Heatmap: Cluster_85 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.36 0.47 0.42 0.61 0.84 0.68 0.62 0.56 0.82 0.85 0.89 0.83 0.61 0.57 0.66 0.68 0.67 0.64 0.68 0.66 0.64 0.61 0.76 0.6 0.64 0.68 0.72 0.66 0.82 0.9 1.0
0.42 0.52 0.67 0.65 0.6 0.48 0.57 0.52 0.59 0.58 0.61 0.63 0.6 0.57 0.6 0.48 0.44 0.5 0.39 0.49 0.46 0.51 0.68 0.42 0.53 0.44 0.4 0.37 1.0 0.84 0.63
0.0 0.0 0.14 0.27 0.24 0.21 0.31 0.77 0.44 0.36 0.37 0.48 0.43 0.13 0.1 0.37 0.56 0.54 0.33 0.6 0.56 0.46 0.23 0.13 0.21 0.14 0.23 0.43 1.0 0.72 0.21
0.53 0.49 0.63 0.79 0.62 0.59 0.54 0.49 0.77 0.81 0.89 0.88 0.55 0.89 0.84 0.68 0.58 0.34 0.59 0.55 0.51 0.51 0.39 0.55 0.58 0.59 0.59 0.42 0.77 0.91 1.0
0.27 0.26 0.34 0.39 0.37 0.34 0.32 0.29 0.54 0.65 0.69 0.58 0.37 0.41 0.44 0.41 0.8 0.04 0.41 0.42 0.41 0.27 0.12 0.58 0.41 0.31 0.39 0.26 0.74 1.0 0.62
0.12 0.3 0.29 0.24 0.29 0.32 0.62 0.99 0.18 0.16 0.2 0.18 0.11 0.09 0.08 0.13 0.15 0.05 0.14 0.09 0.18 0.15 0.01 0.14 0.24 0.16 0.16 0.16 1.0 0.76 0.33
0.0 0.27 0.0 0.0 0.05 0.15 0.41 0.09 0.32 0.12 0.26 0.09 1.0 0.04 0.0 0.28 0.34 0.0 0.0 0.24 0.07 0.12 0.0 0.08 0.21 0.53 0.22 0.09 0.21 0.38 0.35
0.0 0.27 0.0 0.0 0.05 0.15 0.41 0.09 0.32 0.12 0.26 0.09 1.0 0.04 0.0 0.28 0.34 0.0 0.0 0.24 0.07 0.12 0.0 0.08 0.21 0.53 0.22 0.09 0.21 0.38 0.35
0.08 0.7 0.12 0.13 0.21 0.62 0.84 0.28 0.56 0.36 0.71 0.31 0.74 0.0 0.02 0.78 0.66 0.0 0.17 0.29 0.53 0.72 0.0 0.22 0.34 0.83 0.82 0.2 1.0 0.98 0.77
0.0 0.38 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.07 0.0 0.27 0.24 0.07 0.0 0.3 0.85 0.32 0.18 0.11 0.0 0.23 0.26 0.19 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.46
0.22 0.3 0.22 0.35 0.73 0.56 0.41 0.4 0.54 0.61 0.64 0.64 0.44 0.51 0.46 0.44 0.45 0.31 0.41 0.45 0.46 0.43 0.31 0.51 0.44 0.5 0.47 0.42 0.73 0.72 1.0
0.19 0.18 0.23 0.36 0.38 0.74 0.85 1.0 0.7 0.73 0.66 0.41 0.32 0.11 0.37 0.52 0.48 0.33 0.64 0.5 0.51 0.66 0.23 0.41 0.66 0.64 0.74 0.67 0.98 0.87 0.45
