Heatmap: Cluster_16 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-2.05 -1.58 -1.85 -1.73 -0.86 -0.18 1.05 1.27 -2.02 -1.97 -1.3 -1.93 -0.03 0.82 1.45 0.23 0.36 1.38 1.05 -0.3 -0.57 -0.22 0.14 -0.25 -0.3 -0.29 -0.1 -0.26 -0.1 -0.86 0.01
-2.85 -1.09 -1.33 -4.12 -1.57 -1.63 1.2 1.26 -2.53 -3.13 -3.04 -2.99 -0.59 0.24 1.77 0.07 0.55 2.61 1.29 -0.36 -0.91 -0.78 -1.86 -0.36 -0.84 -0.84 -0.51 -1.09 -0.09 -1.08 0.11
-0.48 -0.76 -0.68 -0.7 -0.15 0.09 -0.0 0.15 -0.07 0.02 -0.11 -0.18 0.32 0.33 0.36 -0.05 0.01 0.2 0.16 0.02 -0.18 -0.08 0.21 0.03 0.0 0.06 -0.05 -0.12 0.05 0.13 0.59
-0.45 -0.34 -0.67 -0.74 -0.46 -0.16 0.28 0.42 -0.33 -0.17 -0.27 -0.09 0.25 0.22 0.16 0.0 0.11 0.6 -0.15 -0.13 -0.0 0.01 0.33 -0.12 -0.02 0.11 -0.06 -0.16 0.14 0.19 0.46
-2.05 -1.81 -2.89 -3.71 -1.2 -1.39 1.07 1.52 -1.87 -2.02 -1.91 -1.73 0.91 1.68 1.83 0.3 0.6 1.05 0.84 0.04 -0.53 -0.64 -0.17 -0.2 -0.46 -0.56 -0.68 -0.41 -1.34 -1.38 -1.13
-0.49 -0.32 -0.64 -0.93 -0.01 0.25 0.01 0.1 -0.24 -0.22 -0.09 -0.21 0.17 0.28 0.16 0.27 0.07 0.43 -0.01 -0.14 -0.08 0.01 0.67 -0.25 -0.03 0.05 0.04 -0.08 0.18 0.03 0.1
-0.33 -2.42 -4.43 -2.44 -0.27 -0.62 0.23 1.1 -0.6 -0.64 -0.62 -0.08 0.78 1.4 1.59 0.35 0.38 -1.44 0.18 0.1 -0.21 -0.23 -0.42 0.29 -0.38 -0.22 -0.17 0.23 -0.4 -0.32 -0.62
-0.59 -0.75 -0.9 -0.85 -0.4 0.01 0.23 0.4 -0.38 -0.32 -0.13 -0.16 0.57 0.45 0.35 0.11 0.09 0.14 0.05 0.05 -0.2 0.0 0.02 0.05 0.16 0.1 0.01 -0.05 -0.01 0.08 0.51
-1.82 -0.98 -1.02 -0.81 -0.63 -0.46 0.74 1.02 -0.42 -0.42 -0.38 -0.26 0.58 0.5 0.94 0.11 0.1 0.52 0.35 0.05 -0.33 -0.37 -0.57 -0.23 -0.16 -0.25 -0.21 -0.48 0.1 -0.06 0.85
-1.03 -1.6 -1.88 -2.48 -0.85 -0.32 0.3 0.52 -0.18 -0.33 -0.45 -0.23 0.17 0.72 0.97 -0.26 0.22 0.82 -0.09 -0.13 -0.05 -0.12 0.65 0.28 0.19 -0.1 -0.27 -0.01 -0.25 0.08 0.71
-1.5 -0.81 -2.38 -3.34 0.69 0.68 0.09 0.1 -1.34 -1.64 -1.13 -1.39 0.63 0.89 1.31 0.44 0.25 1.22 0.72 -0.29 -0.5 -0.45 1.04 -0.47 -0.43 -0.23 -0.3 -0.3 -0.29 -0.54 -0.53
