1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_272 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000011 (LL2)
 0.36 0.35 0.42 0.22 0.65 0.51 0.29 0.28 0.26 0.38 0.29 0.23 1.0 0.68 0.71 0.63 0.56 0.79 0.4 0.42 0.37 0.4 0.57 0.35 0.38 0.19 0.31 0.4 0.28 0.25 0.41
Bra000429 (DAG2)
 0.24 0.15 0.13 0.14 0.59 0.37 0.22 0.19 0.31 0.28 0.27 0.23 1.0 0.77 0.5 0.43 0.39 0.83 0.32 0.29 0.36 0.27 0.5 0.34 0.35 0.61 0.21 0.36 0.29 0.33 0.46
0.25 0.13 0.28 0.15 0.29 0.37 0.41 0.39 0.64 0.43 0.49 0.32 0.92 0.75 0.74 0.78 0.47 0.47 0.51 0.32 0.44 0.34 1.0 0.57 0.52 0.41 0.37 0.29 0.42 0.25 0.47
0.32 0.24 0.12 0.12 0.31 0.51 0.25 0.16 0.17 0.25 0.18 0.24 0.87 0.84 0.55 0.28 0.37 1.0 0.28 0.15 0.24 0.22 0.66 0.18 0.28 0.53 0.2 0.18 0.15 0.14 0.2
Bra005398 (PHB)
 0.21 0.15 0.27 0.22 0.48 0.42 0.43 0.4 0.42 0.45 0.53 0.45 1.0 0.78 0.73 0.59 0.43 0.73 0.57 0.42 0.34 0.35 0.84 0.41 0.49 0.41 0.35 0.34 0.29 0.31 0.38
Bra006140 (MSL10)
 0.18 0.09 0.1 0.12 0.75 0.65 0.58 0.52 0.75 0.53 0.53 0.52 0.9 0.89 1.0 0.91 0.56 0.76 0.56 0.58 0.56 0.63 0.46 0.38 0.45 0.28 0.38 0.41 0.46 0.32 0.54
Bra006557 (Phox3)
 0.32 0.21 0.31 0.33 0.61 0.73 0.69 0.65 0.5 0.55 0.49 0.46 0.84 0.78 0.8 1.0 0.96 0.74 0.63 0.79 0.69 0.65 0.89 0.66 0.66 0.52 0.66 0.57 0.63 0.53 0.74
0.4 0.42 0.41 0.36 0.71 0.72 0.54 0.46 0.56 0.58 0.59 0.58 0.82 0.89 0.81 0.75 0.68 1.0 0.69 0.7 0.6 0.63 0.7 0.65 0.67 0.55 0.64 0.65 0.67 0.53 0.69
Bra007742 (TRM5)
 0.01 0.1 0.04 0.04 0.23 0.27 0.18 0.15 0.27 0.13 0.13 0.2 1.0 0.68 0.57 0.38 0.3 0.84 0.22 0.25 0.19 0.22 0.38 0.17 0.19 0.22 0.16 0.18 0.17 0.14 0.13
Bra008185 (HB33)
 0.15 0.08 0.2 0.07 0.31 0.31 0.25 0.28 0.37 0.23 0.26 0.23 0.98 0.57 0.55 0.64 0.29 1.0 0.28 0.26 0.23 0.21 0.53 0.17 0.12 0.11 0.14 0.14 0.18 0.14 0.22
Bra008386 (VP2)
 0.5 0.51 0.48 0.44 0.82 0.76 0.52 0.56 0.52 0.61 0.52 0.49 0.75 0.85 0.81 0.78 0.74 1.0 0.63 0.65 0.52 0.67 0.74 0.56 0.57 0.53 0.63 0.52 0.57 0.59 0.7
Bra008638 (CSLA11)
 0.13 0.07 0.04 0.08 0.46 0.57 0.3 0.31 0.4 0.46 0.44 0.28 1.0 0.62 0.88 0.68 0.53 0.77 0.5 0.53 0.34 0.44 0.54 0.29 0.29 0.26 0.21 0.23 0.2 0.24 0.27
