Heatmap: Cluster_219 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.36 0.4 0.36 0.34 0.8 0.73 0.49 0.6 0.4 0.4 0.42 0.39 0.57 0.87 0.75 0.49 0.44 0.56 0.61 0.37 0.43 0.47 1.0 0.4 0.41 0.43 0.44 0.37 0.69 0.67 0.86
0.37 0.35 0.29 0.4 0.66 0.64 0.47 0.55 0.43 0.45 0.49 0.47 0.59 1.0 0.85 0.56 0.47 0.64 0.51 0.44 0.44 0.47 0.88 0.42 0.43 0.47 0.44 0.42 0.64 0.61 0.82
0.13 0.16 0.16 0.3 0.6 0.65 0.46 0.49 0.43 0.43 0.42 0.4 0.48 0.78 0.74 0.52 0.43 0.46 0.5 0.38 0.43 0.43 1.0 0.4 0.42 0.44 0.49 0.31 0.56 0.52 0.87
0.42 0.42 0.38 0.42 0.62 0.64 0.54 0.63 0.42 0.42 0.48 0.44 0.63 0.81 0.67 0.52 0.46 0.57 0.5 0.43 0.45 0.52 1.0 0.45 0.49 0.5 0.52 0.41 0.57 0.58 0.8
0.43 0.48 0.5 0.52 0.74 0.84 0.57 0.62 0.5 0.55 0.51 0.52 0.58 1.0 0.88 0.71 0.58 0.59 0.61 0.52 0.56 0.56 0.85 0.56 0.56 0.57 0.56 0.48 0.81 0.75 0.88
0.31 0.36 0.34 0.35 0.75 0.75 0.44 0.57 0.42 0.42 0.47 0.39 0.68 1.0 0.82 0.48 0.41 0.61 0.52 0.44 0.46 0.48 0.97 0.49 0.5 0.55 0.44 0.41 0.64 0.64 0.91
0.16 0.25 0.24 0.24 0.47 0.51 0.34 0.39 0.3 0.29 0.36 0.32 0.45 0.81 0.61 0.46 0.39 0.44 0.39 0.29 0.31 0.35 1.0 0.33 0.34 0.35 0.33 0.17 0.6 0.64 0.88
0.37 0.44 0.3 0.32 0.65 0.66 0.51 0.54 0.38 0.41 0.44 0.44 0.6 0.83 0.73 0.54 0.47 0.6 0.55 0.41 0.43 0.47 1.0 0.42 0.44 0.46 0.47 0.46 0.64 0.61 0.78
0.28 0.29 0.21 0.26 0.51 0.53 0.41 0.49 0.39 0.36 0.41 0.37 0.53 0.85 0.64 0.43 0.37 0.58 0.41 0.33 0.35 0.47 1.0 0.36 0.37 0.42 0.41 0.32 0.53 0.54 0.86
0.34 0.37 0.36 0.42 0.67 0.7 0.51 0.58 0.45 0.45 0.44 0.42 0.6 0.96 0.89 0.6 0.5 0.75 0.51 0.4 0.45 0.49 1.0 0.42 0.41 0.5 0.46 0.35 0.56 0.55 0.72
0.34 0.38 0.35 0.39 0.64 0.66 0.52 0.51 0.47 0.48 0.47 0.45 0.63 1.0 0.81 0.61 0.56 0.6 0.47 0.46 0.48 0.49 0.89 0.46 0.45 0.44 0.47 0.42 0.6 0.59 0.73
0.31 0.38 0.36 0.39 0.72 0.67 0.44 0.55 0.39 0.39 0.43 0.36 0.54 1.0 0.87 0.5 0.41 0.49 0.52 0.39 0.39 0.42 0.85 0.39 0.43 0.46 0.43 0.34 0.65 0.61 0.64
0.36 0.36 0.31 0.29 0.56 0.71 0.48 0.5 0.42 0.42 0.52 0.47 0.67 1.0 0.85 0.53 0.56 0.53 0.52 0.44 0.47 0.49 0.93 0.44 0.45 0.51 0.49 0.46 0.68 0.64 0.88
0.38 0.38 0.41 0.37 0.54 0.59 0.52 0.54 0.44 0.43 0.49 0.47 0.63 0.87 0.69 0.62 0.54 0.67 0.53 0.49 0.52 0.51 1.0 0.48 0.53 0.55 0.51 0.45 0.61 0.6 0.78
