Heatmap: Cluster_203 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
5.06 7.23 6.19 6.25 10.02 11.22 9.63 9.92 8.0 8.75 10.1 9.02 13.77 10.41 11.41 11.38 11.45 6.78 9.36 8.7 8.78 8.29 4.35 8.35 9.25 9.41 9.3 8.27 9.72 10.75 13.5
1.52 2.69 1.81 2.17 3.56 4.02 4.8 5.21 3.4 4.84 3.81 4.46 6.39 4.11 3.39 4.37 4.71 2.84 4.12 4.07 3.97 4.54 2.88 4.59 4.98 4.26 4.29 4.04 3.76 4.14 6.42
0.04 0.22 0.25 0.31 0.25 0.26 0.18 0.46 0.51 0.37 0.36 0.23 1.11 0.67 0.43 0.33 0.64 0.11 0.38 0.31 0.23 0.22 0.07 0.43 0.34 0.46 0.3 0.19 0.79 0.74 2.11
23.97 23.42 23.63 25.85 35.41 36.34 28.84 39.14 28.35 26.88 33.0 36.29 46.29 35.17 33.61 32.29 33.64 21.08 26.99 30.61 30.31 31.26 28.65 34.51 31.94 32.7 32.03 29.8 30.15 33.77 51.24
2.55 2.79 1.59 1.85 2.79 3.61 4.74 5.24 4.2 4.09 4.49 4.39 7.39 2.88 4.04 3.84 4.92 2.46 4.14 4.1 4.25 4.29 2.41 4.83 4.16 4.48 4.51 3.8 4.55 5.19 7.04
21.66 26.33 24.47 24.89 41.45 55.59 110.88 126.64 63.22 73.16 70.26 71.0 166.67 80.36 92.42 88.72 93.69 68.53 80.03 88.52 69.12 73.68 12.4 80.63 73.63 73.77 68.15 63.53 67.06 82.82 171.84
11.48 11.56 9.24 11.77 13.42 17.32 12.59 24.8 11.7 14.48 15.76 19.61 17.66 14.42 12.21 14.19 14.7 5.02 12.42 12.25 14.93 15.86 8.28 20.08 17.67 15.03 13.45 13.81 16.86 17.65 26.47
2.48 2.7 2.6 3.27 4.85 6.39 3.63 4.84 4.56 4.59 5.27 4.81 4.28 5.31 3.58 3.59 3.14 2.66 4.25 3.36 2.99 4.22 1.54 5.28 4.79 3.77 3.92 3.19 5.21 5.81 9.05
14.99 11.31 10.02 13.12 19.21 29.43 31.67 31.33 23.56 23.67 26.41 25.61 32.44 31.65 31.09 27.88 28.61 11.39 30.06 27.66 25.63 27.28 18.64 29.3 27.57 26.8 25.16 25.67 21.61 26.29 30.38
1.01 0.87 1.55 2.14 2.06 2.17 1.97 2.85 2.37 1.82 2.16 2.52 3.64 2.83 2.26 2.3 2.28 1.71 2.07 1.91 2.51 1.47 1.14 2.4 2.23 2.45 2.32 2.19 2.9 2.7 5.47
167.49 152.93 176.07 218.58 249.76 330.63 328.08 362.79 252.16 282.59 294.87 270.09 450.9 340.36 297.73 342.75 322.49 334.07 256.02 286.44 280.1 307.37 179.17 327.43 324.92 343.82 321.28 296.78 347.19 340.6 355.1
16.29 15.8 13.25 13.87 18.37 25.87 24.2 30.8 19.62 20.92 20.2 23.39 33.97 35.82 26.16 21.88 20.41 9.76 21.19 22.0 20.71 23.27 12.21 28.8 24.37 24.22 22.95 21.97 22.4 23.62 34.88
9.34 8.1 9.16 11.03 10.82 13.95 11.61 14.33 11.2 11.46 12.75 13.11 12.91 14.07 10.65 11.52 10.62 5.62 10.08 10.1 11.44 12.07 7.71 13.64 11.7 12.08 10.95 10.76 13.26 14.56 19.4
