Heatmap: Cluster_192 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_29701.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_104761.1	0.0	0.0	0.24	0.0	0.39	0.39	0.22	0.0	0.32	0.28	1.0	0.18	0.3	0.7	0.32	0.21	0.09	0.68	0.25	0.0	0.35	0.0	0.0	0.19	0.0	0.43	0.54	0.18	0.0	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_1_108720.1 (EMB3141)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_116060.1 (ALIS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_92020.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_102541.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.26	0.32	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.51	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.92
Lsat_1_v5_gn_2_127540.1 (CDC20.5)	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	1.0	0.54	0.0	0.0	0.16	0.0	0.55	0.58	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_32620.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.15	0.0	0.21	0.0	0.36	0.7	0.0	0.0	0.4	1.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_65581.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.2	0.0	0.39	0.0	0.0	1.0	0.64	0.0	0.0	0.25	0.0	0.93	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_122081.1	0.0	0.29	0.0	0.4	0.09	0.0	0.11	0.49	0.22	0.0	0.37	0.13	0.0	0.28	0.0	0.13	0.25	0.3	0.44	0.21	0.3	0.26	0.45	1.0	1.0	0.09	0.13	0.11	0.44	0.66	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_22581.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.13	0.11	0.13	0.12	0.67	0.53	0.13	0.45	0.12	0.75	0.15	0.1	0.93	0.37	0.88	1.0	0.75	0.21	0.0	0.1	0.11	0.41	0.43
Lsat_1_v5_gn_3_29920.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_92020.1 (FVE)	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.67	0.77	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_142780.1 (TN6)	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.19	0.16	0.0	0.15	0.0	0.19	0.76	0.37	0.17	0.76	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.14	0.0	0.17	0.0	0.16	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_152261.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.31	0.0	0.29
Lsat_1_v5_gn_4_172581.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.2	0.31	0.13	0.32	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.26	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	1.0	0.1	0.25	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_20061.1 (BCHA2)	0.0	0.0	0.59	0.0	0.41	0.19	0.09	0.97	0.0	0.0	0.0	0.87	0.42	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.12	0.58	0.0	0.0	0.41	1.0	0.44	0.15	0.6	0.2	0.4	0.17	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_3121.1 (UGT73B1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_90461.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.43	0.24	0.09	0.0	0.09	1.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.48	0.09	0.58
Lsat_1_v5_gn_4_92341.1 (PME1)	0.39	0.0	0.0	0.0	0.35	0.38	0.69	0.0	0.34	0.3	0.33	0.3	0.11	0.0	0.42	0.42	0.1	0.57	0.0	0.14	0.14	0.0	0.07	1.0	0.21	0.1	0.63	0.33	0.1	0.06	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_96620.1 (PAB6)	0.65	0.33	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.74	0.0	0.0	0.27	0.21	0.0	0.46	0.24
Lsat_1_v5_gn_5_123220.1	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.07	0.08	0.0	0.0	0.0	0.16	0.08	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	1.0	0.0	0.44	0.0	0.08	0.07	0.0	0.28
Lsat_1_v5_gn_5_135480.1 (INP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.1	0.29	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.24
Lsat_1_v5_gn_5_45140.1 (ATR)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_55000.1 (KA120)	0.06	0.31	0.36	0.35	0.72	0.44	0.05	0.64	0.34	0.48	0.77	0.17	0.31	0.42	0.32	0.37	0.39	0.35	0.82	0.16	0.36	0.18	0.44	1.0	0.75	0.66	0.4	0.31	0.72	0.2	0.76
Lsat_1_v5_gn_5_59500.1 (ATCS)	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.12	0.0	0.0	0.12	0.12	0.0	0.49	0.0	0.26	0.33	0.55	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_92240.1 (NSUN5)	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_46940.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.57	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.26	0.0	0.65	0.71	0.0	0.33	0.93	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.81	0.81	1.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_80301.1 (MON1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.2	0.4	0.7	0.67	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_107980.1 (PERK5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.29	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33
Lsat_1_v5_gn_7_48561.1 (SNAP29)	0.12	0.0	0.03	0.3	0.0	0.0	0.09	0.27	0.52	1.0	0.58	0.33	0.66	0.05	0.34	0.08	0.44	0.26	0.0	0.29	0.13	0.15	0.0	0.9	0.94	0.11	0.16	0.23	0.12	0.25	0.56
Lsat_1_v5_gn_7_58040.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.34	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_60281.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_96380.1 (RPT6A)	0.0	0.0	0.23	0.0	0.19	0.09	0.0	1.0	0.29	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.4	0.53	0.31	0.0	0.31	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.18	0.37
Lsat_1_v5_gn_8_114681.1 (LEC1)	0.15	0.27	0.0	0.69	0.14	0.25	0.21	0.31	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.29	0.41	0.18	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.31	0.79	0.0	0.28	0.0	0.1	0.19	0.48	0.42
Lsat_1_v5_gn_8_148940.1 (BTZ1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_64341.1 (LOS2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_71061.1 (IAA2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_96120.1 (GOXL2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_99681.1	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.62	0.23	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.67	0.66	1.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.19	0.59
Lsat_1_v5_gn_9_14541.1 (CRC)	0.0	0.25	0.0	0.46	0.09	0.09	0.18	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.47	0.11	0.21	0.0	0.1	1.0	0.24	0.0	0.08	0.0	0.0	0.55	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_9_37180.1 (TBL34)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_38321.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.45	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)