Heatmap: Cluster_224 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_5800.1 (UMAMIT29)	-0.91	-0.83	-1.03	-0.67	0.37	0.43	-0.32	-0.62	-0.06	-0.01	0.08	0.08	-0.18	0.86	0.88	0.27	-0.04	-0.12	0.16	-0.05	-0.17	-0.02	-0.11	-0.21	-0.29	0.07	0.13	-0.28	0.11	0.12	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_127960.1 (BGLU42)	-0.38	-0.5	-0.76	-0.9	0.63	0.61	-0.24	-0.49	-0.27	-0.13	-0.18	-0.26	0.37	0.56	0.48	0.06	-0.27	-0.06	0.13	-0.19	-0.11	0.19	-0.19	-0.05	0.07	0.05	0.01	0.15	-0.02	0.08	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_16941.1 (UFE1)	-1.43	-1.02	-0.79	-0.49	0.25	-0.02	-0.37	-1.0	0.53	0.51	0.19	-0.06	0.14	0.87	0.88	0.31	0.48	-1.94	0.15	0.11	-0.11	0.12	-3.71	-0.05	-0.13	-0.57	-0.08	-0.2	0.16	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_30941.1	-1.62	-1.33	-1.45	-1.01	0.28	0.21	-0.46	-1.14	0.12	0.02	0.04	-0.12	-0.5	0.55	0.93	0.45	0.34	-0.67	0.38	0.08	0.09	-0.02	0.08	-0.21	0.08	0.12	0.14	-0.18	0.46	0.46	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_39941.1 (CIPK17)	-2.22	-1.75	-2.09	-0.65	0.49	0.43	-0.52	-1.41	0.09	0.24	0.42	0.47	-0.11	0.75	1.07	0.16	0.04	-0.52	0.07	0.16	0.17	0.27	-0.33	-0.19	-0.15	-0.07	-0.1	-0.35	0.07	0.24	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_61681.1 (GALT29A)	-0.64	-0.81	-0.05	0.08	0.39	0.49	-0.56	-0.36	-0.38	-0.11	-0.06	-0.01	-0.22	0.61	0.58	0.29	0.27	-0.53	0.32	-0.14	-0.09	0.17	-0.51	-0.02	-0.28	0.05	-0.06	-0.19	0.11	-0.05	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_100301.1	-1.26	-1.15	-1.39	-1.11	0.64	0.4	0.1	-0.23	-0.12	-0.12	-0.02	0.08	0.07	0.91	0.86	0.39	0.4	-0.17	0.06	0.18	-0.27	-0.06	-1.58	-0.22	-0.13	-0.01	-0.06	-0.21	0.14	0.13	0.36
Lsat_1_v5_gn_2_136220.1	-2.08	-1.59	-1.61	-1.49	0.46	0.77	-0.17	-0.09	-0.52	-0.38	-0.38	-0.4	-0.13	0.95	1.36	0.45	0.05	-0.39	0.31	0.03	-0.26	-0.1	-0.33	-0.17	-0.06	0.06	0.22	-0.35	0.28	0.22	0.27
Lsat_1_v5_gn_2_49201.1 (ARA)	-1.04	-1.24	-0.98	-0.59	0.81	0.66	-0.85	-1.43	-0.29	-0.21	-0.12	-0.19	-0.46	0.84	0.84	0.34	0.15	-0.27	0.03	0.07	0.2	0.28	-1.74	0.08	0.1	0.29	0.36	0.21	0.01	0.06	0.14
