Heatmap: Cluster_9 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_22321.1 (PHL2)	-0.3	-0.44	-1.0	-1.1	-0.44	0.08	-0.2	-0.43	-0.55	-0.4	-0.35	-0.12	0.55	0.6	0.11	-0.23	-0.02	-0.42	0.04	-0.23	0.1	-0.02	0.19	0.29	0.31	0.07	-0.17	0.08	0.5	0.31	1.05
Lsat_1_v5_gn_0_34641.1	-0.63	-0.55	-0.72	-0.34	-0.44	-0.09	0.08	0.3	-0.07	0.03	0.04	0.45	0.4	-0.12	-0.3	-0.19	0.11	-0.93	0.04	0.09	0.05	0.13	-1.44	0.49	0.15	0.15	0.15	0.3	0.16	0.2	0.67
Lsat_1_v5_gn_0_9821.1 (NACA2)	-0.34	-0.64	-0.67	-0.38	-0.2	0.03	-0.07	0.24	-0.21	-0.16	-0.04	0.15	0.73	-0.02	-0.18	0.02	0.11	-0.4	-0.25	-0.06	-0.01	0.02	0.01	0.37	0.25	0.11	0.08	0.11	-0.11	-0.01	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_10140.1 (dNK)	-0.52	-0.65	-0.88	-0.71	-0.45	-0.15	-0.17	0.46	-0.38	-0.28	-0.2	0.06	0.44	0.73	0.36	0.03	-0.01	-0.09	-0.19	-0.28	-0.21	-0.14	0.35	0.16	-0.07	-0.13	-0.25	-0.4	0.15	0.35	1.09
Lsat_1_v5_gn_1_20201.1 (PDE191)	-1.56	-1.52	-2.02	-1.75	-0.78	-0.03	0.23	0.88	-0.15	0.03	0.14	0.41	0.61	-0.23	-0.31	0.24	0.36	-1.35	-0.03	0.28	0.11	0.3	-2.07	0.58	0.35	0.22	0.15	0.14	-0.33	0.2	0.98
Lsat_1_v5_gn_1_40001.1 (TGD4)	-0.4	-0.58	-0.63	-0.8	-0.38	-0.26	-0.41	-0.11	-0.02	0.01	0.16	0.35	0.78	0.32	-0.03	0.07	0.16	-1.08	-0.1	-0.07	-0.08	-0.0	-0.37	0.28	0.23	0.14	0.1	0.13	-0.29	0.11	0.95
Lsat_1_v5_gn_1_55640.1 (MEE40)	-0.14	-0.24	-0.3	-0.01	-0.03	-0.1	-0.14	0.26	-0.14	-0.21	-0.06	0.17	0.78	0.35	-0.16	-0.13	-0.12	-1.55	-0.43	-0.38	-0.2	-0.09	0.18	0.11	-0.03	-0.25	-0.23	-0.05	0.14	0.27	1.01
Lsat_1_v5_gn_1_60941.1	-0.51	-0.7	-0.75	-0.85	-0.39	-0.17	-0.07	0.3	-0.19	-0.07	0.11	0.12	0.61	-0.02	0.07	-0.2	0.04	-0.56	0.06	-0.04	0.07	0.05	0.01	0.34	0.15	-0.06	0.17	0.04	-0.01	0.19	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_77541.1	-0.57	-0.68	-1.22	-1.06	-0.2	0.08	-0.49	0.1	-0.3	-0.52	-0.22	0.07	0.4	0.8	0.27	-0.13	-0.04	-0.85	-0.33	-0.38	-0.04	0.04	-0.2	0.52	0.2	0.04	-0.08	-0.22	0.46	0.45	1.24
