Heatmap: Cluster_22 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_34000.1 (IREH1)	-0.31	-0.37	-0.48	-0.26	0.5	0.21	-0.4	-0.47	-0.2	-0.14	-0.05	-0.17	-0.18	0.59	0.43	-0.03	-0.31	0.28	-0.08	-0.44	-0.37	-0.18	1.12	-0.38	-0.27	-0.23	-0.19	-0.21	0.28	0.29	0.39
Lsat_1_v5_gn_0_3501.1	-0.49	-0.74	-0.53	-0.52	0.02	-0.0	-0.48	-0.33	-0.27	-0.19	-0.22	-0.36	0.27	1.07	0.76	0.1	-0.11	0.25	0.16	-0.22	-0.2	-0.47	1.13	-0.35	-0.27	-0.35	-0.22	-0.59	0.09	0.24	0.4
Lsat_1_v5_gn_0_5460.1 (VPS11)	-0.56	-0.51	-0.84	-0.92	0.59	0.57	-0.28	-0.24	-0.47	-0.41	-0.17	-0.34	0.31	0.73	0.31	0.06	-0.3	-0.11	-0.11	-0.58	-0.56	-0.51	1.39	-0.33	-0.26	-0.42	-0.19	-0.43	0.21	0.29	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_115460.1	-0.58	-0.41	-0.67	-0.24	0.23	0.07	-0.23	-0.24	-0.29	-0.03	0.01	0.03	0.27	0.69	0.45	0.01	-0.18	-0.0	-0.16	-0.4	-0.31	-0.29	0.9	-0.33	-0.19	-0.12	-0.2	-0.38	0.24	0.19	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_1301.1	-0.76	-0.77	-0.4	-0.21	0.32	0.25	-0.47	-0.91	-0.09	-0.15	-0.14	-0.18	-0.13	0.53	0.39	-0.05	-0.41	0.68	-0.09	-0.41	-0.46	-0.3	1.51	-0.53	-0.32	-0.33	-0.21	-0.48	0.17	0.26	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_24520.1	-0.42	-0.45	-0.54	-0.54	0.31	0.32	-0.38	-0.14	-0.5	-0.33	-0.2	-0.42	0.22	0.72	0.48	-0.0	-0.16	0.08	-0.14	-0.31	-0.07	-0.19	1.09	-0.28	-0.13	-0.02	-0.11	-0.34	0.13	0.05	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_39500.1	-1.96	-1.36	-2.42	-2.28	-0.28	0.53	-0.19	-0.24	-0.49	-0.57	-0.3	-0.61	-0.15	0.83	0.48	-0.05	-0.46	0.96	0.02	-0.48	-0.4	-0.17	1.58	-0.24	-0.16	-0.21	-0.09	-0.83	0.58	0.72	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_42900.1 (GYM)	-0.38	-0.27	-0.41	-0.21	0.2	0.11	-0.19	-0.12	-0.36	-0.28	-0.14	-0.23	0.39	0.58	0.35	-0.04	-0.12	0.2	-0.2	-0.41	-0.4	-0.24	1.04	-0.34	-0.25	-0.28	-0.3	-0.4	0.21	0.24	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_52621.1	-0.31	-0.24	-0.32	-0.02	0.53	0.21	-0.53	-0.63	-0.26	-0.28	-0.08	-0.19	0.03	0.6	0.42	-0.08	-0.42	0.2	-0.08	-0.4	-0.42	-0.17	1.21	-0.36	-0.35	-0.25	-0.24	-0.33	0.27	0.24	0.42
Lsat_1_v5_gn_1_65961.1 (VHA-D)	-0.13	-0.24	-0.34	-0.38	0.36	0.32	-0.3	-0.38	-0.23	-0.21	-0.03	-0.14	0.0	0.35	0.1	-0.11	-0.15	0.14	0.13	-0.16	-0.05	0.08	0.53	-0.03	-0.02	-0.04	-0.05	0.0	0.18	0.16	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_77661.1 (SETH2)	-0.86	-0.62	-1.07	-1.46	0.99	0.42	-1.34	-1.22	-0.56	-0.39	-0.4	-0.72	0.0	0.94	0.44	-0.38	-0.55	0.46	-0.23	-1.0	-0.6	-0.75	2.36	-0.69	-0.63	-0.36	-0.55	-0.7	0.18	0.2	0.62
Lsat_1_v5_gn_2_111660.1	-0.48	-0.51	-0.62	-0.5	0.11	0.06	-0.25	-0.21	-0.45	-0.33	-0.15	-0.28	0.02	0.82	0.55	-0.02	-0.19	0.41	-0.01	-0.44	-0.4	-0.38	1.26	-0.38	-0.35	-0.29	-0.29	-0.52	0.32	0.41	0.67