-0.73 -1.45 -1.49 -1.36 -1.49 -0.69 0.61 1.06 -0.11 -0.22 -0.35 -0.11 0.62 1.47 0.69 -0.23 -0.07 -0.24 0.23 0.22 -0.13 -0.01 -1.04 0.11 0.04 -0.01 -0.06 -0.06 -0.38 -0.11 0.23
-0.29 -0.31 -0.74 -1.12 -0.36 -0.15 -0.16 -0.01 -0.2 -0.57 -0.89 -0.61 -0.19 1.76 2.2 0.55 0.12 0.92 -0.43 -1.36 -0.61 -0.86 0.36 -0.64 -1.03 -0.98 -1.45 -1.16 -0.02 0.0 -0.62
-0.79 -0.69 -0.97 -1.28 -0.54 -0.23 0.44 0.74 -0.42 -0.34 -0.39 -0.32 0.32 0.48 0.58 0.06 0.19 -0.24 0.35 0.03 -0.21 -0.05 0.67 -0.04 -0.05 -0.07 -0.12 -0.22 0.23 0.19 0.41
-1.25 -1.05 -1.0 -1.15 0.15 0.03 0.53 0.58 -0.02 -0.02 -0.06 -0.09 -0.04 0.28 0.75 -0.08 -0.03 0.23 0.22 0.09 -0.14 0.11 0.04 -0.13 -0.16 -0.16 -0.29 -0.14 0.16 0.26 0.31
-1.02 -2.69 -2.27 -3.45 -0.06 -0.12 0.65 0.6 -0.61 -0.56 -0.19 -0.06 0.75 0.52 0.79 0.03 -0.0 0.31 0.33 -0.14 -0.4 -0.58 -0.05 0.37 0.33 -0.47 -0.04 -0.26 0.07 0.44 0.83
-2.71 -2.29 -2.89 -2.54 -0.26 0.61 0.61 0.52 -0.58 -0.79 -0.17 -0.49 0.42 0.88 0.72 0.23 -0.18 0.91 -0.17 -0.16 -0.45 -0.32 0.89 -0.72 -0.19 -0.25 -0.03 -0.97 0.13 0.46 0.96
-0.73 -0.67 -0.97 -1.32 -0.51 -0.35 0.44 0.87 -0.6 -0.54 -0.65 -0.51 0.39 0.49 0.75 0.13 0.33 0.27 0.5 -0.13 -0.24 -0.2 0.66 -0.03 -0.07 -0.24 -0.28 -0.19 0.2 0.02 0.34
- - - - -1.01 -0.72 0.07 -0.19 -1.66 -1.25 -1.08 -1.24 -1.14 1.21 1.97 0.03 0.57 2.61 0.35 -0.23 0.21 -1.15 -2.48 0.6 -0.22 -0.81 -0.03 -2.44 -0.09 0.09 -0.05
-0.23 -0.41 -0.34 -0.29 -0.65 -0.45 0.23 0.88 -0.29 -0.53 -0.27 -0.16 0.47 0.62 0.44 0.04 0.03 -0.33 0.05 -0.17 -0.18 -0.12 0.35 0.0 -0.15 -0.15 -0.13 -0.34 -0.02 0.26 0.43
-2.36 -2.35 -2.04 -1.8 -0.35 -0.16 0.02 0.17 -0.33 -0.36 -0.24 -0.11 0.29 1.04 0.87 0.16 0.16 0.63 0.26 0.13 -0.14 -0.35 0.25 0.17 0.22 -0.02 0.08 -0.36 0.08 0.2 0.61
-1.81 -0.85 -2.28 -2.28 -0.61 -0.46 0.39 0.65 -0.41 -0.26 -0.31 -0.06 0.4 0.56 0.43 -0.13 0.22 0.62 0.23 0.09 -0.16 -0.21 0.44 0.19 -0.04 -0.13 -0.2 -0.21 0.27 0.37 0.82
