Heatmap: Cluster_17 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.16 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.17 0.2 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.21 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 1.0 0.2 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.33 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.32 0.35 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.07 0.09 0.0 0.0 0.16 1.0 0.07 0.0 0.09 0.57 0.43 0.0 0.0 0.59 0.14 0.0 0.51 0.17 0.0 0.08 0.07 0.44 0.17 0.31 0.15 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.98 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.15 0.0 0.11 0.25 0.18 0.1 0.27
0.13 0.0 0.0 0.0 0.4 0.24 0.42 0.17 0.25 0.14 0.75 0.15 0.56 0.29 0.22 0.96 0.28 0.26 0.32 0.22 0.05 0.16 0.0 0.28 0.27 0.42 0.13 0.14 0.1 0.28 1.0
0.0 0.32 0.0 0.0 0.22 0.48 0.0 0.0 0.11 0.0 0.61 0.0 0.0 1.0 0.54 0.29 0.0 0.0 0.46 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.34 0.39 0.1 0.23 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.21 0.26 0.95 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.15 0.15 0.31 0.85 0.0 1.0 0.58 0.0 0.88 0.17 0.3 0.14 0.46 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.24 0.4 0.0 0.19 0.16 1.0 0.22 0.17 0.28 0.09 0.0 0.55 0.0 0.21 0.0 0.21 0.1 0.0 0.0 0.0 0.41 0.66 0.15 0.17 0.1 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.6 0.08 0.36 0.5 0.18 0.31 0.57 0.87 0.07 0.45 0.07 0.0 0.0 0.08 0.26 0.0 0.0 0.45 0.24 0.1 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.09 0.09 0.34 0.15 0.43 0.23 0.48 0.5 0.6 0.4 1.0 0.49 0.64 0.49 0.23 0.21 0.41 0.43 0.35 0.22 0.33 0.21 0.09 0.24 0.16 0.14 0.56 0.38 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 1.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.13 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 0.09 0.09 0.0 0.11 0.23 0.13 0.0 0.08 0.65 0.0 0.04 0.04 0.09 0.17 0.09 1.0 0.86 0.37 0.1 0.11 0.12 0.21 0.15 0.22 0.13 0.0 0.04 0.21 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.08 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.0 0.0 0.0 0.1 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.16 0.14 0.0 0.29 0.0 0.0 0.32 0.45 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 1.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.74 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.42 0.43 0.27 0.55 0.66 0.43 0.62 0.53 0.31 0.84 0.47 0.52 0.64 1.0 0.69 0.54 0.58 0.95 0.54 0.43 0.6 0.47 0.54 0.53 0.51 0.57 0.44 0.75 0.63 0.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.16 0.09 0.09 0.22 0.09 0.74 0.0 0.09 0.3 1.0 0.09 0.09 0.3 0.21 0.28 0.22 0.0 0.78 0.0 0.0 0.51 0.07 0.0 0.09 0.08 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)