Heatmap: Cluster_236 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_1320.1	-2.41	-1.44	-2.07	-1.31	0.12	0.34	0.4	0.38	-0.5	0.01	-0.22	-0.35	0.37	1.16	0.91	0.31	-0.1	0.17	0.65	-0.32	-0.16	-0.17	-0.27	-0.12	-0.12	-0.12	-0.13	-0.65	0.17	0.05	0.4
Lsat_1_v5_gn_0_23521.1 (AtACER)	-0.52	-0.41	-0.61	-0.73	0.1	0.14	0.0	0.13	-0.17	-0.22	-0.03	-0.22	0.14	0.62	0.33	0.16	0.01	0.14	0.2	-0.04	0.01	0.15	-0.02	-0.22	-0.03	0.06	0.12	-0.12	0.08	0.1	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_26960.1 (CASPL4A3)	-0.8	-0.71	-0.75	-0.68	0.58	0.55	-0.32	-0.54	-0.35	-0.11	-0.07	-0.23	-0.06	0.84	0.86	0.12	-0.21	0.53	0.14	-0.31	-0.2	-0.17	0.04	-0.16	-0.23	-0.36	-0.09	-0.2	0.27	0.28	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_8801.1 (AIL6)	-1.05	-0.68	-0.32	-0.56	0.27	0.47	-0.23	-0.04	-0.33	-0.73	-0.47	-0.65	-0.27	1.19	0.96	0.27	-0.02	0.65	0.22	-0.38	-0.04	-0.36	0.38	-0.18	-0.31	-0.06	-0.03	-0.3	0.06	-0.21	0.15
Lsat_1_v5_gn_2_111261.1 (UXS1)	-0.44	-0.29	-0.74	-0.58	0.46	0.38	-0.16	-0.43	-0.19	-0.13	-0.09	-0.11	-0.06	0.61	0.48	0.02	-0.07	0.48	0.1	-0.23	-0.11	0.07	0.31	-0.33	-0.2	-0.07	-0.12	-0.1	0.16	0.12	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_111460.1 (CHX20)	-0.57	-0.62	-0.5	-0.56	0.14	0.19	-0.41	-0.61	0.07	0.09	0.08	-0.14	-0.81	1.12	0.87	0.07	-0.03	0.48	0.32	-0.11	-0.04	-0.13	-0.1	-0.17	-0.31	-0.34	-0.06	-0.47	0.25	0.27	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_79441.1 (MAGL15)	-0.36	-0.42	-0.61	-0.45	0.21	0.49	0.2	0.28	-0.27	-0.15	-0.26	-0.36	-0.33	0.76	0.7	0.11	-0.21	-0.07	0.07	-0.14	-0.12	-0.02	0.59	-0.09	-0.04	-0.09	-0.26	-0.38	0.02	0.05	-0.11
Lsat_1_v5_gn_2_81061.1 (PAP23)	-1.04	-0.89	-0.65	-0.53	-0.06	-0.13	-0.54	-0.57	-0.12	-0.09	-0.06	-0.04	-0.04	1.32	0.97	0.32	0.29	0.84	-0.06	-0.33	-0.31	-0.2	0.1	-0.45	-0.54	-0.12	-0.12	-0.52	0.11	0.12	0.38
Lsat_1_v5_gn_3_123940.1 (AGG2)	-1.02	-1.09	-1.09	-1.12	0.18	0.36	-0.86	-0.81	-0.22	-0.05	-0.26	-0.31	0.11	1.5	0.89	0.22	0.07	-0.48	0.27	-0.29	0.08	-0.08	0.28	-0.04	-0.06	0.23	0.17	-0.18	0.11	0.04	-0.05
