Heatmap: Cluster_237 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.82 0.94 0.74 0.9 1.95 2.27 1.48 1.41 1.24 1.03 1.46 1.42 2.84 3.8 2.81 1.68 1.31 2.98 1.4 1.2 1.33 1.39 5.27 1.49 1.38 1.32 1.4 1.17 1.97 1.9 3.9
11.68 13.04 10.53 12.13 20.07 18.75 14.16 14.69 11.7 13.02 15.91 14.38 17.72 35.0 26.1 18.3 15.54 16.05 17.96 13.57 12.67 13.39 45.02 13.66 13.66 15.23 12.46 12.31 20.07 24.13 29.62
8.5 8.86 10.7 12.38 18.96 17.06 14.55 13.87 12.43 12.31 13.02 12.76 13.21 26.26 23.35 17.38 15.76 23.38 12.71 12.14 11.93 13.47 35.7 12.09 12.02 12.48 12.4 10.81 15.42 17.22 20.44
14.8 13.88 14.59 15.4 22.56 22.03 19.14 24.61 15.94 17.66 18.73 18.24 32.6 32.8 24.75 19.04 18.66 32.73 15.4 18.07 16.65 18.69 49.58 17.7 18.41 17.99 17.56 19.75 20.11 18.16 23.03
7.61 6.31 7.93 8.9 11.59 12.72 10.05 12.16 7.6 8.23 9.6 7.76 13.01 16.24 15.73 11.13 10.87 12.31 10.14 9.3 9.39 9.65 23.73 9.88 8.82 9.92 9.91 9.11 11.89 10.86 16.14
7.64 6.92 8.03 8.06 10.91 14.4 10.58 11.67 6.92 8.34 9.32 9.71 20.38 17.8 13.8 11.15 10.85 13.2 11.0 8.88 9.32 9.49 25.65 9.89 10.5 10.09 8.96 9.52 11.81 10.7 15.35
9.0 7.5 7.94 9.0 14.47 15.24 12.21 14.12 8.42 9.05 10.49 10.12 16.23 17.35 15.4 12.05 11.5 17.77 9.44 10.04 11.81 11.03 23.21 11.11 11.32 11.49 11.15 12.59 12.99 11.77 16.22
5.54 6.08 4.76 5.28 10.0 9.53 7.1 8.48 5.61 6.15 6.63 6.59 8.14 11.71 9.47 7.24 6.69 9.53 6.85 6.16 6.8 6.49 13.79 5.83 6.1 6.75 6.81 6.49 8.06 7.37 9.14
3.11 3.16 1.78 1.93 5.67 5.84 4.65 4.71 3.4 3.54 3.46 3.24 5.08 7.34 6.36 3.47 3.58 7.01 4.2 3.91 3.66 3.88 12.33 3.39 3.57 3.79 3.97 3.73 4.49 4.31 6.48
8.6 9.14 8.09 8.37 14.7 15.86 13.02 16.22 9.54 10.49 10.17 10.45 13.37 19.39 16.39 12.03 11.0 13.89 12.01 9.92 9.59 10.8 29.41 10.11 10.28 10.49 10.64 9.69 13.8 13.17 16.72
4.86 4.4 5.47 4.89 8.62 8.35 7.56 8.41 5.6 5.59 6.14 5.71 8.74 12.85 10.27 7.13 6.58 8.28 7.43 6.21 6.4 6.83 14.18 5.69 6.14 6.25 5.76 5.74 7.52 6.76 9.21
1.94 2.48 2.03 2.12 3.03 3.16 2.52 2.58 2.07 2.12 2.49 2.28 3.39 5.09 3.9 2.67 2.36 2.15 2.76 2.27 2.25 2.28 6.71 2.43 2.37 2.49 2.54 2.57 3.1 3.33 4.55
1.62 1.27 1.28 1.79 2.67 2.8 2.28 2.76 1.49 1.7 1.81 1.58 2.78 3.75 3.18 2.16 1.91 2.8 2.11 1.89 2.04 2.3 4.47 1.89 2.0 2.14 2.02 2.03 2.57 2.22 3.37
16.42 16.86 15.32 16.08 28.17 27.72 24.15 29.22 17.81 17.3 20.28 22.42 37.08 36.78 33.16 25.19 26.61 34.88 19.65 21.94 22.3 22.91 55.42 24.73 23.69 23.92 21.78 24.98 24.13 23.33 32.47
