Heatmap: Cluster_223 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.01 -0.23 -0.46 -0.47 -0.12 0.15 0.18 0.37 -0.08 0.11 0.11 0.11 0.07 0.1 -0.12 -0.04 0.01 -1.35 -0.03 0.1 0.13 0.19 -0.96 0.23 0.28 0.21 0.18 0.22 -0.08 -0.11 0.17
-0.46 -0.35 -0.67 -0.99 -0.18 0.21 0.09 0.05 -0.15 0.04 0.17 0.16 0.39 0.06 -0.14 0.06 0.08 -1.14 0.04 0.14 0.17 0.21 -0.49 0.36 0.16 0.25 0.07 0.11 0.04 0.07 0.38
-0.77 -0.77 -0.82 -1.15 -0.75 -0.15 0.18 0.38 -0.17 -0.08 -0.04 -0.02 0.52 0.3 0.32 0.37 0.35 -1.29 0.24 0.18 0.13 0.32 -1.12 0.14 0.36 0.36 0.25 0.08 -0.11 0.08 0.23
0.12 -0.17 -0.62 -0.76 -0.2 0.32 0.23 0.44 -0.11 -0.14 -0.05 -0.13 -0.02 0.4 0.17 0.0 0.01 -2.2 0.3 0.11 0.1 0.22 -1.37 0.27 0.14 0.19 0.22 0.28 0.1 0.02 -0.13
-1.08 -1.39 -1.83 -1.24 -0.61 0.21 0.56 0.63 0.48 0.36 0.25 0.02 -0.46 -0.54 0.13 0.26 0.23 -1.37 0.45 0.42 0.16 0.34 -1.46 0.25 0.32 0.13 0.36 0.21 0.27 0.24 -0.62
-0.22 -0.22 -0.45 -0.52 -0.49 0.03 0.39 0.42 -0.13 -0.15 -0.03 -0.02 0.2 0.0 0.14 0.29 0.31 -1.61 0.27 0.22 0.17 0.23 -1.06 0.19 0.22 0.2 0.1 0.23 -0.08 -0.13 -0.09
-0.25 -0.57 -0.45 -0.43 -0.07 0.14 0.2 0.24 0.11 0.21 0.27 0.11 0.03 0.36 0.25 0.06 0.08 -1.13 0.11 0.08 -0.06 0.01 -1.58 0.08 0.06 0.06 0.18 -0.06 0.19 0.2 0.12
0.26 0.02 -0.32 -0.31 0.01 0.32 0.22 0.42 -0.09 -0.16 0.02 -0.07 0.13 0.37 0.15 0.08 0.01 -1.91 -0.14 -0.14 0.0 0.09 -0.8 0.16 0.07 0.02 0.05 0.08 0.05 0.03 0.02
-0.7 -0.5 -1.05 -0.85 -0.64 0.03 0.21 0.93 -0.33 -0.4 -0.35 -0.07 0.08 0.34 0.28 -0.2 -0.03 -1.05 0.15 0.06 0.0 0.31 -0.8 0.25 0.02 0.03 -0.04 0.08 0.09 0.42 1.09
0.23 -0.27 -0.98 -1.34 0.08 0.58 0.25 0.41 -0.07 -0.34 -0.03 -0.23 -0.25 0.21 0.25 0.14 0.06 -2.62 0.27 -0.13 0.17 0.21 -0.64 0.29 0.25 0.12 0.27 0.1 0.1 0.16 -0.06
-0.04 -0.14 -0.16 -0.33 -0.07 0.07 0.23 0.23 -0.12 -0.14 0.11 -0.01 0.24 0.12 0.02 0.04 0.15 -0.81 -0.08 -0.0 0.02 0.12 -1.25 0.18 0.09 0.17 0.23 0.13 0.11 -0.0 0.11
0.27 -0.04 -0.25 -0.4 -0.27 -0.13 0.27 0.35 -0.04 -0.01 -0.06 -0.01 0.09 0.21 0.21 0.19 0.26 -1.34 0.25 0.13 0.04 0.06 -1.72 0.13 0.09 0.06 0.07 0.18 0.08 0.03 -0.22
0.12 0.06 -0.38 -0.68 -0.4 -0.01 0.28 0.53 -0.13 -0.19 -0.07 -0.03 -0.07 0.24 -0.02 -0.05 0.02 -1.62 0.27 -0.0 0.06 0.08 -0.36 0.15 0.06 -0.03 -0.09 -0.06 0.05 0.16 0.71