0.42 0.45 0.39 0.42 0.68 0.63 0.49 0.5 0.43 0.46 0.47 0.46 0.63 0.89 0.76 0.52 0.47 0.5 0.46 0.43 0.43 0.47 1.0 0.44 0.44 0.47 0.47 0.42 0.62 0.63 0.92
0.42 0.43 0.46 0.53 0.79 0.8 0.59 0.58 0.49 0.54 0.54 0.52 0.65 1.0 0.87 0.66 0.54 0.57 0.73 0.52 0.52 0.55 0.98 0.53 0.5 0.56 0.5 0.47 0.76 0.75 0.95
0.39 0.41 0.34 0.38 0.67 0.72 0.59 0.62 0.49 0.49 0.54 0.5 0.69 1.0 0.84 0.62 0.56 0.64 0.56 0.47 0.46 0.52 0.87 0.47 0.51 0.54 0.55 0.52 0.68 0.74 0.86
0.24 0.24 0.21 0.22 0.57 0.73 0.43 0.42 0.37 0.32 0.4 0.28 0.41 1.0 0.72 0.52 0.43 0.54 0.53 0.34 0.4 0.38 0.98 0.4 0.46 0.4 0.42 0.3 0.61 0.62 0.76
0.27 0.32 0.23 0.26 0.46 0.5 0.45 0.48 0.39 0.38 0.4 0.41 0.57 0.79 0.65 0.51 0.45 0.48 0.48 0.38 0.38 0.43 1.0 0.4 0.4 0.43 0.41 0.34 0.57 0.56 0.76
0.13 0.16 0.15 0.22 0.63 0.72 0.35 0.32 0.32 0.35 0.38 0.34 0.31 0.72 0.74 0.5 0.4 0.5 0.46 0.35 0.35 0.39 1.0 0.37 0.36 0.41 0.42 0.3 0.49 0.5 0.67
0.18 0.25 0.15 0.2 0.49 0.51 0.39 0.42 0.32 0.3 0.34 0.27 0.47 0.99 0.72 0.37 0.36 0.43 0.42 0.29 0.31 0.33 1.0 0.31 0.41 0.36 0.31 0.32 0.49 0.48 0.82
0.25 0.32 0.26 0.22 0.6 0.65 0.45 0.62 0.33 0.32 0.37 0.36 0.43 0.91 0.7 0.47 0.35 0.73 0.46 0.33 0.33 0.4 1.0 0.35 0.38 0.39 0.41 0.33 0.51 0.46 0.54
0.31 0.26 0.31 0.46 0.76 0.72 0.56 0.46 0.47 0.44 0.53 0.51 0.53 0.84 0.81 0.51 0.47 0.7 0.65 0.47 0.46 0.46 1.0 0.45 0.51 0.49 0.55 0.5 0.65 0.68 0.8
0.48 0.46 0.43 0.48 0.67 0.8 0.61 0.63 0.46 0.45 0.44 0.49 0.57 1.0 0.85 0.59 0.55 0.52 0.63 0.49 0.51 0.54 0.92 0.49 0.49 0.53 0.51 0.45 0.68 0.66 0.75
0.29 0.3 0.28 0.45 0.72 0.71 0.52 0.52 0.45 0.52 0.55 0.59 0.63 0.92 0.79 0.49 0.5 0.68 0.65 0.5 0.46 0.51 1.0 0.56 0.54 0.56 0.5 0.47 0.74 0.63 0.96
0.53 0.59 0.47 0.58 0.77 0.72 0.66 0.7 0.58 0.55 0.63 0.59 0.68 1.0 0.89 0.68 0.57 0.8 0.61 0.55 0.55 0.59 1.0 0.59 0.57 0.65 0.64 0.58 0.74 0.77 0.96
0.35 0.4 0.29 0.32 0.55 0.6 0.46 0.56 0.39 0.35 0.4 0.38 0.64 1.0 0.75 0.52 0.43 0.53 0.4 0.35 0.39 0.37 0.94 0.4 0.39 0.43 0.42 0.36 0.54 0.52 0.66
0.25 0.24 0.29 0.36 0.58 0.61 0.58 0.6 0.42 0.4 0.39 0.43 0.52 0.81 0.7 0.51 0.46 0.5 0.53 0.42 0.36 0.41 1.0 0.43 0.45 0.45 0.46 0.4 0.62 0.59 0.86
0.34 0.4 0.45 0.47 0.73 0.74 0.6 0.59 0.53 0.58 0.6 0.57 0.73 0.95 0.83 0.69 0.61 0.76 0.66 0.61 0.56 0.61 0.86 0.55 0.6 0.62 0.61 0.52 0.77 0.73 1.0
