1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_236 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.08 0.16 0.11 0.18 0.49 0.57 0.59 0.58 0.32 0.45 0.38 0.35 0.58 1.0 0.84 0.56 0.42 0.5 0.7 0.36 0.4 0.4 0.37 0.41 0.41 0.41 0.41 0.29 0.5 0.46 0.59
0.45 0.49 0.43 0.39 0.7 0.72 0.65 0.71 0.58 0.56 0.64 0.56 0.72 1.0 0.82 0.73 0.66 0.72 0.75 0.64 0.66 0.72 0.64 0.56 0.64 0.68 0.71 0.6 0.69 0.7 0.7
0.32 0.34 0.33 0.35 0.82 0.81 0.44 0.38 0.43 0.51 0.53 0.47 0.53 0.99 1.0 0.6 0.48 0.8 0.61 0.45 0.48 0.49 0.57 0.49 0.47 0.43 0.52 0.48 0.67 0.67 0.68
0.21 0.27 0.35 0.3 0.53 0.61 0.37 0.43 0.35 0.26 0.32 0.28 0.37 1.0 0.86 0.53 0.43 0.69 0.51 0.34 0.43 0.34 0.57 0.39 0.35 0.42 0.43 0.36 0.46 0.38 0.49
0.48 0.54 0.39 0.44 0.9 0.86 0.59 0.49 0.58 0.6 0.62 0.61 0.63 1.0 0.91 0.67 0.62 0.92 0.71 0.56 0.61 0.69 0.81 0.52 0.57 0.63 0.6 0.61 0.73 0.72 0.76
0.31 0.3 0.33 0.31 0.51 0.52 0.35 0.3 0.49 0.49 0.49 0.42 0.26 1.0 0.84 0.49 0.45 0.64 0.57 0.43 0.45 0.42 0.43 0.41 0.37 0.36 0.44 0.33 0.55 0.56 0.47
0.46 0.44 0.39 0.43 0.69 0.83 0.68 0.72 0.49 0.53 0.49 0.46 0.47 1.0 0.96 0.64 0.51 0.56 0.62 0.54 0.54 0.58 0.89 0.55 0.57 0.56 0.49 0.45 0.6 0.61 0.55
0.2 0.22 0.25 0.28 0.38 0.37 0.28 0.27 0.37 0.38 0.38 0.39 0.39 1.0 0.78 0.5 0.49 0.72 0.38 0.32 0.32 0.35 0.43 0.29 0.27 0.37 0.37 0.28 0.43 0.44 0.52
0.17 0.17 0.17 0.16 0.4 0.45 0.19 0.2 0.3 0.34 0.3 0.28 0.38 1.0 0.66 0.41 0.37 0.25 0.43 0.29 0.38 0.33 0.43 0.34 0.34 0.41 0.4 0.31 0.38 0.36 0.34
0.05 0.07 0.06 0.07 0.25 0.32 0.17 0.13 0.21 0.19 0.17 0.17 0.19 1.0 0.74 0.23 0.3 0.58 0.35 0.24 0.18 0.2 0.13 0.12 0.18 0.22 0.22 0.12 0.12 0.14 0.43
0.4 0.48 0.38 0.41 0.74 0.78 0.52 0.45 0.53 0.48 0.51 0.53 0.85 0.81 0.86 0.68 0.57 1.0 0.71 0.61 0.57 0.58 0.96 0.51 0.65 0.64 0.62 0.62 0.58 0.57 0.92
0.15 0.15 0.16 0.25 0.53 0.53 0.46 0.46 0.34 0.42 0.35 0.31 0.4 1.0 0.81 0.46 0.41 0.56 0.43 0.4 0.39 0.37 0.5 0.31 0.35 0.44 0.43 0.39 0.55 0.43 0.5
0.3 0.19 0.24 0.28 0.52 0.7 0.3 0.25 0.34 0.3 0.35 0.26 0.4 1.0 0.95 0.52 0.33 0.51 0.4 0.29 0.35 0.37 0.54 0.32 0.3 0.34 0.41 0.38 0.46 0.4 0.32