-0.21 -0.45 -1.22 -0.79 0.14 0.36 0.12 0.27 0.06 -0.03 0.17 0.18 -0.16 0.31 0.46 0.27 0.16 -1.92 -0.09 0.05 0.06 0.21 -0.82 0.18 -0.02 0.15 0.1 0.03 -0.01 0.12 0.26
-0.69 -0.66 -0.87 -0.69 -0.42 0.13 0.29 0.5 0.2 0.18 0.26 0.22 -0.02 0.11 0.13 0.23 0.2 -2.9 0.21 0.22 0.2 0.13 -1.76 0.25 0.14 0.21 0.28 0.15 0.09 0.14 0.08
-0.03 -0.14 -0.61 -0.86 -0.19 0.09 0.09 0.15 0.08 -0.09 0.08 0.18 0.07 -0.04 0.21 0.3 0.27 -1.54 0.28 0.15 0.24 0.23 -0.41 0.15 0.02 0.12 0.16 0.17 -0.12 -0.05 -0.16
0.03 -0.19 -0.58 -1.01 -0.45 0.08 0.28 0.47 -0.09 -0.15 0.01 0.03 0.0 -0.31 -0.29 0.08 0.24 -1.17 0.56 0.33 0.15 0.21 -1.21 0.28 0.24 0.23 0.21 0.12 -0.17 0.11 0.21
-0.51 -0.4 -0.51 -0.5 -0.02 0.19 0.33 0.31 -0.02 0.01 0.01 -0.04 0.17 0.28 0.08 0.17 0.22 -1.13 0.16 0.15 0.02 0.13 -1.76 0.01 0.09 0.28 0.24 0.12 0.09 0.11 0.07
-0.13 -0.5 -0.47 -0.34 -0.34 -0.09 0.08 0.36 0.08 0.05 -0.01 0.04 0.12 0.26 0.03 -0.14 0.11 -1.83 0.25 0.26 0.11 0.1 -0.67 0.27 0.24 0.24 0.34 0.09 0.03 0.1 -0.07
-0.08 -0.36 -0.38 -0.27 -0.53 -0.01 0.06 0.19 -0.09 -0.11 0.1 0.36 0.34 -0.37 -0.25 0.19 0.26 -1.48 0.2 0.14 0.05 0.15 -1.41 0.38 0.27 0.26 0.13 0.12 -0.15 0.21 0.37
0.06 -0.05 -0.19 -0.1 -0.26 0.21 0.49 0.6 -0.1 -0.17 -0.07 -0.26 0.1 0.27 0.2 0.16 0.01 -1.91 -0.01 -0.12 -0.04 -0.0 -0.59 0.02 0.04 0.03 -0.01 0.06 0.1 0.11 0.06
-0.28 -0.52 -0.88 -0.93 -0.28 0.32 0.07 0.12 -0.2 -0.26 -0.03 -0.17 0.19 0.08 0.03 0.34 0.33 -1.78 0.35 0.13 0.38 0.38 -0.83 0.26 0.38 0.37 0.29 0.48 -0.08 -0.18 -0.29
-0.89 -0.82 -1.43 -0.82 -0.3 0.36 0.29 0.47 0.09 0.0 0.07 0.02 -0.35 0.73 0.61 0.21 0.11 -1.84 0.42 0.13 0.16 0.16 -1.36 0.22 -0.02 0.24 0.39 -0.08 0.0 0.11 -0.13
0.29 -0.22 -0.5 -0.62 -0.38 0.05 0.17 0.01 0.12 -0.03 0.0 -0.02 0.05 0.15 0.3 0.51 0.51 -2.89 0.13 0.23 0.28 0.25 -2.86 0.22 0.12 0.15 0.17 0.48 -0.08 -0.16 -0.54
-0.15 -0.46 -1.03 -1.11 -0.51 0.06 0.08 0.3 -0.11 0.0 0.14 0.35 0.32 -0.14 -0.25 -0.09 0.13 -1.33 0.01 0.15 0.22 0.31 -0.39 0.55 0.41 0.17 0.09 0.38 -0.1 -0.01 0.21
-0.17 -0.09 -0.15 -0.24 0.03 0.24 0.39 0.2 -0.16 -0.06 -0.04 -0.12 0.15 -0.05 0.2 0.16 0.11 -0.59 0.07 0.05 -0.02 0.08 -1.02 -0.12 0.05 0.1 0.12 0.12 0.02 0.09 0.05
