Heatmap: Cluster_85 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.92 -0.53 -0.71 -0.17 0.29 -0.0 -0.14 -0.28 0.26 0.31 0.39 0.28 -0.15 -0.27 -0.04 -0.01 -0.03 -0.08 -0.0 -0.05 -0.1 -0.17 0.16 -0.19 -0.08 -0.0 0.09 -0.05 0.26 0.4 0.55
-0.39 -0.09 0.28 0.22 0.11 -0.21 0.04 -0.1 0.09 0.07 0.14 0.18 0.11 0.03 0.11 -0.22 -0.34 -0.16 -0.52 -0.17 -0.28 -0.12 0.3 -0.38 -0.07 -0.33 -0.47 -0.57 0.85 0.6 0.19
- - -1.36 -0.37 -0.59 -0.77 -0.2 1.13 0.31 0.02 0.06 0.44 0.28 -1.42 -1.75 0.05 0.67 0.61 -0.11 0.76 0.67 0.37 -0.6 -1.49 -0.72 -1.33 -0.63 0.29 1.5 1.02 -0.76
-0.27 -0.4 -0.02 0.31 -0.06 -0.12 -0.24 -0.39 0.27 0.34 0.47 0.46 -0.23 0.47 0.39 0.08 -0.14 -0.94 -0.12 -0.23 -0.32 -0.33 -0.72 -0.23 -0.14 -0.13 -0.11 -0.6 0.26 0.51 0.64
-0.69 -0.74 -0.35 -0.16 -0.22 -0.34 -0.44 -0.59 0.32 0.58 0.67 0.41 -0.23 -0.1 0.01 -0.08 0.89 -3.37 -0.08 -0.05 -0.07 -0.67 -1.81 0.41 -0.08 -0.49 -0.14 -0.75 0.77 1.2 0.51
-1.06 0.22 0.15 -0.13 0.15 0.32 1.25 1.94 -0.56 -0.68 -0.38 -0.5 -1.19 -1.52 -1.63 -0.97 -0.75 -2.36 -0.93 -1.51 -0.5 -0.8 -4.24 -0.88 -0.11 -0.66 -0.73 -0.7 1.94 1.55 0.36
- 0.52 - - -2.06 -0.35 1.11 -1.02 0.76 -0.69 0.42 -1.02 2.39 -2.14 - 0.54 0.82 - - 0.33 -1.41 -0.69 - -1.25 0.1 1.48 0.23 -1.15 0.14 1.0 0.86
- 0.52 - - -2.06 -0.35 1.11 -1.02 0.76 -0.69 0.42 -1.02 2.39 -2.14 - 0.54 0.82 - - 0.33 -1.41 -0.69 - -1.25 0.1 1.48 0.23 -1.15 0.14 1.0 0.86
-2.55 0.63 -1.88 -1.83 -1.08 0.45 0.9 -0.69 0.32 -0.31 0.65 -0.53 0.71 -7.23 -4.84 0.78 0.54 - -1.41 -0.64 0.23 0.68 - -1.03 -0.42 0.87 0.86 -1.15 1.15 1.12 0.77
- 1.12 - -1.19 - - - - 0.39 - -1.34 - 0.66 0.46 -1.25 - 0.78 2.29 0.87 0.07 -0.6 - 0.41 0.57 0.11 - - - -0.34 2.53 1.42
-1.13 -0.68 -1.17 -0.47 0.58 0.2 -0.25 -0.3 0.16 0.34 0.39 0.39 -0.14 0.06 -0.07 -0.14 -0.1 -0.64 -0.25 -0.12 -0.09 -0.19 -0.63 0.06 -0.15 0.03 -0.04 -0.22 0.59 0.57 1.04
-1.49 -1.6 -1.23 -0.58 -0.48 0.48 0.68 0.91 0.4 0.46 0.3 -0.37 -0.73 -2.28 -0.53 -0.03 -0.14 -0.68 0.27 -0.1 -0.06 0.3 -1.21 -0.39 0.3 0.26 0.47 0.33 0.88 0.71 -0.25
-0.63 -0.91 -0.28 0.57 -0.72 -1.13 -0.84 -0.03 0.43 0.58 0.8 1.26 1.01 -1.8 -2.13 -0.4 -0.03 -1.94 -1.24 0.09 -0.1 0.01 -2.62 0.89 0.48 -0.08 -0.16 0.54 -0.66 -0.0 0.73
