Heatmap: Cluster_223 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.78 0.66 0.56 0.55 0.71 0.86 0.87 1.0 0.73 0.83 0.83 0.83 0.81 0.83 0.71 0.75 0.78 0.3 0.76 0.83 0.84 0.88 0.4 0.9 0.94 0.89 0.87 0.9 0.73 0.72 0.87
0.55 0.6 0.48 0.38 0.67 0.88 0.81 0.79 0.69 0.78 0.86 0.85 1.0 0.79 0.69 0.8 0.8 0.35 0.78 0.84 0.85 0.88 0.54 0.97 0.85 0.9 0.8 0.82 0.78 0.8 0.99
0.41 0.41 0.4 0.31 0.42 0.63 0.79 0.91 0.62 0.66 0.68 0.69 1.0 0.86 0.87 0.9 0.89 0.29 0.83 0.79 0.76 0.87 0.32 0.77 0.9 0.9 0.83 0.74 0.65 0.74 0.82
0.8 0.65 0.48 0.44 0.64 0.92 0.86 1.0 0.68 0.67 0.71 0.67 0.73 0.97 0.83 0.74 0.74 0.16 0.91 0.8 0.79 0.86 0.29 0.89 0.81 0.84 0.86 0.89 0.79 0.75 0.67
0.3 0.25 0.18 0.27 0.42 0.75 0.95 1.0 0.9 0.83 0.76 0.66 0.47 0.44 0.7 0.77 0.76 0.25 0.88 0.86 0.72 0.82 0.23 0.77 0.8 0.71 0.83 0.75 0.78 0.76 0.42
0.64 0.64 0.55 0.52 0.53 0.76 0.98 1.0 0.68 0.67 0.73 0.74 0.86 0.75 0.83 0.91 0.92 0.24 0.9 0.87 0.84 0.88 0.36 0.85 0.87 0.86 0.8 0.88 0.71 0.68 0.7
0.65 0.52 0.57 0.58 0.74 0.86 0.89 0.92 0.84 0.9 0.94 0.84 0.79 1.0 0.92 0.81 0.82 0.36 0.84 0.82 0.75 0.78 0.26 0.82 0.81 0.81 0.88 0.74 0.88 0.9 0.85
0.9 0.76 0.6 0.61 0.75 0.94 0.87 1.0 0.7 0.67 0.76 0.71 0.82 0.97 0.83 0.79 0.75 0.2 0.68 0.68 0.75 0.8 0.43 0.84 0.78 0.76 0.77 0.79 0.77 0.76 0.76
0.29 0.33 0.23 0.26 0.3 0.48 0.54 0.89 0.37 0.36 0.37 0.45 0.5 0.59 0.57 0.41 0.46 0.23 0.52 0.49 0.47 0.58 0.27 0.56 0.48 0.48 0.46 0.5 0.5 0.63 1.0
0.79 0.55 0.34 0.26 0.71 1.0 0.79 0.89 0.63 0.53 0.65 0.57 0.56 0.77 0.79 0.73 0.69 0.11 0.8 0.61 0.75 0.77 0.43 0.82 0.79 0.73 0.8 0.71 0.71 0.75 0.64
0.82 0.77 0.76 0.67 0.8 0.89 0.99 0.99 0.78 0.77 0.91 0.84 1.0 0.92 0.86 0.87 0.94 0.48 0.8 0.84 0.85 0.92 0.35 0.96 0.9 0.95 0.99 0.92 0.91 0.84 0.91
0.95 0.76 0.66 0.6 0.65 0.72 0.95 1.0 0.76 0.78 0.75 0.78 0.84 0.91 0.91 0.89 0.94 0.31 0.93 0.86 0.81 0.82 0.24 0.86 0.83 0.82 0.82 0.89 0.83 0.8 0.67
0.66 0.64 0.47 0.38 0.46 0.61 0.74 0.88 0.56 0.53 0.58 0.6 0.58 0.72 0.6 0.59 0.62 0.2 0.74 0.61 0.64 0.64 0.48 0.68 0.64 0.6 0.58 0.59 0.63 0.68 1.0
