1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_160 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.15 0.12 0.07 0.17 0.47 0.38 0.24 0.21 0.37 0.34 0.34 0.66 5.48 0.15 0.23 0.51 0.28 1.99 0.27 0.36 0.31 0.28 0.6 0.78 0.57 0.47 0.27 0.37 0.36 0.44 4.36
0.46 0.58 0.71 0.73 1.86 1.39 0.87 0.91 1.46 1.68 2.0 2.73 30.12 1.1 1.37 1.27 1.8 8.54 1.29 1.83 1.31 1.47 1.18 3.28 2.93 1.46 1.02 2.1 1.16 2.57 30.07
1.64 0.89 2.06 2.18 3.98 5.08 2.74 1.63 4.9 5.89 4.7 7.75 118.25 4.01 4.79 4.22 5.43 33.33 3.31 5.04 3.43 3.68 2.17 11.1 10.61 4.11 3.7 4.79 3.14 7.16 115.25
0.16 0.07 0.07 0.07 0.26 0.18 0.11 0.14 0.12 0.22 0.19 0.29 3.03 0.22 0.1 0.13 0.27 0.89 0.08 0.2 0.13 0.23 0.5 0.37 0.39 0.2 0.14 0.15 0.16 0.27 3.62
0.14 0.05 0.05 0.07 0.28 0.1 0.1 0.09 0.18 0.15 0.06 0.29 2.53 0.12 0.11 0.17 0.13 0.74 0.07 0.11 0.13 0.09 0.13 0.27 0.2 0.19 0.15 0.16 0.08 0.22 2.64
1.22 0.95 0.88 1.07 3.92 3.1 1.8 1.41 1.63 2.55 2.52 4.08 25.62 2.92 3.08 2.15 2.5 9.55 1.55 2.92 2.89 2.76 3.21 3.28 3.52 2.58 2.07 3.02 1.94 2.37 23.87
0.08 0.06 0.02 0.03 0.18 0.09 0.08 0.06 0.11 0.12 0.17 0.2 2.18 0.05 0.09 0.09 0.13 0.61 0.04 0.11 0.1 0.06 0.11 0.19 0.14 0.07 0.09 0.12 0.08 0.15 1.94
0.11 0.06 0.1 0.19 0.27 0.52 0.14 0.21 0.15 0.23 0.19 0.48 3.28 0.09 0.58 0.33 0.28 1.27 0.2 0.48 0.47 0.35 0.02 0.62 0.35 0.32 0.26 0.35 0.15 0.18 3.02
0.42 0.2 0.29 0.32 0.66 0.39 0.55 0.4 0.51 0.48 0.58 1.01 7.43 0.43 0.46 0.66 0.62 2.66 0.41 0.49 0.43 0.79 0.32 0.7 0.85 0.42 0.55 0.57 0.55 0.78 8.14
0.49 0.42 0.24 0.31 0.7 0.47 0.48 0.61 0.41 0.57 0.56 0.84 5.71 0.34 0.51 0.6 0.68 1.7 0.49 0.62 0.56 0.5 0.84 0.88 0.81 0.62 0.45 0.72 0.35 0.54 5.92
3.1 2.45 2.18 2.87 7.58 5.87 2.7 2.94 4.49 5.59 4.97 7.57 64.7 3.17 4.71 5.08 6.5 26.71 4.08 5.42 4.61 5.02 2.02 10.39 8.09 5.65 4.48 6.26 4.12 7.37 63.12
0.18 0.14 0.23 0.2 0.59 0.41 0.25 0.29 0.38 0.44 0.44 0.66 6.46 0.48 0.65 0.57 0.56 2.43 0.3 0.51 0.43 0.52 0.87 0.78 0.66 0.48 0.37 0.45 0.35 0.64 6.94