0.41 0.39 0.35 0.37 0.83 0.86 0.54 0.68 0.5 0.39 0.43 0.41 0.7 0.97 0.83 0.58 0.54 0.59 0.52 0.49 0.52 0.55 1.0 0.52 0.52 0.57 0.53 0.58 0.62 0.52 0.61
0.15 0.21 0.12 0.28 0.66 0.66 0.44 0.43 0.38 0.4 0.35 0.29 0.38 0.94 0.78 0.42 0.32 0.56 0.47 0.34 0.4 0.37 1.0 0.27 0.35 0.39 0.45 0.31 0.62 0.45 0.73
0.4 0.46 0.39 0.48 0.7 0.67 0.53 0.61 0.51 0.46 0.58 0.52 0.69 0.88 0.8 0.62 0.51 0.56 0.52 0.48 0.46 0.49 1.0 0.48 0.52 0.52 0.51 0.45 0.65 0.64 0.83
0.37 0.42 0.36 0.39 0.81 0.8 0.53 0.49 0.46 0.5 0.51 0.44 0.67 1.0 0.94 0.58 0.49 0.68 0.6 0.49 0.51 0.48 0.97 0.47 0.46 0.5 0.53 0.48 0.61 0.62 0.86
0.41 0.44 0.41 0.49 0.61 0.67 0.64 0.74 0.5 0.5 0.54 0.5 0.77 1.0 0.93 0.59 0.56 0.67 0.54 0.48 0.52 0.51 0.99 0.52 0.49 0.53 0.55 0.46 0.68 0.71 1.0
0.35 0.41 0.34 0.39 0.64 0.68 0.55 0.56 0.43 0.39 0.49 0.44 0.59 1.0 0.75 0.56 0.47 0.55 0.59 0.41 0.42 0.45 0.84 0.46 0.47 0.49 0.51 0.45 0.59 0.59 0.73
0.51 0.47 0.45 0.48 0.68 0.69 0.57 0.61 0.5 0.51 0.51 0.49 0.64 1.0 0.88 0.64 0.55 0.61 0.55 0.49 0.52 0.52 0.9 0.5 0.52 0.55 0.54 0.51 0.68 0.68 0.78
0.42 0.48 0.37 0.41 0.65 0.65 0.54 0.62 0.44 0.41 0.55 0.51 0.65 0.99 0.77 0.6 0.51 0.69 0.59 0.47 0.51 0.5 1.0 0.48 0.51 0.54 0.52 0.5 0.69 0.63 0.86
0.31 0.33 0.25 0.32 0.54 0.59 0.5 0.55 0.46 0.44 0.5 0.48 0.59 0.82 0.73 0.57 0.51 0.46 0.52 0.44 0.45 0.47 1.0 0.48 0.47 0.47 0.47 0.43 0.58 0.58 0.83
0.17 0.25 0.22 0.26 0.66 0.71 0.46 0.36 0.46 0.43 0.52 0.43 0.54 0.77 0.75 0.59 0.45 0.4 0.51 0.38 0.46 0.47 1.0 0.39 0.47 0.48 0.46 0.4 0.56 0.59 0.77
0.23 0.35 0.17 0.3 0.5 0.55 0.45 0.45 0.33 0.38 0.44 0.36 0.6 0.82 0.75 0.46 0.41 0.39 0.47 0.42 0.41 0.47 1.0 0.48 0.39 0.38 0.41 0.37 0.59 0.56 0.69
0.36 0.41 0.32 0.41 0.73 0.71 0.54 0.52 0.53 0.55 0.62 0.51 0.62 0.9 0.86 0.62 0.56 0.58 0.62 0.51 0.53 0.49 1.0 0.52 0.51 0.56 0.57 0.48 0.68 0.78 0.83
0.37 0.41 0.37 0.43 0.77 0.69 0.51 0.58 0.46 0.42 0.52 0.43 0.66 1.0 0.89 0.6 0.45 0.61 0.46 0.39 0.43 0.44 0.94 0.41 0.44 0.45 0.48 0.44 0.63 0.58 0.76
0.54 0.44 0.44 0.41 0.82 0.87 0.6 0.69 0.53 0.53 0.56 0.5 0.58 0.93 0.84 0.63 0.61 0.62 0.57 0.55 0.58 0.61 1.0 0.57 0.54 0.57 0.6 0.63 0.6 0.57 0.64
0.31 0.34 0.28 0.27 0.54 0.62 0.49 0.52 0.4 0.39 0.43 0.41 0.58 0.72 0.63 0.51 0.47 0.62 0.5 0.4 0.42 0.43 1.0 0.42 0.44 0.47 0.45 0.4 0.59 0.59 0.8
