Heatmap: Cluster_219 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_105761.1 (TWD1)	-0.55	-0.4	-0.58	-0.64	0.59	0.45	-0.12	0.18	-0.43	-0.4	-0.34	-0.46	0.09	0.72	0.5	-0.12	-0.26	0.07	0.19	-0.54	-0.31	-0.19	0.91	-0.4	-0.39	-0.31	-0.29	-0.53	0.37	0.32	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_12240.1 (HAM2)	-0.53	-0.63	-0.87	-0.44	0.29	0.24	-0.2	0.03	-0.33	-0.26	-0.13	-0.2	0.14	0.89	0.67	0.06	-0.21	0.24	-0.06	-0.29	-0.29	-0.18	0.71	-0.36	-0.31	-0.18	-0.31	-0.37	0.25	0.19	0.61
Lsat_1_v5_gn_1_2200.1 (SACL2)	-1.88	-1.54	-1.57	-0.66	0.34	0.44	-0.06	0.03	-0.14	-0.15	-0.18	-0.26	0.02	0.71	0.64	0.12	-0.14	-0.07	0.06	-0.32	-0.16	-0.14	1.07	-0.25	-0.19	-0.11	0.03	-0.61	0.22	0.12	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_54260.1 (MDF)	-0.37	-0.37	-0.51	-0.35	0.21	0.24	0.01	0.22	-0.35	-0.36	-0.18	-0.3	0.22	0.58	0.31	-0.06	-0.22	0.08	-0.12	-0.33	-0.25	-0.06	0.89	-0.27	-0.13	-0.1	-0.05	-0.38	0.09	0.11	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_55940.1 (FC1)	-0.53	-0.37	-0.31	-0.28	0.24	0.43	-0.13	-0.02	-0.33	-0.2	-0.29	-0.28	-0.11	0.68	0.49	0.18	-0.1	-0.08	-0.03	-0.25	-0.16	-0.17	0.44	-0.17	-0.15	-0.13	-0.16	-0.38	0.37	0.26	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_62081.1 (HDA9)	-0.84	-0.61	-0.71	-0.65	0.45	0.45	-0.32	0.04	-0.38	-0.38	-0.21	-0.48	0.31	0.87	0.57	-0.19	-0.43	0.15	-0.09	-0.31	-0.26	-0.2	0.82	-0.17	-0.13	0.0	-0.31	-0.42	0.23	0.22	0.72
Lsat_1_v5_gn_1_83221.1 (EIF3B)	-1.4	-0.75	-0.81	-0.78	0.17	0.28	-0.29	-0.12	-0.47	-0.54	-0.22	-0.38	0.09	0.96	0.54	0.12	-0.1	0.08	-0.12	-0.56	-0.43	-0.26	1.25	-0.35	-0.31	-0.25	-0.35	-1.34	0.53	0.62	1.07
Lsat_1_v5_gn_2_102201.1 (UBP12)	-0.5	-0.28	-0.82	-0.72	0.3	0.31	-0.06	0.03	-0.46	-0.35	-0.25	-0.28	0.18	0.66	0.46	0.04	-0.16	0.18	0.06	-0.36	-0.3	-0.17	0.92	-0.31	-0.27	-0.19	-0.18	-0.2	0.28	0.2	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_106300.1	-0.71	-0.67	-1.11	-0.82	0.15	0.19	-0.18	0.1	-0.24	-0.36	-0.16	-0.33	0.22	0.88	0.48	-0.08	-0.3	0.34	-0.18	-0.49	-0.39	0.03	1.12	-0.35	-0.32	-0.14	-0.17	-0.53	0.2	0.24	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_113200.1 (RZ-1c)	-0.7	-0.57	-0.59	-0.37	0.3	0.36	-0.09	0.08	-0.28	-0.25	-0.3	-0.36	0.14	0.82	0.72	0.15	-0.11	0.47	-0.1	-0.45	-0.28	-0.15	0.88	-0.37	-0.4	-0.12	-0.24	-0.63	0.06	0.02	0.42
Lsat_1_v5_gn_2_18260.1 (MBS2)	-0.65	-0.53	-0.63	-0.46	0.23	0.28	-0.05	-0.1	-0.21	-0.19	-0.2	-0.26	0.22	0.88	0.57	0.17	0.05	0.14	-0.22	-0.25	-0.17	-0.16	0.71	-0.23	-0.27	-0.3	-0.21	-0.38	0.15	0.12	0.44