0.27 0.22 0.34 0.62 0.25 0.19 0.23 0.41 0.56 0.63 0.73 1.0 0.84 0.12 0.1 0.32 0.41 0.11 0.18 0.44 0.39 0.42 0.07 0.77 0.58 0.4 0.37 0.61 0.27 0.42 0.69
0.22 0.35 0.23 0.14 0.23 0.24 1.0 0.65 0.32 0.26 0.51 0.18 0.0 0.0 0.05 0.3 0.18 0.0 0.07 0.19 0.21 0.21 0.0 0.5 0.34 0.34 0.33 0.04 0.59 0.54 0.09
0.0 0.12 0.02 0.02 0.11 0.02 0.16 0.1 0.08 0.09 0.16 0.12 0.2 0.18 0.08 0.05 0.18 0.16 0.04 0.1 0.14 0.07 0.25 0.21 0.14 0.29 0.06 0.05 1.0 0.68 0.75
0.06 0.04 0.0 0.14 0.31 0.24 0.3 0.34 0.59 0.68 0.69 0.38 0.63 0.12 0.32 0.61 0.88 0.02 0.36 0.67 0.55 1.0 0.0 0.46 0.58 0.5 0.77 0.53 0.94 0.93 0.79
0.08 0.02 0.04 0.09 0.26 0.15 0.34 0.38 0.53 0.41 0.59 0.34 0.4 0.06 0.19 0.46 0.53 0.01 0.36 0.55 0.48 0.54 0.0 0.41 0.57 0.51 0.68 0.41 0.76 1.0 0.46
0.17 0.14 0.11 0.15 0.26 0.3 0.57 0.73 0.66 0.59 0.62 0.62 0.69 0.2 0.36 0.86 0.89 0.0 0.51 0.79 0.79 0.88 0.0 0.69 0.86 0.75 0.88 0.67 0.9 1.0 0.79
0.17 0.14 0.11 0.15 0.26 0.3 0.57 0.73 0.66 0.59 0.62 0.62 0.69 0.2 0.36 0.86 0.89 0.0 0.51 0.79 0.79 0.88 0.0 0.69 0.86 0.75 0.88 0.67 0.9 1.0 0.79
0.11 0.14 0.11 0.28 0.23 0.19 0.6 0.92 0.57 0.68 0.59 0.75 0.73 0.26 0.43 0.8 0.89 0.0 0.51 0.83 0.8 0.77 0.0 0.65 0.83 0.69 1.0 0.77 0.89 0.99 0.91
0.16 0.0 0.13 0.28 0.41 0.26 0.51 0.82 0.7 0.44 0.49 0.58 0.28 0.02 0.09 0.55 0.36 0.01 0.56 0.35 0.35 0.62 0.02 0.53 0.54 0.33 0.89 0.52 0.85 1.0 0.55
0.17 0.02 0.23 0.09 0.31 0.27 0.47 0.36 0.81 0.55 0.54 0.58 0.27 0.07 0.28 0.52 0.77 0.0 0.53 0.69 0.53 0.63 0.0 0.42 0.54 0.49 0.84 0.38 1.0 0.79 0.88
0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.04 0.11 0.11 0.44 0.65 0.54 0.75 0.01 0.08 0.14 0.39 0.62 0.0 0.25 0.45 0.31 0.11 0.0 0.76 0.67 0.21 0.31 0.25 1.0 0.96 0.44
0.02 0.0 0.03 0.16 0.26 0.2 0.25 0.3 0.35 0.28 0.44 0.59 0.21 0.43 0.27 0.27 0.26 0.11 0.31 0.38 0.39 0.24 0.02 0.22 0.16 0.16 0.2 0.14 1.0 0.65 0.43
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.1 0.05 0.35 0.46 0.35 0.57 0.63 0.0 0.02 0.15 0.15 0.79 0.09 0.35 0.31 0.46 0.03 0.35 0.5 0.14 0.21 0.12 0.51 1.0 0.47