0.63 0.53 0.31 0.42 0.8 0.93 0.79 0.87 0.76 0.71 0.82 0.82 0.65 0.9 1.0 0.88 0.81 0.19 0.68 0.75 0.75 0.84 0.41 0.82 0.72 0.8 0.78 0.74 0.72 0.79 0.87
0.44 0.45 0.39 0.44 0.53 0.77 0.86 1.0 0.81 0.8 0.85 0.82 0.7 0.76 0.77 0.83 0.81 0.09 0.81 0.82 0.81 0.77 0.21 0.84 0.78 0.82 0.86 0.78 0.75 0.78 0.75
0.79 0.74 0.53 0.45 0.71 0.86 0.87 0.9 0.86 0.77 0.86 0.92 0.85 0.79 0.94 1.0 0.98 0.28 0.98 0.9 0.96 0.95 0.61 0.9 0.83 0.88 0.91 0.91 0.75 0.78 0.73
0.69 0.6 0.45 0.34 0.5 0.72 0.83 0.94 0.64 0.61 0.68 0.69 0.68 0.55 0.56 0.72 0.8 0.3 1.0 0.86 0.75 0.79 0.3 0.83 0.81 0.8 0.79 0.74 0.61 0.73 0.79
0.56 0.61 0.56 0.56 0.79 0.91 1.0 0.99 0.79 0.81 0.8 0.77 0.9 0.97 0.84 0.9 0.93 0.36 0.89 0.88 0.81 0.87 0.24 0.8 0.85 0.97 0.94 0.87 0.85 0.86 0.84
0.71 0.55 0.57 0.62 0.62 0.73 0.83 1.0 0.83 0.81 0.78 0.8 0.85 0.94 0.8 0.71 0.84 0.22 0.93 0.93 0.84 0.84 0.49 0.94 0.92 0.92 0.99 0.83 0.8 0.84 0.74
0.73 0.6 0.59 0.64 0.53 0.76 0.8 0.88 0.72 0.72 0.83 0.99 0.97 0.6 0.65 0.88 0.92 0.28 0.88 0.85 0.8 0.86 0.29 1.0 0.93 0.92 0.84 0.84 0.7 0.89 0.99
0.69 0.64 0.58 0.62 0.55 0.76 0.93 1.0 0.62 0.59 0.63 0.55 0.71 0.8 0.76 0.74 0.67 0.18 0.65 0.61 0.64 0.66 0.44 0.67 0.68 0.68 0.66 0.69 0.71 0.71 0.69
0.59 0.5 0.39 0.38 0.59 0.89 0.75 0.78 0.62 0.6 0.7 0.64 0.82 0.75 0.73 0.91 0.9 0.21 0.91 0.78 0.93 0.93 0.4 0.86 0.93 0.93 0.88 1.0 0.68 0.63 0.59
0.33 0.34 0.22 0.34 0.49 0.77 0.73 0.84 0.64 0.6 0.63 0.61 0.47 1.0 0.92 0.7 0.65 0.17 0.8 0.66 0.67 0.67 0.23 0.7 0.59 0.71 0.79 0.57 0.6 0.65 0.55
0.86 0.6 0.5 0.46 0.54 0.73 0.79 0.71 0.76 0.69 0.7 0.69 0.73 0.78 0.86 1.0 1.0 0.09 0.77 0.82 0.85 0.83 0.1 0.82 0.76 0.78 0.79 0.98 0.66 0.63 0.48
0.62 0.5 0.33 0.32 0.48 0.71 0.72 0.84 0.63 0.68 0.75 0.87 0.85 0.62 0.58 0.64 0.75 0.27 0.69 0.76 0.8 0.85 0.52 1.0 0.91 0.77 0.73 0.89 0.64 0.68 0.79
0.68 0.71 0.69 0.64 0.78 0.9 1.0 0.87 0.68 0.73 0.74 0.7 0.84 0.74 0.87 0.85 0.82 0.5 0.8 0.79 0.75 0.81 0.37 0.7 0.79 0.82 0.83 0.83 0.77 0.81 0.79