Lsat_1_v5_gn_3_109761.1 (CORD2)	-0.68	-0.74	-0.31	-0.1	0.8	0.82	-0.23	-0.82	0.12	-0.01	-0.06	-0.31	-0.29	0.58	0.45	-0.04	0.08	-0.22	0.22	0.04	0.0	0.08	-0.75	-0.32	-0.04	0.02	0.2	0.01	-0.16	-0.26	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_68961.1 (PIRL4)	-1.02	-1.75	-0.41	-0.33	0.45	0.51	-0.14	-0.59	0.14	-0.0	0.38	0.12	-0.96	0.82	0.77	0.08	-0.1	0.22	0.31	-0.23	-0.13	-0.7	-1.53	-0.38	-0.36	-0.58	-0.27	-0.01	0.53	0.61	0.74
Lsat_1_v5_gn_3_72520.1 (HK1)	-4.51	-2.07	-5.6	-2.12	0.59	0.58	-0.11	0.52	-0.01	0.53	0.5	-0.98	-2.12	0.93	1.72	0.86	-0.63	-2.69	0.26	0.3	-0.29	-0.86	-1.72	-1.33	-1.68	-0.69	0.2	-2.05	1.29	1.34	-0.15
Lsat_1_v5_gn_3_92740.1 (CYP76C3)	-1.85	-1.13	-1.49	-1.7	0.23	0.7	-0.39	-0.37	0.28	-0.1	0.05	-0.39	-1.19	1.42	0.9	0.42	-0.05	-1.14	0.43	-0.06	-0.33	-0.29	-0.88	-0.17	-0.19	-0.37	-0.15	-0.89	0.97	0.42	0.88
Lsat_1_v5_gn_4_108620.1	0.23	0.37	-0.05	-0.5	1.81	0.96	0.17	-0.22	-0.64	-0.02	-0.39	-0.56	-1.26	0.06	0.72	0.74	0.26	0.34	-1.49	-0.56	-0.41	0.12	-	-1.07	-0.29	0.4	0.15	0.69	-0.62	-2.65	-3.79
Lsat_1_v5_gn_4_124221.1 (scpl40)	-0.25	-0.45	-0.47	-0.44	0.0	0.23	0.12	0.11	-0.14	0.23	0.2	-0.12	-0.6	0.78	0.94	0.4	0.05	-0.81	0.25	-0.07	-0.47	-0.46	-0.89	-0.33	-0.27	-0.03	-0.03	-0.42	0.29	0.47	0.24
Lsat_1_v5_gn_4_138061.1 (DWF2)	-0.8	-0.69	-0.77	-0.4	0.21	0.15	-0.31	-0.65	0.2	0.05	0.17	0.11	-0.02	0.28	0.44	0.27	0.05	-0.66	0.04	-0.05	-0.08	-0.07	-0.04	-0.07	0.04	0.08	0.19	-0.39	0.39	0.47	0.53
Lsat_1_v5_gn_4_166000.1	-0.75	-0.7	-0.64	-0.3	0.17	0.43	-0.31	-0.37	0.03	0.01	0.12	0.08	-0.13	0.7	0.62	0.3	0.07	-0.3	0.27	-0.09	-0.13	-0.07	-0.53	-0.1	-0.09	0.09	0.06	-0.4	0.2	0.21	0.24
Lsat_1_v5_gn_4_182221.1 (CBC1)	-1.43	-0.61	-1.6	-0.72	0.1	0.08	0.11	-0.14	0.06	-0.36	-0.17	-0.27	-0.48	1.14	1.14	0.1	0.01	0.21	0.48	-0.01	-0.25	-0.07	-1.83	-0.23	-0.11	-0.42	-0.27	-0.38	0.4	0.49	0.77
Lsat_1_v5_gn_4_30821.1 (ZIK5)	-0.33	-0.64	-1.09	-1.61	-0.64	-0.73	-0.06	-0.6	0.33	0.29	0.39	0.03	-0.27	0.72	0.49	0.07	0.14	-1.78	0.36	0.24	0.14	0.17	-0.33	0.03	0.13	0.09	0.09	-0.18	0.44	0.68	0.27
