Heatmap: Cluster_186 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_47721.1	-0.82	-0.69	-0.81	-0.5	0.21	0.29	-0.39	-0.63	-0.2	-0.16	-0.18	-0.23	0.35	0.83	0.6	0.12	-0.09	0.05	-0.06	-0.27	-0.12	-0.09	0.28	-0.05	0.09	-0.03	-0.1	-0.17	0.39	0.14	0.6
Lsat_1_v5_gn_0_9540.1	-0.84	-0.52	-0.88	-0.47	0.26	0.47	-0.11	-0.3	-0.16	-0.08	-0.04	0.07	0.04	0.47	0.35	0.15	0.03	0.19	0.13	-0.07	-0.06	0.01	0.35	-0.24	-0.08	0.1	0.13	-0.01	0.06	-0.03	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_2380.1 (AFB4)	-1.2	-1.41	-0.81	-0.6	0.19	0.47	0.05	-0.25	-0.0	-0.06	-0.01	-0.14	-0.14	0.57	0.58	0.14	-0.01	0.01	0.12	-0.03	-0.08	-0.04	0.5	-0.23	-0.11	0.01	0.06	-0.13	0.23	0.1	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_26441.1 (WSS1A)	-0.48	-0.58	-0.35	-0.18	0.21	0.14	-0.23	-0.36	-0.02	-0.01	0.04	0.04	0.07	0.26	0.14	0.08	-0.08	0.05	-0.04	-0.11	-0.38	-0.0	0.43	-0.16	-0.27	-0.1	-0.17	-0.07	0.25	0.42	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_36380.1 (DOF1)	-0.51	-0.57	-1.16	-1.05	0.31	0.28	-0.06	-0.33	-0.25	-0.32	-0.31	-0.31	-0.07	1.17	0.93	0.04	-0.11	-0.25	0.31	-0.16	-0.44	-0.18	0.17	-0.35	-0.35	-0.15	-0.27	-0.46	0.48	0.61	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_59860.1 (TUA1)	-1.43	-1.26	-1.29	-0.75	0.42	0.63	0.24	-0.47	0.05	-0.11	-0.19	-0.29	-0.75	0.78	0.63	0.38	-0.24	-0.11	0.08	-0.27	-0.25	0.13	0.88	-0.36	-0.28	-0.25	-0.04	-0.62	0.51	0.25	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_65160.1	-1.07	-1.03	-0.76	-0.57	0.12	-0.04	-0.3	-0.45	-0.11	0.1	0.21	0.15	0.34	0.8	0.78	0.03	0.03	0.18	-0.07	-0.07	-0.37	-0.2	0.05	-0.07	-0.15	-0.16	-0.18	-0.3	0.1	0.29	0.74
Lsat_1_v5_gn_1_72041.1	-1.4	-1.08	-0.94	-0.61	0.32	0.27	-0.4	-0.55	-0.24	-0.11	0.02	0.03	0.19	0.98	0.65	0.08	-0.14	0.09	0.13	-0.34	-0.28	-0.13	0.77	-0.35	-0.34	-0.08	-0.01	-0.56	0.46	0.34	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_128800.1	-1.17	-0.85	-0.97	-0.85	0.05	0.44	-0.24	-0.12	-0.37	-0.25	0.02	-0.13	0.25	0.95	0.68	0.32	-0.14	0.32	0.15	-0.3	-0.3	-0.05	-0.1	-0.13	-0.15	-0.01	0.1	-0.2	0.26	0.3	0.37
