Heatmap: Cluster_186 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
3.35 3.65 3.37 4.17 6.79 7.22 4.49 3.8 5.11 5.26 5.18 5.01 7.48 10.47 8.94 6.39 5.52 6.12 5.66 4.87 5.41 5.52 7.14 5.67 6.28 5.78 5.49 5.23 7.72 6.51 8.96
7.96 9.91 7.75 10.29 17.02 19.74 13.23 11.58 12.74 13.53 13.89 14.99 14.61 19.77 18.19 15.8 14.54 16.29 15.64 13.55 13.66 14.38 18.18 12.06 13.45 15.32 15.6 14.15 14.87 13.97 15.25
7.39 6.42 9.69 11.23 19.41 23.64 17.66 14.36 16.99 16.3 16.93 15.41 15.48 25.27 25.39 18.81 16.91 17.1 18.51 16.68 16.14 16.58 24.15 14.51 15.82 17.11 17.76 15.58 19.97 18.24 22.58
2.55 2.36 2.79 3.13 4.12 3.92 3.03 2.76 3.5 3.52 3.64 3.65 3.73 4.25 3.91 3.75 3.36 3.67 3.44 3.28 2.72 3.54 4.79 3.18 2.95 3.3 3.15 3.37 4.23 4.76 5.6
2.81 2.69 1.79 1.93 4.94 4.84 3.82 3.18 3.35 3.19 3.23 3.21 3.8 8.98 7.59 4.1 3.71 3.36 4.94 3.57 2.94 3.52 4.49 3.13 3.12 3.61 3.31 2.91 5.56 6.11 6.03
0.94 1.06 1.04 1.51 3.4 3.91 3.0 1.83 2.63 2.34 2.22 2.07 1.51 4.35 3.93 3.31 2.15 2.35 2.68 2.1 2.13 2.78 4.67 1.98 2.09 2.13 2.46 1.65 3.61 3.02 3.75
2.94 3.02 3.65 4.16 6.71 6.03 5.02 4.53 5.73 6.61 7.13 6.87 7.84 10.75 10.65 6.31 6.31 7.03 5.88 5.91 4.79 5.39 6.42 5.87 5.58 5.53 5.47 5.04 6.65 7.57 10.32
0.92 1.14 1.26 1.58 3.0 2.91 1.82 1.65 2.05 2.23 2.45 2.46 2.76 4.75 3.79 2.55 2.18 2.56 2.64 1.91 1.98 2.2 4.1 1.89 1.91 2.28 2.39 1.63 3.32 3.05 3.37
5.22 6.49 5.99 6.52 12.14 15.87 9.9 10.76 9.1 9.87 11.92 10.72 13.95 22.64 18.73 14.67 10.61 14.59 13.04 9.54 9.53 11.34 10.97 10.74 10.57 11.68 12.52 10.19 14.03 14.39 15.11
9.12 9.97 9.33 9.25 17.59 14.87 10.59 9.42 10.33 10.64 10.29 9.52 8.49 16.42 14.34 10.87 9.51 5.85 9.9 8.82 8.8 10.09 11.41 8.58 9.52 10.06 10.35 9.28 11.96 12.05 12.53
2.54 2.48 2.38 2.99 5.46 5.75 4.08 3.29 3.7 4.12 4.27 3.81 3.29 6.13 5.02 4.05 3.47 2.57 3.96 3.14 3.54 3.99 5.18 3.49 3.54 3.91 4.01 3.18 5.36 5.39 5.83
2.57 2.58 3.03 5.99 9.26 7.81 4.22 5.74 5.99 6.59 6.07 6.99 8.15 14.39 11.48 8.14 6.83 10.29 5.99 5.51 7.12 6.92 11.57 7.22 6.59 7.85 7.46 6.67 9.02 8.26 10.74
2.93 3.38 2.57 3.51 5.45 5.91 4.59 4.97 4.82 5.5 5.42 5.65 5.69 10.54 10.34 6.38 5.86 4.24 7.12 5.55 4.92 5.14 7.04 5.15 5.21 4.91 5.17 4.17 7.46 7.36 7.43
2.81 4.33 2.15 3.15 8.94 12.77 8.86 8.84 9.3 9.28 9.72 7.63 11.2 19.69 18.83 13.76 10.88 9.15 11.08 9.97 8.98 10.19 11.49 8.7 9.21 9.59 9.33 8.32 13.72 12.63 14.96
