Heatmap: Cluster_224 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_5800.1 (UMAMIT29)	0.29	0.3	0.26	0.34	0.7	0.73	0.43	0.35	0.52	0.54	0.57	0.57	0.48	0.98	1.0	0.66	0.53	0.5	0.61	0.52	0.48	0.53	0.5	0.47	0.44	0.57	0.59	0.45	0.58	0.59	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_127960.1 (BGLU42)	0.5	0.46	0.38	0.35	1.0	0.99	0.55	0.46	0.54	0.59	0.57	0.54	0.84	0.95	0.9	0.67	0.54	0.62	0.71	0.56	0.6	0.74	0.56	0.62	0.68	0.67	0.65	0.71	0.64	0.68	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_16941.1 (UFE1)	0.2	0.27	0.31	0.39	0.65	0.54	0.42	0.27	0.78	0.77	0.62	0.52	0.6	0.99	1.0	0.67	0.76	0.14	0.6	0.59	0.5	0.59	0.04	0.53	0.5	0.37	0.51	0.47	0.61	0.79	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_30941.1	0.17	0.21	0.19	0.26	0.64	0.61	0.38	0.24	0.57	0.53	0.54	0.48	0.37	0.76	1.0	0.72	0.66	0.33	0.68	0.55	0.56	0.52	0.55	0.45	0.55	0.57	0.57	0.46	0.72	0.72	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_39941.1 (CIPK17)	0.1	0.14	0.11	0.3	0.67	0.64	0.33	0.18	0.51	0.56	0.64	0.66	0.44	0.8	1.0	0.53	0.49	0.33	0.5	0.53	0.54	0.58	0.38	0.42	0.43	0.46	0.45	0.37	0.5	0.56	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_61681.1 (GALT29A)	0.42	0.37	0.63	0.69	0.86	0.92	0.44	0.51	0.5	0.6	0.63	0.65	0.56	1.0	0.98	0.8	0.79	0.45	0.82	0.59	0.61	0.74	0.46	0.65	0.54	0.68	0.63	0.57	0.71	0.63	0.85
Lsat_1_v5_gn_2_100301.1	0.22	0.24	0.2	0.25	0.83	0.7	0.57	0.46	0.49	0.49	0.53	0.56	0.56	1.0	0.96	0.7	0.7	0.47	0.55	0.6	0.44	0.51	0.18	0.46	0.49	0.53	0.51	0.46	0.59	0.58	0.68
Lsat_1_v5_gn_2_136220.1	0.09	0.13	0.13	0.14	0.53	0.66	0.35	0.36	0.27	0.3	0.3	0.29	0.35	0.75	1.0	0.53	0.4	0.3	0.48	0.4	0.33	0.36	0.31	0.34	0.37	0.4	0.45	0.3	0.47	0.45	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_49201.1 (ARA)	0.27	0.24	0.28	0.37	0.98	0.88	0.31	0.21	0.46	0.48	0.52	0.49	0.41	1.0	1.0	0.71	0.62	0.46	0.57	0.59	0.64	0.68	0.17	0.59	0.6	0.68	0.72	0.65	0.56	0.58	0.62
Lsat_1_v5_gn_3_109761.1 (CORD2)	0.35	0.34	0.46	0.53	0.98	1.0	0.48	0.32	0.62	0.56	0.54	0.46	0.46	0.85	0.77	0.55	0.6	0.49	0.66	0.58	0.57	0.6	0.34	0.45	0.55	0.57	0.65	0.57	0.51	0.47	0.67
Lsat_1_v5_gn_3_68961.1 (PIRL4)	0.28	0.17	0.43	0.45	0.78	0.81	0.52	0.38	0.63	0.57	0.74	0.62	0.29	1.0	0.97	0.6	0.53	0.66	0.7	0.48	0.52	0.35	0.2	0.43	0.44	0.38	0.47	0.56	0.82	0.87	0.95