-0.28 0.4 -0.25 -0.99 -0.22 -0.16 1.9 1.28 0.23 -0.07 0.93 -0.55 - - -2.51 0.18 -0.55 - -1.94 -0.53 -0.33 -0.35 - 0.9 0.33 0.33 0.31 -2.59 1.14 1.01 -1.54
- -0.56 -2.96 -2.89 -0.75 -3.29 -0.19 -0.87 -1.14 -0.96 -0.18 -0.65 0.14 -0.05 -1.1 -1.85 -0.02 -0.15 -2.34 -0.83 -0.43 -1.42 0.43 0.23 -0.34 0.67 -1.6 -1.83 2.45 1.91 2.05
-2.95 -3.49 - -1.69 -0.6 -0.98 -0.62 -0.47 0.35 0.55 0.56 -0.29 0.43 -1.97 -0.55 0.39 0.92 -4.48 -0.35 0.52 0.25 1.1 - -0.01 0.32 0.1 0.73 0.19 1.01 0.99 0.77
-2.14 -3.97 -3.28 -2.09 -0.5 -1.34 -0.15 0.01 0.49 0.12 0.65 -0.15 0.1 -2.53 -1.01 0.3 0.5 -5.37 -0.07 0.55 0.35 0.54 - 0.15 0.6 0.46 0.87 0.14 1.02 1.42 0.28
-1.77 -2.01 -2.31 -1.95 -1.13 -0.91 0.02 0.38 0.24 0.07 0.14 0.15 0.28 -1.46 -0.63 0.61 0.67 -7.54 -0.13 0.48 0.5 0.65 -7.25 0.3 0.61 0.41 0.65 0.24 0.67 0.83 0.48
-1.77 -2.01 -2.31 -1.95 -1.13 -0.91 0.02 0.38 0.24 0.07 0.14 0.15 0.28 -1.46 -0.63 0.61 0.67 -7.54 -0.13 0.48 0.5 0.65 -7.25 0.3 0.61 0.41 0.65 0.24 0.67 0.83 0.48
-2.39 -2.08 -2.39 -1.07 -1.31 -1.58 0.05 0.67 -0.02 0.24 0.03 0.37 0.33 -1.15 -0.42 0.46 0.63 - -0.17 0.53 0.46 0.42 - 0.17 0.52 0.26 0.79 0.41 0.63 0.78 0.65
-1.4 - -1.76 -0.63 -0.06 -0.71 0.28 0.95 0.71 0.04 0.21 0.44 -0.61 -4.24 -2.2 0.36 -0.25 -5.71 0.4 -0.27 -0.27 0.54 -4.6 0.31 0.34 -0.35 1.07 0.28 1.0 1.23 0.36
-1.39 -4.2 -0.97 -2.31 -0.54 -0.77 0.04 -0.34 0.84 0.28 0.26 0.35 -0.74 -2.65 -0.68 0.19 0.76 - 0.24 0.61 0.24 0.47 - -0.11 0.25 0.1 0.9 -0.24 1.14 0.8 0.97
- - - -2.71 -2.17 -2.94 -1.46 -1.57 0.49 1.06 0.78 1.25 -4.48 -2.0 -1.21 0.31 0.99 - -0.31 0.53 -0.01 -1.53 - 1.28 1.1 -0.6 -0.02 -0.32 1.67 1.61 0.49
-4.13 - -3.12 -0.85 -0.13 -0.46 -0.2 0.1 0.31 -0.03 0.64 1.07 -0.43 0.63 -0.07 -0.06 -0.11 -1.29 0.13 0.43 0.45 -0.22 -3.89 -0.35 -0.77 -0.8 -0.49 -0.96 1.83 1.2 0.61
- - - -0.83 - - -1.48 -2.51 0.41 0.8 0.38 1.09 1.23 - -4.08 -0.83 -0.87 1.57 -1.61 0.38 0.19 0.8 -3.27 0.39 0.89 -0.97 -0.33 -1.21 0.94 1.91 0.82
-1.57 -0.88 -1.72 -1.52 0.72 0.47 -0.16 -0.62 -0.32 -0.26 0.46 0.26 0.05 -0.09 0.31 0.26 -0.09 0.02 0.12 0.21 -0.4 -0.12 -2.01 -0.01 0.14 -0.01 -0.21 -0.5 0.65 0.64 1.25
