v5_gn_5_51901.1	0.44	0.48	0.41	0.45	0.85	0.79	0.55	0.6	0.47	0.52	0.55	0.5	0.62	0.72	0.68	0.6	0.61	0.85	0.61	0.5	0.52	0.6	1.0	0.53	0.54	0.62	0.66	0.61	0.62	0.63	0.63
Lsat_1_v5_gn_6_22680.1	0.28	0.27	0.31	0.28	0.6	0.64	0.39	0.31	0.42	0.37	0.47	0.43	0.76	0.9	0.75	0.59	0.47	0.6	0.47	0.46	0.45	0.49	1.0	0.48	0.51	0.48	0.48	0.46	0.6	0.5	0.8
Lsat_1_v5_gn_6_52901.1 (TUA3)	0.35	0.32	0.34	0.39	0.77	0.81	0.38	0.32	0.44	0.48	0.49	0.5	0.72	0.84	0.73	0.57	0.53	0.85	0.54	0.49	0.49	0.53	1.0	0.48	0.53	0.55	0.55	0.52	0.65	0.57	0.66
Lsat_1_v5_gn_6_5421.1	0.3	0.23	0.25	0.3	0.73	0.77	0.45	0.43	0.37	0.35	0.4	0.34	0.38	1.0	0.88	0.54	0.35	0.59	0.46	0.39	0.43	0.43	0.9	0.4	0.4	0.44	0.46	0.41	0.55	0.47	0.45
Lsat_1_v5_gn_6_57901.1 (ATB2)	0.3	0.3	0.23	0.28	0.97	0.8	0.36	0.35	0.32	0.37	0.42	0.43	0.53	0.64	0.61	0.53	0.47	0.91	0.59	0.42	0.45	0.46	1.0	0.43	0.45	0.45	0.48	0.57	0.57	0.59	0.63
Lsat_1_v5_gn_6_9400.1 (Hrd1A)	0.38	0.33	0.3	0.33	0.57	0.52	0.3	0.28	0.33	0.34	0.36	0.34	0.4	0.69	0.58	0.42	0.35	0.79	0.41	0.3	0.37	0.38	1.0	0.32	0.32	0.35	0.34	0.34	0.56	0.48	0.46
Lsat_1_v5_gn_7_12700.1 (VP2)	0.4	0.5	0.4	0.44	0.91	0.73	0.5	0.5	0.43	0.46	0.46	0.48	0.67	0.79	0.74	0.57	0.53	0.8	0.54	0.45	0.46	0.48	1.0	0.46	0.5	0.53	0.49	0.51	0.67	0.69	0.76
Lsat_1_v5_gn_7_12880.1 (ACAT2)	0.44	0.46	0.46	0.51	0.79	0.86	0.52	0.45	0.46	0.51	0.5	0.47	0.71	0.96	0.83	0.58	0.52	0.68	0.65	0.44	0.5	0.56	1.0	0.5	0.54	0.5	0.47	0.57	0.59	0.58	0.6
Lsat_1_v5_gn_7_19041.1 (CLC1)	0.43	0.43	0.39	0.42	0.68	0.75	0.49	0.49	0.48	0.48	0.55	0.55	0.7	0.96	0.81	0.67	0.62	1.0	0.62	0.56	0.59	0.6	0.86	0.55	0.6	0.64	0.63	0.55	0.75	0.66	0.78
Lsat_1_v5_gn_7_24321.1 (SK21)	0.37	0.33	0.38	0.46	0.62	0.61	0.39	0.36	0.43	0.45	0.47	0.49	0.64	0.9	0.8	0.6	0.52	0.96	0.53	0.49	0.48	0.54	1.0	0.45	0.54	0.59	0.56	0.53	0.55	0.56	0.68
Lsat_1_v5_gn_7_54680.1 (KOR)	0.34	0.26	0.32	0.23	0.68	0.75	0.3	0.21	0.36	0.34	0.39	0.35	0.75	0.73	0.76	0.6	0.47	0.66	0.49	0.4	0.46	0.5	1.0	0.51	0.47	0.49	0.52	0.36	0.56	0.56	0.9
Lsat_1_v5_gn_7_65181.1 (SUN2)	0.41	0.41	0.37	0.41	0.79	0.73	0.48	0.47	0.44	0.48	0.43	0.47	0.65	0.68	0.71	0.56	0.54	0.85	0.53	0.47	0.46	0.51	1.0	0.46	0.48	0.48	0.5	0.49	0.63	0.6	0.75
Lsat_1_v5_gn_7_84001.1	0.41	0.41	0.43	0.39	0.73	0.74	0.52	0.52	0.47	0.45	0.46	0.46	0.61	0.81	0.78	0.59	0.52	0.97	0.62	0.51	0.47	0.55	1.0	0.48	0.55	0.48	0.53	0.5	0.65	0.63	0.81
Lsat_1_v5_gn_8_112480.1 (AtEH2)	0.43	0.52	0.46	0.52	0.71	0.62	0.43	0.41	0.49	0.51	0.56	0.52	0.67	0.84	0.76	0.63	0.57	0.99	0.59	0.49	0.52	0.54	1.0	0.47	0.51	0.57	0.56	0.48	0.68	0.65	0.74
Lsat_1_v5_gn_8_24101.1	0.39	0.43	0.38	0.44	0.79	0.79	0.56	0.46	0.49	0.56	0.49	0.47	0.52	0.89	0.79	0.6	0.59	0.76	0.55	0.51	0.55	0.64	1.0	0.48	0.58	0.61	0.54	0.54	0.69	0.65	0.74
Lsat_1_v5_gn_8_25680.1	0.3	0.38	0.31	0.36	0.79	0.68	0.47	0.4	0.44	0.44	0.43	0.48	0.57	0.64	0.57	0.52	0.47	0.69	0.55	0.4	0.51	0.57	1.0	0.43	0.46	0.5	0.5	0.53	0.58	0.57	0.73
Lsat_1_v5_gn_8_3160.1 (RGP5)	0.33	0.36	0.29	0.28	0.64	0.58	0.32	0.26	0.4	0.43	0.47	0.45	0.74	0.73	0.67	0.52	0.5	0.76	0.52	0.48	0.43	0.41	1.0	0.48	0.44	0.46	0.49	0.45	0.54	0.61	0.74
Lsat_1_v5_gn_8_4640.1 (PGL3)	0.33	0.32	0.28	0.28	0.7	0.62	0.3	0.24	0.32	0.33	0.38	0.37	0.86	0.84	0.69	0.48	0.47	0.82	0.49	0.43	0.39	0.43	1.0	0.46	0.41	0.37	0.41	0.43	0.43	0.43	0.84
Lsat_1_v5_gn_9_88440.1 (CSN6A)	0.55	0.53	0.48	0.57	0.73	0.81	0.57	0.62	0.56	0.56	0.61	0.64	0.87	0.8	0.81	0.67	0.65	0.86	0.65	0.6	0.63	0.64	1.0	0.64	0.68	0.63	0.6	0.71	0.75	0.74	0.85

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)