Heatmap: Cluster_16 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.09 0.12 0.1 0.11 0.2 0.32 0.76 0.88 0.09 0.09 0.15 0.1 0.36 0.65 1.0 0.43 0.47 0.95 0.76 0.3 0.25 0.31 0.41 0.31 0.3 0.3 0.34 0.31 0.34 0.2 0.37
0.02 0.08 0.07 0.01 0.06 0.05 0.38 0.39 0.03 0.02 0.02 0.02 0.11 0.19 0.56 0.17 0.24 1.0 0.4 0.13 0.09 0.1 0.05 0.13 0.09 0.09 0.12 0.08 0.15 0.08 0.18
0.48 0.39 0.42 0.41 0.6 0.71 0.66 0.74 0.63 0.67 0.62 0.59 0.83 0.84 0.86 0.64 0.67 0.77 0.74 0.68 0.59 0.63 0.77 0.68 0.67 0.7 0.64 0.61 0.69 0.73 1.0
0.48 0.52 0.41 0.4 0.48 0.59 0.8 0.88 0.53 0.59 0.55 0.62 0.78 0.77 0.74 0.66 0.71 1.0 0.59 0.6 0.66 0.67 0.83 0.6 0.65 0.71 0.63 0.59 0.73 0.75 0.91
0.07 0.08 0.04 0.02 0.12 0.11 0.59 0.81 0.08 0.07 0.08 0.08 0.53 0.91 1.0 0.35 0.43 0.58 0.5 0.29 0.2 0.18 0.25 0.25 0.21 0.19 0.18 0.21 0.11 0.11 0.13
0.45 0.5 0.41 0.33 0.63 0.75 0.64 0.68 0.53 0.54 0.59 0.54 0.71 0.77 0.71 0.76 0.66 0.85 0.63 0.57 0.6 0.63 1.0 0.53 0.62 0.65 0.65 0.6 0.72 0.65 0.68
0.27 0.06 0.02 0.06 0.28 0.22 0.39 0.71 0.22 0.21 0.22 0.31 0.57 0.88 1.0 0.42 0.43 0.12 0.38 0.36 0.29 0.28 0.25 0.41 0.25 0.29 0.3 0.39 0.25 0.27 0.22
0.45 0.4 0.36 0.38 0.51 0.68 0.79 0.89 0.52 0.54 0.62 0.6 1.0 0.92 0.86 0.73 0.72 0.74 0.7 0.7 0.59 0.67 0.68 0.7 0.76 0.72 0.68 0.65 0.67 0.71 0.96
0.14 0.25 0.24 0.28 0.32 0.36 0.82 1.0 0.37 0.37 0.38 0.41 0.73 0.69 0.94 0.53 0.53 0.71 0.63 0.51 0.39 0.38 0.33 0.42 0.44 0.41 0.42 0.35 0.53 0.47 0.89
0.25 0.17 0.14 0.09 0.28 0.41 0.63 0.73 0.45 0.41 0.37 0.43 0.57 0.84 1.0 0.43 0.6 0.9 0.48 0.47 0.49 0.47 0.8 0.62 0.58 0.48 0.42 0.51 0.43 0.54 0.83
0.14 0.23 0.08 0.04 0.65 0.65 0.43 0.43 0.16 0.13 0.18 0.15 0.62 0.75 1.0 0.55 0.48 0.94 0.66 0.33 0.28 0.3 0.83 0.29 0.3 0.34 0.33 0.33 0.33 0.28 0.28
0.22 0.13 0.13 0.14 0.13 0.22 0.55 0.75 0.33 0.31 0.28 0.33 0.55 1.0 0.58 0.31 0.34 0.3 0.42 0.42 0.33 0.36 0.18 0.39 0.37 0.36 0.35 0.35 0.28 0.33 0.42
0.18 0.18 0.13 0.1 0.17 0.2 0.19 0.22 0.19 0.15 0.12 0.14 0.19 0.73 1.0 0.32 0.24 0.41 0.16 0.08 0.14 0.12 0.28 0.14 0.11 0.11 0.08 0.1 0.21 0.22 0.14