0.79 0.7 0.54 0.49 0.6 0.77 0.84 1.0 0.62 0.68 0.71 0.72 0.76 0.77 0.7 0.75 0.77 0.2 0.8 0.75 0.77 0.87 0.34 0.86 0.82 0.82 0.81 0.77 0.73 0.76 0.95
0.49 0.47 0.39 0.45 0.53 0.61 0.77 0.86 0.75 0.77 0.8 0.87 0.77 0.65 0.71 0.75 0.82 0.28 0.72 0.78 0.71 0.78 0.41 0.81 0.78 0.77 0.78 0.73 0.68 0.78 1.0
0.79 0.78 0.58 0.44 0.44 0.81 1.0 0.75 0.88 0.78 0.78 0.68 0.58 0.93 0.96 0.87 0.85 0.05 0.84 0.8 0.85 0.88 0.02 0.79 0.91 0.93 0.95 0.93 0.95 0.82 0.58
0.65 0.57 0.44 0.44 0.5 0.54 0.84 1.0 0.78 0.73 0.81 0.72 0.6 0.58 0.75 0.72 0.74 0.26 0.95 0.82 0.69 0.71 0.17 0.75 0.74 0.79 0.81 0.7 0.77 0.77 0.62
0.68 0.57 0.4 0.34 0.75 1.0 0.85 0.9 0.57 0.51 0.56 0.52 0.59 0.88 0.78 0.74 0.68 0.14 0.73 0.65 0.71 0.75 0.52 0.73 0.72 0.69 0.68 0.8 0.68 0.6 0.5
0.81 0.67 0.41 0.37 0.6 1.0 0.8 0.88 0.66 0.54 0.68 0.64 0.67 0.85 0.72 0.78 0.69 0.16 0.72 0.62 0.75 0.71 0.17 0.78 0.72 0.68 0.72 0.7 0.62 0.64 0.6
0.88 0.75 0.5 0.44 0.71 0.9 0.89 0.99 0.77 0.71 0.74 0.76 0.78 1.0 0.85 0.85 0.79 0.24 0.9 0.78 0.84 0.9 0.58 0.78 0.83 0.83 0.84 0.94 0.81 0.82 0.67
0.73 0.65 0.59 0.5 0.58 0.69 0.78 0.88 0.79 0.77 0.82 0.82 0.76 0.86 0.86 0.84 0.88 0.26 0.88 0.87 0.85 0.85 0.38 1.0 0.9 0.84 0.88 0.86 0.81 0.93 0.76
0.76 0.76 0.71 0.59 0.55 0.88 0.81 0.82 0.68 0.59 0.61 0.55 0.68 0.83 1.0 0.87 0.73 0.25 0.82 0.7 0.8 0.84 0.14 0.78 0.85 0.96 0.86 0.72 0.79 0.67 0.54
0.74 0.57 0.41 0.33 0.46 0.68 0.74 1.0 0.64 0.59 0.72 0.74 0.71 0.71 0.61 0.54 0.64 0.12 0.6 0.66 0.64 0.73 0.18 0.83 0.7 0.67 0.72 0.8 0.49 0.54 0.58
0.09 0.13 0.04 0.03 0.24 0.3 0.9 0.89 0.45 0.46 0.39 0.32 0.56 0.56 1.0 0.79 0.75 0.1 0.74 0.7 0.61 0.65 0.08 0.51 0.54 0.59 0.61 0.54 0.57 0.56 0.37
0.51 0.42 0.33 0.33 0.38 0.59 0.73 1.0 0.64 0.73 0.84 0.87 0.61 0.65 0.75 0.72 0.63 0.06 0.72 0.64 0.76 0.63 0.24 0.83 0.63 0.71 0.81 0.68 0.75 0.75 0.59
0.51 0.36 0.29 0.21 0.34 0.46 1.0 0.92 0.55 0.56 0.5 0.6 0.86 0.66 0.86 0.77 0.95 0.18 0.78 0.72 0.69 0.71 0.18 0.61 0.61 0.69 0.64 0.86 0.49 0.45 0.43