-2.37 -2.75 -1.26 -1.07 0.41 0.3 0.25 1.13 -0.38 -0.52 -0.65 -0.49 -1.17 1.04 0.34 -0.54 -0.28 -1.13 0.15 -0.35 0.03 0.1 -0.11 -0.81 -0.73 -0.48 -0.57 -0.65 1.86 1.22 0.25
-0.94 -0.65 -1.17 -1.03 -1.12 0.28 0.36 -0.09 0.19 0.25 0.1 0.1 0.06 -1.03 -0.96 0.69 0.72 -2.86 -0.53 0.22 0.3 0.54 -1.92 0.1 0.44 0.62 0.5 0.0 0.2 0.46 0.46
- - - - - - - - - - 2.01 - - - - - - - - - - - - - 1.97 - - - 3.59 3.46 -
- -3.76 -0.6 -0.03 -0.85 -0.11 0.51 0.92 0.45 0.74 0.59 0.48 -3.3 -2.37 -0.21 0.05 0.37 -4.47 0.06 0.28 -0.26 0.78 - -2.16 -0.37 -0.17 -0.27 -1.34 2.02 1.18 -0.37
-0.73 -0.54 -0.17 0.15 0.18 0.1 0.2 0.0 -0.31 -0.1 -0.15 -0.17 0.34 0.48 0.39 0.18 0.2 -0.38 0.06 -0.21 -0.13 -0.25 0.08 -0.43 -0.26 -0.24 -0.33 -0.07 0.51 0.6 -0.04
-1.75 -0.69 -1.28 -1.06 -0.5 -0.21 0.43 0.01 0.12 -0.13 0.22 0.03 0.54 -1.19 -0.47 0.55 0.8 -1.39 -0.33 0.23 0.11 0.22 -2.3 -0.23 0.02 0.58 0.28 -0.1 0.76 0.82 0.57
-0.89 -0.12 -0.18 -0.16 -0.18 0.13 0.13 0.59 -0.06 0.1 0.25 0.04 -0.53 0.73 0.86 0.12 0.01 -0.53 0.2 -0.31 -0.74 -0.76 -0.91 -0.45 -0.36 -0.42 -0.24 -0.75 0.7 0.84 0.27
-0.01 0.87 -0.43 -0.93 -0.43 0.31 0.35 -0.15 0.27 0.24 0.12 -0.01 -0.27 -5.63 -3.78 0.4 0.38 -2.14 -0.1 0.32 0.18 0.25 -2.76 -0.04 0.2 0.51 0.47 0.18 0.3 0.46 0.25
-0.47 -0.86 -0.58 0.17 0.18 -0.13 -0.27 -0.13 0.18 0.4 0.45 0.65 -0.06 -0.04 -0.03 -0.57 -0.02 -0.34 -0.06 0.17 -0.09 -0.14 -1.56 0.15 -0.3 0.04 -0.09 -0.07 -0.06 0.4 0.99
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.76 - - - - - - - - - - 2.85 4.08 1.81
-1.15 -0.43 -0.46 0.07 0.46 -0.66 -1.02 -1.25 0.63 0.66 0.76 0.93 -0.24 -0.46 -0.38 -0.28 -0.16 -0.89 -0.34 0.07 -0.16 -0.39 -0.73 -0.28 -0.43 -0.06 -0.17 -0.59 0.59 0.95 1.11
-0.27 -0.09 0.06 0.38 -0.11 0.01 -0.11 -0.11 0.04 -0.01 0.23 0.07 -0.4 0.22 0.1 0.02 -0.23 -1.28 0.09 -0.19 0.03 0.01 -0.4 -0.01 0.1 0.1 0.1 -0.24 0.24 0.34 0.44
-1.73 -1.24 -0.4 0.53 0.07 -0.3 -0.26 0.21 -0.57 0.24 0.23 0.26 -4.34 0.86 0.57 -0.11 0.53 -2.71 0.44 0.05 -0.95 -1.07 -7.89 1.11 0.28 -0.66 -0.62 -0.7 0.79 1.55 -0.33
-1.47 -3.65 -3.7 -0.78 -0.34 -0.08 0.58 1.16 -0.07 0.33 0.23 0.26 -0.74 -2.71 -1.5 -0.06 0.66 -2.4 -0.86 0.21 0.33 0.23 -1.27 -0.8 -0.35 -0.1 -0.54 -0.67 2.29 1.23 -0.66
