Heatmap: Cluster_87 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_32861.1 (LecRK-IV.4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_34981.1	0.08	0.08	0.15	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.33	0.05	0.0	0.24	0.0	0.26	0.18	0.24	0.08	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.21	0.41	0.08	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_5041.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_109081.1 (FEI2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_112481.1	0.07	0.3	0.07	0.21	0.34	0.06	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.06	0.22	0.46	0.21	0.01	0.5	0.0	0.16	0.23	0.11	0.06	0.31	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.35	0.0	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_28160.1 (UVSSA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.07	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_70380.1 (HIL1)	0.2	0.12	0.06	0.46	0.08	0.37	0.05	0.18	0.19	0.3	0.46	0.05	0.12	0.17	0.17	0.13	0.32	0.41	0.16	0.09	0.18	0.06	0.15	0.14	0.15	0.29	0.17	0.0	0.42	0.2	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_76201.1 (VC2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04	0.08	0.21	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.05	0.24	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.08	0.0	0.03	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_97200.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.24	0.26	0.12	0.08	0.07	0.0	0.09	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.19	0.06	0.0	0.1	0.07	0.0	0.0	0.0	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_129620.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_2401.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.16	0.18	0.19	0.1	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.24	0.3	0.09	0.0	0.73	0.09	0.0	0.0	0.0	0.61	0.37	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_64901.1 (ALA5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_74580.1 (HNL)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.07
Lsat_1_v5_gn_2_77720.1 (MET2)	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.09	0.17	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.13	0.05	0.0	0.02	0.08	0.12	0.06	0.02	0.05	0.03	0.04	0.02	0.15	0.05	0.0	0.13	0.02	0.26
Lsat_1_v5_gn_2_92080.1 (RPOA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_137921.1 (TPR3)	0.11	0.0	0.0	0.15	0.1	0.04	0.0	0.13	0.16	0.0	0.15	0.04	0.0	0.11	0.0	0.0	0.16	0.0	0.16	0.15	0.11	0.0	0.12	0.0	0.12	0.0	0.1	0.13	0.38	0.05	0.08
Lsat_1_v5_gn_3_36780.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_112601.1 (SOT7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_28220.1	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.73	0.01	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.68	0.0	0.15	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.43	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_40720.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_53361.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.19	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_130560.1 (RABG3c)	0.04	0.0	0.03	0.0	0.0	0.1	0.03	0.0	0.07	0.08	0.2	0.15	0.23	0.09	0.03	0.11	0.05	0.09	0.07	0.1	0.02	0.0	0.11	0.1	0.0	0.04	0.0	0.1	0.24	0.14	0.34
Lsat_1_v5_gn_5_1361.1 (ARF16)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_139640.1 (MOS7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_149700.1 (IEF)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_191400.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_21081.1 (TPS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_3681.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.03	0.0	0.08	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_77300.1 (SMU2)	0.0	0.0	0.55	0.69	0.97	0.82	0.0	1.01	1.14	0.17	0.73	0.77	0.39	0.42	0.4	0.0	1.03	0.0	0.0	0.33	0.96	0.0	0.0	0.16	0.34	0.35	0.99	0.66	0.72	0.99	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_84821.1 (ERF1-2)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.02	0.0	0.09	0.07	0.16	0.0	0.06	0.04	0.0	0.07	0.05	0.09	0.04	0.08	0.02	0.0	0.05	0.06	0.02	0.08	0.0	0.08	0.02	0.07	0.04	0.09