10.53 9.78 7.29 5.16 14.99 18.86 16.18 19.47 12.85 13.45 13.46 14.26 19.21 21.23 17.65 15.24 16.02 9.5 16.4 15.43 15.37 16.72 14.33 17.47 17.03 16.47 15.91 16.57 14.52 16.22 24.24
2.59 1.92 2.02 2.22 2.77 3.3 3.4 4.3 2.48 2.72 2.67 3.18 3.67 3.94 3.39 3.39 3.27 0.95 2.79 2.66 2.47 2.65 1.99 3.3 3.5 3.22 3.56 3.17 2.44 2.93 3.7
8.94 7.75 7.12 8.61 10.86 13.6 12.31 14.01 11.88 12.53 12.91 12.68 14.87 14.74 15.72 13.54 12.59 6.31 12.63 12.65 12.83 13.07 7.96 13.77 12.6 12.67 12.8 13.1 12.15 12.03 14.73
8.82 8.18 7.54 10.93 13.3 14.28 15.93 20.16 11.59 12.79 12.31 14.25 20.4 20.4 19.21 16.64 16.4 9.18 12.39 13.78 13.67 13.21 14.39 14.11 13.03 14.93 13.2 13.19 13.41 13.29 19.21
18.28 12.45 13.66 10.04 12.41 19.21 21.59 34.69 13.56 13.57 14.87 19.31 38.8 32.07 20.91 17.95 20.35 7.54 17.25 15.61 16.96 19.45 12.67 23.98 21.45 17.46 16.64 18.54 18.55 19.91 36.04
5.02 5.1 3.67 4.3 7.47 10.02 9.06 10.56 7.33 8.02 8.38 8.87 10.03 6.98 7.17 8.12 8.78 4.05 7.42 7.5 7.11 8.22 5.55 9.24 8.15 8.44 7.49 7.94 8.95 9.11 13.65
3.56 3.0 3.89 3.62 6.42 8.43 7.91 9.86 7.56 7.59 8.35 8.79 10.48 6.26 8.77 8.6 8.89 4.29 6.78 8.0 6.17 7.1 4.26 7.45 6.57 7.68 7.12 7.59 6.77 8.01 12.11
3.42 2.69 1.99 1.94 5.72 6.47 6.54 8.69 4.29 5.33 6.22 6.36 10.7 9.91 8.46 5.48 5.38 5.43 6.63 6.0 4.7 5.43 1.89 6.54 5.44 5.21 5.28 6.52 5.74 5.96 10.16
20.21 15.46 13.52 14.42 18.9 22.56 19.62 22.24 18.3 19.06 17.93 20.56 25.67 21.51 21.41 20.75 20.84 13.73 17.46 18.8 19.64 20.39 15.24 20.58 20.79 20.1 20.09 23.8 18.8 17.36 18.51
32.17 40.22 35.08 37.69 52.31 73.21 77.74 73.05 61.65 70.24 73.03 69.29 100.15 76.5 78.07 90.79 90.46 40.48 58.08 63.66 64.82 73.01 37.47 69.27 66.76 74.85 65.95 64.36 58.57 64.72 77.87
8.61 7.92 5.67 5.12 10.4 14.99 13.8 17.02 10.64 11.17 12.13 13.18 17.34 14.48 14.77 13.34 12.6 8.15 15.94 12.12 12.3 12.16 7.33 13.93 14.1 12.48 11.31 12.97 11.42 13.37 18.17
5.28 4.97 6.28 7.95 8.78 10.48 8.8 10.25 8.77 9.56 8.58 9.93 13.66 12.25 9.55 9.08 11.15 5.65 9.24 9.0 8.79 8.75 5.92 10.89 10.24 9.66 8.91 8.54 11.63 12.11 17.96
6.33 6.6 5.02 5.37 9.67 12.3 12.08 14.0 7.97 7.73 9.28 9.21 15.21 10.53 10.01 11.35 10.95 7.6 10.16 9.2 9.06 9.67 6.76 10.73 10.72 10.52 10.28 10.16 10.32 11.44 15.87
0.98 1.17 1.22 1.34 1.42 1.55 2.77 4.04 1.87 1.95 1.58 2.32 4.48 1.82 1.85 2.37 2.57 1.28 1.68 2.34 1.75 2.32 0.94 2.73 2.61 2.4 1.8 2.3 2.11 1.96 4.27