-0.8 -1.18 -0.1 0.47 -0.31 0.34 -0.53 -0.91 0.46 0.25 0.34 -0.09 -0.56 0.57 0.58 0.23 -0.09 -0.76 -0.39 -0.18 0.1 -0.01 -1.07 -0.23 -0.47 -0.12 0.26 -0.76 0.2 0.6 1.08
-1.93 -1.25 -0.38 0.61 -0.46 -0.33 0.67 1.12 0.49 0.75 0.69 0.69 -0.76 -2.46 -1.46 -0.09 -0.15 -2.19 -0.38 0.18 -0.07 -0.04 -5.91 -0.05 -0.01 -0.07 -0.14 -0.03 0.89 0.83 -0.07
-2.12 - -3.79 -0.78 -1.31 -1.75 -1.18 -0.48 0.54 1.07 1.12 1.64 -4.04 - - 0.61 -0.23 -2.21 -1.67 0.52 -0.16 -1.65 -4.01 0.13 -0.55 -0.36 -1.99 - 2.15 2.57 -0.82
-0.99 -0.21 -0.02 -0.02 -0.01 -0.12 -0.33 -0.96 0.61 0.39 0.6 0.57 -1.21 -0.68 0.14 0.03 -0.14 -1.52 0.19 0.01 -0.15 -0.07 -0.82 0.19 -0.02 -0.19 -0.16 -0.73 0.8 0.91 0.55
-0.67 -0.66 -0.14 -0.09 -0.03 -0.1 -0.16 -0.1 0.09 0.43 0.38 0.45 -0.26 0.39 0.22 -0.11 -0.13 -0.38 -0.3 -0.13 -0.2 -0.17 -0.27 -0.11 -0.45 0.06 -0.07 -0.51 0.39 0.42 0.87
-0.91 0.05 -2.07 -1.87 -1.42 0.02 0.51 -0.94 0.45 0.38 0.6 -0.2 0.07 -2.3 -2.24 0.2 0.27 -1.38 -1.42 -0.08 0.51 0.64 -2.61 -0.43 0.2 1.3 0.95 0.47 0.72 0.63 0.01
-2.16 -0.3 -1.95 0.58 0.33 -0.93 -0.49 -0.72 0.25 0.55 1.06 -0.41 0.25 -2.16 -0.35 0.86 0.61 - -0.77 -0.54 -0.07 -0.49 -0.97 -0.72 -0.45 0.47 -0.37 -0.04 1.5 1.57 -1.55
-1.53 -1.12 -1.7 -0.7 -1.08 -1.1 -0.03 0.08 0.16 0.26 0.26 -0.06 0.49 -2.25 -0.78 0.74 0.43 -2.28 -0.31 0.34 0.17 0.25 -2.58 0.16 0.58 0.82 0.63 0.23 0.72 1.0 0.15
-1.83 -2.27 -2.74 -1.71 -1.22 -0.76 -0.06 -0.11 0.18 0.12 0.22 0.2 0.67 -3.28 -1.31 0.38 0.76 -5.44 -0.2 0.37 0.51 0.62 -5.24 0.29 0.58 0.65 0.84 -0.17 0.79 1.04 0.66
-3.72 -1.49 -2.09 -0.39 -0.74 -0.59 0.06 0.1 0.3 0.6 0.41 -0.11 -0.45 -4.93 -0.96 0.77 0.68 -4.39 -0.51 0.48 0.36 0.47 -2.71 -0.22 0.65 0.75 0.69 0.51 0.81 0.77 0.06
-0.83 -1.72 -1.74 -3.01 0.09 0.36 -0.0 0.62 0.12 -0.33 0.01 0.26 0.44 -1.0 -0.31 -0.09 -0.07 -0.11 -1.73 0.19 -0.2 0.11 -1.59 -1.29 0.19 -0.03 0.26 -0.34 1.53 1.21 0.86
-1.05 -0.01 0.39 0.21 -0.32 0.13 -0.31 -0.4 0.53 0.19 0.54 -0.04 -1.91 -0.8 -0.37 -0.44 -0.18 -1.0 -0.4 -0.55 0.11 -0.72 -4.92 0.14 0.43 0.3 0.25 -1.97 0.96 1.58 0.71
-0.04 -0.05 0.07 0.29 -0.36 -0.54 -0.41 -0.7 0.41 0.15 0.43 0.48 -0.91 -0.08 -0.7 -0.26 -0.13 -0.73 -0.84 -0.47 -0.3 -0.62 -5.05 0.02 0.54 0.24 0.0 -0.75 0.7 1.34 1.11