0.18 0.31 0.12 0.2 0.92 0.94 0.48 0.4 0.4 0.44 0.44 0.38 0.53 1.0 0.84 0.74 0.62 0.76 0.57 0.46 0.54 0.45 0.6 0.43 0.44 0.54 0.57 0.41 0.71 0.58 0.72
0.25 0.29 0.32 0.34 0.52 0.48 0.41 0.41 0.44 0.45 0.47 0.4 0.32 1.0 0.98 0.51 0.45 0.7 0.48 0.38 0.34 0.35 0.38 0.32 0.32 0.36 0.4 0.29 0.45 0.46 0.45
0.43 0.44 0.4 0.42 0.67 0.74 0.53 0.54 0.54 0.52 0.55 0.56 0.82 0.79 0.82 0.62 0.6 0.98 0.62 0.6 0.58 0.6 1.0 0.56 0.63 0.63 0.58 0.62 0.68 0.64 0.8
0.1 0.07 0.08 0.16 0.43 0.61 0.25 0.3 0.38 0.42 0.42 0.31 0.39 1.0 0.8 0.48 0.38 0.37 0.45 0.33 0.31 0.3 0.51 0.39 0.38 0.38 0.43 0.29 0.37 0.36 0.47
0.31 0.32 0.25 0.24 0.73 0.97 0.75 0.76 0.52 0.52 0.47 0.5 0.49 1.0 0.9 0.71 0.63 0.42 0.7 0.55 0.58 0.57 0.95 0.54 0.54 0.51 0.69 0.55 0.6 0.63 0.56
0.21 0.23 0.3 0.37 0.66 0.52 0.25 0.23 0.42 0.32 0.42 0.34 0.18 1.0 0.74 0.28 0.2 0.85 0.43 0.3 0.26 0.33 0.47 0.23 0.19 0.3 0.31 0.23 0.52 0.37 0.67
0.11 0.17 0.05 0.08 0.45 0.49 0.17 0.21 0.18 0.18 0.29 0.14 0.18 1.0 0.64 0.36 0.15 0.48 0.3 0.18 0.18 0.2 0.33 0.17 0.17 0.22 0.21 0.15 0.3 0.26 0.24
0.16 0.13 0.17 0.19 0.42 0.59 0.37 0.33 0.28 0.27 0.28 0.27 0.37 0.86 1.0 0.53 0.4 0.47 0.43 0.3 0.33 0.34 0.45 0.3 0.32 0.34 0.35 0.26 0.37 0.37 0.38
0.05 0.15 0.06 0.14 0.42 0.72 0.53 0.53 0.34 0.36 0.35 0.35 0.52 1.0 0.86 0.61 0.48 0.59 0.59 0.48 0.44 0.48 0.46 0.48 0.48 0.55 0.5 0.35 0.54 0.54 0.78
0.1 0.18 0.15 0.24 0.67 0.8 0.38 0.23 0.36 0.32 0.38 0.33 0.37 0.92 1.0 0.6 0.47 0.74 0.51 0.41 0.44 0.46 0.59 0.37 0.42 0.47 0.53 0.33 0.44 0.36 0.51
0.26 0.28 0.27 0.33 0.68 0.68 0.56 0.7 0.48 0.47 0.51 0.52 0.63 1.0 0.95 0.6 0.56 0.6 0.61 0.56 0.53 0.55 0.57 0.58 0.56 0.54 0.55 0.53 0.66 0.58 0.7
0.13 0.19 0.29 0.34 0.56 0.55 0.41 0.46 0.53 0.44 0.48 0.48 0.46 0.99 1.0 0.64 0.48 0.6 0.55 0.48 0.47 0.47 0.71 0.42 0.48 0.46 0.48 0.36 0.61 0.53 0.55
0.38 0.36 0.3 0.34 0.67 0.67 0.59 0.52 0.49 0.44 0.52 0.48 0.59 0.99 1.0 0.59 0.55 0.55 0.65 0.52 0.49 0.52 0.6 0.54 0.48 0.52 0.5 0.47 0.7 0.63 0.73
0.07 0.06 0.07 0.11 0.43 0.48 0.29 0.32 0.28 0.25 0.27 0.22 0.2 1.0 0.81 0.34 0.26 0.68 0.41 0.27 0.25 0.31 0.31 0.26 0.29 0.31 0.29 0.25 0.41 0.32 0.32