Lsat_1_v5_gn_3_13280.1 (NLM8)	-2.37	-1.9	-1.98	-1.76	0.05	0.39	-0.5	-0.92	-0.23	-0.39	-0.54	-0.51	-0.37	2.04	1.6	-0.06	0.31	1.24	0.54	-0.02	-0.43	-0.28	-0.86	-1.01	-0.46	-0.16	-0.15	-0.98	-1.01	-0.82	0.82
Lsat_1_v5_gn_3_24081.1	-0.66	-0.4	-0.72	-0.63	0.23	0.3	-0.28	-0.48	-0.25	-0.38	-0.3	-0.24	0.43	0.37	0.45	0.11	-0.15	0.67	0.17	-0.04	-0.13	-0.11	0.61	-0.32	0.05	0.03	-0.03	-0.03	-0.12	-0.14	0.55
Lsat_1_v5_gn_3_35920.1	-1.53	-1.5	-1.4	-0.76	0.3	0.31	0.1	0.1	-0.31	-0.0	-0.29	-0.48	-0.08	1.23	0.92	0.1	-0.07	0.38	0.01	-0.1	-0.14	-0.2	0.25	-0.47	-0.3	0.05	0.02	-0.14	0.36	-0.0	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_4341.1 (KNAT7)	-0.44	-1.1	-0.77	-0.53	0.36	0.77	-0.43	-0.69	-0.24	-0.43	-0.2	-0.65	-0.01	1.29	1.22	0.35	-0.29	0.31	-0.05	-0.47	-0.23	-0.15	0.42	-0.35	-0.42	-0.27	-0.0	-0.11	0.17	-0.01	-0.33
Lsat_1_v5_gn_3_74821.1	-1.58	-0.82	-2.16	-1.41	0.77	0.8	-0.17	-0.42	-0.42	-0.3	-0.3	-0.52	-0.02	0.89	0.63	0.45	0.21	0.49	0.09	-0.22	0.01	-0.25	0.14	-0.32	-0.3	-0.01	0.07	-0.38	0.39	0.11	0.42
Lsat_1_v5_gn_3_93861.1 (GS2)	-0.82	-0.62	-0.46	-0.39	0.24	0.12	-0.11	-0.11	-0.02	0.01	0.1	-0.13	-0.46	1.18	1.15	0.2	0.02	0.66	0.1	-0.21	-0.38	-0.36	-0.23	-0.46	-0.46	-0.3	-0.14	-0.61	0.03	0.05	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_10701.1	-0.54	-0.51	-0.66	-0.59	0.1	0.23	-0.25	-0.22	-0.23	-0.27	-0.19	-0.17	0.38	0.33	0.38	-0.02	-0.07	0.63	-0.02	-0.07	-0.11	-0.08	0.67	-0.16	0.01	0.01	-0.11	-0.03	0.12	0.02	0.34
Lsat_1_v5_gn_4_41260.1 (AHL14)	-1.9	-2.4	-2.2	-1.26	0.17	0.66	-0.6	-0.35	-0.01	0.12	0.13	-0.32	0.03	1.38	1.05	0.32	-0.02	-0.05	0.24	-0.23	-0.31	-0.37	0.41	0.01	-0.02	-0.03	0.15	-0.42	-0.05	-0.08	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_5261.1	-0.92	-0.92	-1.27	-1.33	0.3	0.71	0.33	0.34	-0.19	-0.19	-0.35	-0.24	-0.29	0.75	0.6	0.26	0.08	-0.5	0.24	-0.11	-0.03	-0.05	0.67	-0.15	-0.15	-0.22	0.21	-0.12	0.01	0.08	-0.08