41.95 30.93 28.71 37.23 41.65 50.04 41.89 51.81 40.32 41.41 46.16 50.11 65.31 55.64 49.77 47.77 45.68 36.34 40.44 41.1 40.18 47.18 33.96 46.59 44.13 43.5 44.94 45.98 43.26 42.43 44.77
11.17 12.95 9.83 9.74 16.71 21.08 20.26 17.57 17.36 18.17 17.93 16.29 22.49 17.91 21.38 22.16 19.91 10.01 19.67 17.64 17.14 19.48 7.81 16.58 18.16 18.65 19.01 19.44 19.71 18.61 24.37
7.02 6.79 7.33 7.37 11.1 11.98 11.71 14.52 11.39 12.83 13.53 12.61 18.96 14.36 11.85 12.27 11.86 7.6 11.22 12.42 9.91 10.98 1.31 13.13 12.05 11.28 11.3 12.7 9.73 12.31 21.56
4.8 5.57 3.85 3.78 6.36 10.8 11.26 12.65 7.63 9.08 8.49 8.96 13.23 9.64 8.99 8.63 8.33 9.06 7.93 7.59 7.87 8.97 2.8 10.05 9.71 7.97 9.77 8.18 8.84 9.62 15.73
12.69 14.04 8.14 10.7 22.85 32.9 33.91 35.15 23.27 26.2 27.21 27.54 37.04 21.51 23.43 35.8 32.67 12.5 23.91 29.58 28.18 31.11 16.34 31.32 32.29 31.38 29.29 28.83 23.68 30.59 36.17
17.85 14.98 13.14 14.08 18.86 23.58 23.98 26.96 18.77 21.06 21.15 23.09 32.13 27.92 25.73 24.78 24.97 18.03 25.2 24.2 23.14 23.82 17.46 24.05 24.37 23.25 22.25 25.59 21.97 22.24 29.21
6.2 6.35 6.37 6.58 10.08 12.98 10.18 12.92 9.1 8.58 9.79 10.33 13.43 14.36 10.67 9.74 10.6 2.97 8.12 9.1 9.62 10.35 6.02 11.79 10.55 10.6 10.17 9.38 9.02 9.53 13.02
18.68 16.08 16.68 16.06 17.33 20.73 27.21 27.51 20.36 22.31 20.35 22.72 30.76 18.47 18.96 19.78 23.6 13.03 19.17 20.9 21.71 20.53 17.23 23.2 23.25 21.71 20.84 22.87 19.59 21.12 34.61
18.49 12.44 11.39 11.41 12.08 17.77 19.32 26.58 14.75 15.37 17.4 20.7 22.31 26.01 20.28 16.75 17.87 7.49 15.45 16.66 18.79 20.45 11.59 22.73 20.74 17.76 16.55 20.03 20.69 19.95 26.36
9.19 9.31 11.45 13.27 11.31 12.73 13.24 13.83 12.39 12.86 13.27 13.67 17.48 12.83 13.27 13.88 14.31 7.61 11.2 11.71 11.69 12.57 10.12 13.01 13.41 13.37 13.25 13.5 12.58 15.41 19.28
19.0 16.24 14.97 18.45 22.3 26.25 26.59 31.31 21.15 23.11 24.05 27.41 33.81 34.97 33.17 28.11 28.03 15.29 27.2 26.85 26.57 26.86 24.46 28.77 27.85 27.57 24.59 26.22 27.53 27.01 35.8
13.63 12.93 8.7 11.08 15.54 19.18 16.58 19.68 16.01 15.97 19.04 19.4 22.85 23.46 19.93 18.47 17.8 15.11 14.49 16.41 16.49 17.83 17.85 21.45 19.5 17.89 17.82 18.04 17.75 20.7 25.27