Bra009655 (HSK)
 0.44 0.46 0.52 0.55 0.74 0.75 0.73 0.66 0.58 0.55 0.53 0.58 0.86 0.84 0.89 0.93 0.76 0.8 0.65 0.76 0.68 0.74 1.0 0.56 0.6 0.35 0.5 0.4 0.43 0.48 0.6
0.44 0.44 0.46 0.36 0.64 0.71 0.48 0.56 0.59 0.56 0.53 0.53 0.57 1.0 0.9 0.75 0.83 0.83 0.56 0.57 0.51 0.57 0.88 0.62 0.49 0.42 0.59 0.57 0.66 0.63 0.77
0.22 0.22 0.24 0.21 0.5 0.84 0.55 0.36 0.34 0.44 0.41 0.3 0.95 0.76 0.96 1.0 0.95 0.59 0.46 0.79 0.65 0.53 0.56 0.61 0.57 0.42 0.5 0.39 0.34 0.25 0.55
Bra010485 (HB22)
 0.08 0.12 0.13 0.07 0.64 0.81 0.52 0.43 0.27 0.32 0.3 0.3 1.0 0.97 0.98 0.82 0.67 0.56 0.49 0.55 0.61 0.37 0.15 0.44 0.36 0.14 0.35 0.26 0.31 0.21 0.66
Bra010668 (ACINUS)
 0.52 0.46 0.46 0.41 0.69 0.72 0.61 0.6 0.53 0.57 0.58 0.56 0.79 0.87 1.0 0.85 0.77 0.89 0.61 0.68 0.6 0.62 0.72 0.5 0.55 0.52 0.57 0.52 0.52 0.53 0.68
0.47 0.47 0.46 0.35 0.6 0.43 0.44 0.47 0.55 0.57 0.51 0.55 0.62 0.69 0.67 0.68 0.59 1.0 0.76 0.58 0.51 0.5 0.68 0.6 0.54 0.44 0.62 0.54 0.54 0.61 0.63
Bra011082 (PAP2)
 0.18 0.13 0.2 0.13 0.65 0.63 0.35 0.25 0.48 0.5 0.45 0.32 1.0 0.75 0.9 0.78 0.52 0.79 0.58 0.56 0.53 0.43 0.69 0.45 0.44 0.36 0.35 0.32 0.42 0.25 0.31
Bra013167 (CAS1)
 0.38 0.35 0.39 0.41 0.74 0.78 0.63 0.71 0.74 0.73 0.72 0.68 0.81 1.0 0.92 0.91 0.77 0.74 0.85 0.7 0.67 0.8 0.42 0.62 0.64 0.57 0.64 0.61 0.57 0.59 0.73
Bra013207 (mTERF32)
 0.31 0.33 0.24 0.22 0.66 0.76 0.58 0.66 0.38 0.36 0.37 0.43 0.74 1.0 0.94 0.62 0.68 0.9 0.47 0.65 0.53 0.57 0.37 0.41 0.38 0.28 0.31 0.31 0.38 0.31 0.44
Bra016172 (WDL7)
 0.12 0.09 0.18 0.15 0.41 0.26 0.23 0.1 0.34 0.34 0.33 0.36 1.0 0.8 0.59 0.49 0.33 0.93 0.26 0.31 0.34 0.38 0.83 0.34 0.38 0.35 0.28 0.29 0.22 0.16 0.19
0.49 0.53 0.44 0.37 0.84 0.71 0.46 0.49 0.42 0.47 0.42 0.44 0.69 0.67 0.76 0.63 0.6 1.0 0.51 0.5 0.48 0.47 0.53 0.39 0.44 0.49 0.51 0.47 0.48 0.62 0.66
Bra016865 (LSH10)
 0.05 0.09 0.12 0.09 0.22 0.24 0.28 0.09 0.6 0.52 0.66 0.36 1.0 0.91 0.8 0.72 0.41 0.87 0.52 0.52 0.42 0.32 0.74 0.27 0.36 0.22 0.22 0.19 0.24 0.16 0.18
Bra016916 (PXC3)
