Heatmap: Cluster_203 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10320.1 (FEY)	-0.86	-0.35	-0.57	-0.55	0.13	0.29	0.07	0.11	-0.2	-0.07	0.14	-0.03	0.58	0.18	0.31	0.31	0.32	-0.44	0.03	-0.08	-0.06	-0.15	-1.08	-0.14	0.01	0.04	0.02	-0.15	0.08	0.23	0.56
Lsat_1_v5_gn_1_128461.1 (BAC1)	-1.4	-0.57	-1.14	-0.88	-0.17	0.0	0.26	0.38	-0.24	0.27	-0.07	0.16	0.67	0.04	-0.24	0.12	0.23	-0.5	0.04	0.02	-0.01	0.18	-0.47	0.2	0.32	0.09	0.1	0.01	-0.09	0.05	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_17821.1	-3.47	-0.98	-0.79	-0.46	-0.8	-0.74	-1.27	0.1	0.25	-0.2	-0.26	-0.91	1.38	0.63	0.01	-0.4	0.59	-2.03	-0.18	-0.46	-0.89	-0.94	-2.56	0.0	-0.31	0.1	-0.53	-1.16	0.88	0.79	2.3
Lsat_1_v5_gn_1_20440.1 (RBP47C')	-0.41	-0.44	-0.43	-0.3	0.15	0.19	-0.14	0.3	-0.17	-0.24	0.05	0.19	0.54	0.14	0.08	0.02	0.08	-0.59	-0.24	-0.06	-0.07	-0.03	-0.15	0.12	0.0	0.04	0.01	-0.1	-0.08	0.08	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_34101.1 (FTR)	-0.67	-0.54	-1.35	-1.13	-0.54	-0.17	0.23	0.37	0.05	0.01	0.15	0.12	0.87	-0.49	-0.0	-0.08	0.28	-0.72	0.03	0.02	0.07	0.08	-0.75	0.25	0.04	0.14	0.15	-0.09	0.17	0.36	0.8
Lsat_1_v5_gn_1_35440.1 (HTH)	-1.78	-1.5	-1.6	-1.58	-0.84	-0.42	0.58	0.77	-0.23	-0.02	-0.08	-0.07	1.16	0.11	0.31	0.25	0.33	-0.12	0.11	0.25	-0.11	-0.01	-2.58	0.12	-0.01	-0.01	-0.13	-0.23	-0.15	0.16	1.21
Lsat_1_v5_gn_1_49160.1 (PPR287)	-0.36	-0.35	-0.67	-0.32	-0.13	0.23	-0.23	0.75	-0.33	-0.03	0.1	0.41	0.26	-0.03	-0.27	-0.05	-0.0	-1.55	-0.25	-0.27	0.02	0.11	-0.83	0.45	0.26	0.03	-0.13	-0.09	0.19	0.26	0.85
Lsat_1_v5_gn_1_50620.1 (BIR6)	-0.76	-0.64	-0.69	-0.36	0.21	0.61	-0.21	0.21	0.12	0.13	0.33	0.2	0.03	0.34	-0.23	-0.22	-0.41	-0.65	0.02	-0.32	-0.49	0.01	-1.44	0.33	0.19	-0.15	-0.1	-0.39	0.32	0.47	1.11
Lsat_1_v5_gn_1_76101.1	-0.72	-1.13	-1.3	-0.91	-0.36	0.25	0.36	0.34	-0.07	-0.06	0.1	0.05	0.39	0.36	0.33	0.18	0.21	-1.12	0.28	0.16	0.05	0.14	-0.41	0.25	0.16	0.12	0.03	0.06	-0.19	0.09	0.3
Lsat_1_v5_gn_2_132680.1	-1.17	-1.39	-0.55	-0.08	-0.14	-0.07	-0.2	0.33	0.07	-0.31	-0.07	0.15	0.68	0.32	-0.0	0.02	0.01	-0.41	-0.13	-0.24	0.15	-0.62	-0.99	0.08	-0.02	0.11	0.03	-0.05	0.36	0.25	1.27
Lsat_1_v5_gn_2_66321.1 (ACP2)	-0.82	-0.95	-0.74	-0.43	-0.24	0.17	0.15	0.3	-0.23	-0.06	0.0	-0.13	0.61	0.21	0.01	0.22	0.13	0.18	-0.2	-0.04	-0.07	0.06	-0.72	0.15	0.14	0.22	0.12	0.01	0.24	0.21	0.27
Lsat_1_v5_gn_2_72881.1 (PTAC13)	-0.46	-0.5	-0.76	-0.69	-0.28	0.21	0.11	0.46	-0.19	-0.1	-0.15	0.07	0.6	0.68	0.23	-0.03	-0.13	-1.2	-0.08	-0.02	-0.11	0.06	-0.87	0.37	0.12	0.12	0.04	-0.03	0.0	0.08	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_97721.1	-0.31	-0.52	-0.34	-0.07	-0.1	0.26	-0.0	0.3	-0.05	-0.02	0.13	0.17	0.15	0.28	-0.12	-0.01	-0.13	-1.05	-0.2	-0.2	-0.02	0.06	-0.59	0.23	0.01	0.06	-0.09	-0.11	0.19	0.33	0.74
