Heatmap: Cluster_237 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_17081.1 (PLL3)	0.16	0.18	0.14	0.17	0.37	0.43	0.28	0.27	0.23	0.19	0.28	0.27	0.54	0.72	0.53	0.32	0.25	0.56	0.27	0.23	0.25	0.26	1.0	0.28	0.26	0.25	0.27	0.22	0.37	0.36	0.74
Lsat_1_v5_gn_0_39640.1 (SCY1)	0.26	0.29	0.23	0.27	0.45	0.42	0.31	0.33	0.26	0.29	0.35	0.32	0.39	0.78	0.58	0.41	0.35	0.36	0.4	0.3	0.28	0.3	1.0	0.3	0.3	0.34	0.28	0.27	0.45	0.54	0.66
Lsat_1_v5_gn_0_7461.1 (EPCR2)	0.24	0.25	0.3	0.35	0.53	0.48	0.41	0.39	0.35	0.34	0.36	0.36	0.37	0.74	0.65	0.49	0.44	0.65	0.36	0.34	0.33	0.38	1.0	0.34	0.34	0.35	0.35	0.3	0.43	0.48	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_128600.1 (RBP45B)	0.3	0.28	0.29	0.31	0.45	0.44	0.39	0.5	0.32	0.36	0.38	0.37	0.66	0.66	0.5	0.38	0.38	0.66	0.31	0.36	0.34	0.38	1.0	0.36	0.37	0.36	0.35	0.4	0.41	0.37	0.46
Lsat_1_v5_gn_1_36021.1 (RH20)	0.32	0.27	0.33	0.37	0.49	0.54	0.42	0.51	0.32	0.35	0.4	0.33	0.55	0.68	0.66	0.47	0.46	0.52	0.43	0.39	0.4	0.41	1.0	0.42	0.37	0.42	0.42	0.38	0.5	0.46	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_3980.1 (TRM9)	0.3	0.27	0.31	0.31	0.43	0.56	0.41	0.46	0.27	0.33	0.36	0.38	0.79	0.69	0.54	0.43	0.42	0.51	0.43	0.35	0.36	0.37	1.0	0.39	0.41	0.39	0.35	0.37	0.46	0.42	0.6
Lsat_1_v5_gn_1_39920.1	0.39	0.32	0.34	0.39	0.62	0.66	0.53	0.61	0.36	0.39	0.45	0.44	0.7	0.75	0.66	0.52	0.5	0.77	0.41	0.43	0.51	0.48	1.0	0.48	0.49	0.5	0.48	0.54	0.56	0.51	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_40220.1 (emb1441)	0.4	0.44	0.34	0.38	0.73	0.69	0.51	0.62	0.41	0.45	0.48	0.48	0.59	0.85	0.69	0.53	0.49	0.69	0.5	0.45	0.49	0.47	1.0	0.42	0.44	0.49	0.49	0.47	0.58	0.53	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_42160.1	0.25	0.26	0.14	0.16	0.46	0.47	0.38	0.38	0.28	0.29	0.28	0.26	0.41	0.59	0.52	0.28	0.29	0.57	0.34	0.32	0.3	0.31	1.0	0.28	0.29	0.31	0.32	0.3	0.36	0.35	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_43901.1 (SMEK1)	0.29	0.31	0.28	0.28	0.5	0.54	0.44	0.55	0.32	0.36	0.35	0.36	0.45	0.66	0.56	0.41	0.37	0.47	0.41	0.34	0.33	0.37	1.0	0.34	0.35	0.36	0.36	0.33	0.47	0.45	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_54041.1 (IMPA-9)	0.34	0.31	0.39	0.35	0.61	