0.13 -0.05 -0.41 -0.57 -0.28 0.09 0.22 0.46 -0.23 -0.09 -0.03 -0.01 0.06 0.08 -0.06 0.05 0.09 -1.89 0.15 0.04 0.09 0.26 -1.09 0.25 0.19 0.18 0.16 0.09 0.01 0.07 0.39
-0.51 -0.55 -0.83 -0.61 -0.38 -0.17 0.15 0.31 0.12 0.15 0.21 0.33 0.15 -0.08 0.04 0.11 0.24 -1.33 0.06 0.17 0.04 0.17 -0.75 0.23 0.17 0.15 0.17 0.08 -0.03 0.17 0.53
0.07 0.06 -0.36 -0.76 -0.76 0.11 0.42 0.0 0.23 0.05 0.06 -0.14 -0.38 0.31 0.36 0.22 0.18 -3.78 0.16 0.1 0.19 0.24 -4.94 0.08 0.28 0.31 0.34 0.31 0.34 0.13 -0.37
-0.06 -0.23 -0.61 -0.61 -0.44 -0.34 0.31 0.56 0.2 0.12 0.25 0.1 -0.17 -0.23 0.15 0.08 0.14 -1.36 0.49 0.28 0.02 0.08 -1.97 0.15 0.14 0.22 0.26 0.06 0.18 0.19 -0.12
0.07 -0.2 -0.71 -0.94 0.2 0.62 0.39 0.47 -0.19 -0.34 -0.23 -0.32 -0.15 0.43 0.26 0.19 0.06 -2.26 0.16 -0.01 0.13 0.2 -0.32 0.15 0.13 0.07 0.05 0.3 0.06 -0.12 -0.38
0.31 0.02 -0.68 -0.82 -0.13 0.61 0.29 0.43 0.0 -0.29 0.05 -0.05 0.02 0.37 0.13 0.25 0.07 -2.03 0.13 -0.07 0.19 0.12 -1.98 0.24 0.14 0.05 0.14 0.1 -0.09 -0.04 -0.13
0.17 -0.06 -0.62 -0.81 -0.13 0.21 0.2 0.34 -0.01 -0.14 -0.06 -0.04 0.01 0.36 0.13 0.13 0.03 -1.7 0.21 0.01 0.11 0.2 -0.43 0.01 0.1 0.1 0.12 0.28 0.07 0.07 -0.2
-0.08 -0.25 -0.38 -0.62 -0.42 -0.16 0.02 0.19 0.03 -0.01 0.09 0.1 -0.03 0.17 0.16 0.13 0.19 -1.57 0.19 0.17 0.15 0.14 -1.01 0.38 0.22 0.13 0.19 0.15 0.07 0.28 -0.01
0.09 0.09 -0.01 -0.27 -0.38 0.3 0.19 0.19 -0.07 -0.27 -0.22 -0.38 -0.06 0.21 0.49 0.29 0.03 -1.53 0.2 -0.03 0.16 0.23 -2.36 0.13 0.25 0.43 0.26 0.01 0.14 -0.1 -0.41
0.27 -0.1 -0.6 -0.92 -0.41 0.15 0.27 0.7 0.07 -0.07 0.22 0.27 0.2 0.2 -0.01 -0.2 0.05 -2.35 -0.04 0.09 0.06 0.24 -1.75 0.43 0.19 0.11 0.22 0.38 -0.32 -0.19 -0.08
-2.46 -1.92 -3.69 -3.87 -1.03 -0.7 0.88 0.87 -0.11 -0.09 -0.31 -0.6 0.2 0.2 1.04 0.69 0.62 -2.3 0.6 0.53 0.33 0.42 -2.63 0.07 0.16 0.29 0.34 0.16 0.22 0.22 -0.4
-0.31 -0.59 -0.92 -0.91 -0.74 -0.09 0.21 0.67 0.03 0.22 0.41 0.47 -0.05 0.05 0.26 0.2 -0.01 -3.39 0.2 0.01 0.27 -0.01 -1.38 0.39 -0.0 0.18 0.36 0.1 0.25 0.24 -0.09
-0.22 -0.73 -1.04 -1.5 -0.82 -0.36 0.75 0.63 -0.1 -0.09 -0.24 0.01 0.53 0.14 0.54 0.37 0.67 -1.69 0.39 0.27 0.22 0.25 -1.72 0.03 0.04 0.22 0.1 0.53 -0.28 -0.39 -0.47