Lsat_1_v5_gn_2_70380.1 (MSL2)	-0.53	-0.66	-1.05	-0.87	0.15	0.06	-0.17	-0.0	-0.33	-0.45	-0.25	-0.24	-0.09	0.62	0.43	-0.12	-0.21	0.64	0.2	-0.12	-0.23	-0.14	1.1	-0.06	-0.08	-0.19	-0.1	-0.29	0.14	0.2	0.55
Lsat_1_v5_gn_2_78401.1	-0.29	-0.35	-0.6	-0.29	0.19	0.08	-0.34	-0.34	-0.17	-0.27	-0.0	-0.13	0.16	0.67	0.55	0.14	-0.2	0.04	0.01	-0.28	-0.22	-0.23	0.97	-0.25	-0.15	-0.09	-0.03	-0.42	0.12	0.03	0.41
Lsat_1_v5_gn_2_8701.1	-0.79	-0.75	-0.83	-0.48	0.55	0.43	-0.04	0.23	-0.44	-0.43	-0.26	-0.53	-0.21	0.61	0.47	-0.12	-0.41	-0.1	0.01	-0.46	-0.24	-0.15	1.1	-0.27	-0.18	-0.04	-0.11	-0.24	0.47	0.24	0.63
Lsat_1_v5_gn_2_87621.1	-0.64	-0.52	-0.45	-0.28	0.29	0.16	-0.38	-0.28	-0.26	-0.25	-0.15	-0.3	0.12	0.72	0.58	-0.11	-0.27	0.31	-0.19	-0.15	-0.21	-0.15	0.89	-0.18	-0.28	-0.11	-0.11	-0.32	0.18	0.22	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_90061.1 (PLDrp1)	-0.78	-0.57	-0.59	-0.43	0.39	0.36	-0.24	-0.27	-0.39	-0.35	-0.27	-0.38	-0.23	0.58	0.49	0.06	-0.15	0.52	0.2	-0.24	-0.2	-0.11	1.14	-0.29	-0.19	-0.22	-0.13	-0.45	0.35	0.18	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_92701.1 (SUO)	-0.52	-0.34	-0.57	-0.38	0.32	0.16	-0.27	-0.25	-0.37	-0.18	-0.24	-0.32	0.07	0.88	0.47	0.02	-0.1	0.41	-0.11	-0.46	-0.37	-0.28	1.01	-0.38	-0.33	-0.11	-0.2	-0.34	0.28	0.23	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_102821.1	-0.39	-0.34	-0.86	-0.71	0.4	0.4	-0.24	-0.15	-0.17	-0.19	-0.09	-0.24	0.13	0.59	0.4	-0.09	-0.06	-0.09	-0.09	-0.3	-0.31	-0.11	1.0	-0.36	-0.09	-0.09	0.05	-0.24	0.11	0.32	0.3
Lsat_1_v5_gn_3_107201.1	-0.67	-0.71	-0.56	-0.26	0.13	0.0	-0.53	-0.58	-0.27	-0.13	-0.16	-0.14	0.31	0.66	0.47	0.16	-0.06	0.09	-0.16	-0.31	-0.2	-0.05	1.09	-0.29	-0.13	-0.14	-0.03	-0.32	0.14	0.27	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_115781.1 (BSL3)	-0.34	-0.13	-0.32	-0.07	0.46	0.14	-0.42	-0.37	-0.33	-0.31	-0.12	-0.27	0.29	0.73	0.39	-0.01	-0.18	0.09	-0.29	-0.44	-0.35	-0.27	0.91	-0.38	-0.2	-0.24	-0.24	-0.34	0.28	0.26	0.57
Lsat_1_v5_gn_3_117820.1	-0.64	-0.83	-0.68	-0.66	-0.12	-0.28	-0.19	-0.17	-0.14	-0.27	-0.14	-0.15	0.11	0.65	0.65	0.33	0.0	0.29	0.13	-0.14	-0.22	-0.16	1.15	-0.21	-0.18	-0.09	-0.04	-0.36	0.04	0.11	0.34
Lsat_1_v5_gn_3_129280.1 (NTP9)	-1.01	-0.85	-0.61	-0.3	0.2	-0.0	-0.3	-0.56	-0.31	-0.19	-0.08	-0.22	-0.03	0.77	0.51	-0.09	-0.25	0.63	0.11	-0.22	-0.24	-0.4	1.15	-0.3	-0.23	-0.14	-0.26	-0.45	0.22	0.29	0.71
Lsat_1_v5_gn_3_131781.1 (FBX5)	-0.77	-0.81	-0.85	-0.58	0.19	0.09	-0.33	-0.22	-0.24	-0.21	-0.12	-0.18	0.23	0.66	0.49	-0.07	-0.21	0.1	-0.08	-0.25	-0.22	-0.13	1.07	-0.1	-0.05	-0.21	-0.2	-0.44	0.26	0.38	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_132801.1 (GTA2)	-0.39	-0.43	-0.68	-0.52	0.29	0.2	-0.25	-0.08	-0.32	-0.25	-0.21	-0.27	0.21	0.81	0.52	-0.07	-0.23	0.02	-0.09	-0.4	-0.28	-0.27	1.16	-0.36	-0.29	-0.28	-0.32	-0.43	0.21	0.22	0.73