Lsat_1_v5_gn_4_31621.1 (RbcX2)	-0.68	-1.08	-1.36	-1.16	0.79	-0.27	-0.39	-0.29	0.56	0.62	0.38	0.51	-0.95	1.34	1.76	0.36	0.06	-5.07	-2.7	-0.38	0.09	-0.07	-4.99	0.12	-0.24	-0.62	-0.07	-0.39	-0.12	0.14	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_37741.1 (RKFL1)	-1.55	-1.0	-1.18	-0.76	0.73	0.05	-0.26	-0.06	0.05	0.21	0.15	-0.4	-1.35	1.25	1.64	0.64	0.23	-0.59	-0.02	-0.01	-0.34	-0.22	-2.96	-1.06	-0.67	0.05	-0.14	-1.44	0.64	0.72	-0.13
Lsat_1_v5_gn_4_76660.1	-1.13	-1.24	-1.05	-0.43	0.75	0.69	-0.57	-1.18	-0.03	0.04	0.21	-0.16	-0.25	1.09	1.25	0.47	0.22	-1.0	0.26	0.0	-0.05	0.03	-2.73	-0.29	-0.16	0.06	0.02	-0.01	-0.31	-0.16	0.29
Lsat_1_v5_gn_5_101481.1	-0.89	-0.9	-1.26	-0.52	0.52	0.23	-0.43	-1.03	0.06	0.21	0.29	0.02	-0.46	0.85	0.51	0.02	-0.21	-0.81	-0.21	0.0	-0.0	0.09	-1.1	0.02	0.1	0.38	0.35	-0.16	0.42	0.53	0.47
Lsat_1_v5_gn_5_13060.1	-0.33	-0.5	-0.73	-0.51	0.57	0.59	-0.35	-0.46	-0.29	-0.34	-0.15	-0.16	0.35	0.41	0.21	0.32	0.01	0.06	-0.13	-0.23	-0.15	0.09	0.23	-0.23	-0.21	0.02	-0.05	0.17	0.18	0.14	0.33
Lsat_1_v5_gn_5_145781.1	-0.31	-0.92	-1.56	-0.93	-1.08	-0.81	-0.46	-0.24	-0.08	0.33	0.52	0.21	0.1	0.58	0.41	-0.17	0.22	-1.32	0.1	0.08	0.14	0.2	-1.26	0.42	0.39	0.01	0.12	0.25	0.32	0.58	0.65
Lsat_1_v5_gn_5_154260.1	-0.83	-0.19	-0.48	-0.26	-0.21	-0.6	-0.21	-0.18	-0.05	0.26	0.31	-0.28	-0.54	0.57	0.96	0.31	0.25	-0.92	0.2	-0.17	-0.57	-0.31	-0.2	-0.44	-0.38	0.36	-0.19	-0.5	0.69	0.87	0.31
Lsat_1_v5_gn_5_1821.1 (NUDT2)	-1.18	-1.47	-1.84	-2.0	0.73	0.72	-0.33	-0.29	-0.27	-0.31	-0.08	-0.42	-0.14	0.96	1.27	0.54	0.01	-0.58	0.35	-0.23	0.13	0.17	-1.64	-0.39	-0.03	0.26	0.29	-0.1	0.35	0.11	-0.16
Lsat_1_v5_gn_5_49640.1 (B120)	-0.63	0.31	-0.39	-1.1	0.54	0.6	0.23	-0.04	-0.28	-0.1	-0.1	-0.31	-0.94	1.46	1.53	0.84	0.41	-3.52	-0.03	-0.36	-0.34	-0.21	-2.42	-0.83	-0.53	-0.46	-0.19	-0.42	0.3	0.23	-1.89
Lsat_1_v5_gn_5_60621.1 (SIG1)	-0.87	-0.6	-0.37	-0.55	-0.16	-0.55	-0.22	0.1	0.08	0.32	0.36	-0.31	-0.76	0.84	1.02	0.3	0.29	-0.78	0.61	-0.22	-0.59	-0.22	-0.45	-0.59	-0.27	0.28	-0.39	-0.69	0.53	0.79	0.11