-0.33 -0.18 -0.39 -0.6 0.02 0.04 0.18 0.5 0.26 0.27 0.41 0.44 -0.12 -0.18 -0.13 0.15 0.17 -1.99 0.16 0.12 0.03 0.05 -3.8 0.19 0.09 0.16 0.21 0.02 -0.01 0.21 0.04
-1.12 -1.01 -1.65 -1.22 -0.49 0.19 0.34 0.11 0.22 0.15 0.08 -0.11 -0.21 0.24 0.15 0.48 0.31 -1.78 0.43 0.32 0.28 0.54 -2.57 0.12 0.42 0.56 0.42 0.27 -0.07 0.12 -0.21
0.17 -0.24 -0.61 -0.44 -0.04 0.25 0.5 0.57 0.02 0.04 0.11 0.05 0.11 0.04 0.16 0.22 0.27 -2.37 0.02 0.07 0.06 0.14 -2.04 0.19 0.14 -0.02 0.13 0.28 -0.17 -0.16 -0.23
-0.13 -0.79 -1.05 -0.54 -0.08 0.2 0.15 0.23 0.03 0.01 0.04 0.01 0.41 0.14 -0.02 0.01 0.24 -1.53 -0.1 0.08 -0.05 0.23 -1.2 0.47 0.1 0.2 0.08 0.35 0.19 0.11 0.28
-0.79 -0.56 -0.83 -0.23 0.03 0.22 0.45 0.69 -0.05 0.15 0.18 0.11 0.24 0.36 0.31 0.32 0.37 -1.76 -0.04 0.03 0.08 0.05 -2.29 -0.08 -0.03 -0.06 0.1 0.07 0.16 0.29 -0.52
0.05 -0.38 -0.74 -0.63 -0.2 0.29 0.3 0.48 -0.13 -0.08 0.07 0.09 0.14 0.12 -0.02 0.11 0.14 -2.14 0.18 0.1 0.15 0.26 -1.41 0.25 0.25 0.16 0.14 0.29 -0.03 -0.01 0.01
-0.16 -0.28 -0.94 -1.2 -0.63 -0.12 0.15 0.22 0.05 0.05 0.06 0.02 0.14 0.03 0.22 0.06 0.13 -1.44 0.58 0.3 0.31 0.23 -1.95 0.29 0.35 0.27 0.17 0.35 -0.11 0.16 0.02
-0.02 -0.13 -0.28 -0.45 -0.33 0.02 0.45 0.51 0.02 -0.02 0.0 -0.09 -0.01 -0.05 0.18 0.17 0.21 -1.41 0.16 0.16 0.07 0.06 -0.97 0.16 0.14 0.11 0.1 0.12 0.1 -0.01 -0.17
-0.27 -0.47 -0.13 -0.2 0.03 0.34 0.16 0.38 0.0 0.04 -0.02 0.01 0.08 0.37 0.41 0.11 0.17 -0.96 -0.06 -0.02 -0.17 0.04 -0.97 0.01 -0.0 0.11 0.05 -0.12 0.03 0.09 0.06
-0.03 -0.31 -0.52 -0.54 -0.35 0.08 0.25 0.46 -0.06 -0.05 0.09 0.17 0.34 -0.13 -0.26 0.16 0.21 -2.01 0.07 0.08 0.16 0.25 -1.03 0.33 0.27 0.18 0.13 0.28 -0.19 0.01 0.12
0.21 0.0 -0.43 -0.84 0.04 0.06 -0.16 0.36 -0.03 -0.08 0.08 0.23 0.06 0.38 0.03 -0.16 -0.11 -1.58 0.23 -0.06 -0.01 0.11 -0.84 0.28 0.05 0.02 0.1 -0.02 0.09 0.22 0.39
-0.54 -0.68 -1.04 -1.12 -0.86 0.16 0.49 0.57 -0.34 -0.08 -0.18 -0.24 -0.06 0.08 0.39 0.22 0.19 -1.77 0.52 0.36 0.18 0.21 -2.14 0.39 0.32 0.34 0.43 0.19 0.11 0.16 0.08
-0.63 -0.71 -0.95 -1.2 -0.96 0.16 0.45 0.61 -0.02 -0.0 0.02 -0.03 0.45 0.18 0.1 0.35 0.38 -1.73 0.16 0.2 0.1 0.25 -1.89 0.32 0.33 0.37 0.39 0.11 -0.2 0.0 -0.03
