Heatmap: Cluster_17 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.06 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.04 0.05 0.0 0.0 0.09 0.52 0.04 0.0 0.05 0.3 0.23 0.0 0.0 0.31 0.07 0.0 0.27 0.09 0.0 0.04 0.03 0.23 0.09 0.17 0.08 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.36 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 1.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.08 2.56 0.0 0.0 0.0 0.63 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.37 0.0 0.29 0.65 0.47 0.27 0.69
0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.12 0.05 0.07 0.04 0.21 0.04 0.16 0.08 0.06 0.27 0.08 0.07 0.09 0.06 0.01 0.04 0.0 0.08 0.08 0.12 0.04 0.04 0.03 0.08 0.28
0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.05 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.27 0.34 1.23 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 0.09 0.24 0.0 0.29 0.17 0.0 0.25 0.05 0.09 0.04 0.13 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.14 0.23 0.0 0.11 0.09 0.58 0.13 0.1 0.16 0.05 0.0 0.32 0.0 0.12 0.0 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.24 0.38 0.09 0.1 0.06 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.03 0.05 0.02 0.03 0.05 0.08 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.08 0.08 0.29 0.13 0.38 0.2 0.42 0.43 0.52 0.35 0.87 0.43 0.56 0.42 0.2 0.18 0.35 0.37 0.3 0.19 0.29 0.18 0.08 0.21 0.14 0.12 0.49 0.33 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.36 0.22 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.07 0.07 0.0 0.08 0.18 0.1 0.0 0.06 0.49 0.0 0.03 0.03 0.07 0.13 0.07 0.75 0.65 0.28 0.07 0.08 0.09 0.16 0.11 0.17 0.1 0.0 0.03 0.16 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 0.0 0.0 0.0 0.19 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 2.03 0.0 0.0 0.72 0.0 0.32 0.28 0.0 0.59 0.0 0.0 0.66 0.92 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.41 0.0 0.14 0.0 0.0 0.31 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 0.67 0.68 0.43 0.88 1.04 0.68 0.99 0.85 0.5 1.33 0.74 0.83 1.02 1.59 1.1 0.86 0.92 1.52 0.86 0.68 0.95 0.74 0.86 0.85 0.81 0.91 0.71 1.2 1.01 1.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.14 0.0 0.02 0.06 0.2 0.02 0.02 0.06 0.04 0.05 0.04 0.0 0.15 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.02 0.02 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)