 0.31 0.21 0.25 0.18 0.46 0.35 0.27 0.24 0.32 0.4 0.39 0.34 0.73 0.63 1.0 0.69 0.57 0.73 0.58 0.51 0.39 0.37 0.44 0.28 0.25 0.17 0.27 0.22 0.21 0.17 0.27
Bra017140 (OPL2)
 0.14 0.08 0.09 0.06 0.46 0.3 0.17 0.14 0.31 0.27 0.27 0.36 1.0 0.85 0.73 0.49 0.28 0.9 0.19 0.23 0.21 0.32 0.74 0.22 0.33 0.26 0.34 0.27 0.28 0.42 0.48
Bra017384 (QUL2)
 0.32 0.35 0.29 0.31 0.63 0.5 0.41 0.43 0.36 0.68 0.49 0.5 0.75 0.48 0.64 0.67 0.63 1.0 0.5 0.47 0.47 0.41 0.6 0.46 0.43 0.42 0.38 0.47 0.4 0.43 0.41
Bra018677 (CS1)
 0.14 0.15 0.09 0.1 0.68 0.73 0.53 0.68 0.4 0.35 0.33 0.31 1.0 0.77 0.98 0.93 0.75 0.65 0.54 0.5 0.5 0.37 0.72 0.53 0.51 0.42 0.45 0.32 0.4 0.42 0.51
Bra020116 (AGG3)
 0.09 0.33 0.14 0.13 0.25 0.2 0.23 0.04 0.23 0.24 0.21 0.21 1.0 0.58 0.44 0.37 0.15 0.74 0.19 0.14 0.23 0.2 0.71 0.4 0.16 0.26 0.21 0.23 0.23 0.23 0.26
Bra020928 (BAM3)
 0.4 0.37 0.36 0.28 0.62 0.47 0.35 0.31 0.39 0.42 0.38 0.4 0.73 0.7 0.57 0.71 0.62 1.0 0.55 0.37 0.41 0.32 0.52 0.38 0.39 0.26 0.35 0.41 0.41 0.45 0.51
Bra021619 (MCAT)
 0.46 0.46 0.69 0.45 0.74 0.71 0.71 0.76 0.6 0.59 0.57 0.53 0.89 0.89 0.87 0.85 0.85 1.0 0.75 0.61 0.74 0.68 0.52 0.48 0.53 0.52 0.62 0.53 0.48 0.51 0.65
Bra024245 (HDH)
 0.52 0.56 0.54 0.6 0.65 0.92 0.84 0.84 0.66 0.8 0.69 0.75 0.81 0.85 1.0 0.88 0.92 0.87 0.93 0.76 0.76 0.83 0.96 0.79 0.83 0.67 0.77 0.76 0.67 0.71 0.82
0.39 0.36 0.38 0.37 0.72 0.77 0.72 0.76 0.61 0.64 0.58 0.63 1.0 0.94 0.89 0.96 0.92 0.89 0.61 0.75 0.69 0.75 0.73 0.65 0.64 0.53 0.62 0.52 0.6 0.51 0.69
0.23 0.22 0.38 0.26 0.45 0.33 0.18 0.23 0.3 0.37 0.2 0.22 1.0 0.6 0.62 0.52 0.38 0.66 0.25 0.28 0.24 0.31 0.51 0.28 0.26 0.47 0.27 0.16 0.25 0.23 0.24
Bra025114 (QUL2)
 0.53 0.57 0.57 0.45 1.0 0.75 0.46 0.49 0.57 0.4 0.42 0.49 0.91 0.9 0.86 0.7 0.6 0.86 0.6 0.56 0.5 0.53 0.74 0.54 0.59 0.58 0.52 0.58 0.51 0.53 0.56
Bra025711 (COQ9)
 0.32 0.23 0.25 0.21 0.64 0.89 0.55 0.45 0.53 0.48 0.54 0.46 0.76 0.99 1.0 0.79 0.68 0.68 0.67 0.67 0.64 0.64 0.65 0.42 0.42 0.35 0.36 0.34 0.33 0.23 0.34
Bra026522 (LAG1)