-1.17 -1.23 -1.7 -1.55 -1.11 -0.51 0.73 0.7 -0.67 -0.54 -0.44 -0.3 1.17 0.98 0.84 -0.01 0.19 -0.08 0.35 0.13 -0.07 -0.07 -0.45 0.25 0.18 0.05 -0.01 0.25 -0.39 -0.3 -0.05
-1.78 -1.53 -2.14 -1.9 -0.54 -0.22 0.57 0.92 -1.21 -1.1 -1.09 -1.15 0.15 1.24 1.45 0.19 0.29 0.73 0.82 -0.22 -0.44 -0.28 1.11 -0.18 -0.27 -0.29 -0.25 -0.37 -0.05 -0.41 -0.48
-0.91 -0.44 -0.82 -0.8 -0.13 -0.13 0.14 0.82 -0.45 -0.41 -0.25 -0.13 0.32 0.2 0.25 0.07 0.14 0.55 0.4 -0.05 -0.28 -0.29 0.61 -0.09 -0.17 -0.23 -0.21 -0.54 0.08 0.2 0.65
-0.37 -0.7 -0.8 -0.69 -0.59 -0.47 0.47 0.7 -0.38 -0.32 -0.23 -0.07 0.55 -0.05 0.39 0.16 0.41 -0.24 0.25 0.02 -0.1 -0.12 0.54 0.02 0.05 -0.07 -0.17 0.05 -0.07 0.02 0.27
-1.28 -1.42 -1.76 -1.54 -0.67 -0.14 0.55 0.75 -0.59 -0.54 -0.42 -0.53 0.27 0.48 0.95 0.31 0.45 0.15 0.78 -0.06 -0.35 -0.08 0.23 -0.04 -0.08 -0.31 -0.14 -0.21 0.16 0.18 0.61
-0.71 -0.58 -0.8 -1.17 -0.86 -0.47 0.83 0.86 -0.6 -0.6 -0.72 -0.58 0.41 0.15 0.89 0.66 0.97 0.15 0.41 0.01 -0.27 -0.44 0.53 -0.09 -0.24 -0.22 -0.14 -0.13 -0.29 -0.15 -0.35
-1.27 -1.28 -1.43 -1.61 -0.23 0.12 0.18 0.27 -0.54 -0.37 -0.39 -0.34 -0.25 0.91 0.77 0.19 0.14 0.97 0.58 0.18 -0.02 0.12 0.57 -0.12 -0.14 -0.26 -0.15 -0.02 -0.03 -0.13 -0.08
-0.58 -0.93 -0.91 -0.56 0.13 0.48 0.17 0.23 -0.16 -0.06 0.02 -0.12 -0.26 0.22 0.17 0.12 -0.04 0.68 -0.05 -0.15 -0.13 -0.24 0.55 -0.07 -0.04 -0.05 0.08 -0.05 -0.01 0.08 0.23
-1.16 -1.12 -1.52 -1.44 -0.53 -0.28 0.25 0.79 -1.0 -0.83 -0.77 -0.57 -0.11 0.99 1.13 0.12 0.31 0.86 1.37 -0.13 -0.35 -0.22 0.34 -0.05 -0.19 -0.36 -0.27 -0.39 -0.04 -0.21 -0.13
-2.89 -1.48 -3.16 -2.28 -0.75 0.22 0.6 0.82 -0.74 -0.79 -0.58 -0.36 1.06 1.19 0.83 0.52 0.54 -0.83 0.09 -0.05 0.28 0.32 -0.36 -0.06 -0.14 -0.11 0.19 -0.13 -0.64 -0.79 0.65