0.47 0.48 0.43 0.54 0.69 0.67 0.57 0.66 0.47 0.49 0.57 0.51 0.7 1.0 0.86 0.61 0.57 0.71 0.55 0.5 0.52 0.54 1.0 0.53 0.52 0.55 0.54 0.52 0.76 0.74 0.87
0.25 0.24 0.23 0.28 0.42 0.45 0.4 0.53 0.32 0.35 0.37 0.33 0.49 0.81 0.6 0.43 0.37 0.51 0.4 0.35 0.38 0.4 1.0 0.38 0.36 0.39 0.38 0.3 0.43 0.46 0.71
0.28 0.32 0.29 0.41 0.6 0.56 0.45 0.57 0.36 0.38 0.39 0.39 0.7 0.93 0.78 0.48 0.43 0.57 0.42 0.4 0.43 0.4 1.0 0.44 0.42 0.46 0.42 0.42 0.58 0.52 0.78
0.44 0.4 0.37 0.42 0.71 0.76 0.5 0.65 0.41 0.41 0.48 0.45 0.64 1.0 0.79 0.52 0.44 0.55 0.51 0.43 0.46 0.5 0.89 0.47 0.48 0.5 0.45 0.48 0.58 0.57 0.67
0.42 0.39 0.42 0.38 0.53 0.68 0.49 0.48 0.34 0.33 0.37 0.33 0.48 1.0 0.75 0.53 0.43 0.46 0.64 0.39 0.44 0.44 0.84 0.39 0.42 0.42 0.47 0.38 0.63 0.5 0.6
0.33 0.43 0.29 0.34 0.59 0.59 0.56 0.55 0.45 0.44 0.5 0.44 0.59 0.84 0.76 0.56 0.49 0.38 0.49 0.42 0.45 0.46 1.0 0.43 0.44 0.5 0.51 0.42 0.61 0.61 0.73
0.3 0.3 0.31 0.38 0.78 0.67 0.55 0.49 0.52 0.54 0.61 0.46 0.65 1.0 0.91 0.58 0.51 0.68 0.58 0.47 0.4 0.44 1.0 0.43 0.47 0.54 0.48 0.37 0.57 0.74 0.9
0.31 0.38 0.32 0.38 0.78 0.77 0.63 0.68 0.44 0.49 0.51 0.52 0.65 1.0 0.93 0.61 0.56 0.58 0.58 0.52 0.51 0.52 0.99 0.49 0.5 0.5 0.53 0.41 0.68 0.69 0.92
0.34 0.37 0.44 0.59 0.72 0.73 0.6 0.64 0.6 0.66 0.65 0.58 0.66 0.93 0.9 0.7 0.57 0.66 0.56 0.49 0.54 0.55 1.0 0.52 0.53 0.55 0.58 0.44 0.73 0.76 0.96
0.43 0.41 0.37 0.6 0.74 0.66 0.51 0.56 0.44 0.44 0.5 0.5 0.87 1.0 0.83 0.55 0.54 0.62 0.59 0.48 0.52 0.54 0.99 0.55 0.5 0.54 0.53 0.53 0.67 0.58 0.83
0.23 0.39 0.29 0.32 0.73 0.71 0.48 0.55 0.42 0.42 0.38 0.39 0.51 0.95 0.81 0.48 0.46 0.71 0.45 0.35 0.39 0.41 1.0 0.38 0.35 0.42 0.45 0.38 0.55 0.62 0.66
0.3 0.3 0.3 0.35 0.71 0.74 0.56 0.54 0.41 0.46 0.48 0.45 0.61 1.0 0.81 0.55 0.49 0.56 0.57 0.49 0.53 0.51 0.82 0.46 0.53 0.51 0.5 0.39 0.66 0.69 0.82
0.21 0.28 0.28 0.33 0.67 0.78 0.46 0.51 0.37 0.38 0.36 0.36 0.37 0.87 0.69 0.41 0.37 0.53 0.5 0.39 0.39 0.45 1.0 0.38 0.41 0.45 0.53 0.33 0.64 0.71 0.98
0.23 0.28 0.29 0.28 0.54 0.59 0.45 0.59 0.39 0.38 0.41 0.37 0.58 0.91 0.69 0.51 0.43 0.58 0.45 0.39 0.37 0.4 1.0 0.39 0.41 0.43 0.41 0.3 0.59 0.56 0.84
0.43 0.44 0.43 0.5 0.83 0.69 0.52 0.56 0.41 0.46 0.48 0.48 0.51 0.83 0.74 0.51 0.46 0.52 0.56 0.43 0.41 0.48 1.0 0.42 0.42 0.47 0.45 0.43 0.62 0.59 0.73