0.59	0.53	0.59	0.4	0.39	0.43	0.4	0.62	0.91	0.72	0.5	0.46	0.58	0.52	0.44	0.45	0.48	1.0	0.4	0.43	0.44	0.41	0.4	0.53	0.48	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_71321.1 (LNO1)	0.29	0.37	0.3	0.32	0.45	0.47	0.38	0.38	0.31	0.32	0.37	0.34	0.5	0.76	0.58	0.4	0.35	0.32	0.41	0.34	0.34	0.34	1.0	0.36	0.35	0.37	0.38	0.38	0.46	0.5	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_71561.1 (MTSF1)	0.36	0.28	0.29	0.4	0.6	0.63	0.51	0.62	0.33	0.38	0.4	0.35	0.62	0.84	0.71	0.48	0.43	0.63	0.47	0.42	0.46	0.51	1.0	0.42	0.45	0.48	0.45	0.45	0.58	0.5	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_72341.1 (IBI1)	0.3	0.3	0.28	0.29	0.51	0.5	0.44	0.53	0.32	0.31	0.37	0.4	0.67	0.66	0.6	0.45	0.48	0.63	0.35	0.4	0.4	0.41	1.0	0.45	0.43	0.43	0.39	0.45	0.44	0.42	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_83640.1 (CUM2)	0.37	0.38	0.3	0.31	0.52	0.52	0.5	0.57	0.35	0.35	0.39	0.41	0.66	0.8	0.66	0.52	0.51	0.55	0.48	0.4	0.44	0.45	1.0	0.42	0.47	0.47	0.45	0.44	0.53	0.51	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_70300.1	0.21	0.23	0.24	0.23	0.49	0.51	0.28	0.5	0.23	0.22	0.21	0.29	0.59	0.82	0.62	0.38	0.34	0.62	0.31	0.28	0.31	0.31	1.0	0.27	0.26	0.35	0.38	0.33	0.4	0.34	0.73
Lsat_1_v5_gn_2_8340.1 (XRN3)	0.25	0.39	0.19	0.24	0.41	0.48	0.35	0.42	0.33	0.33	0.35	0.4	0.68	0.79	0.55	0.43	0.38	0.61	0.34	0.33	0.37	0.36	1.0	0.36	0.39	0.38	0.38	0.36	0.45	0.44	0.69
Lsat_1_v5_gn_3_104380.1 (XRN3)	0.29	0.27	0.25	0.33	0.49	0.49	0.41	0.5	0.33	0.39	0.41	0.41	0.62	0.79	0.66	0.5	0.45	0.63	0.41	0.39	0.41	0.4	1.0	0.39	0.36	0.42	0.38	0.4	0.46	0.48	0.63
Lsat_1_v5_gn_3_10880.1	0.37	0.41	0.32	0.45	0.62	0.65	0.59	0.62	0.42	0.42	0.49	0.45	0.63	0.86	0.78	0.58	0.49	0.69	0.57	0.42	0.45	0.5	1.0	0.46	0.49	0.51	0.49	0.42	0.61	0.58	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_116081.1 (SE)	0.31	0.31	0.29	0.29	0.49	0.48	0.43	0.56	0.34	0.34	0.38	0.4	0.79	0.72	0.61	0.49	0.48	0.63	0.37	0.41	0.4	0.42	1.0	0.46	0.41	0.45	0.43	0.38	0.49	0.48	0.74
Lsat_1_v5_gn_3_22060.1 (PDS5C)	0.41	0.4	0.36	0.38	0.59	0.6	0.49	0.51	0.38	0.39	0.44	0.39	0.54	0.84	0.66	0.45	0.42	0.51	0.55	0.41	0.41	0.45	1.0	0.43	0.41	0.44	0.44	0.44	0.58	0.56	0.75