-0.63 -0.88 -0.72 -1.25 -0.07 0.24 0.06 0.23 -0.45 -0.35 -0.27 -0.14 0.25 0.39 0.23 -0.03 -0.01 0.71 -0.06 -0.09 0.02 -0.08 0.7 -0.17 0.06 -0.03 0.1 0.15 0.1 0.03 0.33
-2.57 -3.18 -2.61 -2.39 -1.53 -1.2 0.79 1.61 -0.32 -0.16 -0.44 0.22 0.44 1.15 1.53 0.26 0.45 -0.4 0.57 0.47 -0.41 -0.73 -2.0 -0.18 -0.25 -0.57 -0.22 -0.12 -0.61 -0.17 0.29
-1.19 -0.93 -1.33 -1.24 -0.23 -0.03 0.03 0.0 -0.42 -0.46 -0.42 -0.63 0.04 0.76 0.99 0.12 0.17 0.6 0.77 0.12 -0.24 -0.21 1.04 -0.4 -0.29 -0.3 -0.11 -0.22 -0.12 -0.1 0.56
-0.34 -0.18 -0.21 -0.94 -0.91 -0.86 0.91 1.04 -0.98 -1.02 -1.29 -1.42 0.12 1.11 1.73 0.64 0.75 0.07 1.03 0.08 -0.4 -0.44 -1.38 -0.41 -0.54 -0.38 -0.52 -0.52 -0.45 -1.05 -1.07
-0.42 -0.21 -0.69 -1.18 -0.03 -0.12 0.3 0.67 -0.8 -0.8 -0.79 -0.89 -0.16 1.03 1.47 0.4 0.29 0.7 0.69 -0.21 -0.34 -0.47 0.58 -0.45 -0.47 -0.38 -0.28 -0.44 -0.23 -0.58 -0.58
-0.49 -0.3 -0.65 -0.6 0.01 -0.14 -0.24 -0.05 -0.07 -0.16 0.03 -0.17 -0.05 0.76 0.68 0.18 0.01 0.36 0.3 0.03 -0.12 -0.16 -0.07 -0.15 -0.15 -0.01 0.01 -0.46 0.12 0.13 0.35
-0.35 -0.43 -1.17 -1.7 -0.58 -0.01 0.79 1.06 -0.39 -0.53 -0.41 -0.54 -0.22 0.47 0.74 0.06 0.1 0.26 0.56 0.06 -0.13 0.01 -0.08 0.04 -0.06 -0.12 -0.04 -0.22 0.0 -0.11 0.09
-1.27 -0.71 -1.03 -0.92 -0.01 0.1 0.11 0.26 -0.42 -0.39 -0.48 -0.55 0.22 0.65 0.64 0.14 0.12 0.61 0.09 0.07 -0.13 -0.15 0.63 -0.23 -0.11 -0.16 0.11 -0.14 0.01 0.16 0.51
-0.98 -0.61 -0.67 -0.34 0.02 -0.07 0.21 0.28 -0.2 -0.13 -0.06 -0.15 0.12 0.48 0.31 -0.03 -0.01 0.45 0.04 -0.07 -0.28 -0.24 0.53 -0.11 -0.11 -0.13 -0.06 -0.09 0.12 0.17 0.49
-0.39 -0.88 -0.97 -1.04 -0.25 0.31 0.51 0.19 -0.39 -0.44 -0.34 -0.3 0.55 0.67 0.69 -0.03 -0.02 0.02 0.06 0.0 0.12 0.2 -0.63 -0.24 -0.09 0.01 0.02 0.25 0.3 -0.09 0.27
-0.78 -0.72 -1.15 -0.88 0.01 0.17 -0.04 0.23 -0.34 -0.33 -0.17 -0.25 0.31 0.56 0.3 0.12 0.15 0.53 -0.06 -0.11 -0.01 -0.06 0.61 0.01 -0.02 -0.04 0.11 -0.09 0.06 0.02 0.3