Lsat_1_v5_gn_5_87481.1 (FEI1)	0.0	0.04	0.0	0.0	0.06	0.0	0.23	0.04	0.07	0.0	0.0	0.04	0.0	0.09	0.08	0.0	0.03	0.09	0.2	0.0	0.0	0.13	0.0	0.07	0.0	0.06	0.04	0.03	0.1	0.0	0.15
Lsat_1_v5_gn_5_99060.1 (PAM16L)	0.0	0.1	0.11	0.06	0.07	0.06	0.01	0.08	0.17	0.03	0.11	0.05	0.0	0.14	0.16	0.04	0.07	0.0	0.04	0.11	0.1	0.07	0.06	0.0	0.03	0.07	0.03	0.09	0.06	0.16	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_107740.1 (CNA)	1.26	1.9	1.63	1.42	3.16	2.11	0.61	0.16	0.22	4.26	0.59	3.56	3.61	5.58	4.55	0.55	2.31	1.36	1.13	4.58	0.54	0.84	4.94	1.33	0.94	6.03	1.76	1.32	6.72	4.11	8.71
Lsat_1_v5_gn_6_115341.1 (TMN11)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_14921.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.11	0.07	0.11	0.1	0.07	0.03	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.12	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.06	0.11	0.06
Lsat_1_v5_gn_6_40160.1 (PIP5K7)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.16	0.03	0.03	0.0	0.0	0.25	0.13	0.09	0.07	0.11	0.0	0.0	0.1	0.1	0.0	0.06	0.0	0.03	0.17	0.19	0.06	0.16	0.0	0.0	0.31	0.12	0.42
Lsat_1_v5_gn_6_57441.1	0.0	0.67	0.34	0.0	0.0	0.88	1.15	0.55	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.97	0.34	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.45	0.0	0.0	0.37	0.0	0.29	0.57	1.77
Lsat_1_v5_gn_6_85640.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_12640.1	0.04	0.06	0.03	0.03	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.05	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.0	0.06	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.0	0.05	0.01	0.02	0.11	0.09
Lsat_1_v5_gn_7_22820.1	0.35	0.23	0.34	0.11	0.53	0.72	0.89	0.3	0.89	1.0	0.24	0.11	0.59	0.79	0.5	0.55	0.61	0.0	0.42	0.2	0.1	0.35	0.6	0.5	0.73	0.09	0.49	0.27	0.21	1.16	0.45
Lsat_1_v5_gn_7_29700.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.33	0.0	0.0	0.99	0.0	0.32	0.0	0.0	1.24	0.3	0.0	0.0	0.31	0.63	0.0	0.0	1.29	0.0	0.0	0.0	0.0	1.06	0.62	1.29
Lsat_1_v5_gn_7_56560.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_78700.1	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_87221.1 (GLDP2)	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
Lsat_1_v5_gn_7_9780.1	0.19	0.1	0.0	0.37	0.6	0.0	0.18	0.0	0.16	0.58	0.09	0.81	0.56	0.55	0.38	0.1	0.08	0.08	0.53	0.0	0.15	0.0	0.0	0.32	0.0	0.08	0.0	0.17	0.08	0.16	0.12
Lsat_1_v5_gn_8_105080.1 (SNC4)	0.19	0.06	0.22	0.07	0.09	0.04	0.11	0.14	0.05	0.11	0.15	0.14	0.09	0.1	0.23	0.15	0.04	0.18	0.08	0.07	0.05	0.13	0.13	0.04	0.03	0.03	0.1	0.12	0.17	0.16	0.02
Lsat_1_v5_gn_8_110681.1 (LAF3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_15520.1 (MRL7-L)	0.0	0.03	0.0	0.1	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.09	0.05	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.02	0.05	0.0	0.0	0.04
Lsat_1_v5_gn_8_29581.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	0.03	0.04	0.15	0.13	0.0	0.06	0.04	0.0	0.05	0.02	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.1	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_8_35301.1	3.1	0.51	1.46	2.32	2.97	1.41	0.79	1.57	0.61	1.28	3.91	3.14	1.0	2.93	1.98	1.72	0.7	0.38	0.0	2.63	2.21	0.0	1.77	3.11	0.0	0.42	2.31	0.0	4.55	3.46	2.37
Lsat_1_v5_gn_8_70761.1	0.0	0.0	0.08	0.08	0.0	0.22	0.29	0.0	0.45	0.58	0.0	0.07	0.0	0.0	0.33	0.0	0.16	0.0	0.06	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.29	0.25	0.29	0.25	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_123340.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_31461.1 (RLK1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_35760.1 (FtsHi5)	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.08	0.0	0.05	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.12	0.0	0.0	0.09	0.03	0.04
Lsat_1_v5_gn_9_35960.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_85781.1	0.05	0.11	0.17	0.05	0.65	0.3	0.0	0.12	0.0	0.34	0.2	0.17	0.61	0.88	0.7	0.06	0.29	0.59	0.34	0.32	0.15	0.0	0.42	0.16	0.01	0.36	0.44	0.08	0.62	0.58	0.97

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)