Heatmap: Cluster_113 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.73 2.1 0.15 0.0 0.22 0.0 7.03 0.0 0.0 0.0 0.34 1.89 0.0 0.11 0.24 0.06 0.09 0.0 0.0 0.1 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.02 0.09 0.06 0.05 0.11 0.03 0.07 0.02 0.0 1.02 0.01 0.02 0.05 0.05 0.05 0.07 0.0 0.04 0.06 0.27 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.03 0.11
0.0 0.0 0.0 0.15 0.37 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.19 0.0 3.27 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.63 0.61 0.0 0.0 0.84 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.21 0.37 0.5 0.41 0.36 0.43 0.4 0.64 0.68 0.27 0.53 0.44 1.74 0.73 0.69 0.36 0.69 6.37 1.22 0.67 0.81 1.0 1.58 0.72 0.9 0.78 0.65 0.69 0.87 0.77 1.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.22 0.77 0.77 0.9 0.9 1.23 1.45 1.57 0.53 0.66 1.39 4.85 0.91 2.03 2.81 2.2 12.35 2.06 2.62 2.33 2.04 1.4 2.58 2.28 1.59 1.79 0.96 1.18 1.38 1.62
3.17 1.74 3.87 1.05 1.62 1.44 1.57 2.01 3.98 2.79 4.62 4.67 13.96 2.58 3.95 3.07 3.23 6.33 3.95 3.48 3.99 7.73 0.31 4.84 4.52 3.14 3.09 3.81 3.04 2.87 3.84
17.19 19.4 23.81 15.84 12.75 25.26 21.49 33.23 31.74 25.13 41.44 34.83 158.89 42.71 49.09 34.36 38.49 253.9 58.82 36.04 52.69 68.13 16.71 48.18 47.02 32.78 37.92 33.11 45.7 30.29 58.35
3.3 2.57 5.12 4.19 4.37 5.58 2.71 4.11 7.5 7.63 5.5 11.33 40.06 13.31 10.63 3.28 11.27 29.39 6.33 7.74 8.79 7.64 1.62 7.07 8.02 7.77 5.14 4.5 5.42 2.1 11.63
3.5 1.11 1.09 3.63 2.14 3.57 1.68 3.69 3.39 3.45 3.68 4.13 16.35 4.22 4.72 3.5 3.52 48.89 10.02 7.31 5.12 6.67 11.92 5.71 4.36 4.96 4.72 2.56 5.18 4.46 5.55
1.26 0.73 0.8 1.13 0.48 0.75 1.21 1.44 0.66 1.24 2.09 2.64 7.23 1.68 2.98 3.01 1.61 2.28 2.21 1.85 1.97 3.04 0.69 1.23 2.47 1.84 1.22 1.14 2.11 0.85 1.86
0.19 0.11 0.31 0.35 0.26 0.43 0.29 0.38 0.22 0.19 0.25 0.43 1.2 0.46 0.7 0.65 0.53 1.28 0.58 0.45 0.6 0.62 0.44 0.34 0.46 0.65 0.34 0.33 0.5 0.35 0.75
0.28 0.1 0.25 0.19 0.2 0.28 0.3 0.35 0.61 0.65 0.65 0.83 3.86 0.38 1.14 0.86 0.88 1.94 0.53 0.68 0.69 0.86 0.91 1.1 1.42 0.69 0.65 0.5 0.65 0.88 1.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.34 0.73 0.32 0.54 0.6 0.81 0.96 0.76 0.46 0.69 0.73 4.22 1.78 1.55 0.99 1.17 9.05 1.12 0.96 1.0 0.94 1.15 1.06 1.28 1.14 1.35 0.56 0.9 0.81 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.72 0.01 0.08 0.02 0.05 0.18 0.0 0.08 0.07 0.01 0.02 0.02 0.03 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.04 0.05 0.03 0.03 0.29 0.09 0.04 0.03 0.04 0.33 0.04 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 0.04 0.01 0.05 0.07 0.01 0.21
0.05 0.08 0.1 0.22 0.05 0.07 0.13 0.42 0.18 0.19 0.13 0.24 1.18 0.07 0.16 0.13 0.19 1.86 0.14 0.13 0.32 0.25 0.09 0.14 0.17 0.19 0.34 0.22 0.3 0.36 0.47