Lsat_1_v5_gn_3_72520.1 (HK1)	0.01	0.07	0.01	0.07	0.46	0.45	0.28	0.44	0.3	0.44	0.43	0.15	0.07	0.58	1.0	0.55	0.2	0.05	0.36	0.37	0.25	0.17	0.09	0.12	0.1	0.19	0.35	0.07	0.74	0.77	0.27
Lsat_1_v5_gn_3_92740.1 (CYP76C3)	0.1	0.17	0.13	0.11	0.44	0.61	0.29	0.29	0.46	0.35	0.39	0.29	0.16	1.0	0.7	0.5	0.36	0.17	0.51	0.36	0.3	0.31	0.2	0.33	0.33	0.29	0.34	0.2	0.73	0.5	0.69
Lsat_1_v5_gn_4_108620.1	0.33	0.37	0.27	0.2	1.0	0.55	0.32	0.24	0.18	0.28	0.22	0.19	0.12	0.3	0.47	0.47	0.34	0.36	0.1	0.19	0.21	0.31	0.0	0.14	0.23	0.38	0.32	0.46	0.18	0.05	0.02
Lsat_1_v5_gn_4_124221.1 (scpl40)	0.44	0.38	0.38	0.38	0.52	0.61	0.57	0.56	0.47	0.61	0.59	0.48	0.34	0.89	1.0	0.68	0.54	0.3	0.62	0.49	0.38	0.38	0.28	0.41	0.43	0.51	0.51	0.39	0.64	0.72	0.61
Lsat_1_v5_gn_4_138061.1 (DWF2)	0.4	0.43	0.41	0.52	0.8	0.77	0.56	0.44	0.79	0.71	0.78	0.75	0.68	0.84	0.94	0.83	0.72	0.44	0.71	0.67	0.65	0.66	0.67	0.66	0.71	0.73	0.79	0.53	0.9	0.95	1.0
Lsat_1_v5_gn_4_166000.1	0.37	0.38	0.4	0.5	0.69	0.83	0.5	0.47	0.63	0.62	0.67	0.65	0.56	1.0	0.94	0.75	0.64	0.5	0.74	0.58	0.56	0.58	0.43	0.57	0.58	0.66	0.64	0.47	0.71	0.71	0.73
Lsat_1_v5_gn_4_182221.1 (CBC1)	0.17	0.3	0.15	0.28	0.49	0.48	0.49	0.41	0.47	0.35	0.4	0.38	0.33	1.0	1.0	0.49	0.46	0.52	0.63	0.45	0.38	0.43	0.13	0.39	0.42	0.34	0.37	0.35	0.6	0.63	0.77
Lsat_1_v5_gn_4_30821.1 (ZIK5)	0.49	0.39	0.29	0.2	0.39	0.37	0.58	0.4	0.76	0.74	0.79	0.62	0.5	1.0	0.85	0.64	0.67	0.18	0.78	0.72	0.67	0.69	0.48	0.62	0.67	0.65	0.65	0.54	0.82	0.98	0.74
Lsat_1_v5_gn_4_31621.1 (RbcX2)	0.18	0.14	0.12	0.13	0.51	0.25	0.23	0.24	0.44	0.45	0.38	0.42	0.15	0.75	1.0	0.38	0.31	0.01	0.05	0.23	0.31	0.28	0.01	0.32	0.25	0.19	0.28	0.23	0.27	0.32	0.32
Lsat_1_v5_gn_4_37741.1 (RKFL1)	0.11	0.16	0.14	0.19	0.53	0.33	0.27	0.31	0.33	0.37	0.36	0.24	0.13	0.76	1.0	0.5	0.38	0.21	0.32	0.32	0.25	0.27	0.04	0.15	0.2	0.33	0.29	0.12	0.5	0.53	0.29
Lsat_1_v5_gn_4_76660.1	0.19	0.18	0.2	0.31	0.7	0.68	0.28	0.19	0.41	0.43	0.48	0.38	0.35	0.89	1.0	0.58	0.49	0.21	0.5	0.42	0.41	0.43	0.06	0.34	0.38	0.44	0.43	0.42	0.34	0.38	0.51
Lsat_1_v5_gn_5_101481.1	0.3	0.3	0.23	0.39	0.8	0.65	0.41	0.27	0.58	0.64	0.68	0.56	0.4	1.0	0.79	0.56	0.48	0.32	0.48	0.56	0.55	0.59	0.26	0.57	0.6	0.72	0.71	0.5	0.74	0.8	0.77