8.3 11.46 11.29 9.23 16.07 16.73 20.04 19.59 14.13 15.62 16.55 15.52 24.16 18.02 16.69 18.98 19.37 10.82 16.18 15.93 15.71 17.38 8.89 15.31 16.75 17.69 16.18 13.91 18.36 19.98 20.48
11.27 9.05 8.67 8.66 11.72 12.63 11.99 12.58 10.29 10.92 10.09 10.86 18.38 15.36 11.79 11.3 12.1 8.63 12.26 10.99 11.26 12.95 14.48 12.79 11.64 11.12 11.31 13.18 11.73 12.54 18.82
0.52 0.51 0.35 0.92 0.85 0.97 1.68 1.75 1.63 1.59 2.04 1.82 2.88 2.0 1.88 1.3 1.07 1.63 1.52 1.64 1.59 1.36 0.58 1.28 1.3 1.39 1.41 1.16 1.52 2.01 4.34
11.55 12.69 11.82 13.06 17.05 17.96 15.53 14.79 15.17 15.74 16.1 16.98 19.57 13.99 13.78 15.83 16.01 12.04 13.24 15.06 14.6 16.65 7.89 15.09 16.26 15.91 16.47 16.1 16.2 16.69 22.98
17.91 13.92 10.57 10.58 16.69 20.66 17.1 20.16 14.42 15.39 17.93 18.04 24.29 21.69 20.09 19.97 19.03 11.51 21.08 18.14 18.41 20.65 13.12 19.68 17.5 19.48 19.28 20.94 15.91 15.26 20.43
10.62 10.03 9.01 9.46 13.53 14.25 14.59 13.91 11.79 12.54 12.35 12.14 16.92 18.24 16.28 14.63 13.87 7.17 15.48 13.09 12.87 13.48 5.82 13.66 13.66 12.99 13.76 13.73 15.05 14.37 17.29
6.21 5.98 4.65 4.85 7.81 9.84 11.8 13.35 9.91 10.57 10.51 11.09 12.91 13.37 11.33 11.03 11.9 3.38 9.66 9.79 10.01 10.2 5.72 11.26 11.09 10.28 10.13 10.81 9.45 11.2 13.27
5.06 5.88 4.86 4.16 7.78 8.13 7.94 8.2 6.2 6.99 7.21 7.25 9.74 7.85 6.79 7.56 8.08 4.52 8.07 7.43 7.62 8.21 2.82 7.1 7.88 7.91 7.53 7.26 8.0 9.03 12.14
20.44 15.68 13.79 13.79 19.62 24.33 20.31 23.35 15.79 17.13 17.05 20.11 30.61 27.18 23.58 20.01 20.61 9.97 16.81 19.56 20.68 21.56 16.58 23.47 21.74 19.39 19.75 21.17 18.04 20.09 36.19
17.79 14.94 16.83 19.81 26.38 31.35 29.96 31.73 24.66 26.38 25.45 28.01 35.77 25.18 23.98 24.49 27.15 14.88 23.25 27.8 25.97 25.89 19.69 28.14 28.08 27.74 25.94 29.96 22.79 29.31 43.15
7.49 6.29 3.91 4.46 7.44 10.21 9.86 11.56 7.97 7.19 8.75 8.9 12.41 10.58 8.46 8.55 9.47 4.79 9.21 8.67 8.54 9.07 5.35 10.35 9.22 8.38 8.55 9.41 7.56 8.43 11.25
32.53 33.19 27.08 26.65 29.58 38.77 36.03 45.97 34.65 32.17 37.57 41.07 43.91 57.6 39.5 37.68 36.63 21.93 32.4 34.02 39.14 39.7 37.39 42.47 38.58 42.16 39.33 35.14 42.77 38.28 49.69
10.17 9.74 7.46 7.2 13.53 15.55 13.04 11.95 11.05 10.22 11.7 12.47 16.27 14.08 12.79 13.08 13.11 9.62 12.13 11.51 11.24 12.94 12.9 12.98 13.61 12.87 11.76 14.2 12.11 12.12 15.94
1.73 2.07 1.54 1.35 3.08 3.74 4.28 4.83 2.28 2.53 2.41 3.42 5.02 3.5 3.52 4.0 3.62 3.23 2.78 3.29 3.21 3.34 2.53 3.27 3.49 3.37 3.24 3.89 3.27 3.45 5.4