6.52 6.59 5.29 5.49 9.15 9.08 8.77 9.97 6.1 6.05 6.88 7.09 11.49 14.02 11.59 9.15 8.83 9.52 8.37 6.99 7.67 7.78 17.44 7.31 8.15 8.18 7.86 7.65 9.31 8.87 12.13
0.91 1.02 1.08 1.01 2.17 2.26 1.26 2.22 1.02 0.99 0.94 1.27 2.59 3.63 2.73 1.69 1.52 2.75 1.35 1.23 1.35 1.38 4.42 1.2 1.16 1.53 1.69 1.44 1.78 1.51 3.22
2.67 4.12 1.98 2.54 4.39 5.11 3.68 4.49 3.46 3.47 3.67 4.24 7.21 8.33 5.82 4.53 3.98 6.41 3.64 3.48 3.94 3.81 10.57 3.77 4.09 3.99 4.0 3.82 4.79 4.7 7.32
6.97 6.56 5.92 7.89 11.64 11.78 9.71 11.98 7.93 9.31 9.81 9.89 14.73 18.91 15.76 11.93 10.86 15.14 9.76 9.3 9.75 9.53 23.9 9.44 8.53 9.98 9.11 9.67 10.96 11.38 15.03
7.74 8.55 6.75 9.44 13.08 13.7 12.32 13.03 8.85 8.72 10.22 9.44 13.34 18.03 16.33 12.14 10.4 14.52 12.0 8.82 9.51 10.53 21.01 9.7 10.28 10.64 10.37 8.77 12.89 12.16 15.42
8.21 8.29 7.74 7.64 12.93 12.72 11.33 14.8 8.91 9.05 9.93 10.47 20.74 18.97 16.15 12.81 12.76 16.47 9.85 10.84 10.61 10.99 26.34 12.12 10.79 11.86 11.28 9.89 12.78 12.68 19.44
11.3 11.08 9.81 10.5 16.24 16.4 13.51 13.88 10.47 10.73 11.91 10.6 14.86 23.07 17.95 12.23 11.61 14.01 15.01 11.25 11.34 12.19 27.36 11.79 11.29 11.96 12.07 11.94 15.91 15.19 20.56
3.46 3.5 2.75 2.43 5.29 5.7 4.67 4.85 4.09 4.03 4.23 4.12 7.37 9.66 7.51 4.67 4.38 5.5 5.17 4.05 3.86 4.09 13.5 4.31 4.69 4.33 4.02 3.83 5.71 6.11 9.61
4.18 3.81 4.85 9.96 45.93 43.34 33.46 41.89 23.96 21.87 25.7 19.03 26.89 92.43 59.3 17.26 12.9 46.25 25.43 16.22 19.69 20.67 124.38 17.83 19.46 15.11 19.29 14.36 73.61 53.56 45.26
9.45 10.16 7.87 9.23 14.47 13.65 12.57 14.73 9.09 9.61 10.02 10.41 19.48 21.82 16.25 12.25 11.62 14.53 10.92 9.59 9.77 10.53 26.24 10.48 11.3 11.14 10.74 10.67 13.87 13.49 20.9
2.82 3.05 2.97 2.58 6.01 6.97 4.38 4.92 3.67 3.45 4.04 3.7 4.51 7.55 6.97 4.14 3.68 5.19 4.65 3.8 4.4 4.26 11.1 4.06 3.67 4.01 4.0 4.05 5.32 4.67 7.31
2.69 3.9 3.29 4.34 11.2 11.02 5.89 7.43 4.94 4.4 5.02 5.15 9.01 15.25 12.23 6.59 5.33 11.14 6.4 5.64 5.93 5.81 18.34 6.2 5.91 6.09 6.59 5.32 8.63 8.85 10.74
16.65 14.06 14.4 13.75 23.11 23.61 15.97 21.24 13.41 14.9 14.59 15.3 22.41 28.99 22.9 17.67 16.09 27.36 17.35 14.87 14.89 17.25 39.4 15.65 15.01 16.53 15.7 17.69 21.45 19.55 25.11
8.01 9.02 8.08 9.6 15.66 15.9 14.09 15.41 11.24 12.34 11.47 12.47 15.74 17.9 16.23 14.07 13.36 14.61 14.1 12.53 12.44 12.57 27.46 12.11 13.05 13.2 12.62 12.74 14.11 14.8 16.7