1.27 1.09 1.52 1.8 1.1 1.46 1.12 1.37 2.88 1.7 1.64 2.43 8.96 1.44 2.18 1.7 1.61 19.94 2.21 2.32 2.18 2.78 3.99 3.24 3.01 2.6 2.6 1.71 2.52 2.48 2.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.02 0.0 0.05 0.0 0.03 0.12 0.61 0.01 0.01 0.09 0.09 0.62 0.05 0.02 0.04 0.17 0.04 0.01 0.04 0.09 0.08 0.03 0.0 0.03 0.15
0.07 0.24 0.11 0.06 0.2 0.15 0.1 0.27 0.25 0.19 0.19 0.29 0.81 0.27 0.36 0.23 0.29 2.52 0.35 0.2 0.23 0.29 0.23 0.28 0.33 0.41 0.37 0.31 0.22 0.23 0.42
0.76 0.34 0.18 0.19 1.52 1.4 0.95 0.68 1.6 1.22 1.27 1.59 2.53 1.1 1.82 1.05 1.49 2.88 1.9 2.07 1.38 1.38 0.06 1.42 1.61 0.98 1.54 1.55 0.59 0.91 0.94
0.06 0.0 0.04 0.02 0.05 0.07 0.13 0.15 0.05 0.07 0.1 0.09 0.59 0.08 0.15 0.12 0.14 0.43 0.09 0.08 0.04 0.16 0.16 0.07 0.11 0.07 0.08 0.08 0.11 0.06 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.02 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.17 0.06 0.04 0.05 0.1 0.06 0.09 0.58 0.0 0.11 0.04 0.21 0.04 0.06 0.01 0.17 0.07 0.1 0.08 0.04 0.22 0.03 0.28 0.05 0.06 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.48 0.18 0.11 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.33 0.12 0.0 0.0 0.11 0.11 1.12
0.14 0.0 0.06 0.06 0.08 0.11 0.02 0.07 0.28 0.58 0.23 0.43 1.7 0.32 0.52 0.33 0.57 0.84 0.1 0.32 0.36 0.12 0.14 0.64 0.41 0.28 0.16 0.41 0.16 0.24 0.79
8.78 8.86 14.56 8.44 8.73 14.21 6.81 8.7 10.68 8.1 13.91 15.43 41.71 16.23 19.4 10.58 13.72 141.75 23.28 14.23 14.34 18.9 22.15 19.3 17.54 14.23 16.97 12.54 14.09 11.98 22.42
0.61 0.86 0.34 1.25 1.0 1.54 1.03 1.34 3.23 1.34 2.32 2.23 7.88 2.98 3.24 1.91 2.42 15.09 2.81 1.8 1.97 2.73 2.99 3.01 2.19 1.72 2.34 1.46 1.89 1.83 3.12
3.35 4.97 5.13 2.84 3.37 4.15 2.89 2.62 6.17 5.05 6.07 8.37 23.09 4.85 8.76 3.4 6.78 28.07 12.06 7.75 9.25 10.86 0.9 9.85 10.93 7.42 6.35 9.33 4.86 4.09 5.1
1.32 1.15 1.09 1.47 1.54 1.65 1.06 1.62 2.07 1.46 2.45 2.28 8.75 3.17 3.13 1.66 2.25 5.44 2.67 2.39 2.0 2.76 2.42 2.77 2.34 2.18 2.03 2.26 2.08 1.87 2.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.24 0.11 0.03 0.14 0.0 0.04 0.17 0.07 0.15 0.13 0.11 0.11 0.48 0.02 0.03 0.1 0.19 1.78 0.07 0.11 0.06 0.01 0.0 0.06 0.16 0.03 0.11 0.14 0.09 0.01 0.2
0.71 0.59 0.73 0.56 0.43 0.54 0.49 0.66 0.89 0.55 0.72 1.06 2.9 0.77 1.11 0.63 0.78 3.25 1.22 0.85 0.99 1.1 0.92 0.97 0.99 0.97 0.83 0.97 0.91 0.72 1.01
0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.02 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.11 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.17 0.02 0.0 0.02 0.01 0.3 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.16
0.71 1.18 0.95 1.04 0.94 1.1 0.69 1.08 1.56 0.67 1.26 1.74 6.64 2.01 2.38 1.38 1.58 10.1 2.57 1.47 1.71 2.42 0.02 1.94 1.51 1.87 2.13 0.9 1.44 1.21 1.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.04 0.0 0.01 2.29 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.04 0.0 0.01 2.29 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