-0.54 -0.37 -1.02 -0.96 0.1 0.16 0.35 0.83 -0.5 -0.5 -0.34 -0.46 -0.08 0.53 0.66 0.07 0.02 -0.03 0.51 -0.0 -0.14 -0.23 0.79 0.01 -0.18 -0.16 -0.11 -0.27 0.08 -0.09 -0.12
-0.85 -1.49 -1.07 -1.18 -0.16 0.05 -0.69 -0.12 -0.11 0.0 0.4 -0.14 0.08 1.12 0.81 0.07 0.1 0.39 0.29 -0.63 0.03 -0.24 0.03 -0.32 -0.06 -0.08 0.19 -0.27 0.26 0.33 0.32
-1.24 -1.48 -1.18 -1.16 -0.3 0.1 -0.16 -0.05 -0.35 -0.46 -0.47 -0.06 0.37 1.15 0.9 0.25 0.29 0.09 -0.02 -0.14 -0.07 -0.25 0.22 0.21 0.06 0.28 -0.1 -0.12 0.13 -0.03 0.42
-0.97 -1.2 -0.94 -0.82 0.03 0.23 0.18 0.12 -0.35 -0.1 -0.11 -0.07 0.53 0.34 -0.01 -0.26 -0.08 0.4 -0.23 0.09 -0.14 0.01 0.2 0.13 0.14 0.14 -0.29 -0.2 0.06 0.26 0.97
-1.67 -0.88 -1.06 -0.93 -0.21 0.04 0.07 0.42 -0.35 -0.33 -0.33 -0.32 -0.18 0.6 0.44 0.01 0.07 1.08 0.19 -0.16 -0.15 -0.28 0.93 -0.45 -0.07 -0.3 -0.09 -0.39 0.12 -0.03 0.87
-0.56 -0.43 -0.62 -0.46 -0.03 0.19 -0.48 -0.21 -0.36 -0.43 -0.34 -0.05 0.4 0.71 0.57 0.11 0.02 0.03 0.17 -0.15 0.1 -0.06 0.26 0.15 0.13 0.07 -0.21 -0.02 0.17 0.02 0.22
-1.75 -2.81 -3.39 -2.21 -0.56 0.04 -0.11 0.05 -0.41 -0.56 0.0 -0.78 0.52 1.38 1.03 0.55 0.08 1.19 0.18 -0.14 -0.42 -0.2 -0.16 -0.06 -0.23 -0.33 0.08 -0.42 0.0 0.1 0.71
-2.83 -2.44 -2.09 -1.36 -0.65 0.19 0.28 0.55 -0.23 -0.43 -0.44 -1.16 -0.55 0.75 0.81 -0.03 -0.31 1.11 0.26 -0.19 -0.02 -0.17 1.23 0.01 0.11 -0.15 0.21 -0.28 0.49 0.19 -0.09
-0.43 -1.18 -2.08 -2.26 -0.74 -0.68 0.42 0.83 -0.19 -0.44 -0.33 -0.3 0.29 0.93 0.71 -0.2 -0.12 0.72 0.58 0.31 -0.06 -0.29 0.61 -0.02 -0.2 -0.22 -0.48 -0.37 0.17 0.16 0.16
-1.19 -1.16 -1.34 -1.27 -0.31 -0.29 -0.3 -0.31 -0.15 -0.03 0.04 -0.14 0.02 1.07 0.9 -0.01 -0.01 0.5 0.12 0.0 0.12 0.03 0.25 0.01 -0.08 -0.02 0.2 -0.56 0.21 0.31 0.39
-0.48 -0.32 -0.94 -0.9 0.1 0.11 -0.06 -0.07 -0.19 -0.33 0.1 -0.1 0.22 0.85 0.37 0.16 0.13 0.24 0.08 -0.19 -0.02 0.05 0.07 -0.13 -0.11 -0.15 -0.1 -0.18 0.02 0.19 0.4
-1.14 -1.16 -1.75 -1.34 0.17 -0.09 0.3 0.7 -0.26 -0.23 -0.21 -0.15 0.49 0.29 0.58 0.06 0.31 0.73 0.22 -0.04 -0.35 -0.4 0.52 -0.08 -0.23 -0.3 -0.4 -0.3 0.02 0.02 0.72