Lsat_1_v5_gn_3_23420.1 (AFH14)	0.26	0.26	0.2	0.18	0.39	0.42	0.35	0.36	0.3	0.3	0.31	0.31	0.55	0.72	0.56	0.35	0.32	0.41	0.38	0.3	0.29	0.3	1.0	0.32	0.35	0.32	0.3	0.28	0.42	0.45	0.71
Lsat_1_v5_gn_3_49741.1 (HB16)	0.03	0.03	0.04	0.08	0.37	0.35	0.27	0.34	0.19	0.18	0.21	0.15	0.22	0.74	0.48	0.14	0.1	0.37	0.2	0.13	0.16	0.17	1.0	0.14	0.16	0.12	0.16	0.12	0.59	0.43	0.36
Lsat_1_v5_gn_3_7501.1 (BRR2)	0.36	0.39	0.3	0.35	0.55	0.52	0.48	0.56	0.35	0.37	0.38	0.4	0.74	0.83	0.62	0.47	0.44	0.55	0.42	0.37	0.37	0.4	1.0	0.4	0.43	0.42	0.41	0.41	0.53	0.51	0.8
Lsat_1_v5_gn_4_154740.1	0.25	0.28	0.27	0.23	0.54	0.63	0.39	0.44	0.33	0.31	0.36	0.33	0.41	0.68	0.63	0.37	0.33	0.47	0.42	0.34	0.4	0.38	1.0	0.37	0.33	0.36	0.36	0.36	0.48	0.42	0.66
Lsat_1_v5_gn_4_1741.1	0.15	0.21	0.18	0.24	0.61	0.6	0.32	0.4	0.27	0.24	0.27	0.28	0.49	0.83	0.67	0.36	0.29	0.61	0.35	0.31	0.32	0.32	1.0	0.34	0.32	0.33	0.36	0.29	0.47	0.48	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_34641.1 (STE24)	0.42	0.36	0.37	0.35	0.59	0.6	0.41	0.54	0.34	0.38	0.37	0.39	0.57	0.74	0.58	0.45	0.41	0.69	0.44	0.38	0.38	0.44	1.0	0.4	0.38	0.42	0.4	0.45	0.54	0.5	0.64
Lsat_1_v5_gn_4_94840.1 (NMT1)	0.29	0.33	0.29	0.35	0.57	0.58	0.51	0.56	0.41	0.45	0.42	0.45	0.57	0.65	0.59	0.51	0.49	0.53	0.51	0.46	0.45	0.46	1.0	0.44	0.48	0.48	0.46	0.46	0.51	0.54	0.61
Lsat_1_v5_gn_5_104301.1 (MTR4)	0.34	0.33	0.27	0.35	0.5	0.49	0.49	0.64	0.32	0.37	0.35	0.35	0.74	0.7	0.59	0.45	0.46	0.45	0.38	0.42	0.41	0.41	1.0	0.42	0.36	0.42	0.41	0.43	0.44	0.47	0.71
Lsat_1_v5_gn_5_13520.1	0.3	0.27	0.22	0.27	0.38	0.5	0.45	0.65	0.25	0.3	0.3	0.36	0.65	0.68	0.59	0.48	0.47	0.48	0.3	0.35	0.38	0.43	1.0	0.43	0.39	0.43	0.37	0.38	0.38	0.38	0.63
Lsat_1_v5_gn_5_160760.1 (INO80)	0.31	0.35	0.32	0.37	0.49	0.53	0.46	0.51	0.34	0.34	0.38	0.36	0.49	0.61	0.56	0.45	0.4	0.32	0.4	0.35	0.36	0.39	1.0	0.37	0.38	0.38	0.38	0.36	0.43	0.48	0.58
Lsat_1_v5_gn_5_180141.1 (OZS3)	0.32	0.32	0.25	0.24	0.54	0.56	0.41	0.46	0.29	0.32	0.36	0.32	0.48	0.76	0.66	0.43	0.38	0.6	0.43	0.37	0.38	0.37	1.0	0.36	0.36	0.38	0.4	0.34	0.49	0.46	0.63
Lsat_1_v5_gn_5_59220.1	0.28	0.3	0.22	0.22	0.47	0.57	0.47	0.63	0.26	0.28	0.29	0.36	0.59	0.89	0.66	0.47	0.47	0.55	0.36	0.33	0.39	0.42	1.0	0.39	0.4	0.39	0.37	0.42	0.53	0.47	0.59