0.15 0.16 0.13 0.2 0.46 0.6 0.43 0.36 0.35 0.3 0.32 0.22 0.26 1.0 0.82 0.36 0.34 0.57 0.62 0.38 0.4 0.36 0.83 0.38 0.34 0.39 0.39 0.33 0.37 0.38 0.41
0.35 0.35 0.24 0.26 0.62 0.82 0.61 0.6 0.47 0.46 0.44 0.35 0.48 1.0 0.82 0.57 0.49 0.44 0.57 0.48 0.51 0.54 0.89 0.43 0.48 0.49 0.51 0.43 0.61 0.6 0.53
0.24 0.37 0.21 0.22 0.64 0.82 0.76 0.7 0.48 0.48 0.53 0.49 0.45 1.0 1.0 0.59 0.45 0.57 0.69 0.5 0.5 0.5 0.79 0.51 0.49 0.47 0.5 0.44 0.61 0.58 0.56
0.34 0.45 0.29 0.32 0.73 0.76 0.7 0.78 0.51 0.51 0.55 0.56 0.69 1.0 1.0 0.64 0.58 0.52 0.67 0.48 0.52 0.57 0.91 0.49 0.54 0.47 0.59 0.51 0.67 0.61 0.61
0.02 0.05 0.07 0.1 0.18 0.29 0.19 0.18 0.21 0.27 0.25 0.19 0.32 1.0 0.7 0.31 0.26 0.68 0.24 0.2 0.2 0.15 0.53 0.28 0.18 0.17 0.17 0.13 0.33 0.36 0.42
0.27 0.3 0.23 0.28 0.61 0.71 0.63 0.67 0.49 0.47 0.53 0.47 0.54 1.0 0.96 0.63 0.54 0.7 0.52 0.48 0.51 0.5 0.67 0.51 0.51 0.56 0.54 0.46 0.63 0.68 0.79
0.31 0.32 0.29 0.32 0.57 0.76 0.5 0.32 0.54 0.46 0.49 0.41 0.69 1.0 0.91 0.75 0.67 0.86 0.55 0.48 0.55 0.55 0.93 0.41 0.52 0.6 0.53 0.43 0.56 0.62 0.95
0.34 0.43 0.4 0.45 0.79 0.77 0.51 0.48 0.44 0.48 0.49 0.48 0.62 0.93 0.82 0.64 0.59 1.0 0.75 0.51 0.51 0.54 0.71 0.45 0.47 0.54 0.54 0.53 0.68 0.68 0.66
0.35 0.37 0.31 0.31 0.73 0.82 0.57 0.63 0.45 0.5 0.54 0.43 0.6 1.0 0.94 0.69 0.55 0.47 0.57 0.45 0.58 0.59 0.81 0.52 0.57 0.63 0.54 0.52 0.73 0.61 0.67
0.45 0.46 0.31 0.39 1.0 0.88 0.59 0.7 0.57 0.53 0.54 0.43 0.6 0.99 0.95 0.7 0.53 0.76 0.55 0.49 0.52 0.54 0.7 0.5 0.44 0.58 0.59 0.53 0.77 0.66 0.74
0.44 0.42 0.41 0.41 0.77 0.77 0.62 0.7 0.54 0.59 0.59 0.52 0.67 1.0 0.94 0.61 0.63 0.72 0.59 0.58 0.57 0.55 0.92 0.61 0.59 0.6 0.69 0.58 0.67 0.74 0.79
0.41 0.46 0.38 0.4 0.82 0.88 0.56 0.48 0.57 0.55 0.56 0.58 0.71 1.0 0.91 0.68 0.62 0.94 0.59 0.56 0.57 0.61 0.67 0.52 0.57 0.61 0.63 0.51 0.78 0.67 0.63
0.32 0.28 0.25 0.31 0.73 0.68 0.54 0.57 0.48 0.5 0.51 0.58 0.73 1.0 0.93 0.58 0.56 0.71 0.6 0.48 0.5 0.53 0.88 0.51 0.54 0.53 0.52 0.5 0.58 0.6 0.77
0.18 0.25 0.2 0.23 0.5 0.66 0.62 0.69 0.38 0.39 0.45 0.3 0.3 1.0 0.8 0.51 0.44 0.65 0.61 0.44 0.48 0.44 0.83 0.46 0.43 0.43 0.48 0.33 0.48 0.49 0.44