Lsat_1_v5_gn_5_13060.1	0.53	0.47	0.4	0.47	0.99	1.0	0.52	0.48	0.54	0.53	0.6	0.6	0.85	0.88	0.77	0.83	0.67	0.69	0.61	0.57	0.6	0.71	0.78	0.57	0.58	0.68	0.64	0.75	0.76	0.73	0.84
Lsat_1_v5_gn_5_145781.1	0.51	0.34	0.22	0.34	0.3	0.36	0.46	0.54	0.6	0.8	0.92	0.74	0.69	0.95	0.85	0.57	0.74	0.26	0.68	0.67	0.7	0.73	0.27	0.86	0.84	0.64	0.69	0.76	0.8	0.96	1.0
Lsat_1_v5_gn_5_154260.1	0.29	0.45	0.37	0.43	0.44	0.34	0.44	0.45	0.5	0.62	0.64	0.43	0.35	0.76	1.0	0.64	0.61	0.27	0.59	0.46	0.35	0.42	0.45	0.38	0.39	0.66	0.45	0.36	0.83	0.94	0.64
Lsat_1_v5_gn_5_1821.1 (NUDT2)	0.18	0.15	0.12	0.1	0.69	0.68	0.33	0.34	0.34	0.33	0.39	0.31	0.38	0.8	1.0	0.6	0.42	0.28	0.53	0.35	0.45	0.46	0.13	0.32	0.4	0.49	0.51	0.39	0.53	0.45	0.37
Lsat_1_v5_gn_5_49640.1 (B120)	0.22	0.43	0.26	0.16	0.5	0.52	0.41	0.34	0.28	0.32	0.32	0.28	0.18	0.95	1.0	0.62	0.46	0.03	0.34	0.27	0.27	0.3	0.06	0.19	0.24	0.25	0.3	0.26	0.43	0.4	0.09
Lsat_1_v5_gn_5_60621.1 (SIG1)	0.27	0.33	0.38	0.34	0.44	0.34	0.43	0.53	0.52	0.62	0.63	0.4	0.29	0.88	1.0	0.61	0.61	0.29	0.75	0.43	0.33	0.42	0.36	0.33	0.41	0.6	0.38	0.31	0.71	0.85	0.53
Lsat_1_v5_gn_6_103041.1	0.25	0.31	0.38	0.35	0.6	0.51	0.43	0.48	0.61	0.47	0.62	0.59	0.4	1.0	0.97	0.71	0.65	0.24	0.53	0.5	0.49	0.59	0.12	0.42	0.45	0.43	0.43	0.46	0.41	0.46	0.37
Lsat_1_v5_gn_6_34200.1 (ABCG27)	0.54	0.62	0.38	0.33	0.73	0.85	0.55	0.45	0.67	0.62	0.62	0.51	0.35	0.95	1.0	0.72	0.53	0.09	0.6	0.46	0.45	0.41	0.04	0.36	0.34	0.37	0.37	0.55	0.28	0.29	0.3
Lsat_1_v5_gn_6_46140.1 (MTP4)	0.12	0.21	0.16	0.21	0.68	0.72	0.41	0.39	0.49	0.53	0.5	0.48	0.28	0.93	1.0	0.52	0.5	0.26	0.64	0.57	0.43	0.48	0.28	0.31	0.35	0.49	0.54	0.34	0.43	0.39	0.53
Lsat_1_v5_gn_6_4741.1 (PGF9)	0.08	0.12	0.16	0.2	0.48	0.36	0.28	0.2	0.41	0.35	0.48	0.37	0.23	0.9	1.0	0.44	0.37	0.16	0.49	0.36	0.34	0.3	0.01	0.26	0.33	0.4	0.42	0.18	0.66	0.8	0.69
Lsat_1_v5_gn_6_57060.1	0.0	0.01	0.01	0.0	0.08	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.02	0.01	1.0	0.93	0.05	0.0	0.02	0.1	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.04	0.04	0.0	0.57	0.29	0.03
Lsat_1_v5_gn_6_69600.1 (PDR11)	0.32	0.29	0.29	0.41	0.63	0.54	0.45	0.34	0.64	0.66	0.65	0.63	0.5	0.89	1.0	0.66	0.69	0.42	0.55	0.6	0.52	0.51	0.13	0.49	0.53	0.46	0.54	0.58	0.61	0.55	0.48