Lsat_1_v5_gn_5_59321.1 (RGD3)	0.4	0.39	0.33	0.37	0.58	0.55	0.55	0.63	0.45	0.46	0.47	0.47	0.69	0.8	0.67	0.55	0.51	0.49	0.46	0.43	0.44	0.44	1.0	0.47	0.46	0.45	0.46	0.46	0.61	0.64	0.82
Lsat_1_v5_gn_5_60900.1 (PIA2)	0.27	0.28	0.31	0.41	0.76	0.71	0.46	0.61	0.47	0.45	0.48	0.44	0.6	0.91	0.75	0.49	0.45	0.66	0.46	0.43	0.4	0.44	1.0	0.42	0.43	0.46	0.49	0.46	0.57	0.52	0.74
Lsat_1_v5_gn_6_26220.1 (AK6)	0.27	0.26	0.26	0.35	0.49	0.52	0.41	0.51	0.29	0.32	0.34	0.34	0.66	0.72	0.57	0.41	0.45	0.63	0.39	0.4	0.42	0.41	1.0	0.39	0.44	0.45	0.41	0.45	0.46	0.37	0.56
Lsat_1_v5_gn_6_4021.1	0.27	0.28	0.32	0.44	0.46	0.44	0.36	0.47	0.28	0.32	0.36	0.36	0.63	0.59	0.5	0.38	0.34	0.62	0.33	0.33	0.31	0.33	1.0	0.34	0.37	0.33	0.34	0.32	0.39	0.38	0.56
Lsat_1_v5_gn_6_52280.1 (RH37)	0.36	0.4	0.28	0.31	0.55	0.49	0.42	0.62	0.36	0.33	0.4	0.41	0.65	0.73	0.62	0.46	0.42	0.7	0.42	0.34	0.36	0.36	1.0	0.41	0.41	0.39	0.42	0.38	0.48	0.49	0.68
Lsat_1_v5_gn_6_94800.1 (CKB1)	0.45	0.43	0.39	0.44	0.73	0.77	0.64	0.72	0.46	0.45	0.52	0.53	0.71	0.98	0.83	0.56	0.56	0.82	0.5	0.54	0.54	0.54	1.0	0.5	0.54	0.56	0.57	0.56	0.57	0.57	0.69
Lsat_1_v5_gn_6_95721.1	0.29	0.32	0.28	0.24	0.66	0.75	0.47	0.45	0.32	0.34	0.39	0.32	0.47	0.95	0.64	0.41	0.37	0.65	0.45	0.3	0.35	0.38	1.0	0.34	0.33	0.35	0.36	0.31	0.5	0.5	0.66
Lsat_1_v5_gn_7_101481.1 (CID9)	0.27	0.26	0.25	0.24	0.63	0.62	0.46	0.53	0.39	0.4	0.43	0.42	0.5	0.73	0.66	0.48	0.47	0.59	0.46	0.45	0.44	0.44	1.0	0.38	0.42	0.41	0.39	0.43	0.52	0.48	0.61
Lsat_1_v5_gn_7_108740.1 (NMT1)	0.33	0.3	0.28	0.37	0.57	0.52	0.46	0.52	0.3	0.35	0.38	0.44	0.72	0.76	0.56	0.49	0.48	0.66	0.35	0.36	0.39	0.4	1.0	0.46	0.43	0.44	0.41	0.43	0.45	0.46	0.76
Lsat_1_v5_gn_7_17321.1 (PCFS4)	0.41	0.37	0.38	0.45	0.55	0.57	0.45	0.45	0.49	0.39	0.47	0.45	0.65	0.87	0.74	0.54	0.49	0.7	0.52	0.45	0.46	0.5	1.0	0.47	0.49	0.45	0.48	0.49	0.57	0.58	0.74
Lsat_1_v5_gn_7_19061.1 (CPL1)	0.33	0.4	0.26	0.4	0.49	0.52	0.53	0.56	0.4	0.41	0.44	0.39	0.47	0.86	0.69	0.48	0.43	0.65	0.43	0.39	0.41	0.44	1.0	0.42	0.42	0.45	0.45	0.39	0.58	0.61	0.66