Lsat_1_v5_gn_3_137161.1 (CCT)	-0.6	-0.49	-0.58	-0.21	0.29	0.09	-0.37	-0.42	-0.36	-0.31	-0.16	-0.28	-0.02	0.88	0.56	0.04	-0.26	0.42	-0.14	-0.48	-0.32	-0.36	1.12	-0.38	-0.26	-0.27	-0.24	-0.49	0.39	0.35	0.59
Lsat_1_v5_gn_3_140700.1 (VPS8)	-0.47	-0.2	-0.66	-0.61	0.42	0.28	-0.27	-0.51	-0.15	-0.08	-0.06	-0.12	0.16	0.63	0.51	0.09	-0.1	-0.34	-0.05	-0.35	-0.35	-0.2	0.88	-0.39	-0.29	-0.14	-0.18	-0.16	0.28	0.27	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_28241.1	-0.19	-0.4	-0.41	-0.41	0.58	0.42	-0.18	-0.2	-0.38	-0.23	-0.27	-0.44	0.05	0.5	0.17	-0.25	-0.5	0.33	0.16	-0.23	-0.08	-0.07	0.75	-0.15	-0.11	-0.03	-0.07	0.0	0.22	0.06	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_32540.1 (NEF1)	-0.5	-0.42	-0.58	-0.2	0.29	0.3	-0.21	-0.37	-0.31	-0.31	-0.16	-0.2	0.2	0.61	0.41	0.22	-0.02	0.03	0.03	-0.21	-0.11	-0.05	0.62	-0.26	-0.14	-0.07	-0.18	-0.1	0.13	0.14	0.43
Lsat_1_v5_gn_3_33541.1 (MAP3KE1)	-0.34	-0.33	-0.21	-0.05	0.39	0.13	-0.27	-0.33	-0.18	-0.17	0.01	-0.14	-0.05	0.59	0.34	0.01	-0.17	0.0	-0.14	-0.33	-0.21	-0.21	0.77	-0.3	-0.27	-0.09	-0.14	-0.27	0.26	0.22	0.5
Lsat_1_v5_gn_3_49260.1 (SNL3)	-0.76	-0.52	-0.71	-0.59	0.15	0.12	-0.14	-0.16	-0.3	-0.22	-0.05	-0.27	0.18	0.63	0.44	-0.05	-0.21	0.03	0.05	-0.24	-0.22	-0.06	1.0	-0.21	-0.23	-0.2	-0.03	-0.21	0.23	0.23	0.71
Lsat_1_v5_gn_3_55840.1 (MED23)	-0.5	-0.42	-0.43	-0.14	0.44	0.03	-0.51	-0.64	-0.21	-0.21	-0.14	-0.3	-0.08	0.95	0.62	-0.05	-0.24	-0.03	-0.04	-0.47	-0.39	-0.28	1.12	-0.43	-0.4	-0.23	-0.23	-0.32	0.29	0.32	0.68
Lsat_1_v5_gn_3_62981.1 (TAFL)	-0.31	-0.82	-0.48	-0.06	0.26	0.33	-0.4	-0.47	-0.18	-0.33	-0.06	-0.27	-0.14	0.84	0.71	0.03	-0.27	0.1	-0.23	-0.32	-0.39	-0.22	1.13	-0.36	-0.19	-0.18	-0.21	-0.21	0.23	0.07	0.42
Lsat_1_v5_gn_3_7681.1	-0.33	-0.22	-0.46	-0.14	0.43	0.15	-0.48	-0.41	-0.21	-0.24	-0.24	-0.28	0.09	0.65	0.5	-0.06	-0.27	0.08	-0.09	-0.31	-0.3	-0.27	1.2	-0.38	-0.37	-0.33	-0.25	-0.23	0.19	0.15	0.59
Lsat_1_v5_gn_3_9121.1 (GC6)	-0.5	-0.38	-0.34	-0.17	0.46	0.34	-0.2	-0.31	-0.27	-0.24	-0.11	-0.32	0.04	0.68	0.41	-0.06	-0.25	-0.01	-0.14	-0.29	-0.34	-0.21	0.96	-0.36	-0.23	-0.15	-0.19	-0.35	0.26	0.27	0.55
Lsat_1_v5_gn_3_98161.1 (SCC2)	-0.38	-0.32	-0.5	-0.35	0.19	0.04	-0.36	-0.47	-0.27	-0.12	-0.07	-0.12	0.19	0.62	0.49	0.05	-0.13	-0.1	0.05	-0.38	-0.41	-0.39	1.02	-0.39	-0.2	-0.21	-0.26	-0.32	0.31	0.41	0.7
Lsat_1_v5_gn_4_102000.1 (SNX3)	-0.83	-0.42	-0.53	-0.45	0.66	0.43	-0.17	-0.36	-0.22	-0.18	-0.04	-0.15	-0.25	0.67	0.45	0.11	-0.22	-0.14	0.02	-0.31	-0.15	-0.19	0.83	-0.33	-0.27	-0.09	-0.13	-0.24	0.3	0.28	0.33
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.