Lsat_1_v5_gn_2_76460.1 (PUB5)	-0.22	-0.09	-0.19	-0.2	0.73	0.48	-0.01	-0.17	-0.04	0.0	-0.05	-0.16	-0.32	0.63	0.43	0.03	-0.16	-0.86	-0.1	-0.27	-0.27	-0.08	0.1	-0.31	-0.16	-0.08	-0.04	-0.2	0.17	0.18	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_118161.1	-0.66	-0.69	-0.75	-0.42	0.45	0.52	0.03	-0.28	-0.11	0.04	0.1	-0.07	-0.28	0.62	0.33	0.02	-0.2	-0.64	-0.01	-0.35	-0.18	-0.0	0.37	-0.2	-0.18	-0.03	0.0	-0.33	0.42	0.43	0.54
Lsat_1_v5_gn_3_120800.1 (NDR1)	-1.51	-1.51	-1.27	-0.29	0.34	0.09	-0.79	-0.35	-0.29	-0.15	-0.27	-0.07	0.16	0.97	0.65	0.15	-0.1	0.49	-0.29	-0.41	-0.04	-0.08	0.66	-0.02	-0.15	0.1	0.03	-0.14	0.3	0.17	0.55
Lsat_1_v5_gn_3_138481.1 (ABIL1)	-0.94	-0.73	-1.13	-0.68	-0.05	0.07	-0.29	-0.18	-0.22	-0.03	-0.05	0.01	0.02	0.91	0.88	0.18	0.06	-0.41	0.34	-0.02	-0.19	-0.13	0.32	-0.13	-0.11	-0.2	-0.12	-0.43	0.41	0.39	0.4
Lsat_1_v5_gn_3_18021.1 (KAN2)	-1.83	-1.2	-2.21	-1.66	-0.16	0.36	-0.17	-0.17	-0.1	-0.11	-0.04	-0.39	0.17	0.98	0.92	0.46	0.12	-0.13	0.15	-0.0	-0.15	0.03	0.2	-0.2	-0.12	-0.06	-0.1	-0.26	0.46	0.34	0.58
Lsat_1_v5_gn_3_47821.1	-0.93	-0.72	-0.78	-0.6	-0.01	0.16	-0.22	-0.43	-0.2	-0.01	0.0	-0.01	-0.12	0.89	0.65	0.17	0.19	0.1	0.1	-0.11	-0.15	-0.15	0.81	-0.24	-0.17	0.09	0.01	-0.21	-0.1	-0.03	0.31
Lsat_1_v5_gn_3_99781.1 (KIN10)	-1.39	-1.55	-1.52	-0.82	0.6	0.55	0.02	-0.03	0.21	-0.02	0.07	-0.15	-0.31	0.66	0.79	-0.12	-0.52	-0.28	-0.13	-0.19	-0.36	-0.29	0.77	-0.1	-0.12	-0.26	-0.3	-0.59	0.56	0.44	0.7
Lsat_1_v5_gn_4_108960.1	-0.94	-0.69	-0.81	-0.2	0.49	0.31	-0.7	-1.17	0.13	0.06	0.39	0.1	-0.37	0.37	0.36	-0.0	-0.11	0.28	-0.13	-0.17	-0.15	-0.14	0.56	-0.07	-0.09	0.02	0.06	-0.2	0.23	0.27	0.5
Lsat_1_v5_gn_4_148140.1	-0.89	-0.5	-0.31	-0.04	0.52	0.68	-0.22	-0.21	-0.03	-0.16	-0.01	-0.48	-0.6	1.08	0.48	0.25	-0.14	-0.95	-0.03	-0.63	-0.5	-0.24	0.46	-0.46	-0.29	-0.11	0.01	-0.98	0.54	0.62	0.4