3.84 4.44 4.27 4.82 7.26 8.18 6.29 5.45 6.4 7.25 7.34 7.29 6.75 13.55 11.52 8.23 8.37 7.84 7.87 6.8 6.61 6.59 12.88 6.21 6.5 7.79 7.36 6.31 6.82 7.16 9.07
4.27 3.84 3.91 6.34 16.98 16.42 11.39 10.96 13.0 11.09 11.82 10.14 9.08 17.78 19.34 10.31 7.81 9.25 10.25 9.87 8.76 9.2 19.13 10.5 10.33 9.36 9.14 7.47 16.55 15.19 18.28
4.93 5.86 5.4 8.23 13.31 11.68 5.83 4.2 10.36 9.84 12.4 10.11 7.31 12.17 12.12 9.42 8.74 11.45 8.66 8.42 8.51 8.55 13.93 9.02 8.9 9.61 9.87 8.22 11.06 11.38 13.38
1.18 1.54 1.77 2.13 3.13 3.5 1.87 1.88 2.14 1.96 2.17 1.57 1.45 4.62 3.04 2.6 1.98 1.13 2.14 1.41 1.55 1.84 3.0 1.59 1.79 2.02 2.21 1.11 3.17 3.35 2.88
1.49 1.63 1.61 2.85 4.22 3.92 2.24 1.46 3.08 3.11 3.48 4.18 3.85 6.03 5.06 3.72 2.93 5.67 3.34 2.97 2.99 3.09 4.46 2.8 2.94 3.33 3.34 2.57 4.06 3.67 5.85
10.23 8.82 9.38 14.13 23.3 20.68 10.74 9.29 16.01 16.4 16.53 14.89 13.91 23.68 23.19 14.53 12.14 15.82 15.93 14.42 15.46 14.83 31.48 14.23 13.44 14.89 15.11 13.08 20.46 19.49 23.24
3.06 1.96 2.86 4.15 11.59 10.46 4.67 3.75 7.9 8.04 9.72 7.84 7.39 16.96 14.28 9.79 8.23 7.72 9.51 7.65 8.28 8.8 15.53 6.91 8.1 8.43 8.92 6.89 9.53 9.4 12.98
11.59 12.03 11.74 12.54 19.59 17.75 12.02 16.52 14.35 12.6 15.17 14.63 10.73 22.93 20.13 15.05 10.88 11.08 16.86 12.53 13.27 13.6 24.5 13.48 12.43 14.72 13.97 11.59 18.9 18.66 21.26
3.41 3.0 2.63 3.97 6.73 7.52 4.81 4.66 5.86 6.29 6.54 5.58 7.85 10.46 9.46 7.44 6.18 6.15 6.68 5.4 6.03 6.56 9.22 6.22 6.53 6.11 6.39 5.41 7.85 8.48 9.21
2.42 3.14 3.25 4.35 6.8 6.87 4.02 3.25 5.14 5.38 5.79 5.45 5.28 7.73 7.1 5.54 5.3 7.99 5.53 5.14 4.8 5.55 7.78 4.96 5.15 5.82 5.39 4.35 6.49 6.62 7.7
19.29 19.97 20.72 25.98 37.99 33.86 21.2 24.46 32.91 29.35 30.25 26.05 19.71 42.43 33.74 25.64 26.83 20.88 21.51 23.11 22.37 25.14 43.04 19.63 22.43 26.07 25.5 23.96 31.55 31.9 34.38
2.29 2.29 2.63 2.87 4.72 4.82 3.23 3.64 3.76 3.65 3.9 3.55 4.65 7.52 7.67 4.95 4.13 5.82 4.36 4.01 4.1 3.94 5.61 3.92 4.02 3.84 3.91 3.44 6.16 6.66 7.24
136.47 137.01 111.4 139.43 201.56 254.69 179.13 168.58 195.87 173.91 182.65 182.2 235.66 323.34 307.6 237.84 217.53 191.01 293.34 254.92 235.12 245.09 174.92 228.38 241.58 263.15 271.68 203.64 223.26 219.45 241.03
1.9 2.06 1.81 2.59 5.15 4.5 3.01 3.07 4.23 3.67 4.8 4.51 4.63 5.32 5.23 4.36 4.09 3.41 5.19 3.49 3.62 3.82 6.39 3.51 3.26 4.24 4.32 3.41 4.51 4.98 5.76
5.39 5.58 5.72 5.8 9.02 10.51 8.35 7.57 7.04 7.74 7.7 6.91 7.96 11.24 10.24 8.49 8.27 6.38 8.43 6.66 7.09 7.81 9.01 6.52 7.32 7.57 8.26 7.02 10.11 9.0 10.31