Lsat_1_v5_gn_7_111841.1	0.62	0.55	0.53	0.55	1.0	0.58	0.54	0.42	0.52	0.51	0.53	0.5	0.39	0.77	0.92	0.62	0.57	0.3	0.55	0.51	0.49	0.46	0.16	0.36	0.4	0.51	0.58	0.53	0.49	0.42	0.34
Lsat_1_v5_gn_7_23140.1 (TBL38)	0.27	0.3	0.34	0.45	0.41	0.41	0.49	0.38	0.41	0.38	0.4	0.35	0.35	0.92	1.0	0.55	0.55	0.33	0.49	0.45	0.42	0.39	0.23	0.37	0.39	0.46	0.47	0.35	0.65	0.71	0.71
Lsat_1_v5_gn_7_45121.1	0.34	0.3	0.39	0.47	0.73	0.73	0.41	0.32	0.63	0.57	0.63	0.56	0.38	0.9	1.0	0.64	0.46	0.45	0.54	0.56	0.51	0.54	0.25	0.38	0.5	0.54	0.52	0.55	0.74	0.68	0.55
Lsat_1_v5_gn_7_48481.1 (SIP3)	0.02	0.03	0.02	0.07	0.6	0.57	0.33	0.37	0.29	0.38	0.34	0.33	0.22	0.56	1.0	0.51	0.35	0.2	0.42	0.38	0.31	0.33	0.34	0.29	0.27	0.26	0.28	0.18	0.33	0.33	0.49
Lsat_1_v5_gn_7_62320.1	0.45	0.39	0.61	0.53	0.77	0.65	0.4	0.31	0.58	0.63	0.62	0.58	0.46	0.93	1.0	0.87	0.64	0.44	0.65	0.57	0.61	0.67	0.43	0.62	0.6	0.67	0.69	0.65	0.71	0.72	0.72
Lsat_1_v5_gn_7_6780.1 (SOC1)	0.38	0.32	0.16	0.17	0.51	0.51	0.38	0.33	0.56	0.54	0.52	0.57	0.22	0.75	1.0	0.62	0.62	0.08	0.63	0.63	0.61	0.54	0.54	0.44	0.5	0.57	0.58	0.36	0.56	0.63	0.6
Lsat_1_v5_gn_7_97721.1 (IRK)	0.11	0.09	0.09	0.11	0.59	0.51	0.32	0.18	0.36	0.42	0.42	0.42	0.31	0.74	1.0	0.6	0.51	0.29	0.43	0.35	0.39	0.37	0.09	0.32	0.34	0.41	0.42	0.37	0.45	0.49	0.44
Lsat_1_v5_gn_7_97741.1 (TAFL)	0.22	0.21	0.25	0.37	0.62	0.55	0.3	0.3	0.42	0.34	0.4	0.29	0.26	1.0	0.95	0.5	0.45	0.25	0.68	0.56	0.47	0.62	0.17	0.44	0.47	0.52	0.56	0.36	0.81	0.81	0.65
Lsat_1_v5_gn_7_97821.1 (RLP19)	0.36	0.22	0.14	0.12	1.0	0.72	0.21	0.15	0.26	0.34	0.45	0.36	0.29	0.8	0.98	0.56	0.45	0.19	0.47	0.36	0.43	0.49	0.24	0.42	0.42	0.42	0.48	0.38	0.65	0.6	0.53
Lsat_1_v5_gn_8_102361.1	0.28	0.29	0.2	0.32	0.49	0.45	0.31	0.31	0.39	0.4	0.43	0.38	0.28	1.0	0.94	0.51	0.36	0.47	0.6	0.38	0.39	0.43	0.24	0.38	0.41	0.41	0.42	0.4	0.7	0.61	0.48
Lsat_1_v5_gn_8_150161.1 (NPX1)	0.45	0.38	0.14	0.11	0.59	0.38	0.27	0.26	0.33	0.3	0.27	0.2	0.03	0.96	1.0	0.32	0.26	0.0	0.35	0.28	0.31	0.29	0.06	0.21	0.18	0.2	0.3	0.31	0.63	0.53	0.13
Lsat_1_v5_gn_8_167541.1	0.66	0.32	0.28	0.39	1.0	0.62	0.44	0.47	0.28	0.25	0.26	0.23	0.14	0.49	0.75	0.73	0.62	0.39	0.51	0.49	0.41	0.43	0.04	0.28	0.25	0.37	0.43	0.57	0.31	0.21	0.09