Lsat_1_v5_gn_4_5600.1 (MKK3)	-0.88	-0.77	-0.38	-0.09	0.75	0.4	-0.66	-0.75	0.09	-0.28	0.11	-0.21	-1.08	1.35	0.92	-0.5	-0.96	1.12	0.15	-0.38	-0.6	-0.25	0.27	-0.79	-1.01	-0.4	-0.32	-0.75	0.4	-0.07	0.78
Lsat_1_v5_gn_4_57641.1 (CRK41)	-1.3	-0.61	-2.39	-1.72	0.76	0.89	-0.67	-0.36	-0.55	-0.54	0.15	-0.96	-0.53	1.91	1.26	0.44	-0.8	0.84	0.16	-0.53	-0.56	-0.44	0.29	-0.63	-0.67	-0.3	-0.33	-0.84	0.18	-0.01	-0.17
Lsat_1_v5_gn_4_71501.1 (MYB4)	-1.26	-1.48	-1.11	-0.95	0.15	0.65	-0.02	-0.17	-0.44	-0.49	-0.4	-0.49	-0.03	1.19	1.41	0.49	0.11	0.33	0.2	-0.31	-0.19	-0.14	0.25	-0.32	-0.22	-0.15	-0.08	-0.52	-0.03	-0.04	0.03
Lsat_1_v5_gn_5_123300.1	-3.13	-1.63	-3.05	-1.77	-0.17	0.6	0.15	0.15	-0.47	-0.41	-0.43	-0.45	0.13	1.08	0.85	0.36	0.02	0.31	0.32	0.02	-0.1	0.02	-0.05	0.03	0.01	0.21	0.07	-0.46	0.18	0.17	0.72
Lsat_1_v5_gn_5_153900.1 (LecRK-V.9)	-2.17	-1.3	-1.62	-0.92	0.56	0.81	-0.27	-0.95	-0.32	-0.49	-0.25	-0.47	-0.27	1.02	1.14	0.39	0.06	0.7	0.17	-0.16	-0.05	0.0	0.38	-0.31	-0.11	0.04	0.23	-0.45	-0.05	-0.35	0.16
Lsat_1_v5_gn_5_1601.1	-1.12	-1.03	-1.08	-0.77	0.26	0.27	-0.01	0.3	-0.26	-0.27	-0.15	-0.12	0.15	0.81	0.74	0.08	-0.03	0.08	0.1	-0.02	-0.11	-0.05	0.0	0.03	-0.03	-0.06	-0.04	-0.1	0.22	0.04	0.31
Lsat_1_v5_gn_5_162620.1	-1.91	-1.38	-0.82	-0.57	0.15	0.14	-0.31	-0.13	0.08	-0.19	-0.07	-0.08	-0.12	0.98	0.99	0.36	-0.07	0.26	0.12	-0.08	-0.09	-0.11	0.49	-0.25	-0.05	-0.12	-0.07	-0.48	0.28	0.06	0.12
Lsat_1_v5_gn_5_165000.1	-0.57	-0.66	-0.9	-0.71	0.25	0.26	0.07	-0.11	-0.2	-0.35	-0.11	-0.24	0.06	0.83	0.84	0.08	-0.01	-0.02	0.21	-0.12	-0.18	-0.1	0.11	-0.06	-0.22	-0.1	-0.17	-0.26	0.33	0.16	0.37
Lsat_1_v5_gn_5_19541.1 (MYB30)	-2.3	-2.38	-2.16	-1.59	0.39	0.57	-0.18	-0.05	-0.24	-0.4	-0.26	-0.54	-0.68	1.61	1.3	0.05	-0.31	1.05	0.34	-0.29	-0.4	-0.09	-0.1	-0.35	-0.19	-0.09	-0.17	-0.36	0.34	-0.01	-0.04
Lsat_1_v5_gn_5_40921.1 (SRD2)	-1.41	-1.35	-1.61	-1.02	0.19	0.57	0.08	-0.18	-0.22	-0.43	-0.34	-0.92	-0.63	1.29	1.0	-0.19	-0.25	0.48	0.61	-0.08	-0.04	-0.17	1.03	-0.1	-0.28	-0.06	-0.06	-0.29	-0.13	-0.08	0.01