2.22 2.28 1.57 1.82 5.67 4.57 1.74 1.7 3.73 3.38 3.64 2.84 4.07 4.98 4.68 3.13 2.91 2.62 3.53 3.15 3.21 3.46 6.75 3.05 2.87 2.83 3.48 3.0 3.2 3.14 4.78
4.5 4.6 4.34 4.69 8.27 7.3 5.28 4.57 5.87 6.57 6.65 6.35 6.45 7.38 7.63 7.06 6.3 7.03 6.34 6.24 6.46 6.21 7.98 5.66 6.0 6.45 6.13 5.85 8.38 8.21 9.69
3.18 2.65 2.89 2.85 4.06 5.21 3.77 3.87 3.73 3.44 4.61 4.29 5.14 6.77 6.47 6.52 5.07 3.53 5.14 4.62 4.46 4.36 5.38 4.76 4.57 4.66 4.25 4.36 5.74 5.04 7.36
0.14 0.24 0.15 0.29 2.74 2.19 0.83 0.43 1.08 1.46 1.7 1.22 0.72 2.05 1.79 1.4 1.15 1.53 1.4 1.38 1.17 1.26 2.94 1.11 1.19 1.29 1.64 0.62 1.65 1.94 3.33
2.59 2.59 2.49 3.37 4.83 4.16 2.95 2.46 3.5 3.42 3.38 3.24 3.46 5.56 4.96 3.47 3.04 3.01 3.81 2.9 2.85 2.96 7.06 2.9 3.15 3.33 3.26 3.03 3.89 4.1 4.78
3.84 3.64 5.98 5.16 11.8 9.67 8.25 11.25 12.63 11.31 14.49 12.07 10.8 25.04 22.97 14.75 14.67 14.66 9.47 10.4 10.24 8.99 14.06 10.52 11.59 9.72 13.81 6.52 12.98 12.82 26.46
1.72 2.01 1.78 2.44 3.72 3.55 2.11 1.62 3.02 3.24 3.2 2.95 2.64 5.23 4.17 3.26 2.74 3.18 3.08 2.7 2.57 2.68 4.34 2.49 2.86 2.7 2.79 2.25 3.85 4.02 4.97
3.92 5.37 4.44 4.33 7.74 8.63 6.25 6.09 6.04 5.93 7.11 6.62 7.87 10.17 10.31 8.41 7.98 5.67 7.55 6.35 7.03 6.88 8.26 5.94 6.91 6.41 7.35 5.88 7.78 8.12 9.91
13.56 10.59 10.29 10.69 19.01 18.38 10.7 11.01 15.26 15.55 16.96 15.02 16.43 21.84 21.28 17.55 14.31 13.32 14.37 14.9 15.09 15.96 23.71 13.64 16.75 16.18 15.32 13.71 15.07 15.78 18.27
4.16 4.33 3.31 3.72 6.94 6.55 4.01 3.79 5.25 4.16 6.5 5.37 6.35 12.99 11.2 6.15 5.5 6.14 6.54 5.15 5.23 5.32 12.94 4.64 6.24 5.03 6.17 4.57 5.26 6.29 7.75
9.92 8.53 9.84 9.67 13.83 15.79 12.14 10.6 12.2 11.86 12.19 11.92 11.06 20.45 17.29 14.32 12.05 8.99 13.24 11.86 10.83 12.01 16.37 10.79 10.88 11.55 11.84 10.18 14.57 16.02 16.39
1.51 2.01 1.55 1.8 3.74 3.49 2.48 2.03 2.54 2.58 2.81 2.46 2.87 5.03 4.19 3.37 2.63 2.83 3.09 2.69 2.48 2.66 5.32 2.37 2.41 2.57 2.89 2.46 3.62 3.94 4.32
0.9 0.39 0.93 1.35 4.2 2.96 2.08 1.78 3.17 3.17 3.57 3.27 3.27 7.05 8.82 4.23 3.65 3.71 3.17 3.68 2.93 2.63 3.86 3.4 3.22 2.76 3.12 2.66 3.42 4.14 7.85
20.21 25.37 19.77 34.23 60.56 52.46 43.07 44.86 48.49 47.45 50.74 45.05 26.81 75.31 61.6 36.49 33.23 24.84 41.16 34.57 38.83 39.03 52.98 40.03 39.37 40.62 41.59 34.44 64.92 57.53 52.91