0.14 0.23 0.13 0.15 0.69 0.58 0.38 0.27 0.34 0.35 0.58 0.5 0.44 0.39 0.52 0.5 0.4 0.43 0.46 0.49 0.32 0.39 0.1 0.42 0.46 0.42 0.36 0.3 0.66 0.66 1.0
0.05 0.04 0.11 0.13 0.36 0.34 0.33 0.6 0.21 0.19 0.18 0.2 0.12 0.57 0.35 0.19 0.23 0.13 0.31 0.22 0.28 0.29 0.25 0.16 0.17 0.2 0.18 0.18 1.0 0.64 0.33
0.32 0.39 0.27 0.3 0.28 0.73 0.78 0.57 0.69 0.72 0.65 0.65 0.63 0.3 0.31 0.98 1.0 0.08 0.42 0.7 0.75 0.88 0.16 0.65 0.82 0.93 0.86 0.61 0.69 0.83 0.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.92 0.0
0.0 0.02 0.16 0.24 0.14 0.23 0.35 0.47 0.34 0.41 0.37 0.34 0.03 0.05 0.21 0.26 0.32 0.01 0.26 0.3 0.21 0.42 0.0 0.06 0.19 0.22 0.21 0.1 1.0 0.56 0.19
0.4 0.45 0.58 0.73 0.75 0.71 0.76 0.66 0.53 0.62 0.59 0.59 0.83 0.92 0.87 0.74 0.76 0.51 0.69 0.57 0.6 0.55 0.7 0.49 0.55 0.56 0.53 0.63 0.94 1.0 0.64
0.17 0.35 0.23 0.27 0.4 0.49 0.77 0.57 0.62 0.52 0.66 0.58 0.82 0.25 0.41 0.83 0.99 0.22 0.45 0.66 0.61 0.66 0.12 0.49 0.58 0.85 0.69 0.53 0.96 1.0 0.84
0.3 0.51 0.49 0.49 0.49 0.61 0.6 0.83 0.53 0.59 0.66 0.57 0.38 0.92 1.0 0.6 0.56 0.38 0.63 0.45 0.33 0.33 0.29 0.41 0.43 0.41 0.47 0.33 0.9 0.99 0.66
0.54 1.0 0.41 0.29 0.4 0.68 0.69 0.49 0.66 0.65 0.59 0.54 0.45 0.01 0.04 0.72 0.71 0.12 0.51 0.68 0.62 0.65 0.08 0.53 0.63 0.78 0.76 0.62 0.67 0.75 0.65
0.36 0.28 0.34 0.57 0.57 0.46 0.42 0.46 0.57 0.66 0.69 0.79 0.48 0.49 0.49 0.34 0.5 0.4 0.48 0.57 0.47 0.46 0.17 0.56 0.41 0.52 0.47 0.48 0.48 0.66 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 1.0 0.21
0.21 0.34 0.34 0.49 0.64 0.29 0.23 0.19 0.71 0.73 0.78 0.88 0.39 0.34 0.36 0.38 0.41 0.25 0.37 0.49 0.41 0.35 0.28 0.38 0.34 0.44 0.41 0.31 0.7 0.89 1.0
0.61 0.69 0.77 0.96 0.68 0.74 0.68 0.68 0.76 0.73 0.86 0.77 0.56 0.86 0.79 0.74 0.63 0.3 0.78 0.65 0.75 0.74 0.56 0.73 0.79 0.79 0.79 0.62 0.87 0.93 1.0
0.1 0.14 0.26 0.49 0.36 0.28 0.28 0.39 0.23 0.4 0.4 0.41 0.02 0.62 0.5 0.31 0.49 0.05 0.46 0.35 0.18 0.16 0.0 0.73 0.41 0.22 0.22 0.21 0.59 1.0 0.27