Lsat_1_v5_gn_7_79181.1 (CPSF73-I)	0.22	0.22	0.19	0.21	0.38	0.45	0.41	0.54	0.21	0.21	0.23	0.24	0.57	0.78	0.54	0.37	0.34	0.42	0.33	0.33	0.32	0.33	1.0	0.34	0.33	0.37	0.33	0.34	0.42	0.34	0.48
Lsat_1_v5_gn_8_107961.1 (NTP6)	0.2	0.29	0.21	0.31	0.5	0.54	0.43	0.53	0.39	0.42	0.42	0.43	0.45	0.79	0.69	0.47	0.42	0.67	0.46	0.39	0.42	0.43	1.0	0.39	0.39	0.48	0.48	0.36	0.49	0.55	0.58
Lsat_1_v5_gn_8_22281.1	0.16	0.19	0.13	0.18	0.46	0.54	0.38	0.46	0.25	0.31	0.28	0.28	0.38	0.62	0.55	0.35	0.36	0.41	0.3	0.29	0.28	0.3	1.0	0.3	0.32	0.32	0.33	0.25	0.5	0.46	0.62
Lsat_1_v5_gn_8_26980.1 (NFD3)	0.21	0.21	0.21	0.2	0.4	0.39	0.28	0.34	0.21	0.23	0.23	0.24	0.56	0.58	0.47	0.25	0.25	0.52	0.32	0.28	0.29	0.3	1.0	0.29	0.26	0.27	0.28	0.31	0.31	0.28	0.49
Lsat_1_v5_gn_8_41780.1 (NUA)	0.31	0.38	0.24	0.27	0.57	0.55	0.48	0.54	0.34	0.36	0.4	0.38	0.63	0.79	0.6	0.5	0.42	0.63	0.41	0.35	0.35	0.39	1.0	0.37	0.41	0.4	0.4	0.37	0.52	0.54	0.72
Lsat_1_v5_gn_8_59861.1 (IMPA-2)	0.33	0.33	0.27	0.25	0.54	0.6	0.46	0.55	0.34	0.34	0.35	0.34	0.7	0.67	0.58	0.5	0.46	0.45	0.39	0.38	0.42	0.43	1.0	0.42	0.43	0.45	0.42	0.47	0.49	0.42	0.6
Lsat_1_v5_gn_8_95961.1 (PFA3)	0.27	0.27	0.19	0.18	0.52	0.51	0.32	0.31	0.31	0.29	0.35	0.29	0.65	0.88	0.84	0.44	0.4	0.65	0.43	0.34	0.37	0.34	1.0	0.34	0.33	0.35	0.35	0.28	0.44	0.45	0.82
Lsat_1_v5_gn_9_121880.1 (IES2B)	0.25	0.26	0.24	0.26	0.56	0.58	0.44	0.5	0.33	0.32	0.35	0.35	0.5	0.79	0.61	0.45	0.36	0.48	0.41	0.34	0.38	0.38	1.0	0.33	0.36	0.38	0.36	0.37	0.45	0.46	0.65
Lsat_1_v5_gn_9_25080.1	0.28	0.21	0.23	0.25	0.54	0.5	0.35	0.36	0.31	0.29	0.32	0.26	0.38	0.88	0.69	0.42	0.32	0.56	0.4	0.32	0.31	0.35	1.0	0.29	0.32	0.34	0.31	0.26	0.44	0.42	0.57
Lsat_1_v5_gn_9_33761.1 (CPL2)	0.23	0.25	0.14	0.2	0.42	0.38	0.38	0.43	0.29	0.31	0.33	0.32	0.39	0.57	0.53	0.37	0.33	0.37	0.36	0.32	0.31	0.3	1.0	0.32	0.33	0.34	0.33	0.3	0.53	0.44	0.42
Lsat_1_v5_gn_9_4320.1 (SL4)	0.33	0.36	0.29	0.33	0.48	0.49	0.45	0.5	0.39	0.36	0.41	0.37	0.52	0.73	0.67	0.5	0.44	0.53	0.42	0.36	0.38	0.36	1.0	0.34	0.36	0.4	0.39	0.34	0.54	0.52	0.62
Lsat_1_v5_gn_9_8701.1	0.18	0.18	0.18	0.21	0.45	0.45	0.42	0.52	0.31	0.27	0.24	0.38	0.55	0.64	0.51	0.38	0.39	0.37	0.37	0.33	0.36	0.37	1.0	0.34	0.33	0.31	0.28	0.3	0.53	0.47	0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)