1.49 1.82 1.83 2.29 3.91 3.5 2.29 2.19 2.68 2.54 2.68 2.66 2.48 4.31 4.23 2.5 2.11 3.06 2.63 2.24 2.05 2.68 3.58 1.94 2.06 2.54 2.45 2.24 3.38 3.45 3.95
19.04 17.92 18.31 15.8 26.89 27.56 16.7 15.18 19.05 18.66 22.92 19.58 25.65 41.16 36.44 23.11 20.54 20.22 29.13 21.24 19.9 21.0 43.62 22.78 21.28 21.03 20.81 20.06 23.58 24.84 30.42
0.97 1.26 1.18 1.44 2.2 2.05 0.81 0.92 1.71 1.67 1.92 1.85 2.67 3.84 4.16 1.92 1.64 1.85 1.73 1.51 1.57 1.33 2.49 1.3 1.61 1.36 1.31 1.33 1.61 1.52 3.67
6.52 6.56 8.3 10.09 15.9 18.76 11.23 10.34 15.51 15.86 16.3 12.9 21.66 26.41 24.76 20.71 13.49 17.92 17.82 13.14 12.92 13.25 29.13 12.06 13.68 13.46 12.97 8.87 17.93 18.23 27.49
12.27 13.07 15.71 15.76 25.87 24.99 15.38 15.71 20.77 22.25 20.25 20.85 20.87 36.01 33.13 23.91 20.52 23.92 20.56 21.37 19.12 20.01 35.27 20.21 20.38 21.93 23.54 19.66 27.26 25.94 27.64
0.78 0.84 0.85 1.71 3.14 2.46 1.02 1.07 2.17 2.37 2.85 2.63 2.18 3.17 2.91 1.9 2.08 1.7 2.6 2.14 2.1 1.96 4.45 2.22 1.75 2.05 1.95 1.5 2.59 2.47 3.95
3.42 2.83 3.86 4.26 5.67 4.46 3.58 3.49 5.91 6.71 6.07 6.24 5.66 10.53 9.72 5.83 6.04 6.68 5.96 5.81 5.46 4.93 6.3 6.42 5.34 5.17 5.22 4.07 6.08 7.63 11.97
3.3 3.61 2.83 3.75 6.93 6.83 4.57 4.31 4.84 4.42 5.02 4.81 3.35 6.9 6.23 5.02 4.28 1.17 3.88 3.54 3.97 4.44 5.72 3.69 4.14 4.41 4.6 3.65 5.97 5.83 6.5
83.95 98.59 99.29 135.81 272.38 260.26 188.96 170.58 210.1 215.0 216.26 183.47 139.95 402.16 371.61 219.41 183.13 248.54 277.23 191.52 187.12 200.13 275.09 168.84 189.52 203.68 210.25 145.65 325.95 291.71 336.91
376.76 431.12 466.73 589.48 1358.77 1348.5 966.26 934.6 986.31 1058.35 917.8 763.57 641.51 1854.61 1513.85 872.55 797.65 1309.92 1241.3 929.81 882.12 1021.14 1337.69 797.71 913.38 996.64 1044.71 688.31 1528.62 1352.49 1458.68
0.53 0.88 0.76 1.13 5.33 4.92 1.36 0.89 2.95 2.94 3.64 3.27 1.89 3.94 4.31 2.77 1.82 4.33 3.45 2.83 2.36 2.72 4.17 1.92 1.72 2.82 2.67 1.72 3.46 3.81 5.95
29.66 25.39 25.25 31.23 62.73 58.15 38.29 38.59 43.57 42.37 47.98 41.82 35.37 68.89 63.67 43.16 42.14 51.93 37.06 42.48 45.56 50.24 72.64 44.39 43.95 51.63 49.39 39.27 52.37 50.35 53.63
7.87 6.44 5.85 5.47 10.41 10.28 6.31 6.73 8.05 8.03 8.52 7.55 8.67 14.67 13.15 9.05 7.04 9.72 9.8 8.11 8.05 8.55 16.26 8.67 7.89 8.47 8.32 6.53 9.79 9.76 12.06
4.42 4.58 3.84 5.55 11.88 12.75 8.39 7.34 9.21 8.44 10.8 8.41 9.31 16.99 14.87 10.46 9.21 9.86 13.22 8.3 9.53 10.59 11.13 9.08 9.02 9.93 10.24 7.87 12.32 12.03 15.35