Lsat_1_v5_gn_3_113801.1 (HY2)	-0.53	-0.64	-1.06	-1.56	-0.02	0.31	0.09	0.36	-0.24	-0.18	-0.18	-0.09	0.34	0.48	0.21	0.0	0.07	-0.68	0.11	0.02	0.01	0.14	-0.09	0.2	0.16	0.11	0.06	0.12	-0.07	0.09	0.67
Lsat_1_v5_gn_3_119881.1 (AEF1)	-0.17	-0.61	-0.54	-0.4	-0.08	0.17	0.22	0.56	-0.24	-0.11	-0.13	0.12	0.33	0.43	0.21	0.21	0.16	-1.62	-0.07	-0.13	-0.24	-0.14	-0.55	0.18	0.26	0.14	0.29	0.12	-0.26	0.01	0.34
Lsat_1_v5_gn_3_25521.1 (CMAL)	-0.43	-0.64	-0.76	-0.49	-0.15	0.17	0.03	0.22	-0.02	0.05	0.1	0.07	0.3	0.29	0.38	0.17	0.06	-0.94	0.07	0.07	0.09	0.12	-0.6	0.19	0.06	0.07	0.09	0.12	0.01	-0.0	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_6100.1	-0.67	-0.78	-0.89	-0.36	-0.07	0.03	0.19	0.53	-0.27	-0.13	-0.19	0.03	0.54	0.54	0.46	0.25	0.23	-0.61	-0.18	-0.02	-0.04	-0.08	0.04	0.01	-0.1	0.09	-0.08	-0.09	-0.06	-0.08	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_6620.1 (MURE)	-0.07	-0.63	-0.49	-0.94	-0.63	-0.0	0.17	0.85	-0.5	-0.5	-0.37	0.01	1.01	0.74	0.12	-0.1	0.08	-1.35	-0.16	-0.3	-0.18	0.02	-0.6	0.32	0.16	-0.14	-0.21	-0.05	-0.05	0.05	0.91
Lsat_1_v5_gn_3_77561.1	-0.64	-0.61	-1.09	-0.86	-0.06	0.36	0.22	0.44	-0.09	0.04	0.1	0.19	0.36	-0.16	-0.12	0.06	0.17	-0.95	-0.07	-0.06	-0.13	0.08	-0.49	0.24	0.06	0.11	-0.06	0.03	0.2	0.22	0.81
Lsat_1_v5_gn_4_106460.1 (MCA1)	-1.01	-1.25	-0.88	-0.98	-0.16	0.24	0.14	0.46	0.08	0.08	0.22	0.3	0.55	-0.19	0.29	0.26	0.31	-0.74	-0.08	0.16	-0.21	-0.01	-0.75	0.06	-0.12	0.1	-0.01	0.08	-0.08	0.16	0.76
Lsat_1_v5_gn_4_126840.1	-0.77	-1.12	-1.55	-1.59	-0.03	0.15	0.17	0.58	-0.44	-0.13	0.09	0.13	0.88	0.77	0.54	-0.09	-0.11	-0.1	0.19	0.04	-0.31	-0.1	-1.62	0.17	-0.1	-0.16	-0.14	0.16	-0.02	0.03	0.8
Lsat_1_v5_gn_4_134101.1	0.07	-0.32	-0.51	-0.42	-0.03	0.23	0.02	0.2	-0.08	-0.02	-0.11	0.09	0.41	0.16	0.15	0.1	0.11	-0.49	-0.14	-0.04	0.03	0.08	-0.34	0.09	0.11	0.06	0.06	0.3	-0.04	-0.15	-0.06
Lsat_1_v5_gn_4_145621.1 (ROP1)	-1.01	-0.69	-0.89	-0.78	-0.31	0.17	0.26	0.17	-0.07	0.11	0.17	0.09	0.63	0.24	0.27	0.48	0.48	-0.68	-0.16	-0.03	-0.0	0.17	-0.79	0.09	0.04	0.21	0.02	-0.01	-0.15	-0.0	0.26
Lsat_1_v5_gn_4_163661.1 (CYCD3;3)	-0.51	-0.63	-1.11	-1.26	-0.23	0.29	0.17	0.48	-0.2	-0.13	-0.01	0.11	0.5	0.24	0.27	0.13	0.04	-0.59	0.38	-0.01	0.01	-0.01	-0.74	0.19	0.21	0.03	-0.11	0.09	-0.1	0.13	0.57
Lsat_1_v5_gn_4_170180.1	-0.84	-0.93	-0.59	-0.25	-0.1	0.15	-0.1	0.12	-0.11	0.02	-0.14	0.07	0.53	0.38	0.02	-0.06	0.24	-0.74	-0.03	-0.07	-0.1	-0.11	-0.67	0.21	0.12	0.03	-0.08	-0.14	0.3	0.36	0.93