0.07 0.02 0.02 0.12 0.16 0.19 0.31 0.46 0.19 0.26 0.24 0.24 0.12 0.03 0.07 0.2 0.32 0.04 0.11 0.24 0.26 0.24 0.08 0.12 0.16 0.19 0.14 0.13 1.0 0.48 0.13
0.27 0.21 0.44 0.66 0.38 0.6 0.33 0.25 0.65 0.57 0.6 0.44 0.32 0.7 0.71 0.55 0.45 0.28 0.36 0.42 0.51 0.47 0.23 0.4 0.34 0.44 0.57 0.28 0.55 0.72 1.0
0.12 0.19 0.35 0.7 0.34 0.37 0.73 1.0 0.65 0.77 0.74 0.74 0.27 0.08 0.17 0.43 0.41 0.1 0.35 0.52 0.44 0.45 0.01 0.45 0.46 0.44 0.42 0.45 0.85 0.82 0.44
0.04 0.0 0.01 0.1 0.07 0.05 0.07 0.12 0.24 0.35 0.37 0.52 0.01 0.0 0.0 0.26 0.14 0.04 0.05 0.24 0.15 0.05 0.01 0.18 0.11 0.13 0.04 0.0 0.75 1.0 0.1
0.27 0.46 0.53 0.53 0.53 0.49 0.42 0.28 0.82 0.7 0.81 0.79 0.23 0.33 0.59 0.54 0.48 0.19 0.61 0.54 0.48 0.51 0.3 0.61 0.53 0.47 0.48 0.32 0.93 1.0 0.78
0.34 0.35 0.5 0.51 0.54 0.51 0.49 0.51 0.58 0.74 0.71 0.74 0.46 0.71 0.63 0.5 0.5 0.42 0.44 0.5 0.47 0.49 0.45 0.5 0.4 0.57 0.52 0.38 0.71 0.73 1.0
0.22 0.42 0.1 0.11 0.15 0.41 0.58 0.21 0.55 0.53 0.62 0.35 0.43 0.08 0.09 0.47 0.49 0.16 0.15 0.38 0.58 0.63 0.07 0.3 0.47 1.0 0.78 0.56 0.67 0.63 0.41
0.08 0.27 0.09 0.5 0.42 0.18 0.24 0.2 0.4 0.49 0.7 0.25 0.4 0.08 0.26 0.61 0.51 0.0 0.2 0.23 0.32 0.24 0.17 0.2 0.25 0.47 0.26 0.33 0.95 1.0 0.11
0.17 0.23 0.15 0.31 0.24 0.23 0.49 0.53 0.56 0.6 0.6 0.48 0.7 0.11 0.29 0.84 0.68 0.1 0.4 0.63 0.57 0.59 0.08 0.56 0.75 0.88 0.78 0.59 0.82 1.0 0.56
0.14 0.1 0.07 0.15 0.21 0.29 0.47 0.45 0.55 0.53 0.57 0.56 0.77 0.05 0.2 0.63 0.82 0.01 0.42 0.63 0.69 0.75 0.01 0.6 0.73 0.76 0.87 0.43 0.84 1.0 0.77
0.04 0.2 0.13 0.44 0.34 0.38 0.6 0.61 0.7 0.87 0.76 0.53 0.42 0.02 0.29 0.97 0.92 0.03 0.4 0.8 0.73 0.79 0.09 0.49 0.9 0.96 0.92 0.81 1.0 0.98 0.59
0.19 0.11 0.1 0.04 0.37 0.44 0.35 0.53 0.38 0.28 0.35 0.42 0.47 0.17 0.28 0.33 0.33 0.32 0.1 0.4 0.3 0.37 0.12 0.14 0.4 0.34 0.41 0.27 1.0 0.8 0.63
0.16 0.33 0.44 0.39 0.27 0.37 0.27 0.25 0.48 0.38 0.49 0.33 0.09 0.19 0.26 0.25 0.29 0.17 0.25 0.23 0.36 0.2 0.01 0.37 0.45 0.41 0.4 0.09 0.65 1.0 0.55
0.38 0.38 0.41 0.48 0.31 0.27 0.3 0.24 0.52 0.44 0.53 0.55 0.21 0.37 0.24 0.33 0.36 0.24 0.22 0.28 0.32 0.26 0.01 0.4 0.57 0.47 0.4 0.23 0.64 1.0 0.85