-2.02 -1.58 -1.08 -0.73 -0.37 -0.78 0.21 0.72 -2.65 -1.7 -2.15 -2.0 -0.87 1.86 2.02 -0.41 -0.05 1.8 0.79 -0.71 -1.31 -1.22 1.78 -1.78 -1.59 -1.24 -1.23 -1.48 -0.38 -1.2 0.23
0.03 -0.22 0.0 -0.3 0.09 0.6 -0.01 0.0 -0.43 -0.17 -0.52 -0.44 -0.01 1.23 1.33 0.28 0.1 -0.3 0.17 -0.38 -0.44 -0.8 0.16 -0.45 -0.42 -0.58 -0.64 -0.48 -0.14 -0.17 0.12
-1.51 -0.92 -1.53 -1.52 -0.2 0.21 -0.13 -0.31 -0.49 -0.7 -0.03 -0.44 0.15 1.33 1.32 -0.01 -0.26 1.11 0.18 -0.09 -0.48 -0.51 -0.11 0.01 -0.1 -0.35 -0.39 -0.62 0.14 0.25 0.73
-0.92 -1.04 -1.5 -1.63 -0.56 -0.08 0.29 0.54 -0.18 -0.16 -0.01 -0.17 0.46 0.53 0.38 0.11 0.16 0.34 0.12 0.18 -0.06 0.02 -0.19 0.11 0.16 -0.0 0.2 -0.09 0.02 0.2 0.34
-0.73 -0.75 -0.93 -0.95 0.03 0.14 0.12 0.27 -0.38 -0.31 -0.24 -0.28 0.34 0.36 0.41 -0.0 0.13 0.34 0.15 0.09 -0.14 -0.11 0.61 -0.03 0.06 -0.11 -0.18 -0.07 0.17 0.09 0.45
-1.89 -2.3 -2.22 -1.93 0.04 0.07 0.67 0.93 -0.4 -0.31 -0.33 -0.37 -0.4 0.6 0.66 0.15 -0.09 1.22 0.4 -0.1 -0.58 -0.92 1.07 -0.29 -0.3 -0.41 -0.16 -0.91 0.12 0.44 0.39
-1.9 -1.79 -2.12 -1.24 -0.08 0.26 -0.31 -0.14 -0.59 -0.46 -0.36 -0.58 -0.35 1.26 0.98 0.42 0.21 0.83 0.31 -0.09 -0.36 -0.14 0.28 -0.3 -0.11 0.06 -0.05 -0.91 0.4 0.45 0.68
-1.64 -1.02 -1.48 -1.58 -0.85 -0.28 0.86 0.95 -1.54 -1.37 -1.43 -1.4 0.18 1.11 1.68 0.81 0.96 0.34 1.03 0.01 -0.28 -0.21 -0.19 -0.43 -0.29 -0.25 -0.17 -0.03 -0.88 -1.35 -0.71
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-0.51 -0.54 -0.7 -0.5 -0.09 -0.13 0.18 0.49 -0.2 -0.25 -0.1 -0.24 -0.03 0.37 0.16 0.0 0.0 0.67 0.04 0.03 -0.1 0.12 0.27 -0.2 -0.19 -0.08 0.04 -0.14 0.19 0.15 0.35
-0.64 -0.48 -1.03 -1.0 0.06 0.21 0.54 0.56 -0.45 -0.51 -0.37 -0.42 -0.19 0.44 0.49 0.08 0.12 0.6 0.2 -0.04 -0.11 -0.06 0.64 -0.16 -0.21 -0.06 -0.05 -0.17 0.1 0.01 0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.