1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_192 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.05 0.03 0.0 0.04 0.04 0.13 0.02 0.04 0.09 0.04 0.03 0.01 0.09 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.07 0.02 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.05 0.0 0.09 0.18 0.0 0.0 0.1 0.26 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.14 0.03 0.0 0.04 0.17 0.08 0.0 0.13 0.04 0.0 0.1 0.0 0.04 0.09 0.1 0.15 0.07 0.1 0.09 0.16 0.34 0.34 0.03 0.05 0.04 0.15 0.22 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.04 0.05 0.05 0.27 0.21 0.05 0.18 0.05 0.3 0.06 0.04 0.37 0.15 0.35 0.4 0.3 0.08 0.0 0.04 0.04 0.16 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.06 0.03 0.01 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 2.07 0.0 1.17 0.0 0.0 0.65 0.0 0.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.23 0.36 0.15 0.37 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.31 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 1.17 0.12 0.3 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.03 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.06 0.14 0.06 0.02 0.08 0.03 0.06 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.05
0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.1 0.0 0.05 0.04 0.05 0.04 0.02 0.0 0.06 0.06 0.01 0.08 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.15 0.03 0.01 0.09 0.05 0.02 0.01 0.0
0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.15 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.22 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.68 0.78 0.77 1.57 0.96 0.1 1.39 0.73 1.05 1.67 0.38 0.69 0.91 0.69 0.8 0.84 0.77 1.78 0.34 0.79 0.38 0.96 2.18 1.64 1.44 0.87 0.67 1.56 0.44 1.66
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 3.04 0.0 0.0 0.0 0.56 0.36 0.0 0.0 0.38 0.38 0.0 1.5 0.0 0.78 1.02 1.69 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.13 0.14 0.0 0.07 0.18 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.16 0.2 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.06 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.37 0.0 0.0 0.0 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41
0.04 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.03 0.08 0.16 0.31 0.18 0.1 0.2 0.01 0.1 0.02 0.14 0.08 0.0 0.09 0.04 0.05 0.0 0.28 0.29 0.03 0.05 0.07 0.04 0.08 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.03 0.0 0.34 0.1 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.13 0.18 0.1 0.0 0.1 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.13
0.71 1.29 0.0 3.29 0.68 1.22 0.99 1.49 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 2.68 1.39 1.97 0.86 0.0 0.0 4.79 0.0 0.0 1.51 3.77 0.0 1.36 0.0 0.5 0.92 2.32 2.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05
0.0 0.06 0.0 0.12 0.02 0.02 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.05 0.0 0.02 0.25 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.21 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)