0.35 0.37 0.31 0.25 0.41 0.51 0.81 1.0 0.45 0.47 0.46 0.48 0.75 0.83 0.89 0.62 0.68 0.51 0.76 0.61 0.52 0.58 0.96 0.58 0.58 0.57 0.55 0.51 0.7 0.68 0.8
0.25 0.29 0.3 0.27 0.66 0.61 0.86 0.89 0.59 0.59 0.57 0.56 0.58 0.73 1.0 0.56 0.58 0.7 0.69 0.63 0.54 0.64 0.61 0.54 0.53 0.53 0.49 0.54 0.67 0.72 0.74
0.28 0.09 0.12 0.05 0.54 0.52 0.89 0.85 0.37 0.38 0.49 0.54 0.95 0.81 0.98 0.57 0.56 0.7 0.71 0.51 0.43 0.38 0.54 0.73 0.71 0.41 0.55 0.47 0.59 0.76 1.0
0.08 0.1 0.07 0.09 0.43 0.79 0.78 0.74 0.35 0.3 0.46 0.37 0.69 0.95 0.85 0.6 0.45 0.97 0.46 0.46 0.38 0.41 0.96 0.31 0.45 0.43 0.5 0.26 0.56 0.71 1.0
0.33 0.34 0.28 0.22 0.38 0.43 0.74 1.0 0.36 0.38 0.35 0.38 0.72 0.77 0.92 0.6 0.69 0.66 0.77 0.5 0.46 0.48 0.86 0.54 0.52 0.46 0.45 0.48 0.63 0.55 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.17 0.14 0.05 0.07 0.08 0.07 0.07 0.38 0.64 0.17 0.24 1.0 0.21 0.14 0.19 0.07 0.03 0.25 0.14 0.09 0.16 0.03 0.15 0.17 0.16
0.46 0.41 0.43 0.45 0.35 0.4 0.64 1.0 0.45 0.38 0.45 0.49 0.76 0.84 0.74 0.56 0.56 0.43 0.56 0.49 0.48 0.5 0.69 0.55 0.49 0.49 0.5 0.43 0.54 0.65 0.74
0.1 0.1 0.12 0.14 0.38 0.44 0.49 0.55 0.39 0.38 0.41 0.45 0.59 1.0 0.89 0.54 0.55 0.75 0.58 0.53 0.44 0.38 0.58 0.55 0.57 0.48 0.51 0.38 0.51 0.56 0.74
0.16 0.31 0.12 0.12 0.37 0.41 0.74 0.89 0.42 0.47 0.46 0.54 0.75 0.83 0.76 0.52 0.66 0.87 0.66 0.6 0.51 0.49 0.76 0.64 0.55 0.52 0.49 0.49 0.68 0.73 1.0
0.2 0.19 0.14 0.15 0.21 0.31 0.74 0.72 0.28 0.31 0.33 0.36 1.0 0.88 0.79 0.44 0.51 0.42 0.57 0.49 0.42 0.42 0.33 0.53 0.5 0.46 0.44 0.53 0.34 0.36 0.43
0.11 0.13 0.08 0.1 0.25 0.32 0.54 0.69 0.16 0.17 0.17 0.16 0.41 0.86 1.0 0.42 0.45 0.61 0.65 0.32 0.27 0.3 0.79 0.32 0.3 0.3 0.31 0.28 0.35 0.28 0.26
0.3 0.42 0.32 0.32 0.52 0.52 0.62 1.0 0.41 0.43 0.48 0.52 0.71 0.65 0.67 0.59 0.62 0.82 0.74 0.54 0.47 0.46 0.86 0.53 0.5 0.48 0.49 0.39 0.6 0.65 0.88
0.47 0.38 0.35 0.38 0.41 0.44 0.85 1.0 0.47 0.49 0.52 0.59 0.9 0.6 0.8 0.69 0.82 0.52 0.73 0.62 0.57 0.56 0.9 0.62 0.64 0.59 0.54 0.64 0.59 0.62 0.74