0.9 0.68 0.54 0.86 1.91 1.31 0.75 0.95 1.11 1.34 1.42 2.62 29.52 0.64 1.08 1.45 2.19 7.64 0.83 1.92 1.19 1.46 1.77 3.01 2.9 1.82 1.31 2.52 0.81 1.8 30.3
0.15 0.07 0.1 0.31 0.18 0.17 0.39 0.26 0.73 1.3 0.72 1.99 18.11 0.28 0.42 0.7 1.02 6.2 0.51 1.46 0.8 0.68 0.22 1.09 1.52 0.97 0.62 0.64 0.67 1.76 17.51
0.3 0.13 0.25 0.19 0.51 0.37 0.32 0.3 0.36 0.5 0.36 0.77 7.5 0.16 0.31 0.28 0.53 2.54 0.3 0.53 0.27 0.53 0.45 0.87 0.66 0.49 0.32 0.47 0.29 0.49 8.48
0.38 0.44 0.37 0.41 1.21 0.83 0.61 0.67 0.72 1.1 1.18 1.41 21.9 0.54 0.81 0.94 1.36 8.99 0.68 1.18 0.71 0.76 2.64 2.01 2.17 0.92 0.7 1.03 0.75 1.71 21.16
0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.02 0.01 0.16 1.52 0.0 0.0 0.01 0.03 0.38 0.0 0.05 0.01 0.04 0.04 0.13 0.07 0.04 0.0 0.05 0.01 0.01 1.39
0.18 0.04 0.11 0.1 0.3 0.17 0.09 0.11 0.12 0.18 0.22 0.3 2.8 0.2 0.17 0.18 0.2 0.75 0.11 0.22 0.15 0.22 0.46 0.33 0.39 0.13 0.15 0.27 0.13 0.25 2.35
0.69 0.5 0.42 0.49 1.13 0.92 0.81 0.43 0.65 0.76 0.6 1.31 11.9 0.41 0.58 1.09 1.06 4.49 0.44 0.88 0.47 0.65 0.18 1.48 1.46 0.77 0.79 1.05 0.97 1.17 11.34
0.04 0.01 0.03 0.02 0.13 0.11 0.06 0.04 0.04 0.06 0.05 0.23 1.02 0.05 0.13 0.04 0.1 0.47 0.08 0.12 0.07 0.09 0.03 0.11 0.12 0.06 0.07 0.05 0.06 0.08 1.03
0.88 0.46 0.75 0.73 2.09 1.46 0.78 0.93 1.48 1.78 1.72 2.97 32.86 0.95 1.05 1.51 2.25 14.08 1.14 2.38 1.66 1.99 5.5 4.08 3.18 2.36 1.38 2.42 1.11 2.08 36.43
0.3 0.48 0.24 0.38 0.98 0.82 0.52 0.8 0.64 1.01 1.13 1.63 19.69 0.61 0.62 0.94 1.13 6.5 0.66 1.13 0.55 0.9 0.67 2.68 1.89 1.15 0.6 0.95 0.79 1.33 20.54
0.29 0.33 0.17 0.36 1.01 0.81 0.38 0.46 0.62 0.89 0.97 1.44 15.35 1.22 1.09 0.8 1.11 5.0 0.63 1.18 1.19 0.96 1.23 2.09 1.18 1.1 0.54 0.95 0.96 1.31 17.33
0.18 0.17 0.2 0.09 0.45 0.33 0.15 0.16 0.22 0.27 0.39 0.47 4.32 0.17 0.21 0.24 0.26 1.26 0.19 0.26 0.2 0.26 0.42 0.53 0.52 0.33 0.24 0.49 0.22 0.32 4.1
2.35 1.57 1.38 3.12 5.71 4.98 3.19 3.16 4.94 7.24 5.01 10.48 107.91 2.91 3.83 5.28 6.96 30.62 2.92 6.9 4.27 4.15 11.09 13.19 9.23 5.1 4.44 6.64 4.12 6.96 99.44
0.35 0.28 0.16 0.23 0.51 0.35 0.3 0.31 0.41 0.48 0.61 0.87 8.8 0.2 0.31 0.41 0.73 2.44 0.37 0.61 0.79 0.37 0.45 0.83 0.9 0.53 0.45 0.68 0.31 0.45 8.81