Lsat_1_v5_gn_4_15320.1	-1.2	-1.07	-1.09	-0.26	0.3	0.2	-0.61	-1.23	-0.15	-0.13	0.03	0.29	0.17	0.82	0.57	0.12	-0.22	0.73	-0.03	-0.2	-0.19	-0.15	0.38	-0.29	-0.22	-0.04	-0.03	-0.41	0.25	0.1	0.77
Lsat_1_v5_gn_5_128721.1 (CTL09)	-0.66	-0.87	-0.78	-0.19	0.53	0.36	-0.59	-0.79	-0.01	0.02	0.04	-0.11	-0.21	0.55	0.52	-0.15	-0.41	-0.03	-0.02	-0.16	-0.06	-0.12	0.97	-0.18	-0.26	-0.11	-0.09	-0.3	0.34	0.27	0.53
Lsat_1_v5_gn_5_158661.1	-1.46	-2.1	-1.56	-1.02	0.46	0.31	-0.85	-1.17	-0.09	-0.07	0.21	-0.1	-0.19	1.01	0.76	0.22	-0.03	-0.13	0.17	-0.14	-0.03	0.06	0.88	-0.29	-0.06	0.0	0.08	-0.29	0.18	0.16	0.62
Lsat_1_v5_gn_5_24060.1 (PCO3)	-0.38	-0.32	-0.36	-0.26	0.38	0.24	-0.33	0.13	-0.07	-0.26	0.01	-0.04	-0.49	0.61	0.42	-0.0	-0.47	-0.44	0.16	-0.27	-0.18	-0.15	0.7	-0.16	-0.28	-0.03	-0.11	-0.38	0.33	0.31	0.5
Lsat_1_v5_gn_5_24240.1	-0.91	-1.1	-1.28	-0.69	0.07	0.23	-0.41	-0.46	-0.13	-0.03	0.03	-0.2	0.29	0.71	0.56	0.21	-0.05	-0.06	0.06	-0.25	-0.09	0.03	0.52	-0.04	0.03	-0.07	-0.0	-0.24	0.29	0.4	0.52
Lsat_1_v5_gn_5_67200.1 (AtSEC23G)	-1.18	-0.81	-0.75	-0.34	0.31	0.32	-0.45	-0.76	-0.09	-0.03	0.08	-0.01	-0.06	0.49	0.37	0.01	-0.05	0.54	0.01	-0.09	-0.19	0.02	0.5	-0.15	-0.09	0.08	-0.03	-0.33	0.24	0.27	0.49
Lsat_1_v5_gn_5_76821.1 (DSPTP1)	-0.49	-0.44	-0.39	-0.06	0.48	0.32	-0.36	-0.15	0.28	0.11	0.16	-0.06	-0.46	0.64	0.31	-0.08	-0.02	-0.38	-0.34	-0.23	-0.28	-0.11	0.66	-0.47	-0.28	-0.06	-0.09	-0.18	0.22	0.23	0.34
Lsat_1_v5_gn_5_93901.1	-0.95	-0.95	-0.75	-0.63	0.09	0.12	-0.45	-0.28	-0.24	-0.28	-0.18	-0.32	0.07	0.76	0.79	0.16	-0.1	0.39	-0.02	-0.14	-0.11	-0.17	0.34	-0.18	-0.14	-0.21	-0.18	-0.37	0.48	0.59	0.71
Lsat_1_v5_gn_6_111560.1	-0.66	-0.65	-0.95	-0.63	-0.09	0.24	-0.26	-0.35	-0.14	-0.31	-0.24	-0.24	0.13	0.59	0.52	0.14	0.02	-0.17	0.45	0.24	0.13	0.19	-0.3	0.09	0.17	0.29	0.34	-0.08	0.05	0.03	0.16
Lsat_1_v5_gn_6_12600.1 (PRLIP9)	-1.09	-0.97	-1.15	-0.64	0.36	0.16	-0.42	-0.39	0.07	-0.14	0.25	0.16	0.2	0.4	0.38	0.11	0.02	-0.24	0.37	-0.21	-0.15	-0.08	0.67	-0.2	-0.31	0.07	0.1	-0.24	0.16	0.31	0.52