4.05 5.12 5.23 5.74 8.79 9.12 6.49 7.14 8.6 7.33 9.32 8.72 13.81 14.47 14.0 11.58 10.33 8.6 8.47 7.79 7.54 7.45 13.87 9.33 9.64 8.19 9.57 6.78 10.98 10.73 15.61
10.74 10.91 9.17 11.95 16.09 16.37 12.98 14.0 15.99 16.19 18.38 17.66 23.0 23.6 21.36 20.42 18.97 18.89 15.53 14.45 16.62 16.82 23.71 15.38 17.81 16.84 17.79 16.08 19.82 18.73 22.86
3.71 3.6 4.72 6.06 11.6 11.21 7.25 5.51 9.7 8.64 8.45 8.4 8.49 13.0 13.23 8.4 7.25 10.11 8.92 7.4 7.38 7.39 13.63 7.39 7.35 7.83 8.36 6.69 11.1 10.47 12.44
1.21 1.3 2.05 3.38 13.49 12.94 6.62 4.48 7.48 8.77 8.31 6.87 7.13 9.24 10.42 7.37 6.97 8.07 7.33 8.86 7.14 8.12 14.11 5.27 7.34 7.59 8.1 6.04 8.6 8.4 15.76
2.14 1.51 2.09 3.32 7.24 7.07 3.72 2.75 4.48 4.61 4.17 3.99 4.06 7.44 6.76 4.12 3.44 5.96 5.63 4.61 4.15 4.72 7.51 4.67 4.67 4.09 4.38 3.64 5.18 5.04 5.23
7.77 7.94 6.44 11.32 16.19 18.36 10.46 9.31 13.17 12.86 14.16 13.19 18.2 26.13 25.97 17.61 13.58 15.66 14.5 13.16 11.94 15.96 15.37 12.93 13.97 14.43 13.53 12.9 19.65 19.16 23.66
3.81 4.15 4.67 5.34 9.61 12.64 9.36 10.31 8.48 9.61 10.26 8.89 10.22 13.71 13.64 11.55 9.44 11.83 11.09 8.56 9.27 10.89 15.66 9.53 10.98 10.84 10.66 9.2 10.63 12.06 14.42
36.81 37.58 32.69 36.02 59.15 64.84 46.41 43.23 54.69 55.23 61.94 56.33 63.29 94.1 86.99 70.13 60.31 59.26 65.57 61.05 61.89 59.76 62.22 63.09 63.0 66.8 66.19 54.39 67.52 65.41 71.32
1.82 2.2 2.3 2.81 3.75 4.05 3.17 3.67 3.51 3.29 3.95 3.5 4.29 7.14 5.55 3.77 3.7 2.9 4.48 3.19 3.31 3.62 3.92 3.52 3.93 3.22 3.35 3.34 4.7 4.32 5.45
17.5 16.97 15.5 19.86 30.98 34.93 22.01 18.44 27.57 27.65 27.66 26.58 33.64 49.09 51.81 37.84 32.73 34.9 29.59 30.14 28.33 27.61 34.36 26.88 29.52 33.29 33.03 22.91 35.87 36.95 45.5
8.26 7.95 8.21 10.16 13.89 15.29 10.52 12.72 10.31 10.83 13.26 11.19 8.86 19.53 15.23 11.53 9.24 7.45 9.11 9.32 10.99 11.44 15.32 10.6 10.82 11.72 12.84 8.04 15.34 16.56 19.11
23.05 26.19 29.5 38.74 53.18 52.3 36.79 39.65 35.44 41.28 41.22 37.08 26.18 60.92 49.29 37.94 27.68 27.09 36.22 25.21 33.15 35.3 59.11 27.45 26.91 35.79 36.04 30.18 55.0 47.37 48.49
4.61 5.34 7.56 9.9 11.77 11.69 8.52 6.28 9.5 9.66 8.53 8.94 11.64 21.81 19.46 12.13 9.49 11.63 11.6 10.55 10.57 10.03 12.75 10.06 10.18 10.72 10.19 7.73 12.73 13.0 15.27
0.52 0.59 0.65 0.48 1.52 1.23 0.71 0.77 1.77 1.76 1.26 1.69 0.99 5.75 3.64 1.22 1.66 1.59 1.04 1.47 0.78 0.82 1.86 1.78 1.42 1.6 0.83 0.54 2.72 3.94 5.08

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)