Lsat_1_v5_gn_2_31440.1 (TGA2)	-0.69	-0.43	-0.5	-0.38	0.5	0.4	-0.21	0.11	-0.38	-0.39	-0.22	-0.5	0.09	0.98	0.77	-0.01	-0.31	-0.04	0.05	-0.39	-0.37	-0.27	0.75	-0.36	-0.25	-0.14	-0.25	-0.56	0.35	0.27	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_49140.1	-0.6	-0.6	-0.81	-0.92	0.05	0.37	-0.18	-0.13	-0.37	-0.38	-0.08	-0.22	0.3	0.87	0.64	-0.05	0.04	-0.06	-0.06	-0.31	-0.22	-0.15	0.77	-0.33	-0.29	-0.1	-0.15	-0.26	0.32	0.22	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_6000.1 (BSK1)	-0.55	-0.55	-0.42	-0.58	-0.04	0.1	-0.09	-0.04	-0.32	-0.35	-0.18	-0.25	0.18	0.66	0.32	0.17	-0.04	0.28	-0.05	-0.19	-0.1	-0.11	0.86	-0.19	-0.07	-0.01	-0.11	-0.3	0.14	0.11	0.49
Lsat_1_v5_gn_2_64920.1 (HST)	-0.37	-0.26	-0.46	-0.35	0.34	0.22	-0.14	-0.12	-0.32	-0.23	-0.21	-0.25	0.23	0.72	0.5	-0.05	-0.21	-0.12	-0.24	-0.34	-0.32	-0.2	0.88	-0.3	-0.3	-0.22	-0.2	-0.37	0.2	0.22	0.76
Lsat_1_v5_gn_2_86020.1 (WIT1)	-0.57	-0.54	-0.43	-0.24	0.34	0.37	-0.08	-0.09	-0.34	-0.21	-0.2	-0.25	0.06	0.68	0.48	0.08	-0.21	-0.13	0.24	-0.27	-0.26	-0.17	0.65	-0.24	-0.3	-0.16	-0.3	-0.42	0.28	0.27	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_91520.1	-0.58	-0.54	-0.79	-0.63	0.19	0.3	0.01	0.08	-0.25	-0.27	-0.12	-0.23	0.24	0.76	0.51	0.08	-0.07	0.12	-0.08	-0.34	-0.35	-0.18	0.57	-0.33	-0.22	-0.11	-0.09	-0.18	0.2	0.32	0.55
Lsat_1_v5_gn_2_95681.1 (AGC1-9)	-1.0	-0.95	-1.18	-1.08	0.26	0.63	-0.13	-0.16	-0.37	-0.58	-0.24	-0.76	-0.2	1.08	0.6	0.15	-0.14	0.21	0.17	-0.46	-0.25	-0.33	1.06	-0.25	-0.05	-0.24	-0.17	-0.68	0.37	0.39	0.68
Lsat_1_v5_gn_3_107981.1 (CHR4)	-0.77	-0.57	-1.05	-0.83	-0.04	0.1	-0.05	0.03	-0.28	-0.29	-0.24	-0.21	0.29	0.75	0.46	0.13	-0.06	0.04	0.02	-0.29	-0.3	-0.13	1.09	-0.22	-0.25	-0.12	-0.19	-0.46	0.28	0.26	0.69
Lsat_1_v5_gn_3_11980.1 (CSLG3)	-1.67	-1.42	-1.52	-0.96	0.55	0.75	-0.32	-0.4	-0.42	-0.3	-0.19	-0.32	-0.45	0.75	0.79	0.23	-0.11	0.23	0.09	-0.3	-0.3	-0.15	1.22	-0.2	-0.27	-0.06	-0.03	-0.54	0.19	0.2	0.64
Lsat_1_v5_gn_3_135080.1 (mCSF1)	-1.2	-0.74	-1.52	-1.06	0.22	0.28	-0.12	0.0	-0.4	-0.47	-0.3	-0.62	0.17	1.24	0.78	-0.18	-0.23	0.04	-0.02	-0.55	-0.46	-0.34	1.25	-0.42	-0.02	-0.21	-0.45	-0.4	0.23	0.2	0.96
Lsat_1_v5_gn_3_25981.1 (ELF3)	-0.9	-0.5	-0.81	-1.05	0.38	0.51	-0.03	0.44	-0.46	-0.54	-0.32	-0.36	-0.08	0.99	0.61	0.03	-0.38	0.66	0.01	-0.5	-0.45	-0.21	1.12	-0.38	-0.29	-0.25	-0.16	-0.48	0.15	0.01	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_29581.1	-0.85	-1.11	-0.87	-0.27	0.44	0.37	0.01	-0.28	-0.26	-0.34	-0.09	-0.12	-0.07	0.58	0.54	-0.13	-0.24	0.32	0.21	-0.25	-0.27	-0.28	0.84	-0.31	-0.15	-0.2	-0.03	-0.15	0.22	0.29	0.52
Lsat_1_v5_gn_3_62021.1	-0.28	-0.34	-0.44	-0.29	0.19	0.45	0.06	0.11	-0.35	-0.38	-0.41	-0.24	-0.04	0.77	0.53	0.02	-0.09	-0.16	0.1	-0.27	-0.2	-0.12	0.65	-0.26	-0.26	-0.16	-0.19	-0.37	0.22	0.17	0.36