Lsat_1_v5_gn_5_72601.1	-0.61	-0.58	-1.14	-1.03	0.22	0.64	0.2	0.18	-0.18	-0.21	-0.27	-0.6	-0.14	0.92	0.63	0.12	-0.13	-0.27	0.11	-0.14	-0.06	0.02	0.74	-0.3	-0.15	-0.1	-0.06	-0.29	0.2	0.19	-0.0
Lsat_1_v5_gn_6_102241.1	-1.22	-0.57	-1.4	-1.35	0.22	0.56	0.45	0.34	-0.22	-0.19	-0.06	-0.16	-0.3	0.85	0.85	0.1	-0.3	0.04	0.32	-0.15	-0.16	-0.15	0.52	-0.11	-0.17	-0.22	-0.15	-0.32	0.14	0.06	0.02
Lsat_1_v5_gn_6_15181.1 (JMJ32)	-0.82	-0.41	-1.03	-0.9	0.29	0.33	0.23	0.38	-0.25	-0.23	-0.13	-0.09	0.19	0.74	0.73	0.1	-0.06	-0.21	0.17	-0.32	-0.2	-0.08	0.61	-0.29	-0.14	-0.35	-0.01	-0.24	0.16	0.02	0.03
Lsat_1_v5_gn_6_28141.1 (DOGT1)	-4.11	-2.38	-1.91	-1.48	-0.67	0.06	-0.59	-0.6	-0.38	-0.04	-0.17	-0.53	0.18	1.84	1.33	0.16	-0.09	1.28	-0.23	-0.48	-0.45	-0.86	0.93	-0.0	-0.62	-0.72	-0.69	-1.06	0.23	0.36	0.6
Lsat_1_v5_gn_6_38401.1 (OTLD1)	-1.07	-0.92	-1.31	-1.01	0.13	0.34	0.17	0.26	-0.2	-0.24	-0.08	-0.26	-0.06	0.84	0.78	0.16	-0.06	0.32	-0.12	-0.23	-0.13	-0.16	0.26	-0.13	-0.13	-0.0	-0.07	-0.29	0.17	0.29	0.5
Lsat_1_v5_gn_6_45461.1 (PNF)	-0.89	-0.84	-0.99	-0.87	-0.0	0.4	-0.21	-0.84	-0.1	-0.33	-0.24	-0.49	0.26	0.8	0.66	0.38	0.21	0.59	-0.06	-0.26	-0.06	-0.07	0.69	-0.5	-0.15	0.06	-0.11	-0.41	-0.04	0.11	0.72
Lsat_1_v5_gn_6_55000.1 (UTR6)	-0.79	-0.45	-0.56	-0.38	0.43	0.39	-0.2	-0.3	-0.43	-0.3	-0.27	-0.3	0.08	0.66	0.48	0.11	0.02	0.76	0.34	-0.21	-0.19	-0.13	0.27	-0.38	-0.31	-0.11	-0.11	-0.14	0.21	0.2	0.16
Lsat_1_v5_gn_6_64781.1	-0.73	-0.64	-0.92	-0.89	0.32	0.49	-0.03	0.12	-0.37	-0.21	-0.12	-0.43	0.05	0.78	0.69	0.25	-0.08	-0.31	-0.04	-0.39	-0.0	0.02	0.48	-0.17	-0.02	0.1	-0.12	-0.16	0.32	0.07	0.19
Lsat_1_v5_gn_6_69500.1	-0.46	-0.43	-0.96	-0.65	0.71	0.53	-0.05	0.2	-0.1	-0.21	-0.18	-0.51	-0.02	0.7	0.63	0.19	-0.21	0.31	-0.17	-0.31	-0.23	-0.18	0.19	-0.31	-0.48	-0.07	-0.05	-0.22	0.34	0.1	0.27
Lsat_1_v5_gn_7_12841.1	-0.55	-0.61	-0.63	-0.65	0.26	0.27	-0.04	0.13	-0.23	-0.11	-0.13	-0.3	0.07	0.65	0.56	-0.07	-0.02	0.17	-0.13	-0.15	-0.16	-0.21	0.53	-0.07	-0.11	-0.1	0.11	-0.13	0.07	0.2	0.3
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.