Lsat_1_v5_gn_6_15860.1 (TLP3)	-0.55	-0.5	-0.47	-0.45	0.19	0.41	0.08	-0.06	-0.17	-0.03	-0.04	-0.19	0.01	0.51	0.37	0.1	0.07	-0.31	0.09	-0.25	-0.16	-0.02	0.19	-0.28	-0.11	-0.06	0.06	-0.17	0.35	0.19	0.38
Lsat_1_v5_gn_6_30041.1 (IMPA-9)	-0.6	-0.56	-1.1	-0.88	0.76	0.45	-0.95	-0.98	0.15	0.01	0.12	-0.24	0.28	0.57	0.48	-0.1	-0.2	-0.35	0.07	-0.09	-0.06	0.04	1.01	-0.14	-0.23	-0.24	0.05	-0.16	-0.07	-0.1	0.51
Lsat_1_v5_gn_6_44060.1 (FUC1)	-0.52	-0.49	-0.58	-0.46	0.36	0.18	-0.29	-0.5	-0.14	0.02	0.04	-0.03	-0.0	0.19	0.24	0.13	-0.04	0.12	-0.03	-0.05	-0.0	-0.06	0.3	-0.19	-0.11	-0.0	-0.08	-0.14	0.38	0.34	0.58
Lsat_1_v5_gn_6_52400.1	-0.53	-0.8	-0.67	-0.69	-0.18	0.18	-0.29	-0.25	-0.31	-0.42	0.0	-0.1	0.16	0.56	0.49	0.5	0.14	-0.38	0.16	0.0	-0.05	-0.08	0.22	0.05	-0.01	0.02	-0.12	-0.08	0.32	0.13	0.68
Lsat_1_v5_gn_6_56321.1 (RPC14)	-3.23	-2.5	-3.17	-2.2	1.02	0.69	-0.7	-1.65	-0.32	0.1	0.32	-0.15	-0.92	0.6	0.4	0.05	-0.23	0.17	0.05	0.02	-0.21	-0.11	1.12	-0.29	-0.19	-0.07	0.27	-1.14	0.28	0.51	1.3
Lsat_1_v5_gn_6_8380.1	-0.46	-0.46	-0.51	-0.08	0.44	0.22	-0.27	-0.54	-0.03	-0.06	-0.08	-0.14	-0.04	0.64	0.48	-0.04	-0.23	-0.24	0.1	-0.3	-0.32	-0.27	0.99	-0.3	-0.18	-0.1	-0.13	-0.23	0.12	0.2	0.42
Lsat_1_v5_gn_6_85360.1	-1.64	-1.72	-1.0	-1.21	-0.02	-0.31	-0.53	-0.09	0.08	-0.08	0.28	0.01	-0.15	1.07	0.94	0.3	0.3	0.29	-0.34	-0.2	-0.22	-0.41	0.23	-0.18	-0.04	-0.3	0.21	-0.88	0.12	0.1	1.15
Lsat_1_v5_gn_6_90960.1	-0.82	-0.59	-0.77	-0.31	0.3	0.23	-0.52	-0.9	-0.01	0.1	0.08	-0.04	-0.2	0.79	0.46	0.11	-0.14	0.07	0.02	-0.17	-0.23	-0.17	0.52	-0.28	-0.08	-0.17	-0.12	-0.43	0.34	0.41	0.71
Lsat_1_v5_gn_7_10760.1	-0.84	-0.38	-0.66	-0.7	0.14	0.3	-0.16	-0.2	-0.21	-0.24	0.02	-0.08	0.17	0.54	0.56	0.26	0.19	-0.31	0.11	-0.14	0.0	-0.03	0.24	-0.24	-0.02	-0.13	0.07	-0.25	0.15	0.21	0.5
Lsat_1_v5_gn_7_14601.1 (SDRA)	-0.19	-0.55	-0.59	-0.54	0.29	0.25	-0.53	-0.49	-0.02	0.0	0.13	-0.04	0.08	0.49	0.46	0.18	-0.11	-0.22	-0.11	-0.06	-0.04	0.04	0.61	-0.18	0.11	0.06	-0.02	-0.18	-0.04	0.03	0.24
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.