-1.14 -0.67 -0.31 0.43 0.6 -0.73 -0.85 0.04 0.42 0.77 0.77 1.15 0.73 -1.35 -1.64 -0.89 -0.32 -0.86 -0.65 0.12 -0.33 -0.1 -2.24 0.4 0.15 -0.22 -0.2 0.09 -0.19 0.14 0.99
-0.02 -0.66 -0.17 0.54 -0.24 -1.06 -0.88 0.06 0.41 0.45 0.85 1.01 0.42 -0.47 -0.24 -0.63 -0.4 -1.66 -0.52 -0.33 -0.38 -0.31 -2.41 0.47 0.1 -0.4 -0.33 -0.44 0.01 0.62 1.28
-1.52 -1.4 -0.03 0.34 0.0 0.18 0.52 0.85 0.16 0.16 0.05 0.18 0.07 -0.49 -0.39 0.24 0.15 -0.7 -0.33 -0.21 -0.11 -0.05 -3.26 -0.2 -0.12 -0.18 -0.03 -0.3 0.93 0.74 0.15
- 2.56 - 2.61 - - - - - - - - - - - - - 2.26 - - - - - - - - - - - 3.83 -
-0.68 0.27 0.15 -0.2 -0.59 -0.8 0.26 0.12 0.2 0.01 0.31 0.3 -0.9 0.36 0.75 0.31 0.43 -1.24 -0.6 -0.13 -0.82 -0.88 -1.9 -0.18 -0.44 -0.98 -0.61 -1.45 1.29 1.36 0.51
-3.94 -1.52 -2.4 -2.72 -1.87 -0.28 0.44 0.43 0.0 -0.1 0.06 -0.17 -0.08 -0.8 -0.03 0.99 0.68 -6.24 0.27 0.21 0.43 0.5 -0.17 0.28 0.5 0.31 0.43 -0.23 0.38 0.7 0.54
-0.47 -0.84 0.02 0.24 -0.15 -0.41 -0.17 -0.42 0.07 -0.02 0.12 -0.21 -0.69 -0.15 0.1 -0.05 -0.32 -0.13 -0.37 0.06 -0.19 -0.05 0.19 -0.16 0.06 0.04 0.02 -0.42 0.82 0.91 0.84
-0.41 -0.41 0.12 0.39 -0.2 -0.05 -0.31 -0.2 0.18 0.11 0.16 0.02 -0.4 0.41 0.13 -0.16 -0.29 -1.03 0.1 -0.21 -0.04 -0.03 -0.3 -0.02 -0.03 0.2 0.06 -0.11 0.31 0.52 0.48
-0.93 - 0.31 -1.73 0.08 0.16 -0.16 0.85 -0.03 -1.76 0.5 1.06 - 0.66 1.2 -0.29 0.12 - -0.25 -1.02 -0.21 -0.11 - 0.7 -1.34 -0.43 0.17 -0.9 0.71 1.72 0.06
-4.64 -3.66 -2.76 -1.69 -1.67 -1.83 0.58 0.96 -0.24 -0.13 -0.14 -0.1 1.1 -2.18 0.01 1.1 1.06 -1.93 -1.02 0.49 0.16 -0.61 -3.77 0.36 0.68 0.48 0.11 -0.38 0.21 0.78 1.12
-0.93 -3.38 -4.22 -0.28 0.47 -0.6 -0.2 1.31 0.48 0.82 0.91 0.17 -1.6 -2.35 -1.96 -0.85 -0.46 -1.68 -0.29 -0.14 -0.05 0.67 -3.48 -0.58 0.15 -0.54 -0.11 -0.77 1.91 1.24 0.1
-2.02 -1.65 -1.4 -0.68 0.75 0.19 -1.53 -1.85 0.38 0.37 0.57 0.75 0.57 -0.5 -0.08 -0.01 0.04 -0.53 -0.4 0.06 -0.15 -0.04 -0.45 -0.17 -0.08 0.12 -0.12 -0.85 0.63 0.88 1.12
-0.67 -0.47 -1.12 -1.52 -0.95 -0.06 0.49 0.34 0.13 0.06 0.06 -0.15 -0.38 -1.45 -0.24 0.77 0.61 -0.91 0.25 0.37 0.23 0.18 -4.1 0.11 0.36 0.29 0.33 -0.09 0.43 0.63 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.