0.3 0.32 0.32 0.36 0.65 0.74 0.51 0.47 0.42 0.43 0.49 0.46 0.72 1.0 0.84 0.58 0.54 0.68 0.59 0.49 0.51 0.51 0.92 0.54 0.52 0.52 0.53 0.45 0.71 0.75 0.91
0.38 0.38 0.29 0.33 0.71 0.69 0.4 0.44 0.39 0.4 0.43 0.35 0.59 0.85 0.71 0.5 0.34 0.48 0.5 0.41 0.38 0.4 1.0 0.37 0.5 0.45 0.4 0.4 0.58 0.54 0.88
0.37 0.43 0.31 0.37 0.6 0.61 0.47 0.5 0.38 0.41 0.42 0.41 0.55 0.81 0.65 0.55 0.44 0.47 0.45 0.36 0.41 0.41 1.0 0.37 0.4 0.4 0.41 0.39 0.55 0.57 0.74
0.39 0.35 0.35 0.44 0.72 0.76 0.54 0.54 0.5 0.52 0.58 0.49 0.63 0.94 0.87 0.63 0.55 0.54 0.6 0.51 0.51 0.55 1.0 0.47 0.52 0.6 0.56 0.54 0.64 0.61 0.68
0.36 0.46 0.35 0.44 0.82 0.7 0.53 0.6 0.55 0.57 0.6 0.55 0.65 1.0 0.89 0.56 0.5 0.68 0.59 0.47 0.48 0.49 0.98 0.46 0.49 0.56 0.54 0.43 0.69 0.71 0.82
0.31 0.3 0.32 0.39 0.68 0.65 0.55 0.64 0.42 0.45 0.49 0.49 0.64 0.86 0.77 0.56 0.46 0.48 0.53 0.45 0.42 0.48 1.0 0.46 0.44 0.48 0.47 0.44 0.66 0.59 0.83
0.47 0.45 0.45 0.54 0.67 0.65 0.62 0.59 0.53 0.58 0.63 0.6 0.67 0.89 0.78 0.55 0.6 0.51 0.57 0.54 0.58 0.6 1.0 0.5 0.54 0.59 0.55 0.57 0.67 0.69 0.86
0.34 0.38 0.37 0.42 0.57 0.64 0.53 0.64 0.4 0.43 0.47 0.43 0.6 1.0 0.84 0.57 0.52 0.65 0.5 0.44 0.43 0.42 0.84 0.45 0.45 0.46 0.48 0.4 0.6 0.58 0.79
0.45 0.42 0.42 0.51 0.62 0.62 0.52 0.59 0.46 0.43 0.49 0.46 0.61 0.78 0.71 0.57 0.5 0.44 0.46 0.44 0.45 0.48 1.0 0.43 0.45 0.48 0.48 0.47 0.58 0.57 0.77
0.45 0.43 0.37 0.43 0.72 0.74 0.53 0.57 0.53 0.58 0.54 0.54 0.67 0.95 0.79 0.62 0.58 0.67 0.51 0.52 0.54 0.54 1.0 0.53 0.47 0.6 0.54 0.55 0.63 0.66 0.77
0.46 0.42 0.4 0.42 0.72 0.76 0.51 0.5 0.45 0.47 0.51 0.45 0.69 1.0 0.8 0.61 0.52 0.53 0.53 0.44 0.48 0.48 1.0 0.48 0.5 0.5 0.52 0.48 0.62 0.6 0.77
0.33 0.37 0.27 0.4 0.59 0.56 0.55 0.63 0.44 0.45 0.45 0.43 0.63 0.9 0.7 0.54 0.5 0.5 0.46 0.47 0.47 0.46 1.0 0.46 0.45 0.47 0.47 0.42 0.61 0.57 0.71
0.31 0.33 0.31 0.29 0.55 0.5 0.42 0.52 0.3 0.32 0.37 0.34 0.55 0.73 0.65 0.42 0.37 0.41 0.43 0.34 0.34 0.37 1.0 0.36 0.37 0.37 0.37 0.3 0.49 0.5 0.8
0.4 0.42 0.37 0.35 0.72 0.74 0.59 0.64 0.44 0.46 0.45 0.46 0.63 1.0 0.79 0.6 0.49 0.65 0.55 0.46 0.48 0.49 1.0 0.44 0.43 0.48 0.47 0.43 0.58 0.57 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)