0.17 0.13 0.16 0.08 0.37 0.65 0.28 0.22 0.16 0.21 0.24 0.37 7.02 0.12 0.38 0.47 0.49 2.85 0.14 0.47 0.23 0.28 0.12 0.61 0.6 0.27 0.39 0.49 0.14 0.39 6.52
0.05 0.0 0.02 0.01 0.07 0.04 0.07 0.02 0.06 0.1 0.1 0.17 1.68 0.03 0.04 0.08 0.09 0.47 0.04 0.08 0.05 0.01 0.1 0.14 0.2 0.08 0.08 0.13 0.11 0.17 1.93
0.08 0.04 0.07 0.08 0.34 0.22 0.08 0.16 0.11 0.33 0.21 0.37 3.72 0.14 0.25 0.21 0.36 1.27 0.11 0.21 0.22 0.34 0.43 0.53 0.49 0.27 0.18 0.33 0.19 0.36 4.13
1.04 0.79 0.82 1.18 2.36 1.46 1.15 1.21 1.79 2.2 2.31 4.16 37.3 1.06 1.63 1.96 3.1 11.27 1.18 2.89 2.04 2.05 2.61 4.57 4.43 2.48 1.8 3.06 1.29 2.52 39.59
0.11 0.12 0.07 0.11 0.29 0.25 0.18 0.15 0.13 0.18 0.3 0.26 4.19 0.17 0.28 0.22 0.26 0.67 0.17 0.2 0.22 0.14 0.17 0.31 0.26 0.23 0.15 0.24 0.18 0.37 4.04
2.34 2.64 2.57 2.61 3.01 1.85 2.12 1.92 2.18 2.68 2.77 3.88 35.17 1.62 1.86 2.1 2.75 9.71 1.54 2.57 2.19 2.79 2.34 4.7 3.91 2.76 2.51 3.42 1.92 2.74 34.33
0.29 0.32 0.11 0.31 0.99 0.39 0.42 0.53 1.0 0.97 1.47 1.46 19.76 0.3 0.67 0.89 1.55 7.7 0.75 1.42 0.83 1.24 1.24 2.31 1.92 1.13 0.91 1.26 0.5 1.65 23.44
0.28 0.42 0.32 0.34 0.71 0.92 0.75 0.84 0.48 0.6 0.62 0.81 7.9 0.18 0.59 0.77 0.86 3.57 0.58 0.69 0.48 0.59 0.55 1.5 1.09 0.69 0.59 0.83 0.53 0.88 8.9
0.39 0.94 0.66 1.05 2.41 1.44 1.09 1.15 1.94 2.17 1.8 3.18 42.71 2.47 2.48 2.05 2.41 14.77 1.45 2.25 1.86 2.18 2.03 5.0 4.37 2.83 1.35 2.92 1.7 3.43 47.02
0.07 0.29 0.21 0.35 1.13 0.69 0.31 0.58 1.02 1.29 0.96 2.22 18.13 0.19 0.58 0.91 1.09 7.55 0.49 1.13 0.82 0.95 0.43 2.6 2.0 1.3 0.97 1.54 0.64 1.29 23.04
3.66 1.89 3.5 5.06 13.21 9.77 5.67 6.17 11.14 10.54 10.93 18.49 228.36 3.89 6.46 9.29 12.35 87.04 6.03 13.77 10.03 9.3 3.2 28.75 25.22 11.53 10.94 16.02 7.73 13.76 300.14
0.89 0.59 0.69 0.77 1.63 1.04 0.66 0.89 1.17 1.44 1.32 2.37 24.82 0.55 0.96 1.37 2.04 6.95 0.7 1.89 1.29 1.4 1.59 3.32 2.49 1.62 0.91 2.05 0.77 1.49 26.18
9.1 8.32 7.66 9.65 16.71 14.98 13.12 12.9 12.7 12.36 15.35 16.08 93.75 14.75 15.79 12.3 13.7 39.47 13.26 13.49 13.79 12.26 24.9 19.01 18.78 13.55 13.71 16.77 14.51 15.24 99.64