0.2 0.28 0.36 0.61 0.68 0.27 0.25 0.46 0.61 0.77 0.77 1.0 0.75 0.18 0.14 0.24 0.36 0.25 0.29 0.49 0.36 0.42 0.1 0.6 0.5 0.39 0.39 0.48 0.4 0.5 0.89
0.4 0.26 0.37 0.6 0.35 0.2 0.22 0.43 0.55 0.56 0.74 0.83 0.55 0.3 0.35 0.26 0.31 0.13 0.29 0.33 0.32 0.33 0.08 0.57 0.44 0.31 0.33 0.3 0.41 0.63 1.0
0.18 0.2 0.52 0.67 0.53 0.6 0.76 0.95 0.59 0.59 0.55 0.6 0.55 0.38 0.4 0.62 0.59 0.32 0.42 0.46 0.49 0.51 0.06 0.46 0.48 0.46 0.51 0.43 1.0 0.88 0.59
0.0 0.41 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.24 0.47 0.43 0.34 0.26 0.22 0.47 0.43 0.45 0.39 0.48 0.48 0.21 0.5 0.66 0.49 0.52 0.17 0.26 0.36 0.22 0.21 0.1 0.34 0.29 0.2 0.26 0.14 0.95 1.0 0.56
0.03 0.17 0.1 0.08 0.14 0.41 0.68 0.68 0.5 0.47 0.52 0.44 0.48 0.29 0.49 1.0 0.8 0.01 0.61 0.58 0.68 0.71 0.45 0.61 0.71 0.62 0.68 0.43 0.65 0.81 0.73
0.38 0.3 0.54 0.63 0.48 0.4 0.47 0.4 0.56 0.53 0.58 0.46 0.33 0.48 0.57 0.51 0.43 0.49 0.41 0.56 0.47 0.51 0.61 0.48 0.56 0.55 0.54 0.4 0.94 1.0 0.95
0.53 0.53 0.76 0.92 0.61 0.68 0.56 0.61 0.79 0.75 0.78 0.71 0.53 0.93 0.76 0.63 0.57 0.34 0.75 0.6 0.68 0.69 0.57 0.69 0.69 0.81 0.73 0.65 0.87 1.0 0.98
0.16 0.0 0.38 0.09 0.32 0.34 0.27 0.55 0.3 0.09 0.43 0.63 0.0 0.48 0.7 0.25 0.33 0.0 0.26 0.15 0.26 0.28 0.0 0.49 0.12 0.22 0.34 0.16 0.5 1.0 0.32
0.02 0.04 0.07 0.14 0.14 0.13 0.69 0.89 0.39 0.42 0.42 0.43 0.99 0.1 0.46 0.99 0.96 0.12 0.23 0.64 0.51 0.3 0.03 0.59 0.74 0.64 0.5 0.35 0.53 0.79 1.0
0.14 0.03 0.01 0.22 0.37 0.17 0.23 0.66 0.37 0.47 0.5 0.3 0.09 0.05 0.07 0.15 0.19 0.08 0.22 0.24 0.26 0.42 0.02 0.18 0.29 0.18 0.25 0.16 1.0 0.63 0.29
0.11 0.15 0.17 0.29 0.77 0.52 0.16 0.13 0.6 0.59 0.68 0.78 0.68 0.33 0.43 0.46 0.47 0.32 0.35 0.48 0.41 0.45 0.34 0.41 0.43 0.5 0.42 0.25 0.71 0.84 1.0
0.37 0.42 0.27 0.2 0.3 0.56 0.82 0.74 0.64 0.61 0.61 0.53 0.45 0.21 0.49 1.0 0.89 0.31 0.7 0.76 0.69 0.66 0.03 0.63 0.75 0.72 0.73 0.55 0.79 0.9 0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)