0.56 0.62 0.54 0.47 0.72 0.73 0.8 1.0 0.85 0.85 0.94 0.96 0.65 0.62 0.65 0.79 0.79 0.18 0.79 0.77 0.72 0.73 0.05 0.81 0.75 0.79 0.82 0.72 0.7 0.82 0.73
0.31 0.34 0.22 0.29 0.48 0.78 0.86 0.73 0.79 0.75 0.72 0.63 0.59 0.8 0.75 0.95 0.85 0.2 0.92 0.85 0.82 0.99 0.11 0.74 0.91 1.0 0.91 0.82 0.65 0.74 0.59
0.76 0.57 0.44 0.5 0.66 0.8 0.96 1.0 0.69 0.7 0.73 0.7 0.73 0.69 0.76 0.79 0.82 0.13 0.69 0.71 0.7 0.74 0.16 0.77 0.75 0.67 0.74 0.82 0.6 0.6 0.58
0.66 0.42 0.35 0.5 0.69 0.83 0.8 0.85 0.74 0.73 0.75 0.73 0.96 0.8 0.71 0.73 0.85 0.25 0.68 0.76 0.7 0.85 0.31 1.0 0.77 0.83 0.77 0.92 0.82 0.78 0.88
0.36 0.42 0.35 0.53 0.64 0.72 0.85 1.0 0.6 0.69 0.7 0.67 0.73 0.8 0.77 0.78 0.8 0.18 0.6 0.63 0.66 0.64 0.13 0.59 0.61 0.6 0.67 0.65 0.7 0.76 0.43
0.74 0.55 0.43 0.46 0.62 0.88 0.88 1.0 0.66 0.68 0.75 0.76 0.79 0.78 0.71 0.77 0.79 0.16 0.81 0.77 0.8 0.86 0.27 0.85 0.85 0.8 0.79 0.87 0.7 0.71 0.72
0.6 0.55 0.35 0.29 0.43 0.61 0.74 0.78 0.69 0.69 0.69 0.68 0.73 0.68 0.78 0.7 0.73 0.25 1.0 0.82 0.83 0.79 0.17 0.81 0.85 0.81 0.75 0.85 0.62 0.74 0.68
0.7 0.65 0.58 0.52 0.56 0.71 0.96 1.0 0.72 0.7 0.71 0.66 0.7 0.68 0.8 0.79 0.81 0.26 0.79 0.79 0.74 0.74 0.36 0.78 0.78 0.76 0.75 0.77 0.75 0.7 0.63
0.63 0.54 0.69 0.66 0.77 0.96 0.85 0.98 0.76 0.78 0.74 0.76 0.8 0.98 1.0 0.81 0.85 0.39 0.72 0.75 0.67 0.78 0.38 0.76 0.75 0.81 0.78 0.7 0.77 0.8 0.79
0.71 0.58 0.51 0.5 0.57 0.76 0.86 1.0 0.7 0.7 0.77 0.82 0.92 0.66 0.61 0.81 0.84 0.18 0.76 0.77 0.81 0.86 0.36 0.91 0.88 0.82 0.8 0.88 0.64 0.73 0.79
0.89 0.76 0.57 0.43 0.78 0.8 0.68 0.98 0.75 0.72 0.81 0.9 0.8 0.99 0.78 0.69 0.71 0.26 0.89 0.73 0.76 0.83 0.43 0.93 0.79 0.78 0.82 0.75 0.81 0.89 1.0
0.46 0.42 0.33 0.31 0.37 0.75 0.95 1.0 0.53 0.64 0.59 0.57 0.65 0.71 0.89 0.79 0.77 0.2 0.97 0.87 0.76 0.78 0.15 0.88 0.84 0.85 0.91 0.77 0.73 0.76 0.71
0.43 0.4 0.34 0.29 0.34 0.73 0.9 1.0 0.65 0.66 0.67 0.64 0.9 0.75 0.71 0.84 0.86 0.2 0.73 0.76 0.7 0.78 0.18 0.82 0.83 0.85 0.86 0.71 0.57 0.66 0.64