Lsat_1_v5_gn_1_78401.1 (CPN20)	-0.37	-0.53	-0.53	-0.33	-0.09	0.1	-0.28	-0.0	-0.17	-0.14	0.03	0.16	0.77	0.4	-0.06	-0.22	-0.12	-0.78	-0.54	-0.37	-0.2	-0.12	-0.07	0.26	-0.02	-0.1	-0.17	0.14	0.14	0.3	1.2
Lsat_1_v5_gn_1_91720.1 (ATH)	-0.38	-0.56	-0.84	-0.97	-0.35	-0.28	-0.56	0.33	-0.34	-0.41	-0.13	0.1	0.45	1.05	0.57	-0.18	-0.12	-0.72	-0.41	-0.41	-0.24	-0.21	0.31	0.12	-0.03	-0.12	-0.24	-0.47	0.37	0.52	1.23
Lsat_1_v5_gn_2_103740.1 (LDA)	-0.3	-0.39	-0.62	-0.25	-0.58	-0.6	0.15	0.39	0.23	0.24	0.28	0.41	0.73	-0.19	-0.0	-0.12	0.11	-1.28	-0.17	0.07	-0.1	-0.06	-1.68	0.28	0.04	0.01	-0.01	0.24	0.02	0.33	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_104041.1 (METS1)	-0.94	-1.05	-0.96	-0.69	-0.48	-0.55	-0.3	-0.17	-0.16	-0.06	-0.07	0.21	0.69	-0.09	0.08	-0.08	0.23	-0.26	0.21	0.18	0.03	-0.03	0.73	0.4	0.25	-0.02	-0.03	0.08	0.13	0.26	0.56
Lsat_1_v5_gn_2_105620.1 (dS17)	-1.63	-1.73	-2.5	-1.13	-0.8	-0.43	0.05	0.89	-0.4	-0.71	-0.43	0.26	1.57	-0.3	-0.27	0.22	0.35	-0.41	-0.54	0.06	0.13	-0.01	-0.45	0.61	0.26	0.12	-0.26	0.33	-0.58	-0.06	1.23
Lsat_1_v5_gn_2_108021.1 (CJD1)	-0.33	-0.44	-0.89	-0.9	-0.63	-0.18	0.16	0.48	0.01	0.06	0.23	0.42	0.67	-0.51	-0.62	0.04	0.17	-0.7	-0.15	0.14	-0.01	0.24	-0.51	0.4	0.32	0.21	0.05	0.28	-0.26	-0.02	0.5
Lsat_1_v5_gn_2_11821.1 (ORRM6)	-0.48	-0.72	-0.43	-0.48	-0.59	-0.24	-0.22	0.14	-0.05	-0.02	0.25	0.54	0.68	0.22	-0.05	-0.19	-0.14	-0.74	-0.23	0.1	0.02	0.17	-0.71	0.47	0.37	0.02	-0.05	-0.14	0.01	0.16	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_16580.1 (PTAC3)	-0.82	-0.86	-1.01	-0.53	-0.81	-0.51	-0.73	-0.19	-0.3	-0.14	0.04	0.48	1.24	0.63	0.11	-0.27	-0.06	-1.27	-0.66	-0.46	-0.21	-0.18	-0.85	0.46	0.1	-0.13	-0.38	-0.43	0.24	0.62	1.75
Lsat_1_v5_gn_2_41161.1 (CMT1)	-0.28	-0.31	-0.37	-0.41	-0.28	-0.08	-0.32	-0.22	-0.05	0.01	-0.0	0.17	0.58	0.03	-0.14	-0.08	0.05	-0.75	-0.09	-0.12	-0.11	0.01	0.4	0.28	0.05	-0.02	-0.02	0.06	0.2	0.38	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_43480.1 (CAC2)	-2.13	-2.5	-3.56	-3.54	0.18	-0.71	-0.41	0.41	0.26	-0.81	-0.0	0.06	0.05	1.3	0.81	0.05	-0.28	-0.52	-1.13	-1.83	-0.88	-0.64	0.22	0.16	-0.57	-0.18	-1.77	-1.47	0.41	1.26	2.28