0.21 0.19 0.15 0.18 0.33 0.47 0.76 0.87 0.34 0.36 0.39 0.36 0.62 0.73 1.0 0.64 0.71 0.58 0.89 0.5 0.41 0.49 0.61 0.51 0.49 0.42 0.47 0.45 0.58 0.59 0.79
0.31 0.34 0.29 0.23 0.28 0.37 0.9 0.92 0.34 0.34 0.31 0.34 0.68 0.56 0.94 0.81 1.0 0.57 0.68 0.51 0.42 0.38 0.73 0.48 0.43 0.44 0.46 0.47 0.42 0.46 0.4
0.21 0.21 0.19 0.17 0.43 0.56 0.58 0.62 0.35 0.4 0.39 0.4 0.43 0.96 0.87 0.58 0.56 1.0 0.76 0.58 0.51 0.56 0.76 0.47 0.47 0.43 0.46 0.5 0.5 0.47 0.48
0.42 0.33 0.33 0.42 0.68 0.87 0.7 0.73 0.56 0.6 0.63 0.58 0.52 0.73 0.7 0.68 0.61 1.0 0.61 0.56 0.57 0.53 0.92 0.6 0.61 0.6 0.66 0.6 0.62 0.66 0.73
0.17 0.18 0.13 0.14 0.27 0.32 0.46 0.67 0.19 0.22 0.23 0.26 0.36 0.77 0.85 0.42 0.48 0.7 1.0 0.35 0.3 0.33 0.49 0.37 0.34 0.3 0.32 0.29 0.37 0.33 0.35
0.06 0.16 0.05 0.09 0.26 0.51 0.66 0.78 0.26 0.25 0.29 0.34 0.92 1.0 0.78 0.63 0.64 0.25 0.47 0.42 0.53 0.55 0.34 0.42 0.4 0.41 0.5 0.4 0.28 0.25 0.69
0.4 0.33 0.37 0.26 0.58 0.72 0.64 0.71 0.45 0.48 0.51 0.55 0.73 0.8 0.72 0.6 0.61 1.0 0.58 0.57 0.62 0.58 0.99 0.54 0.64 0.6 0.65 0.68 0.65 0.62 0.77
0.06 0.04 0.05 0.06 0.11 0.14 0.57 1.0 0.26 0.29 0.24 0.38 0.44 0.73 0.95 0.39 0.45 0.25 0.49 0.46 0.25 0.2 0.08 0.29 0.28 0.22 0.28 0.3 0.21 0.29 0.4
0.21 0.26 0.19 0.21 0.41 0.48 0.5 0.49 0.36 0.35 0.36 0.31 0.5 0.82 0.97 0.53 0.55 0.74 0.83 0.53 0.41 0.42 1.0 0.37 0.4 0.4 0.45 0.42 0.45 0.45 0.72
0.24 0.27 0.26 0.16 0.16 0.17 0.57 0.62 0.15 0.15 0.12 0.11 0.33 0.65 1.0 0.47 0.51 0.32 0.62 0.32 0.23 0.22 0.12 0.23 0.21 0.23 0.21 0.21 0.22 0.15 0.14
0.27 0.31 0.22 0.16 0.35 0.33 0.44 0.58 0.21 0.21 0.21 0.2 0.32 0.74 1.0 0.48 0.44 0.59 0.58 0.31 0.28 0.26 0.54 0.26 0.26 0.28 0.3 0.27 0.31 0.24 0.24
0.42 0.48 0.38 0.39 0.59 0.53 0.5 0.57 0.56 0.53 0.6 0.52 0.57 1.0 0.94 0.67 0.59 0.76 0.73 0.6 0.54 0.53 0.56 0.53 0.53 0.59 0.6 0.43 0.64 0.64 0.75
0.38 0.36 0.21 0.15 0.32 0.48 0.83 1.0 0.37 0.33 0.36 0.33 0.41 0.66 0.81 0.5 0.52 0.58 0.71 0.5 0.44 0.49 0.46 0.5 0.46 0.44 0.47 0.41 0.48 0.45 0.51
0.26 0.39 0.31 0.34 0.63 0.68 0.69 0.76 0.48 0.49 0.46 0.43 0.74 1.0 0.99 0.7 0.69 0.97 0.68 0.67 0.58 0.58 0.99 0.54 0.59 0.57 0.69 0.58 0.64 0.71 0.91