 0.39 0.33 0.37 0.34 0.77 0.71 0.74 0.89 0.48 0.53 0.52 0.57 0.98 0.75 0.74 0.78 0.76 0.76 0.51 0.6 0.64 0.72 1.0 0.64 0.65 0.46 0.64 0.53 0.56 0.53 0.73
Bra026577 (ARPN)
 0.01 0.02 0.01 0.0 0.17 0.05 0.04 0.01 0.15 0.17 0.17 0.11 1.0 0.61 0.28 0.3 0.18 0.87 0.13 0.09 0.11 0.08 0.6 0.05 0.07 0.03 0.04 0.06 0.04 0.05 0.09
0.05 0.01 0.31 0.23 0.2 0.15 0.11 0.21 0.14 0.24 0.19 0.21 1.0 0.59 0.32 0.32 0.38 0.87 0.2 0.15 0.12 0.15 0.41 0.05 0.04 0.04 0.02 0.05 0.07 0.09 0.13
Bra027374 (LSM1B)
 0.57 0.47 0.28 0.3 0.6 0.76 0.44 0.48 0.77 0.57 0.59 0.59 0.92 1.0 0.96 0.69 0.64 0.79 0.62 0.66 0.63 0.75 0.81 0.45 0.49 0.37 0.49 0.44 0.47 0.49 0.58
0.52 0.64 0.46 0.49 0.75 0.84 0.79 0.78 0.64 0.72 0.67 0.64 0.88 0.81 0.96 1.0 0.99 0.71 0.79 0.8 0.73 0.75 0.77 0.8 0.77 0.66 0.82 0.74 0.68 0.73 0.9
Bra028313 (OVA6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.13 0.14 0.14 0.35 0.52 0.52 0.28 0.72 0.73 0.62 0.67 0.07 0.53 0.46 0.22 0.3 0.18 1.0 0.35 0.46 0.28 0.24 0.18 0.34 0.18 0.21
Bra029309 (TSN2)
 0.51 0.45 0.42 0.35 0.8 0.82 0.6 0.77 0.7 0.64 0.62 0.6 0.84 1.0 0.96 0.86 0.84 0.87 0.7 0.66 0.67 0.71 0.81 0.71 0.66 0.48 0.68 0.57 0.57 0.57 0.82
Bra030023 (CLM)
 0.3 0.17 0.16 0.17 0.49 0.42 0.49 0.5 0.4 0.37 0.38 0.31 0.92 0.77 0.83 0.59 0.57 1.0 0.46 0.44 0.38 0.44 0.65 0.38 0.34 0.32 0.32 0.3 0.35 0.38 0.58
Bra030745 (HTA5)
 0.07 0.11 0.12 0.11 0.53 0.62 0.49 0.48 0.34 0.37 0.37 0.28 0.83 0.71 1.0 0.53 0.5 0.57 0.57 0.43 0.51 0.45 0.75 0.41 0.39 0.2 0.31 0.28 0.23 0.12 0.2
0.28 0.24 0.24 0.25 0.69 0.58 0.61 0.6 0.64 0.63 0.58 0.57 0.94 1.0 0.92 0.88 0.7 0.86 0.72 0.76 0.53 0.76 0.69 0.52 0.55 0.32 0.49 0.46 0.44 0.42 0.41
0.12 0.08 0.11 0.1 0.74 0.66 0.58 0.48 0.52 0.62 0.56 0.42 0.84 0.89 0.84 1.0 0.7 0.53 0.58 0.65 0.57 0.56 0.32 0.44 0.4 0.27 0.36 0.31 0.35 0.29 0.45
Bra032006 (EXP13)
 0.16 0.13 0.17 0.06 0.33 0.34 0.33 0.37 0.39 0.49 0.43 0.46 0.65 0.66 0.64 0.59 0.51 0.8 0.56 0.5 0.44 0.38 1.0 0.46 0.45 0.41 0.43 0.25 0.25 0.2 0.29
Bra032687 (FATA2)
 0.37 0.39 0.41 0.33 0.72 0.8 0.53 0.7 0.39 0.5 0.48 0.43 1.0 0.98 0.94 0.89 0.78 0.9 0.46 0.67 0.62 0.58 0.64 0.49 0.48 0.45 0.5 0.42 0.44 0.43 0.66