Lsat_1_v5_gn_8_30460.1 (LOG1)	0.3	0.39	0.31	0.29	0.53	0.37	0.32	0.27	0.4	0.4	0.37	0.38	0.13	0.75	1.0	0.36	0.35	0.08	0.4	0.35	0.31	0.3	0.06	0.26	0.23	0.28	0.29	0.29	0.31	0.24	0.12
Lsat_1_v5_gn_8_44400.1 (HMGA)	0.17	0.07	0.14	0.08	0.46	0.36	0.32	0.22	0.63	0.64	0.49	0.61	0.34	0.83	1.0	0.51	0.5	0.41	0.59	0.49	0.38	0.22	0.09	0.45	0.36	0.29	0.37	0.3	0.36	0.58	0.87
Lsat_1_v5_gn_8_65901.1 (TWD40-1)	0.31	0.18	0.06	0.01	0.29	0.23	0.39	0.24	0.65	0.43	0.47	0.4	0.06	0.79	1.0	0.47	0.6	0.0	0.54	0.73	0.63	0.39	0.0	0.45	0.38	0.44	0.65	0.3	0.48	0.9	0.39
Lsat_1_v5_gn_8_94781.1 (DLK2)	0.18	0.26	0.19	0.24	0.35	0.54	0.47	0.47	0.6	0.58	0.57	0.48	0.21	1.0	0.96	0.58	0.52	0.05	0.3	0.26	0.28	0.28	0.04	0.15	0.17	0.17	0.17	0.22	0.01	0.02	0.08
Lsat_1_v5_gn_9_19600.1 (CYP72A8)	0.26	0.36	0.36	0.39	0.45	0.33	0.44	0.53	0.59	0.69	0.63	0.41	0.36	0.87	1.0	0.64	0.68	0.29	0.61	0.45	0.35	0.46	0.41	0.36	0.42	0.6	0.42	0.37	0.87	0.92	0.65
Lsat_1_v5_gn_9_19620.1 (SIG1)	0.4	0.61	0.53	0.56	0.47	0.47	0.53	0.68	0.55	0.62	0.59	0.44	0.37	0.89	0.96	0.55	0.65	0.36	0.81	0.55	0.42	0.55	0.44	0.46	0.54	0.81	0.58	0.43	0.95	1.0	0.7
Lsat_1_v5_gn_9_30340.1 (PAT4)	0.67	0.57	0.56	0.47	0.66	0.82	0.56	0.39	0.39	0.45	0.44	0.48	0.34	0.78	1.0	0.81	0.62	0.37	0.68	0.57	0.42	0.44	0.24	0.35	0.34	0.42	0.36	0.41	0.38	0.34	0.36
Lsat_1_v5_gn_9_42121.1	0.32	0.31	0.29	0.39	1.0	0.75	0.53	0.41	0.63	0.7	0.69	0.7	0.47	0.92	0.92	0.75	0.67	0.68	0.66	0.62	0.61	0.62	0.47	0.53	0.6	0.63	0.69	0.61	0.75	0.69	0.79
Lsat_1_v5_gn_9_5640.1 (mzm1)	0.33	0.26	0.26	0.25	0.74	0.87	0.38	0.31	0.51	0.45	0.51	0.49	0.53	1.0	0.85	0.52	0.53	0.58	0.6	0.55	0.62	0.68	0.47	0.56	0.55	0.52	0.6	0.57	0.5	0.5	0.7
Lsat_1_v5_gn_9_65581.1	0.35	0.42	0.42	0.4	0.54	0.39	0.39	0.32	0.59	0.59	0.61	0.7	0.67	0.75	1.0	0.53	0.66	0.49	0.54	0.61	0.39	0.4	0.19	0.53	0.52	0.39	0.46	0.41	0.48	0.61	0.71
Lsat_1_v5_gn_9_77921.1 (TRAPPC5)	0.37	0.45	0.35	0.37	0.9	0.86	0.5	0.5	0.56	0.6	0.64	0.55	0.54	0.96	1.0	0.72	0.63	0.49	0.72	0.56	0.53	0.57	0.5	0.52	0.49	0.6	0.63	0.43	0.71	0.77	0.81
Lsat_1_v5_gn_9_93240.1	0.4	0.35	0.33	0.28	0.59	0.67	0.55	0.39	0.59	0.56	0.6	0.52	0.47	1.0	0.95	0.63	0.56	0.46	0.7	0.59	0.53	0.54	0.34	0.44	0.46	0.49	0.52	0.54	0.85	0.8	0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)