0.35 0.45 0.43 0.55 0.7 0.66 0.8 0.84 0.6 0.63 0.66 0.63 0.75 0.96 0.86 0.68 0.69 0.94 0.71 0.66 0.57 0.59 1.0 0.64 0.64 0.63 0.67 0.65 0.75 0.78 0.97
0.47 0.34 0.32 0.3 0.52 0.76 0.88 0.7 0.47 0.46 0.49 0.5 0.91 0.99 1.0 0.6 0.61 0.62 0.64 0.62 0.67 0.71 0.4 0.53 0.58 0.62 0.63 0.74 0.76 0.58 0.74
0.38 0.4 0.3 0.36 0.66 0.74 0.64 0.77 0.52 0.52 0.59 0.55 0.82 0.97 0.81 0.72 0.73 0.95 0.63 0.61 0.65 0.63 1.0 0.66 0.65 0.64 0.71 0.62 0.69 0.67 0.81
0.39 0.43 0.28 0.29 0.6 0.63 0.72 1.0 0.4 0.4 0.44 0.41 0.53 0.81 0.89 0.59 0.57 0.55 0.8 0.56 0.51 0.48 0.97 0.57 0.5 0.5 0.52 0.47 0.59 0.53 0.52
0.25 0.16 0.22 0.2 0.41 0.47 0.28 0.42 0.42 0.46 0.6 0.42 0.48 1.0 0.81 0.48 0.49 0.6 0.56 0.3 0.47 0.39 0.47 0.37 0.44 0.43 0.52 0.38 0.55 0.58 0.57
0.19 0.16 0.2 0.2 0.37 0.48 0.4 0.44 0.35 0.33 0.33 0.43 0.58 1.0 0.84 0.54 0.55 0.48 0.45 0.41 0.43 0.38 0.53 0.52 0.47 0.55 0.42 0.42 0.5 0.44 0.6
0.26 0.22 0.27 0.29 0.52 0.6 0.58 0.55 0.4 0.48 0.47 0.49 0.74 0.65 0.51 0.43 0.48 0.68 0.44 0.55 0.47 0.52 0.59 0.56 0.56 0.56 0.42 0.45 0.53 0.61 1.0
0.15 0.26 0.23 0.25 0.41 0.49 0.5 0.63 0.37 0.38 0.38 0.38 0.42 0.72 0.64 0.48 0.5 1.0 0.54 0.42 0.43 0.39 0.9 0.35 0.45 0.39 0.44 0.36 0.51 0.46 0.87
0.41 0.46 0.4 0.44 0.6 0.7 0.44 0.53 0.48 0.45 0.48 0.59 0.81 1.0 0.91 0.66 0.62 0.62 0.69 0.55 0.66 0.59 0.73 0.68 0.67 0.64 0.53 0.6 0.69 0.62 0.71
0.11 0.05 0.04 0.08 0.26 0.39 0.36 0.4 0.29 0.26 0.38 0.22 0.55 1.0 0.79 0.56 0.4 0.88 0.43 0.35 0.29 0.33 0.34 0.37 0.33 0.3 0.4 0.29 0.38 0.41 0.63
0.06 0.08 0.1 0.17 0.27 0.49 0.52 0.62 0.36 0.32 0.31 0.19 0.29 0.72 0.75 0.42 0.34 0.92 0.51 0.37 0.42 0.38 1.0 0.43 0.46 0.38 0.49 0.35 0.6 0.49 0.4
0.39 0.23 0.12 0.11 0.31 0.33 0.7 0.93 0.46 0.39 0.42 0.42 0.64 1.0 0.86 0.46 0.48 0.86 0.78 0.65 0.5 0.43 0.8 0.51 0.45 0.45 0.37 0.41 0.59 0.59 0.59
0.21 0.21 0.19 0.2 0.38 0.39 0.39 0.38 0.43 0.47 0.49 0.43 0.48 1.0 0.88 0.47 0.47 0.67 0.52 0.48 0.52 0.48 0.57 0.48 0.45 0.47 0.55 0.32 0.55 0.59 0.62
0.4 0.44 0.29 0.3 0.59 0.6 0.53 0.53 0.49 0.44 0.6 0.52 0.65 1.0 0.72 0.62 0.61 0.65 0.59 0.49 0.55 0.57 0.58 0.51 0.51 0.5 0.52 0.49 0.56 0.63 0.73