3.06 2.37 2.06 1.94 4.0 4.71 5.22 6.95 3.49 3.61 4.2 4.42 6.44 5.71 4.98 4.14 4.44 2.65 4.52 4.75 4.25 4.92 3.07 6.05 4.58 4.47 4.49 4.16 4.82 5.69 8.07
9.09 8.39 7.71 7.77 9.98 10.56 11.59 12.66 9.58 9.97 10.97 10.63 15.06 12.5 11.28 10.08 10.49 6.98 11.08 11.69 10.17 11.75 11.69 12.13 11.24 11.57 11.21 12.41 11.93 12.9 16.93
6.64 6.91 5.72 7.08 11.92 16.65 18.54 19.77 11.76 12.57 12.61 12.74 21.26 15.06 14.04 16.43 16.12 7.38 11.05 14.72 13.33 14.59 6.19 15.36 13.81 13.93 14.84 11.09 12.37 14.4 20.22
7.03 6.27 7.15 7.1 10.2 12.47 14.79 18.56 12.86 12.55 13.76 13.47 22.81 14.86 14.0 13.33 13.31 13.69 12.78 14.37 12.72 12.7 5.88 13.23 13.52 11.19 12.98 12.21 12.83 15.34 29.23
32.54 33.24 30.36 42.02 53.34 52.78 45.17 52.32 42.04 43.19 47.56 50.62 60.44 56.44 46.03 41.57 43.03 29.22 41.02 40.77 42.24 46.63 36.11 56.75 51.34 48.74 48.19 42.45 46.72 54.5 87.23
7.63 6.97 4.26 3.41 8.51 10.57 10.11 10.53 7.2 7.72 8.45 8.35 12.75 9.48 9.67 8.61 8.52 3.37 9.18 7.55 7.8 9.01 2.23 8.21 8.57 8.81 8.57 9.76 9.09 9.09 11.87
9.47 9.84 7.0 5.92 11.95 12.39 11.93 12.98 9.09 9.59 9.83 10.23 13.49 14.28 12.37 11.39 11.2 7.42 11.33 10.32 9.79 10.84 9.11 10.43 10.89 11.3 10.98 11.94 11.77 12.3 12.51
1.14 1.03 0.68 1.23 1.52 2.58 3.36 4.28 1.83 1.5 2.31 2.24 3.72 2.42 2.37 2.26 2.17 1.12 1.67 1.94 2.56 2.2 2.07 2.52 2.33 1.95 1.96 2.04 2.67 3.0 5.48
12.99 13.35 11.55 12.82 11.87 13.88 13.78 18.64 13.55 12.57 13.73 16.77 21.04 20.86 15.95 14.17 15.95 6.55 13.65 13.25 14.99 14.88 12.85 18.26 16.55 14.65 13.48 15.02 16.21 16.44 22.26
4.82 5.04 5.39 6.07 9.87 9.35 5.52 7.85 7.36 8.46 9.57 8.63 7.89 9.57 8.6 7.82 7.12 4.53 9.08 6.58 6.7 6.91 4.0 7.55 8.11 6.8 7.51 6.04 8.79 9.66 12.65
2.03 1.74 1.37 1.6 2.41 4.52 3.54 4.72 2.7 3.15 3.11 3.18 3.41 4.97 4.21 3.02 3.04 0.56 3.83 2.87 2.89 3.94 1.35 3.65 3.37 3.44 3.36 2.6 3.11 3.85 3.91
9.41 10.3 12.27 9.97 14.81 18.63 16.58 18.01 15.13 17.3 17.64 20.35 21.47 18.37 15.34 18.78 20.16 12.69 15.67 17.38 15.34 17.84 15.61 17.54 17.57 18.71 18.46 16.67 13.48 19.03 31.14
2.36 2.01 2.51 2.62 2.86 3.45 4.03 4.39 3.32 3.39 3.05 3.49 3.92 3.6 3.93 3.81 3.62 1.47 3.48 3.3 3.19 3.17 1.98 3.72 3.34 2.98 3.08 3.24 3.58 4.53 4.71

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)