0.43 0.49 0.37 0.31 0.33 0.63 1.0 1.0 0.62 0.6 0.61 0.57 0.55 0.76 0.87 0.87 0.84 0.08 0.86 0.77 0.67 0.75 0.09 0.7 0.66 0.78 0.75 0.65 0.69 0.69 0.58
0.55 0.42 0.39 0.34 0.41 0.56 0.58 0.65 0.53 0.55 0.55 0.59 0.69 0.48 0.61 0.69 0.71 0.24 1.0 0.73 0.58 0.59 0.09 0.65 0.59 0.57 0.59 0.65 0.43 0.48 0.43
0.87 0.74 0.71 0.54 0.57 0.82 1.0 1.0 0.81 0.77 0.8 0.74 0.7 0.81 0.94 0.95 0.91 0.09 0.95 0.84 0.84 0.9 0.07 0.87 0.85 0.87 0.84 0.82 0.76 0.77 0.84
0.75 0.61 0.5 0.48 0.58 0.73 0.91 1.0 0.61 0.61 0.63 0.64 0.72 0.65 0.66 0.72 0.73 0.1 0.7 0.65 0.67 0.71 0.36 0.72 0.73 0.68 0.66 0.79 0.66 0.65 0.56
0.46 0.44 0.39 0.38 0.39 0.61 0.59 0.64 0.65 0.64 0.75 0.78 1.0 0.64 0.51 0.65 0.7 0.2 0.48 0.68 0.67 0.71 0.48 0.78 0.74 0.69 0.65 0.8 0.66 0.84 0.85
0.7 0.72 0.6 0.51 0.56 0.72 0.91 0.94 0.83 0.82 0.85 0.88 0.88 0.65 0.67 0.96 1.0 0.19 0.89 0.85 0.89 0.9 0.35 0.94 0.93 0.91 0.89 0.82 0.87 0.96 0.9
0.49 0.45 0.37 0.37 0.66 0.96 0.9 1.0 0.73 0.75 0.72 0.8 0.86 0.83 0.76 0.9 0.77 0.32 0.77 0.65 0.83 0.77 0.51 0.87 0.78 0.85 0.7 0.83 0.72 0.72 0.92
0.88 0.81 0.64 0.52 0.76 0.92 0.97 1.0 0.74 0.71 0.79 0.72 0.75 0.99 0.97 0.95 0.91 0.1 0.88 0.77 0.84 0.9 0.47 0.85 0.85 0.87 0.89 0.85 0.82 0.79 0.66
0.29 0.32 0.07 0.04 0.2 0.35 0.54 0.75 0.44 0.34 0.38 0.41 0.66 1.0 0.71 0.51 0.55 0.01 0.58 0.52 0.6 0.58 0.02 0.57 0.53 0.59 0.54 0.52 0.38 0.38 0.39
0.32 0.37 0.25 0.28 0.46 0.61 0.69 0.68 0.57 0.56 0.56 0.53 0.65 1.0 0.96 0.66 0.65 0.24 0.71 0.63 0.64 0.65 0.04 0.64 0.63 0.68 0.72 0.62 0.66 0.62 0.57
0.14 0.23 0.15 0.36 0.45 0.72 0.96 1.0 0.76 0.83 0.73 0.68 0.64 0.52 0.78 0.8 0.81 0.13 0.86 0.85 0.75 0.84 0.06 0.75 0.83 0.77 0.81 0.71 0.77 0.81 0.78
0.41 0.46 0.2 0.14 0.45 0.71 0.82 0.94 0.66 0.6 0.67 0.61 0.77 1.0 0.93 0.72 0.8 0.15 0.81 0.68 0.72 0.77 0.03 0.8 0.71 0.81 0.74 0.63 0.63 0.72 0.75
0.57 0.6 0.42 0.4 0.56 0.76 0.94 0.99 0.84 0.86 0.88 0.85 0.8 1.0 0.99 0.9 0.96 0.21 0.88 0.89 0.83 0.87 0.29 0.95 0.89 0.89 0.92 0.76 0.74 0.82 0.74

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)