5.2 5.04 4.19 5.39 7.75 7.56 7.5 9.81 4.92 5.68 5.46 5.38 11.47 10.8 9.04 6.94 7.13 6.89 5.86 6.49 6.3 6.3 15.41 6.46 5.53 6.55 6.33 6.58 6.85 7.24 10.9
5.9 5.28 4.38 5.27 7.48 9.87 8.83 12.77 4.93 5.84 6.0 7.15 12.76 13.42 11.69 9.49 9.25 9.54 5.87 6.82 7.44 8.42 19.77 8.45 7.66 8.44 7.22 7.53 7.52 7.48 12.38
9.15 10.16 9.33 10.78 14.26 15.3 13.24 14.8 10.0 10.02 11.11 10.6 14.29 17.88 16.32 13.06 11.75 9.41 11.68 10.1 10.58 11.24 29.09 10.73 10.92 11.15 11.12 10.53 12.45 13.85 16.93
7.56 7.74 5.99 5.78 12.92 13.51 9.94 11.11 6.96 7.55 8.71 7.62 11.44 18.28 15.82 10.25 9.09 14.34 10.3 8.75 9.0 8.94 23.96 8.55 8.56 9.12 9.49 8.22 11.84 11.14 15.03
11.22 11.76 8.61 8.76 18.87 22.54 18.78 25.22 10.41 11.16 11.54 14.29 23.62 35.37 26.14 18.79 18.56 22.0 14.11 13.26 15.62 16.86 39.74 15.5 15.78 15.47 14.51 16.76 21.16 18.59 23.38
8.07 7.86 6.61 7.38 11.67 11.08 10.9 12.55 8.9 9.22 9.34 9.32 13.77 15.92 13.33 10.98 10.14 9.84 9.24 8.55 8.88 8.72 19.99 9.31 9.2 9.08 9.21 9.1 12.24 12.7 16.4
12.75 13.12 14.9 19.53 35.95 33.73 21.87 29.03 22.14 21.32 22.67 20.66 28.25 42.97 35.83 23.39 21.47 31.21 21.9 20.4 18.76 20.84 47.47 19.82 20.52 21.86 23.37 22.02 26.98 24.91 34.95
9.94 9.53 9.61 12.71 17.72 18.82 14.79 18.58 10.5 11.79 12.48 12.26 23.83 25.96 20.57 14.91 16.27 22.75 14.3 14.58 15.06 15.02 36.28 14.27 15.84 16.4 14.82 16.49 16.57 13.51 20.27
7.92 8.31 9.44 12.91 13.53 12.95 10.6 13.82 8.41 9.48 10.8 10.54 18.57 17.44 14.85 11.21 10.13 18.24 9.91 9.69 9.12 9.8 29.66 10.11 10.95 9.82 10.08 9.38 11.61 11.13 16.55
10.36 11.56 8.1 8.98 15.66 14.02 12.02 17.83 10.43 9.6 11.44 11.7 18.66 20.96 17.66 13.28 11.91 20.13 11.94 9.75 10.18 10.44 28.67 11.9 11.86 11.08 12.03 10.95 13.86 14.19 19.48
14.71 13.96 12.91 14.41 23.82 25.11 20.96 23.69 14.93 14.8 16.99 17.27 23.19 31.96 27.28 18.34 18.29 26.98 16.47 17.63 17.71 17.6 32.72 16.37 17.64 18.35 18.5 18.43 18.54 18.78 22.46
4.65 5.2 4.45 3.93 10.61 12.04 7.6 7.18 5.07 5.49 6.24 5.21 7.55 15.28 10.3 6.55 5.98 10.46 7.28 4.79 5.69 6.12 16.1 5.42 5.28 5.69 5.83 5.02 8.02 8.06 10.68
6.23 6.06 5.63 5.45 14.33 14.28 10.65 12.05 8.98 9.09 9.96 9.66 11.5 16.77 15.02 11.11 10.69 13.49 10.57 10.23 10.02 10.04 22.92 8.82 9.7 9.31 8.97 9.75 11.9 10.99 13.89
5.86 5.27 4.86 6.47 10.11 9.12 8.17 9.24 5.34 6.16 6.73 7.77 12.68 13.44 9.93 8.72 8.45 11.64 6.25 6.29 6.85 7.0 17.63 8.11 7.61 7.77 7.18 7.58 8.0 8.03 13.48