-0.55 -0.37 -0.77 -1.02 -0.94 0.0 0.66 0.66 -0.02 -0.07 -0.05 -0.15 -0.2 0.26 0.46 0.46 0.41 -3.04 0.45 0.29 0.09 0.25 -2.88 0.15 0.07 0.31 0.26 0.05 0.13 0.12 -0.13
0.02 -0.38 -0.49 -0.66 -0.42 0.04 0.08 0.26 -0.04 0.01 0.01 0.12 0.34 -0.2 0.16 0.35 0.38 -1.17 0.87 0.43 0.08 0.11 -2.57 0.26 0.1 0.06 0.11 0.25 -0.35 -0.19 -0.36
0.17 -0.06 -0.12 -0.53 -0.43 0.08 0.37 0.37 0.07 -0.01 0.05 -0.07 -0.15 0.07 0.28 0.3 0.23 -3.12 0.29 0.12 0.12 0.22 -3.46 0.17 0.13 0.17 0.12 0.08 -0.02 -0.0 0.11
0.21 -0.08 -0.39 -0.45 -0.16 0.16 0.49 0.62 -0.1 -0.09 -0.04 -0.03 0.15 0.01 0.03 0.14 0.16 -2.65 0.1 -0.01 0.04 0.13 -0.84 0.14 0.16 0.05 0.03 0.27 0.01 -0.01 -0.22
-0.44 -0.51 -0.67 -0.72 -0.68 -0.04 -0.08 0.03 0.06 0.02 0.25 0.32 0.67 0.02 -0.31 0.05 0.16 -1.64 -0.38 0.1 0.09 0.17 -0.39 0.31 0.24 0.15 0.04 0.35 0.08 0.43 0.44
-0.17 -0.13 -0.41 -0.62 -0.5 -0.13 0.21 0.25 0.07 0.06 0.11 0.16 0.16 -0.29 -0.24 0.28 0.34 -2.03 0.17 0.1 0.17 0.18 -1.16 0.25 0.24 0.2 0.17 0.04 0.14 0.28 0.19
-0.56 -0.68 -0.99 -0.99 -0.14 0.39 0.31 0.46 0.01 0.05 -0.02 0.14 0.24 0.19 0.06 0.31 0.08 -1.2 0.09 -0.17 0.19 0.08 -0.53 0.25 0.11 0.23 -0.05 0.19 -0.01 -0.01 0.33
0.15 0.03 -0.32 -0.61 -0.06 0.21 0.3 0.34 -0.1 -0.16 -0.0 -0.13 -0.09 0.32 0.29 0.25 0.2 -2.93 0.15 -0.04 0.09 0.19 -0.76 0.1 0.1 0.13 0.17 0.1 0.05 -0.0 -0.26
-0.59 -0.49 -2.71 -3.45 -1.13 -0.33 0.28 0.76 -0.02 -0.38 -0.22 -0.11 0.57 1.17 0.68 0.21 0.3 -4.89 0.38 0.22 0.43 0.38 -4.58 0.36 0.24 0.41 0.28 0.23 -0.23 -0.23 -0.18
-0.84 -0.64 -1.2 -1.02 -0.32 0.09 0.26 0.23 -0.02 -0.04 -0.04 -0.12 0.17 0.8 0.74 0.2 0.18 -1.25 0.3 0.12 0.14 0.18 -4.03 0.16 0.14 0.25 0.33 0.1 0.19 0.11 -0.03
-2.24 -1.5 -2.09 -0.85 -0.53 0.14 0.55 0.61 0.22 0.34 0.15 0.06 -0.04 -0.32 0.25 0.29 0.31 -2.31 0.4 0.38 0.2 0.36 -3.49 0.2 0.35 0.23 0.3 0.12 0.23 0.31 0.26
-0.64 -0.48 -1.72 -2.16 -0.5 0.14 0.36 0.56 0.03 -0.11 0.07 -0.08 0.27 0.64 0.54 0.17 0.32 -2.07 0.34 0.09 0.17 0.27 -4.22 0.31 0.15 0.34 0.21 -0.02 -0.02 0.17 0.24
-0.45 -0.36 -0.87 -0.95 -0.47 -0.03 0.29 0.36 0.12 0.16 0.18 0.13 0.04 0.37 0.35 0.22 0.3 -1.89 0.19 0.2 0.09 0.17 -1.41 0.29 0.21 0.21 0.24 -0.03 -0.06 0.08 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.