Lsat_1_v5_gn_2_51040.1	-0.04	-0.62	-1.01	-1.12	-0.93	-0.25	-0.36	0.1	-0.13	-0.09	0.04	0.45	0.8	0.24	-0.35	-0.02	0.2	-1.36	-0.41	-0.03	0.07	0.18	-1.34	0.59	0.35	0.19	0.07	-0.01	0.16	0.4	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_6520.1	-0.13	-0.36	-0.4	-0.33	-0.02	-0.08	-0.33	-0.17	-0.1	-0.04	0.1	0.24	0.85	0.28	0.07	-0.03	0.06	-0.84	-0.14	-0.19	-0.18	-0.16	-0.2	0.21	0.04	-0.13	-0.14	0.08	0.02	0.13	0.8
Lsat_1_v5_gn_2_67361.1 (DPE1)	-0.35	-0.42	-0.22	-0.18	-0.33	-0.48	-0.15	-0.23	0.25	0.13	0.34	0.5	0.82	0.28	0.05	0.05	0.16	-1.18	-0.2	-0.04	-0.18	-0.21	-1.87	0.3	-0.04	-0.14	-0.1	0.07	-0.25	0.04	1.04
Lsat_1_v5_gn_2_77400.1 (ERA1)	-0.58	-0.8	-0.89	-1.06	-0.47	0.2	-0.23	0.09	-0.09	-0.0	0.16	0.37	0.7	0.61	0.13	-0.01	-0.01	-1.21	-0.19	-0.13	-0.06	0.08	-0.58	0.37	0.19	0.02	0.03	0.01	-0.17	0.1	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_78460.1	-0.44	-0.59	-0.94	-1.16	-0.89	-0.4	-0.04	0.35	-0.03	0.05	0.12	0.55	0.97	-0.48	-0.66	-0.14	0.12	-0.73	-0.25	0.13	0.19	0.23	-0.91	0.6	0.3	0.13	-0.04	0.31	-0.21	0.09	0.9
Lsat_1_v5_gn_2_96400.1 (TIC100)	-0.45	-0.7	-0.93	-0.97	-0.44	-0.08	0.16	0.58	-0.15	-0.05	0.09	0.34	0.73	-0.05	-0.24	0.06	0.23	-1.27	-0.11	0.02	0.01	0.1	-0.83	0.42	0.24	0.1	-0.0	0.24	-0.16	0.11	0.77
Lsat_1_v5_gn_3_102740.1 (TGD2)	-0.18	-0.42	-0.35	-0.39	-0.24	-0.03	-0.18	-0.11	-0.03	0.04	0.12	0.23	0.6	-0.06	-0.1	0.13	0.2	-0.82	0.03	-0.04	-0.04	0.04	-0.66	0.19	0.1	0.02	0.03	0.14	0.08	0.21	0.59
Lsat_1_v5_gn_3_13260.1 (FAX4)	-0.76	-0.67	-0.81	-0.88	-0.43	-0.22	-0.31	-0.02	-0.16	-0.36	-0.11	0.06	0.71	0.28	0.04	-0.03	-0.14	-0.22	-0.03	-0.17	-0.22	0.03	0.52	0.37	0.04	0.03	-0.17	-0.13	0.27	0.39	1.11
Lsat_1_v5_gn_3_32880.1 (DUF177)	-0.78	-0.9	-1.21	-1.41	-0.7	-0.27	0.19	0.83	-0.09	-0.02	0.09	0.44	0.49	-0.07	-0.08	0.0	0.15	-1.15	-0.01	0.13	0.23	0.25	-0.45	0.49	0.21	0.26	0.12	-0.09	-0.18	0.01	0.7
