Heatmap: Cluster_47 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10701.1 (SMU1)	-0.34	-0.39	-0.42	-0.47	0.05	0.16	0.04	0.3	-0.31	-0.35	-0.07	-0.16	0.41	0.47	0.29	-0.01	-0.03	-0.28	-0.13	-0.06	-0.21	0.02	0.16	-0.12	0.02	-0.05	-0.14	-0.01	0.11	0.11	0.65
Lsat_1_v5_gn_0_13881.1	-0.98	-0.57	-1.42	-1.24	-0.07	0.26	0.31	1.0	-1.05	-0.8	-0.94	-0.47	0.9	0.73	0.34	-0.05	0.12	0.24	-0.54	-0.39	-0.25	-0.02	0.59	-0.16	-0.21	0.02	-0.4	-0.08	0.15	0.05	0.92
Lsat_1_v5_gn_1_10961.1 (PCP2)	-1.43	-1.1	-1.94	-1.74	-0.33	0.16	0.49	1.56	-1.03	-0.54	-0.77	-0.16	1.01	0.17	0.0	-0.08	0.2	0.35	-0.49	-0.23	0.02	0.21	0.43	0.17	0.01	-0.23	-0.49	0.08	-0.14	-0.32	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_1120.1 (PCN)	-0.68	-0.5	-0.92	-0.39	-0.06	-0.06	0.24	0.91	-0.58	-0.41	-0.36	-0.21	0.96	0.55	0.1	0.07	0.08	-0.29	-0.32	-0.16	-0.12	-0.03	0.16	0.09	0.03	-0.0	-0.19	0.06	-0.09	-0.12	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_126340.1	-0.88	-0.82	-1.38	-1.49	-0.09	0.27	0.25	0.6	-0.65	-0.52	-0.45	-0.23	0.7	0.45	0.25	0.21	0.17	-0.04	-0.05	-0.09	-0.07	0.13	0.51	0.11	0.05	0.06	0.06	0.14	-0.05	-0.1	0.44
Lsat_1_v5_gn_1_13001.1 (RH5)	-0.33	-0.42	-0.85	-0.91	-0.05	0.24	0.51	0.74	-0.56	-0.57	-0.43	-0.36	0.45	0.46	0.33	0.18	0.19	-0.35	-0.22	-0.08	-0.03	0.09	0.31	-0.01	-0.01	0.06	-0.15	0.13	0.08	-0.14	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_13920.1 (DOM1)	-1.38	-1.36	-1.89	-1.37	-0.11	0.31	0.36	1.13	-1.03	-0.95	-1.02	-0.39	0.91	0.81	0.62	0.12	0.18	0.11	-0.54	-0.28	-0.18	-0.03	0.56	0.04	0.02	-0.05	-0.25	-0.16	0.21	-0.19	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_17721.1	-0.62	-0.53	-1.22	-1.14	0.08	0.22	0.24	0.75	-0.52	-0.4	-0.23	-0.26	0.55	0.54	0.22	-0.04	0.03	0.17	-0.01	-0.21	-0.13	0.1	0.33	-0.12	-0.03	-0.12	-0.12	-0.11	0.03	0.11	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_27101.1	-1.12	-0.57	-1.3	-1.02	-0.11	0.19	0.16	0.85	-0.95	-0.48	-0.66	-0.21	0.82	0.68	0.26	0.05	0.04	-0.01	-0.42	-0.36	-0.26	-0.14	0.75	-0.13	-0.18	-0.17	-0.51	-0.18	0.25	0.26	1.03
Lsat_1_v5_gn_1_33541.1 (PWP2)	-1.32	-0.81	-1.56	-1.29	-0.1	0.17	0.3	1.1	-0.93	-0.76	-0.71	-0.38	0.83	0.63	0.35	-0.08	-0.01	0.12	-0.36	-0.09	-0.17	-0.04	0.88	-0.07	-0.02	-0.06	-0.25	-0.02	0.08	-0.03	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_41900.1 (RAN2)	-0.23	-0.22	-0.51	-0.57	-0.08	0.2	0.07	0.24	-0.21	-0.16	-0.2	-0.09	0.48	0.27	0.02	0.01	0.06	-0.17	-0.2	-0.1	-0.03	0.13	-0.14	-0.02	0.0	0.03	-0.01	0.1	0.14	0.09	0.52
Lsat_1_v5_gn_1_45101.1	-0.67	-0.59	-0.8	-0.79	-0.01	0.12	0.24	0.67	-0.42	-0.3	-0.18	-0.2	0.68	0.71	0.47	0.04	0.02	-0.27	-0.18	-0.19	-0.23	-0.14	-0.17	-0.2	-0.07	-0.07	-0.04	-0.29	0.18	0.18	0.72
Lsat_1_v5_gn_1_56161.1	-0.68	-0.57	-0.91	-1.04	-0.21	0.22	0.25	0.7	-0.29	-0.63	-0.22	-0.28	0.45	0.67	0.51	0.07	0.06	-0.2	-0.1	-0.11	-0.16	-0.11	0.29	-0.24	0.02	-0.07	-0.05	-0.17	-0.02	0.07	0.79