1.12 1.53 1.72 1.03 0.97 1.0 0.99 1.4 1.6 1.47 1.85 2.43 4.86 0.93 2.06 1.27 1.88 11.25 2.79 1.61 2.21 3.32 1.27 2.82 2.32 2.36 2.27 2.13 1.85 2.02 1.95
0.41 0.61 0.42 0.32 0.74 0.96 1.44 0.72 1.23 1.29 1.28 1.04 0.98 0.85 1.15 1.29 1.32 2.36 1.18 1.22 1.17 1.26 0.17 0.92 0.84 1.18 1.13 1.38 1.07 1.1 0.93
0.35 0.69 0.0 0.0 0.0 0.15 0.67 0.19 0.78 0.27 0.83 0.3 5.49 1.46 1.71 0.88 0.98 12.44 0.86 0.32 0.32 0.28 0.0 0.68 0.93 0.0 0.35 1.76 0.8 0.07 1.89
0.04 0.4 0.0 0.1 0.1 0.32 0.1 0.13 0.01 0.02 0.16 0.02 1.67 0.01 0.04 0.14 0.06 0.29 0.1 0.07 0.18 0.04 0.02 0.1 0.09 0.1 0.14 0.14 0.09 0.06 0.1
2.34 2.26 3.25 2.91 2.28 2.74 1.96 2.09 4.63 2.87 3.27 5.14 16.15 5.23 7.52 3.71 4.06 9.65 7.1 5.06 4.89 5.32 1.36 5.01 5.19 3.9 4.5 3.14 4.18 3.31 5.24
0.97 0.62 0.81 0.48 0.94 0.85 0.65 1.29 1.66 0.93 1.55 1.89 6.1 0.71 1.76 1.39 1.69 3.73 2.27 1.96 1.87 2.14 0.35 1.88 1.61 1.44 1.17 1.59 1.92 1.92 3.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
2.32 1.66 3.08 1.96 0.93 1.86 1.66 2.39 3.44 1.48 2.82 2.5 8.33 3.57 3.61 1.99 2.8 16.68 6.02 3.17 3.33 2.44 1.83 3.87 5.12 3.6 3.73 3.31 3.19 3.39 3.14
0.73 0.26 0.16 0.41 0.53 0.32 0.32 0.39 0.5 0.45 0.7 0.62 1.62 0.65 0.85 0.46 0.6 2.22 0.59 0.78 0.51 0.47 0.05 0.6 0.65 0.66 0.64 1.26 0.22 0.15 0.01
0.6 0.23 0.45 0.12 0.4 0.31 0.2 0.33 0.41 0.48 0.33 0.89 1.39 0.48 1.03 0.46 0.43 1.52 0.56 0.62 0.46 0.81 0.12 0.44 0.46 0.51 0.56 0.3 0.16 0.29 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.56 0.0 0.0 0.03 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
1.45 1.27 2.27 1.8 1.34 1.49 1.59 2.09 2.6 2.14 2.31 3.17 8.83 2.56 4.08 2.33 2.8 9.18 3.86 3.3 3.29 3.85 1.98 2.9 3.06 2.61 3.19 2.55 2.73 2.41 2.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Lsat_1_v5_gn_7_9121.1 (FMO GS-OX5)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.3 0.0 0.06 0.0 0.0 1.33 0.27 0.03 0.0 0.0 0.06 0.05 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.03 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.82 0.0 0.0 0.02 0.0 2.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.15 0.16 0.22 0.06 0.03 0.05 0.04 0.27 0.52 0.32 0.65 2.19 0.15 0.14 0.19 0.33 0.4 0.1 0.29 0.32 0.11 0.13 0.13 0.14 0.11 0.09 0.1 0.13 0.32 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
9.13 7.97 10.57 8.09 6.5 8.93 5.52 6.16 10.99 7.9 12.57 11.0 31.33 15.52 16.84 8.97 10.08 123.44 21.43 14.62 13.82 14.82 24.56 18.24 13.14 11.02 11.71 11.16 16.4 9.96 16.33
0.25 0.3 0.52 0.3 0.1 0.05 0.18 0.21 0.57 0.18 0.29 0.62 1.15 0.01 0.13 0.13 0.14 0.85 0.52 0.33 0.41 0.49 0.14 0.63 0.36 0.3 0.26 0.5 0.59 0.23 0.25

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)