Lsat_1_v5_gn_3_34561.1 (FSD3)	-0.45	-0.85	-1.32	-1.49	-0.5	-0.09	-0.21	0.29	-0.25	-0.25	-0.06	0.33	1.18	0.2	-0.15	-0.07	0.01	-0.69	-0.06	-0.08	0.04	0.27	0.01	0.52	0.18	-0.0	-0.06	0.27	-0.29	0.01	0.79
Lsat_1_v5_gn_3_35721.1 (FtsHi5)	-0.7	-0.7	-1.09	-1.06	-0.29	-0.22	-0.21	0.02	-0.02	0.06	0.14	0.42	0.57	0.19	-0.09	-0.04	0.06	-1.14	-0.07	-0.12	-0.09	0.04	-0.47	0.23	0.14	0.07	-0.06	-0.03	0.14	0.44	1.3
Lsat_1_v5_gn_3_35820.1	-0.18	-0.07	-0.04	0.05	-0.28	-0.02	0.02	0.17	-0.02	-0.01	0.02	0.18	0.48	0.14	-0.15	-0.04	0.07	-0.57	-0.18	-0.18	-0.09	0.0	-0.29	0.18	0.05	-0.02	-0.12	-0.05	0.13	0.07	0.38
Lsat_1_v5_gn_3_49121.1 (PRIN2)	-1.05	-0.91	-1.24	-1.1	-0.36	0.04	-0.42	-0.09	-0.33	-0.36	-0.13	0.26	0.75	0.57	0.19	-0.31	-0.12	-0.46	-0.47	-0.24	-0.24	-0.02	0.35	0.52	0.15	0.06	-0.37	-0.44	0.16	0.49	1.52
Lsat_1_v5_gn_3_53720.1 (FLN2)	-1.58	-1.38	-1.92	-1.73	-0.63	-0.03	-0.59	0.35	-0.5	-0.4	-0.21	0.42	1.09	0.63	0.18	-0.21	-0.12	-0.59	-0.37	-0.48	-0.03	-0.0	-0.16	0.66	0.29	0.03	-0.34	-0.4	0.21	0.38	1.6
Lsat_1_v5_gn_3_65141.1 (EMB2247)	-0.31	-0.29	-0.44	-0.27	-0.65	-0.4	-0.19	0.39	0.12	0.14	0.24	0.46	0.76	0.19	-0.1	-0.12	0.14	-1.81	-0.42	-0.16	-0.13	-0.09	-1.54	0.37	0.13	-0.1	-0.17	0.07	-0.04	0.28	1.09
Lsat_1_v5_gn_4_100861.1 (TRZ3)	-0.52	-0.36	-0.86	-0.51	-0.09	0.01	-0.13	0.38	-0.4	-0.42	-0.36	-0.04	0.59	0.72	0.38	0.07	-0.03	-0.61	-0.18	-0.38	-0.18	-0.14	0.13	-0.01	-0.09	-0.2	-0.44	-0.33	0.46	0.42	1.08
Lsat_1_v5_gn_4_136101.1 (dNK)	-1.1	-1.11	-1.43	-0.9	-0.82	-0.21	-0.47	0.5	-0.41	-0.28	-0.26	0.2	0.92	0.99	0.44	0.03	0.02	-0.75	-0.87	-0.4	-0.3	-0.1	-0.12	0.49	0.1	-0.16	-0.36	-0.32	0.14	0.38	1.51
Lsat_1_v5_gn_4_142580.1 (RNE)	-0.37	-0.53	-0.71	-0.47	-0.53	-0.27	0.19	0.32	0.02	0.03	0.17	0.27	0.51	0.22	0.12	-0.05	0.08	-1.45	0.09	0.16	-0.06	0.01	-1.31	0.22	0.06	0.13	0.14	-0.03	-0.1	0.19	0.89
Lsat_1_v5_gn_4_30200.1	-0.4	-0.59	-0.53	-0.3	-0.3	-0.19	-0.34	-0.42	0.11	0.08	0.29	0.28	0.77	0.35	0.05	-0.01	0.17	-1.19	-0.22	-0.0	-0.11	-0.07	-0.73	0.35	0.23	-0.08	-0.02	0.11	-0.11	0.2	0.88
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.