Lsat_1_v5_gn_1_62020.1	-0.93	-0.91	-1.54	-1.63	-0.19	0.14	0.14	0.81	-1.13	-0.96	-0.83	-0.28	1.09	0.44	0.02	0.05	0.17	0.11	-0.37	-0.36	-0.11	0.07	0.48	0.14	-0.06	0.01	-0.38	0.24	0.32	0.2	1.0
Lsat_1_v5_gn_1_75680.1	-0.84	-1.01	-1.1	-0.69	-0.0	0.3	0.26	0.91	-0.65	-0.5	-0.52	-0.12	0.7	0.32	0.04	0.04	0.17	-0.17	-0.49	-0.04	0.0	0.1	0.53	0.36	0.17	0.03	-0.19	0.31	-0.16	-0.25	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_77700.1 (EIF2 GAMMA)	-0.52	-0.63	-0.7	-0.64	0.06	0.23	0.25	0.63	-0.57	-0.5	-0.39	-0.22	0.57	0.37	0.26	0.08	0.12	0.23	-0.15	-0.2	-0.18	-0.02	0.63	-0.0	-0.08	-0.04	-0.2	-0.09	-0.07	-0.11	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_9521.1	-0.98	-0.81	-1.49	-0.89	0.2	0.35	0.17	0.69	-0.46	-0.54	-0.43	-0.19	0.57	0.7	0.26	-0.03	-0.02	0.13	-0.02	-0.37	-0.07	-0.03	0.63	0.03	-0.52	-0.2	-0.19	-0.08	0.09	0.14	0.73
Lsat_1_v5_gn_1_98220.1 (UBP24)	-1.21	-0.73	-1.24	-1.35	0.12	0.38	0.24	0.53	-0.53	-0.34	-0.3	-0.16	0.57	0.56	0.31	0.31	0.25	0.05	-0.33	-0.04	-0.09	-0.01	0.33	-0.2	-0.12	0.05	-0.05	0.26	0.1	-0.0	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_104580.1	-1.1	-0.65	-1.24	-1.14	-0.1	0.26	0.23	0.86	-0.95	-0.58	-0.69	-0.58	0.74	0.89	0.5	0.13	-0.04	0.11	-0.69	-0.32	-0.27	-0.14	0.59	-0.25	-0.48	-0.21	-0.33	0.01	0.47	0.25	0.93
Lsat_1_v5_gn_2_108061.1	-0.72	-0.7	-0.99	-0.78	-0.05	0.3	0.23	0.58	-0.58	-0.54	-0.4	-0.2	0.62	0.44	0.22	0.19	0.17	-0.46	-0.21	-0.24	-0.1	0.08	0.47	0.09	-0.03	0.01	-0.25	0.02	0.05	0.1	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_121020.1 (UBA2A)	-0.47	-0.51	-0.73	-0.6	0.32	0.12	0.21	0.32	-0.38	-0.22	-0.21	-0.22	0.33	0.62	0.46	0.04	-0.03	-0.03	-0.03	-0.24	-0.13	-0.04	0.36	-0.17	-0.2	-0.06	-0.1	-0.22	0.09	0.13	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_122660.1	-0.47	-0.57	-1.46	-1.38	0.19	0.43	0.15	0.61	-0.6	-0.63	-0.59	-0.53	0.56	0.67	0.55	0.24	0.22	-0.5	-0.07	-0.35	-0.05	0.1	0.44	0.05	-0.0	-0.06	-0.22	0.06	0.07	0.05	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_132381.1	-1.9	-0.93	-1.21	-1.46	-0.22	0.31	0.38	1.1	-0.52	-0.49	-0.34	-0.16	0.43	0.71	0.5	0.1	0.01	0.28	-0.27	0.06	-0.17	-0.09	0.33	-0.18	-0.1	0.13	-0.12	-0.14	-0.12	-0.23	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_42041.1	-0.96	-0.63	-1.41	-1.21	-0.25	0.08	0.41	0.99	-0.65	-0.43	-0.35	-0.19	0.69	0.63	0.33	0.0	0.14	-0.12	-0.29	-0.21	-0.15	-0.09	0.77	-0.09	-0.09	-0.12	-0.3	-0.05	0.07	0.0	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_46281.1 (THAL)	-0.84	-0.64	-1.01	-0.73	-0.01	0.4	0.26	0.94	-0.61	-0.71	-0.45	-0.33	0.61	0.69	0.42	0.02	0.0	-0.03	-0.28	-0.43	-0.2	0.01	0.65	-0.17	-0.17	0.04	-0.29	-0.19	0.19	-0.01	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_5041.1	-0.74	-0.65	-1.02	-0.65	-0.16	