Lsat_1_v5_gn_6_103041.1	-0.99	-0.67	-0.36	-0.48	0.28	0.07	-0.2	-0.03	0.32	-0.06	0.34	0.25	-0.31	1.02	0.99	0.52	0.4	-1.03	0.12	0.03	0.01	0.27	-2.05	-0.21	-0.13	-0.19	-0.18	-0.11	-0.25	-0.1	-0.42
Lsat_1_v5_gn_6_34200.1 (ABCG27)	0.13	0.34	-0.39	-0.6	0.57	0.79	0.15	-0.13	0.43	0.34	0.33	0.05	-0.52	0.94	1.02	0.55	0.1	-2.49	0.28	-0.11	-0.14	-0.27	-3.56	-0.47	-0.55	-0.43	-0.42	0.15	-0.81	-0.77	-0.73
Lsat_1_v5_gn_6_46140.1 (MTP4)	-1.93	-1.11	-1.56	-1.11	0.58	0.65	-0.16	-0.23	0.1	0.2	0.13	0.08	-0.71	1.03	1.13	0.18	0.12	-0.81	0.48	0.32	-0.1	0.07	-0.72	-0.57	-0.4	0.09	0.25	-0.4	-0.07	-0.21	0.21
Lsat_1_v5_gn_6_4741.1 (PGF9)	-2.35	-1.66	-1.24	-0.96	0.32	-0.09	-0.43	-0.95	0.11	-0.12	0.33	-0.05	-0.75	1.24	1.39	0.22	-0.03	-1.28	0.35	-0.07	-0.18	-0.35	-4.85	-0.58	-0.21	0.05	0.15	-1.09	0.8	1.07	0.86
Lsat_1_v5_gn_6_57060.1	-	-2.91	-3.53	-4.46	-0.42	-2.86	-4.85	-	-2.85	-1.85	-4.82	-2.32	-3.83	3.22	3.12	-1.09	-4.84	-2.61	-0.17	-2.65	-3.91	-	-3.26	-3.27	-	-1.4	-1.32	-5.08	2.4	1.45	-1.74
Lsat_1_v5_gn_6_69600.1 (PDR11)	-0.74	-0.87	-0.89	-0.39	0.24	0.02	-0.26	-0.64	0.26	0.31	0.28	0.24	-0.08	0.74	0.9	0.3	0.37	-0.34	0.04	0.16	-0.04	-0.06	-2.03	-0.13	-0.02	-0.21	0.01	0.11	0.2	0.05	-0.15
Lsat_1_v5_gn_7_111841.1	0.24	0.06	0.02	0.07	0.93	0.16	0.05	-0.32	-0.02	-0.05	0.02	-0.06	-0.43	0.55	0.81	0.25	0.13	-0.8	0.08	-0.05	-0.1	-0.19	-1.69	-0.55	-0.39	-0.03	0.16	0.02	-0.09	-0.3	-0.63
Lsat_1_v5_gn_7_23140.1 (TBL38)	-0.8	-0.64	-0.45	-0.03	-0.16	-0.19	0.09	-0.29	-0.19	-0.28	-0.22	-0.4	-0.39	0.98	1.11	0.24	0.23	-0.5	0.08	-0.06	-0.15	-0.24	-1.0	-0.31	-0.25	-0.0	0.01	-0.39	0.49	0.61	0.62
Lsat_1_v5_gn_7_45121.1	-0.69	-0.87	-0.47	-0.2	0.44	0.44	-0.4	-0.77	0.23	0.08	0.23	0.04	-0.51	0.74	0.89	0.25	-0.25	-0.28	-0.01	0.04	-0.08	0.01	-1.11	-0.5	-0.12	-0.0	-0.07	0.03	0.45	0.33	0.03
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Lsat_1_v5_gn_7_62320.1	-0.46	-0.67	-0.02	-0.22	0.32	0.08	-0.61	-0.98	-0.1	0.02	0.0	-0.09	-0.43	0.58	0.69	0.49	0.06	-0.48	0.08	-0.12	-0.01	0.12	-0.53	-0.0	-0.05	0.11	0.16	0.08	0.19	0.22	0.21
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.