0.27 0.27 0.18 0.24 0.68 0.56 0.74 0.98 0.5 0.51 0.52 0.54 0.85 0.74 0.9 0.63 0.75 1.0 0.7 0.58 0.47 0.46 0.87 0.57 0.52 0.49 0.46 0.49 0.61 0.61 0.99
0.06 0.08 0.12 0.15 0.19 0.14 0.29 0.4 0.04 0.08 0.06 0.06 0.13 0.89 1.0 0.18 0.24 0.86 0.43 0.15 0.1 0.11 0.84 0.07 0.08 0.1 0.11 0.09 0.19 0.11 0.29
0.41 0.34 0.4 0.32 0.43 0.6 0.4 0.4 0.3 0.35 0.28 0.29 0.4 0.94 1.0 0.49 0.43 0.32 0.45 0.31 0.29 0.23 0.45 0.29 0.3 0.27 0.26 0.29 0.36 0.35 0.43
0.14 0.21 0.14 0.14 0.35 0.46 0.36 0.32 0.28 0.24 0.39 0.29 0.44 1.0 0.99 0.39 0.33 0.86 0.45 0.37 0.29 0.28 0.37 0.4 0.37 0.31 0.3 0.26 0.44 0.47 0.66
0.36 0.33 0.24 0.22 0.46 0.65 0.84 1.0 0.6 0.61 0.68 0.61 0.94 0.99 0.89 0.74 0.76 0.87 0.75 0.78 0.66 0.7 0.6 0.74 0.77 0.68 0.79 0.64 0.7 0.79 0.87
0.4 0.39 0.35 0.34 0.67 0.72 0.71 0.79 0.5 0.53 0.56 0.54 0.83 0.84 0.87 0.66 0.72 0.83 0.73 0.7 0.59 0.61 1.0 0.64 0.69 0.61 0.58 0.62 0.74 0.7 0.9
0.12 0.09 0.09 0.11 0.44 0.45 0.68 0.82 0.32 0.35 0.34 0.33 0.33 0.65 0.68 0.48 0.41 1.0 0.57 0.4 0.29 0.23 0.9 0.35 0.35 0.32 0.39 0.23 0.47 0.58 0.56
0.11 0.12 0.1 0.18 0.4 0.5 0.34 0.38 0.28 0.3 0.33 0.28 0.33 1.0 0.82 0.56 0.48 0.74 0.52 0.39 0.32 0.38 0.51 0.34 0.39 0.44 0.4 0.22 0.55 0.57 0.67
0.1 0.15 0.11 0.1 0.17 0.26 0.57 0.6 0.11 0.12 0.12 0.12 0.35 0.67 1.0 0.55 0.61 0.39 0.63 0.31 0.26 0.27 0.27 0.23 0.25 0.26 0.28 0.31 0.17 0.12 0.19
0.36 0.36 0.3 0.37 0.6 0.73 0.68 0.73 0.54 0.58 0.61 0.55 0.88 0.74 0.75 0.64 0.67 0.8 0.68 0.65 0.59 0.65 0.78 0.72 0.63 0.64 0.62 0.61 0.64 0.68 1.0
0.52 0.54 0.45 0.44 0.62 0.82 0.9 0.92 0.5 0.51 0.59 0.51 0.83 1.0 0.96 0.76 0.78 0.68 0.84 0.66 0.64 0.64 0.76 0.61 0.65 0.6 0.66 0.65 0.73 0.76 0.71
0.44 0.43 0.39 0.45 0.59 0.58 0.71 0.89 0.55 0.53 0.59 0.53 0.62 0.82 0.71 0.63 0.63 1.0 0.65 0.64 0.59 0.68 0.76 0.55 0.55 0.6 0.65 0.57 0.72 0.7 0.8
0.41 0.46 0.31 0.32 0.67 0.74 0.93 0.95 0.47 0.45 0.5 0.48 0.56 0.87 0.9 0.68 0.7 0.97 0.74 0.62 0.6 0.61 1.0 0.57 0.55 0.62 0.62 0.57 0.69 0.65 0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)