5.3 4.71 4.88 5.74 7.05 7.27 5.81 5.73 6.28 5.05 6.0 5.75 8.31 11.17 9.42 6.96 6.23 8.97 6.59 5.79 5.93 6.41 12.8 5.96 6.29 5.79 6.16 6.3 7.26 7.37 9.44
5.55 6.74 4.43 6.74 8.37 8.92 9.03 9.45 6.84 7.05 7.42 6.72 7.98 14.69 11.78 8.09 7.4 11.1 7.38 6.69 7.03 7.45 17.01 7.17 7.07 7.68 7.7 6.65 9.93 10.39 11.15
3.26 3.14 2.81 3.09 5.57 6.49 5.97 7.8 3.1 3.06 3.26 3.44 8.33 11.25 7.8 5.4 4.89 6.08 4.74 4.79 4.62 4.72 14.5 4.95 4.73 5.31 4.82 5.0 6.06 4.9 6.94
2.08 3.01 2.26 3.24 5.25 5.76 4.53 5.57 4.15 4.45 4.39 4.52 4.71 8.3 7.29 5.0 4.45 7.06 4.85 4.09 4.4 4.54 10.57 4.09 4.17 5.03 5.04 3.83 5.22 5.83 6.08
2.05 2.42 1.64 2.3 5.96 6.98 4.96 5.99 3.25 3.99 3.61 3.67 4.89 8.01 7.13 4.51 4.68 5.3 3.91 3.74 3.6 3.92 13.02 3.87 4.16 4.19 4.36 3.2 6.52 5.96 8.06
28.83 29.51 28.98 27.54 55.92 54.92 39.83 47.41 29.14 32.7 32.07 33.06 78.55 81.91 65.73 35.49 34.81 73.25 45.1 39.07 40.53 41.69 140.56 41.4 36.0 37.61 39.86 44.01 43.92 39.06 69.27
6.17 7.47 4.78 5.34 11.27 10.74 9.45 10.69 6.6 7.16 7.79 7.37 12.42 15.42 11.83 9.75 8.24 12.46 8.05 6.83 6.93 7.64 19.63 7.31 8.04 7.95 7.81 7.29 10.14 10.56 14.18
12.18 12.11 9.82 9.28 20.05 22.11 16.96 20.38 12.41 12.38 12.86 12.68 25.79 24.89 21.41 18.41 17.13 16.53 14.48 14.0 15.66 15.92 36.93 15.51 15.81 16.58 15.34 17.39 18.11 15.64 22.11
8.56 8.6 6.21 5.63 16.68 16.53 10.32 9.97 9.83 9.27 11.32 9.38 20.93 28.33 27.13 14.19 12.78 20.86 13.78 10.94 11.88 10.94 32.14 10.8 10.58 11.1 11.36 9.13 14.06 14.41 26.22
4.82 4.98 4.63 5.01 10.68 11.01 8.34 9.37 6.14 6.11 6.53 6.55 9.54 15.0 11.59 8.54 6.78 9.01 7.75 6.5 7.21 7.2 18.9 6.22 6.79 7.21 6.87 7.01 8.53 8.74 12.38
5.54 4.14 4.64 4.95 10.76 10.05 7.06 7.15 6.15 5.85 6.34 5.18 7.67 17.52 13.85 8.41 6.35 11.18 8.08 6.43 6.15 6.91 19.98 5.75 6.38 6.82 6.22 5.28 8.81 8.34 11.46
6.85 7.36 4.17 6.11 12.64 11.41 11.37 13.02 8.82 9.18 9.78 9.49 11.61 17.03 15.8 11.14 9.96 11.1 10.9 9.51 9.22 9.11 29.99 9.58 10.01 10.19 9.86 9.05 15.9 13.09 12.64
8.79 9.71 7.7 8.79 12.9 13.21 11.97 13.27 10.46 9.57 10.92 9.85 13.92 19.58 17.84 13.45 11.64 14.24 11.18 9.73 10.2 9.58 26.7 9.15 9.65 10.55 10.5 9.19 14.33 13.91 16.58
1.4 1.43 1.41 1.68 3.53 3.49 3.31 4.11 2.42 2.11 1.85 2.94 4.35 5.04 3.97 3.0 3.04 2.93 2.9 2.55 2.82 2.9 7.84 2.64 2.55 2.4 2.22 2.36 4.16 3.69 5.09

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)