Lsat_1_v5_gn_4_145960.1 (TRM4g)	-1.0	-0.97	-1.04	-0.37	0.31	0.29	-0.16	-0.15	-0.37	-0.15	-0.07	0.03	0.11	0.66	0.45	-0.25	-0.21	0.23	0.16	-0.22	-0.32	-0.18	0.79	-0.05	-0.11	-0.06	-0.22	-0.3	0.34	0.12	0.72
Lsat_1_v5_gn_4_146300.1 (CHR5)	-0.34	-0.19	-0.52	-0.2	0.2	0.1	-0.02	0.07	-0.2	-0.3	-0.09	-0.19	0.01	0.58	0.41	0.03	-0.23	0.25	-0.15	-0.29	-0.28	-0.18	0.58	-0.19	-0.23	-0.04	-0.07	-0.22	0.15	0.19	0.51
Lsat_1_v5_gn_4_1641.1 (ILP1)	-0.47	-0.28	-0.75	-0.6	0.18	0.3	-0.07	0.21	-0.31	-0.49	-0.29	-0.35	0.4	1.04	0.63	0.09	-0.18	0.12	-0.29	-0.46	-0.33	-0.4	0.95	-0.29	-0.33	-0.19	-0.2	-0.42	0.16	0.1	0.43
Lsat_1_v5_gn_4_38500.1	-1.0	-1.08	-0.77	-0.49	0.2	0.27	0.2	0.25	-0.25	-0.34	-0.38	-0.24	0.06	0.68	0.47	0.01	-0.14	-0.02	0.08	-0.27	-0.5	-0.29	0.99	-0.22	-0.17	-0.16	-0.14	-0.34	0.29	0.22	0.78
Lsat_1_v5_gn_4_43041.1 (CHIQ1)	-0.9	-0.67	-0.52	-0.44	0.19	0.22	-0.11	-0.11	-0.27	-0.15	-0.1	-0.18	0.18	0.57	0.38	0.12	-0.07	0.24	0.03	-0.07	-0.2	-0.07	0.43	-0.23	-0.09	-0.05	-0.08	-0.3	0.26	0.2	0.64
Lsat_1_v5_gn_5_108021.1 (PIS1)	-0.5	-0.58	-0.71	-0.63	0.52	0.57	-0.11	0.23	-0.22	-0.57	-0.42	-0.49	0.27	0.75	0.53	-0.01	-0.09	0.04	-0.16	-0.24	-0.16	-0.07	0.79	-0.14	-0.16	-0.03	-0.11	-0.0	0.09	-0.15	0.07
Lsat_1_v5_gn_5_112540.1 (FUT11)	-1.56	-1.1	-1.92	-0.7	0.56	0.56	-0.04	-0.05	-0.26	-0.17	-0.35	-0.62	-0.23	1.06	0.8	-0.11	-0.47	0.32	0.05	-0.41	-0.17	-0.28	1.16	-0.75	-0.37	-0.19	0.01	-0.54	0.46	0.02	0.7
Lsat_1_v5_gn_5_129921.1 (BTZ1)	-0.53	-0.34	-0.55	-0.27	0.28	0.22	-0.13	0.09	-0.19	-0.34	-0.0	-0.15	0.26	0.6	0.47	0.09	-0.17	-0.05	-0.17	-0.26	-0.33	-0.22	0.79	-0.27	-0.15	-0.16	-0.17	-0.37	0.17	0.15	0.52
Lsat_1_v5_gn_5_137600.1	-0.67	-0.48	-0.69	-0.58	0.47	0.45	-0.13	-0.25	-0.33	-0.21	-0.18	-0.4	0.21	0.78	0.69	-0.01	-0.23	0.23	0.05	-0.25	-0.19	-0.27	0.74	-0.32	-0.33	-0.21	-0.13	-0.27	0.08	0.09	0.57
Lsat_1_v5_gn_5_1520.1	-0.56	-0.46	-0.58	-0.31	0.0	0.14	0.06	0.28	-0.28	-0.3	-0.19	-0.3	0.34	0.71	0.61	-0.05	-0.11	0.14	-0.18	-0.35	-0.25	-0.25	0.69	-0.23	-0.33	-0.22	-0.15	-0.42	0.14	0.21	0.71
Lsat_1_v5_gn_5_166940.1 (NFRKB1)	-0.6	-0.38	-0.66	-0.47	0.25	0.35	0.04	0.06	-0.33	-0.47	-0.13	-0.27	0.15	0.9	0.5	0.07	-0.2	0.04	0.13	-0.37	-0.36	-0.26	0.66	-0.23	-0.2	-0.11	-0.06	-0.25	0.15	0.15	0.45
Lsat_1_v5_gn_5_185161.1 (EDM2)	-0.22	-0.35	-0.4	-0.31	0.19	0.2	-0.08	0.04	-0.26	-0.24	-0.23	-0.27	0.11	0.74	0.55	0.1	-0.11	0.03	-0.12	-0.3	-0.2	-0.19	0.59	-0.26	-0.21	-0.11	-0.15	-0.22	0.18	0.18	0.39
Lsat_1_v5_gn_5_24161.1 (TGH)	-0.48	-0.29	-0.66	-0.49	0.16	0.16	-0.12	0.1	-0.41	-0.51	-0.08	-0.2	0.17	0.77	0.41	0.05	-0.18	0.25	0.02	-0.32	-0.2	-0.24	0.78	-0.29	-0.18	-0.12	-0.16	-0.22	0.24	0.11	0.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.