Lsat_1_v5_gn_4_177241.1 (PBL34)	-0.64	-0.58	-0.98	-0.88	-0.03	0.32	0.29	0.5	-0.31	-0.35	-0.09	-0.1	0.62	0.09	0.02	0.2	0.15	-0.38	0.04	-0.1	-0.12	-0.03	-0.55	0.12	0.12	0.09	0.06	0.04	0.06	0.21	0.68
Lsat_1_v5_gn_4_183181.1 (TRM61)	-1.12	-0.86	-0.8	-0.66	-0.58	-0.46	0.39	0.93	-0.18	-0.12	-0.43	0.13	1.08	-0.22	-0.19	0.16	0.27	-0.73	-0.34	0.14	-0.28	0.13	-1.18	0.36	0.3	0.18	-0.24	0.11	-0.01	-0.11	1.01
Lsat_1_v5_gn_4_2821.1	-0.07	-0.51	-0.61	-0.24	-0.08	0.19	-0.07	0.24	-0.12	-0.08	0.07	0.19	0.57	0.34	0.18	0.12	0.06	-0.27	-0.12	-0.1	-0.13	0.1	-0.37	0.09	0.01	-0.01	0.03	0.07	-0.02	-0.05	0.03
Lsat_1_v5_gn_4_3621.1 (ORP1D)	-0.64	-0.43	-0.82	-0.84	-0.06	0.28	0.22	0.01	-0.0	0.06	0.04	-0.09	0.37	0.04	0.3	0.35	0.2	-0.8	0.18	0.02	-0.02	0.16	-1.16	-0.07	0.06	0.1	0.13	0.16	0.18	0.1	0.49
Lsat_1_v5_gn_4_65340.1 (GAUT4)	-0.71	-0.75	-0.64	-0.64	-0.05	0.07	0.03	0.34	-0.01	0.16	0.24	0.14	0.73	0.33	0.05	0.1	0.05	-0.59	-0.03	0.12	-0.21	-0.06	-3.13	0.2	0.07	-0.02	-0.02	0.15	-0.23	0.1	0.91
Lsat_1_v5_gn_4_85941.1	-0.84	-0.62	-1.16	-1.18	-0.43	0.33	0.39	0.56	-0.17	0.08	-0.02	0.06	0.62	0.17	0.07	0.01	-0.04	0.08	-0.11	-0.18	-0.13	0.06	-1.62	0.23	0.18	-0.11	0.19	-0.07	0.04	0.16	0.87
Lsat_1_v5_gn_5_135061.1	-1.04	-0.9	-1.68	-1.29	-0.19	0.33	0.38	0.43	-0.17	0.0	0.06	0.08	0.5	-0.28	-0.16	0.45	0.32	-1.06	-0.13	0.18	0.11	0.25	-0.68	0.26	0.3	0.26	0.16	0.14	-0.14	0.23	0.47
Lsat_1_v5_gn_5_137380.1	-0.33	-0.59	-0.78	-0.68	-0.26	0.07	0.09	0.26	-0.26	-0.1	-0.09	0.04	0.51	0.31	0.19	0.14	0.15	-0.32	0.16	0.1	0.04	0.08	-0.37	0.1	0.11	0.05	-0.02	0.18	-0.03	-0.02	0.38
Lsat_1_v5_gn_5_150720.1	-0.63	-0.6	-0.6	-0.55	0.07	0.43	0.08	0.42	-0.08	-0.17	0.02	0.1	0.48	0.58	0.15	0.02	0.14	-1.7	-0.25	-0.08	-0.0	0.1	-0.68	0.29	0.13	0.14	0.08	-0.04	-0.09	-0.01	0.44
Lsat_1_v5_gn_5_154661.1 (AKR4C9)	-0.18	-0.4	-0.35	-0.4	-0.29	-0.03	0.36	0.38	-0.06	0.07	-0.06	0.1	0.54	-0.2	-0.16	-0.1	0.15	-0.7	-0.15	-0.02	0.03	-0.05	-0.3	0.13	0.13	0.03	-0.03	0.11	-0.11	-0.01	0.71
Lsat_1_v5_gn_5_30481.1 (OCP3)	0.04	-0.53	-0.66	-0.65	-0.57	-0.01	0.11	0.57	-0.28	-0.22	-0.04	0.21	0.31	0.54	0.18	-0.1	-0.01	-1.26	-0.22	-0.11	0.07	0.19	-0.63	0.34	0.21	-0.01	-0.12	0.16	0.21	0.15	0.56
Lsat_1_v5_gn_5_65361.1 (PHGAP2)	-0.48	-0.46	-0.16	0.05	-0.18	-0.01	0.05	0.11	-0.05	0.01	0.05	0.09	0.45	0.0	0.05	0.12	0.16	-0.75	-0.19	-0.13	-0.13	-0.03	-0.34	0.02	0.07	0.06	0.05	0.08	-0.03	0.27	0.59
Lsat_1_v5_gn_5_7861.1 (TUP5)	-0.44	-0.67	-0.79	-0.49	-0.21	0.02	0.04	0.28	-0.29	-0.16	-0.1	0.08	0.39	0.44	0.36	0.12	0.12	-0.76	0.07	0.05	0.04	0.06	-0.08	0.15	0.11	0.09	-0.07	0.02	0.09	0.06	0.47
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.