11.51 13.13 14.69 20.01 36.1 30.05 18.8 27.74 32.73 35.95 35.88 56.04 595.57 46.29 51.9 38.65 42.39 232.26 26.07 44.68 30.38 35.0 103.19 68.15 67.09 36.15 34.46 31.13 33.07 50.78 592.27
13.77 12.82 10.46 15.81 30.29 37.48 28.69 27.5 27.09 32.21 26.71 41.04 371.05 44.56 45.39 31.99 34.2 120.5 19.35 31.98 27.05 29.11 5.04 56.62 49.96 30.05 31.36 34.7 23.03 35.71 412.25
1.25 0.84 0.81 1.45 1.85 1.61 0.99 1.17 2.43 2.22 2.63 3.05 32.67 3.13 2.61 2.02 2.61 9.93 1.28 2.37 1.38 1.4 1.56 4.57 3.06 2.22 1.53 2.26 1.27 3.51 33.97
0.06 0.09 0.12 0.11 0.44 0.41 0.23 0.12 0.21 0.27 0.33 0.4 4.45 0.22 0.18 0.29 0.3 1.77 0.22 0.3 0.25 0.2 0.08 0.51 0.27 0.27 0.29 0.48 0.13 0.31 4.29
0.16 0.17 0.04 0.14 0.47 0.2 0.13 0.18 0.21 0.28 0.32 0.61 5.16 0.14 0.25 0.2 0.33 1.17 0.13 0.34 0.37 0.3 0.1 0.43 0.43 0.41 0.23 0.33 0.18 0.33 5.09
0.93 0.66 0.5 0.64 1.96 1.32 0.85 1.02 1.3 1.59 1.58 2.99 31.49 1.03 1.26 1.65 2.15 8.61 1.15 2.52 1.6 1.6 2.07 3.85 3.02 2.11 1.32 2.38 0.84 2.09 32.47
0.0 0.02 0.04 0.0 0.07 0.09 0.05 0.01 0.1 0.11 0.12 0.26 1.92 0.06 0.02 0.06 0.15 0.84 0.03 0.17 0.05 0.05 0.16 0.22 0.2 0.11 0.02 0.08 0.04 0.25 2.06
0.34 0.6 0.53 0.25 0.83 0.55 0.45 0.43 0.56 0.66 0.63 0.74 5.94 0.63 0.71 0.72 0.71 2.45 0.32 0.7 0.51 0.55 1.12 0.92 0.87 0.47 0.38 0.62 0.53 0.82 6.07
0.05 0.08 0.1 0.1 0.39 0.36 0.17 0.25 0.18 0.19 0.25 0.5 4.89 0.18 0.21 0.27 0.21 1.98 0.07 0.33 0.24 0.18 0.34 0.65 0.48 0.33 0.12 0.42 0.34 0.4 5.02
1.24 1.41 1.42 1.42 3.27 2.96 1.89 2.03 3.71 4.66 4.13 8.15 98.49 1.65 3.21 3.22 4.5 38.11 2.27 5.87 2.87 4.12 3.04 9.25 7.94 3.92 3.03 4.14 2.09 5.17 113.13
0.25 0.35 0.16 0.28 0.56 0.54 0.39 0.32 0.41 0.36 0.54 0.53 5.07 0.67 0.44 0.58 0.86 1.86 0.42 0.59 0.45 0.48 1.05 0.86 0.94 0.59 0.52 0.66 0.55 0.85 5.24
0.06 0.02 0.1 0.03 0.23 0.12 0.12 0.11 0.13 0.11 0.11 0.23 2.48 0.18 0.11 0.2 0.18 0.88 0.15 0.11 0.15 0.15 0.49 0.25 0.2 0.21 0.13 0.3 0.05 0.23 2.44

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)