Bra033741 (PHT4;6)
 0.26 0.24 0.38 0.28 0.67 0.56 0.49 0.55 0.38 0.62 0.4 0.48 0.77 0.91 0.82 0.88 0.7 0.96 0.57 0.59 0.52 0.47 1.0 0.48 0.59 0.37 0.6 0.47 0.56 0.52 0.56
Bra034531 (MYB3R1)
 0.25 0.31 0.29 0.22 0.69 0.74 0.78 0.85 0.43 0.61 0.54 0.51 0.78 0.82 0.87 1.0 0.95 0.61 0.55 0.68 0.62 0.78 0.49 0.47 0.51 0.43 0.56 0.41 0.39 0.46 0.51
0.43 0.55 0.59 0.41 0.82 0.73 0.59 0.82 0.52 0.49 0.55 0.56 0.7 0.94 0.95 0.69 0.62 1.0 0.54 0.61 0.59 0.59 0.42 0.58 0.57 0.48 0.52 0.52 0.53 0.44 0.58
Bra036313 (AtSEC23A)
 0.57 0.65 0.63 0.59 0.87 0.85 0.62 0.65 0.65 0.75 0.68 0.72 0.77 0.93 1.0 0.88 0.86 0.91 0.71 0.7 0.64 0.72 0.86 0.69 0.7 0.62 0.71 0.56 0.73 0.79 0.85
Bra036319 (ABC1)
 0.33 0.41 0.48 0.32 0.65 0.76 0.86 0.84 0.39 0.51 0.47 0.48 0.86 0.88 0.9 0.89 0.74 1.0 0.58 0.68 0.61 0.65 0.97 0.51 0.59 0.53 0.59 0.52 0.43 0.43 0.77
Bra037631 (PAX)
 0.14 0.11 0.15 0.13 0.61 0.42 0.19 0.15 0.22 0.35 0.28 0.18 1.0 0.86 0.68 0.67 0.48 0.87 0.51 0.54 0.37 0.36 0.56 0.28 0.28 0.27 0.37 0.23 0.23 0.18 0.25
Bra038518 (CYCD2;1)
 0.24 0.31 0.29 0.21 0.59 0.68 0.67 0.74 0.48 0.49 0.51 0.37 0.79 0.83 0.85 0.7 0.68 0.63 0.49 0.54 0.7 0.61 1.0 0.65 0.59 0.42 0.58 0.33 0.39 0.4 0.49
0.03 0.07 0.18 0.03 0.53 0.41 0.31 0.24 0.41 0.41 0.4 0.4 0.63 0.69 0.86 0.71 0.52 0.66 0.39 0.53 0.42 0.31 1.0 0.47 0.44 0.46 0.46 0.35 0.4 0.26 0.29
Bra039089 (Cyc1-1)
 0.37 0.44 0.37 0.41 0.73 0.8 0.82 0.76 0.5 0.53 0.52 0.49 0.69 0.82 0.94 0.74 0.74 0.72 0.6 0.62 0.61 0.5 1.0 0.52 0.49 0.42 0.49 0.47 0.48 0.39 0.45
Bra039263 (CRK3)
 0.39 0.54 0.48 0.34 0.73 0.7 0.51 0.62 0.51 0.54 0.43 0.49 0.66 0.78 0.87 0.62 0.56 1.0 0.5 0.47 0.46 0.45 0.68 0.55 0.59 0.72 0.62 0.58 0.54 0.51 0.7
0.17 0.09 0.1 0.09 0.57 0.58 0.23 0.3 0.31 0.28 0.28 0.2 0.65 0.98 1.0 0.46 0.37 0.66 0.41 0.31 0.43 0.34 0.86 0.44 0.29 0.24 0.14 0.3 0.23 0.21 0.28
0.45 0.43 0.51 0.4 0.73 0.95 0.81 0.78 0.48 0.58 0.57 0.54 0.85 0.9 0.86 1.0 0.94 0.68 0.6 0.84 0.82 0.89 0.67 0.63 0.59 0.5 0.66 0.55 0.54 0.51 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)