0.18 0.17 0.16 0.22 0.47 0.66 0.48 0.53 0.5 0.49 0.52 0.46 0.48 1.0 0.83 0.69 0.51 0.73 0.54 0.43 0.49 0.56 0.61 0.47 0.44 0.52 0.52 0.38 0.54 0.57 0.57
0.34 0.37 0.31 0.36 0.83 0.76 0.61 0.69 0.46 0.46 0.54 0.52 0.55 0.98 1.0 0.62 0.56 0.64 0.54 0.51 0.49 0.52 0.62 0.46 0.49 0.52 0.52 0.54 0.64 0.57 0.69
0.27 0.3 0.28 0.31 0.76 0.86 0.59 0.7 0.48 0.48 0.55 0.48 0.5 1.0 0.9 0.72 0.58 0.56 0.63 0.46 0.54 0.59 0.58 0.49 0.49 0.55 0.56 0.45 0.57 0.54 0.57
0.09 0.17 0.1 0.16 0.46 0.82 0.55 0.54 0.33 0.36 0.38 0.26 0.32 1.0 0.77 0.49 0.36 0.27 0.54 0.31 0.43 0.44 0.98 0.4 0.4 0.41 0.45 0.34 0.46 0.39 0.42
0.31 0.36 0.37 0.43 0.58 0.54 0.37 0.34 0.44 0.44 0.45 0.42 0.39 1.0 0.75 0.47 0.39 0.72 0.45 0.4 0.39 0.44 0.41 0.35 0.39 0.41 0.43 0.31 0.56 0.5 0.59
0.22 0.31 0.22 0.22 0.92 0.95 0.5 0.41 0.43 0.47 0.49 0.43 0.4 1.0 0.88 0.56 0.47 0.86 0.54 0.44 0.46 0.5 0.6 0.35 0.45 0.54 0.49 0.4 0.69 0.56 0.56
0.15 0.15 0.14 0.17 0.55 0.65 0.42 0.37 0.3 0.39 0.35 0.39 0.52 1.0 0.85 0.64 0.52 0.66 0.58 0.49 0.35 0.41 0.67 0.44 0.39 0.43 0.42 0.36 0.39 0.46 0.5
0.46 0.45 0.5 0.5 0.91 0.93 0.65 0.73 0.59 0.59 0.6 0.59 0.8 1.0 0.92 0.75 0.68 0.91 0.63 0.64 0.62 0.56 0.72 0.63 0.65 0.66 0.69 0.62 0.71 0.72 0.73
0.36 0.36 0.36 0.29 0.75 0.71 0.54 0.57 0.48 0.44 0.51 0.54 0.73 1.0 0.96 0.6 0.57 0.57 0.66 0.58 0.51 0.55 0.76 0.45 0.51 0.48 0.51 0.51 0.6 0.59 0.79
0.26 0.34 0.28 0.32 0.64 0.64 0.36 0.35 0.39 0.36 0.4 0.35 0.37 1.0 0.87 0.53 0.38 0.47 0.46 0.38 0.4 0.4 0.56 0.3 0.37 0.44 0.41 0.34 0.47 0.42 0.52
0.25 0.28 0.29 0.28 0.49 0.36 0.23 0.21 0.47 0.53 0.44 0.41 0.27 1.0 0.82 0.42 0.37 0.61 0.39 0.34 0.35 0.36 0.38 0.33 0.29 0.31 0.39 0.32 0.49 0.45 0.51
0.25 0.3 0.3 0.34 0.66 0.77 0.55 0.6 0.39 0.43 0.46 0.44 0.41 1.0 0.85 0.43 0.46 0.78 0.64 0.55 0.51 0.48 0.96 0.47 0.44 0.54 0.54 0.46 0.62 0.6 0.67
0.36 0.32 0.32 0.46 0.58 0.67 0.6 0.65 0.47 0.52 0.49 0.41 0.49 1.0 0.92 0.57 0.54 0.71 0.59 0.5 0.51 0.48 0.86 0.5 0.55 0.54 0.55 0.49 0.68 0.63 0.61
0.18 0.22 0.2 0.25 0.6 0.69 0.46 0.43 0.47 0.44 0.47 0.42 0.69 0.92 1.0 0.68 0.56 0.97 0.64 0.53 0.46 0.45 0.98 0.48 0.49 0.54 0.44 0.39 0.46 0.52 0.7

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)