0.07	0.15	0.86	-0.47	-0.44	-0.49	-0.35	0.77	0.63	0.33	0.12	0.07	-0.21	-0.45	-0.34	-0.29	-0.06	0.25	-0.03	-0.1	-0.08	-0.37	-0.01	0.22	0.23	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_51000.1 (PES)	-0.79	-0.84	-0.97	-0.73	-0.04	0.19	0.34	1.03	-0.73	-0.57	-0.54	-0.26	0.83	0.66	0.31	0.03	0.09	0.54	-0.54	-0.35	-0.21	-0.12	0.35	-0.14	-0.23	-0.06	-0.22	-0.09	-0.06	-0.17	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_64421.1 (TPR10)	-0.45	-0.42	-0.84	-0.89	-0.3	0.06	0.02	0.97	-0.99	-0.79	-0.63	-0.33	0.73	0.6	0.08	-0.2	-0.17	0.6	-0.53	-0.4	-0.3	-0.32	0.83	-0.06	-0.33	-0.39	-0.45	-0.25	0.29	0.25	1.16
Lsat_1_v5_gn_2_68300.1	-0.9	-0.63	-0.84	-0.78	-0.08	0.07	0.32	0.5	-0.43	-0.18	-0.47	-0.26	0.68	0.48	0.31	-0.02	0.13	-0.28	0.05	0.01	-0.18	-0.01	0.11	0.08	0.01	-0.05	-0.08	-0.18	0.16	0.23	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_8601.1	-0.77	-0.91	-0.95	-1.01	0.06	0.3	0.25	0.76	-0.37	-0.32	-0.37	-0.15	0.62	0.46	0.12	-0.1	0.06	-0.12	-0.24	-0.15	-0.01	0.05	0.33	-0.07	0.07	-0.09	-0.05	0.0	0.07	0.07	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_91141.1	-0.57	-0.44	-1.06	-0.95	0.16	0.3	0.17	0.75	-0.5	-0.62	-0.38	-0.26	0.36	0.73	0.51	0.07	0.07	-0.01	-0.03	-0.1	-0.09	0.01	0.28	-0.02	0.04	-0.05	-0.23	-0.08	0.01	-0.17	0.32
Lsat_1_v5_gn_2_95881.1	-1.59	-1.28	-2.1	-1.6	-0.39	0.08	0.1	0.85	-1.09	-0.86	-0.85	-0.4	1.06	0.75	0.42	0.05	0.05	0.32	-0.42	-0.38	-0.19	-0.02	0.42	0.09	-0.03	-0.15	-0.44	-0.14	0.5	0.08	1.31
Lsat_1_v5_gn_3_104900.1 (NFRKB2)	-0.66	-0.56	-0.96	-0.56	-0.23	0.19	0.21	0.55	-0.26	-0.17	-0.12	-0.1	0.36	0.52	0.33	0.1	0.03	0.01	-0.04	-0.09	-0.15	-0.11	0.26	-0.12	-0.03	0.03	-0.02	-0.24	0.05	0.13	0.5
Lsat_1_v5_gn_3_105661.1 (EMA1)	-0.64	-0.46	-0.95	-0.82	0.11	0.15	0.25	0.73	-0.51	-0.42	-0.38	-0.1	0.68	0.5	0.16	0.25	0.3	-0.1	-0.44	-0.22	-0.05	-0.04	0.22	-0.01	-0.09	0.08	-0.18	0.11	-0.0	0.0	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_110060.1	-1.22	-0.65	-1.79	-1.46	-0.38	0.04	0.13	0.88	-1.03	-0.86	-0.85	-0.36	0.76	0.99	0.38	-0.16	-0.2	0.34	-0.46	-0.35	-0.17	-0.09	0.76	-0.03	-0.16	-0.31	-0.37	-0.16	0.5	0.33	1.08
Lsat_1_v5_gn_3_126861.1 (AtRGGA)	-0.4	-0.4	-0.52	-0.38	0.22	0.36	0.39	0.84	-0.43	-0.33	-0.32	-0.17	0.5	0.46	0.18	0.05	0.05	-0.72	-0.45	-0.23	-0.14	-0.04	0.24	0.03	-0.01	0.0	-0.07	-0.01	-0.08	-0.22	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_22761.1 (ZRF1a)	-1.34	-0.76	-1.45	-1.4	-0.18	-0.0	0.64	1.45	-0.7	-0.64	-0.52	-0.24	0.76	0.3	-0.01	0.12	0.2	0.15	-0.26	-0.11	-0.1	0.03	0.32	0.12	0.03	-0.03	-0.19	0.0	-0.33	-0.18	0.52
Lsat_1_v5_gn_3_23200.1	-0.69	-0.61	-1.0	-1.3	0.11	0.28	0.19	0.52	-0.54	-0.39	-0.41	-0.18	0.65	0.44	0.18	0.17	0.1	-0.34	-0.02	-0.12	0.07	0.13	0.51	0.05	0.08	0.04	-0.03	0.14	-0.01	-0.08	0.29
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.