1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_276 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000403 (PMM)
 0.31 0.39 0.31 0.34 0.54 0.42 0.69 0.72 0.29 0.55 0.33 0.46 0.69 0.31 0.27 0.6 0.99 0.46 0.33 0.47 0.64 0.61 0.98 0.86 1.0 0.78 0.98 0.78 0.56 0.71 0.83
Bra001131 (CYSD1)
 0.05 0.02 0.03 0.02 0.14 0.31 0.08 0.16 0.12 0.1 0.15 0.06 0.31 0.59 0.56 0.23 0.19 0.39 0.25 0.13 0.12 0.1 0.61 0.59 0.55 0.35 0.52 0.54 0.8 0.7 1.0
Bra002877 (CRR21)
 0.65 0.27 0.4 0.61 0.57 0.38 0.88 0.67 0.44 0.61 0.61 0.65 0.92 0.36 0.48 0.74 0.93 0.5 0.64 0.66 0.55 0.42 0.49 0.72 0.67 0.76 0.7 0.86 0.61 0.64 1.0
Bra003045 (PLR1)
 0.42 0.36 0.41 0.4 0.63 0.79 0.84 0.87 0.55 0.82 0.63 0.59 0.61 0.58 0.75 0.83 0.54 0.5 0.72 0.88 0.61 0.56 0.55 0.83 0.87 0.77 0.82 0.86 0.92 0.79 1.0
Bra003788 (QKY)
 0.41 0.29 0.29 0.22 0.58 0.44 0.63 0.95 0.47 0.39 0.53 0.62 0.81 0.69 0.76 0.61 0.65 0.56 0.43 0.51 0.59 0.48 0.79 0.9 0.81 0.51 0.92 0.69 0.75 0.74 1.0
Bra003833 (alpha-DOX2)
 0.29 0.17 0.14 0.23 0.48 0.83 0.68 0.72 0.7 0.64 0.59 0.67 0.69 0.66 0.64 0.84 0.83 0.43 0.73 0.79 0.77 0.61 0.48 0.82 0.85 0.71 0.83 0.79 0.91 0.76 1.0
0.03 0.08 0.04 0.03 0.08 0.14 0.07 0.06 0.27 0.11 0.16 0.13 0.18 0.59 0.33 0.16 0.36 0.19 0.15 0.12 0.06 0.14 0.41 0.51 0.51 0.5 0.55 0.57 0.93 0.87 1.0
Bra004001 (CM3)
 0.2 0.11 0.1 0.1 0.31 0.18 0.24 0.12 0.24 0.38 0.19 0.25 0.26 0.31 0.18 0.39 0.35 0.12 0.3 0.33 0.15 0.15 0.16 0.73 0.74 0.56 0.6 0.36 0.51 0.65 1.0
Bra004144 (HKL)
 0.02 0.15 0.13 0.21 0.61 0.47 0.4 0.56 0.18 0.2 0.21 0.24 0.79 0.58 0.67 0.49 0.38 0.32 0.48 0.26 0.48 0.39 0.77 1.0 0.62 0.59 0.86 0.7 0.7 0.62 0.78
Bra004318 (CRF10)
 0.28 0.24 0.28 0.23 0.44 0.4 0.28 0.42 0.17 0.26 0.25 0.22 0.49 0.47 0.52 0.45 0.41 0.55 0.33 0.21 0.28 0.19 0.6 0.73 0.74 0.6 0.76 0.69 0.76 0.66 1.0
Bra004378 (ARC12)
 0.47 0.41 0.43 0.48 0.6 0.56 0.66 0.59 0.64 0.76 0.74 0.73 0.65 0.61 0.62 0.72 0.75 0.5 0.67 0.76 0.68 0.72 0.48 0.96 0.93 0.86 0.9 0.97 0.82 0.9 1.0
0.51 0.41 0.57 0.56 0.56 0.55 0.74 0.68 0.4 0.53 0.5 0.53 0.65 0.38 0.41 0.68 0.66 0.45 0.55 0.63 0.42 0.41 0.42 0.76 0.77 0.73 0.65 1.0 0.72 0.56 0.7
Bra005386 (PSA2)
 0.28 0.25 0.21 0.29 0.53 0.68 0.3 0.81 0.36 0.72 0.62 0.28 0.61 0.35 0.7 0.72 0.64 0.38 0.45 0.56 0.41 0.61 0.3 0.8 0.81 0.65 0.84 0.99 0.8 0.71 1.0
Bra006200 (ATP5)
 0.23 0.32 0.31 0.27 0.47 0.34 0.43 0.46 0.28 0.43 0.21 0.29 0.51 0.34 0.32 0.35 0.43 0.54 0.3 0.5 0.38 0.34 1.0 0.71 0.72 0.66 0.73 0.71 0.48 0.52 0.45
Bra006838 (LUT2)
 0.4 0.27 0.33 0.49 0.63 0.59 0.74 0.7 0.67 0.76 0.72 0.7 0.68 0.49 0.44 0.74 0.87 0.35 0.63 0.69 0.62 0.68 0.22 0.78 0.83 0.71 0.74 0.81 1.0 0.79 0.84
0.11 0.04 0.13 0.11 0.39 0.34 0.21 0.23 0.3 0.29 0.25 0.18 0.39 0.55 0.41 0.28 0.28 0.38 0.28 0.17 0.18 0.21 0.51 0.5 0.59 0.59 0.48 0.55 1.0 0.63 0.74
0.52 0.42 0.55 0.41 0.45 0.61 0.77 1.0 0.61 0.46 0.87 0.68 0.95 0.53 0.82 0.85 0.86 0.83 0.62 0.74 0.58 0.82 0.33 0.6 0.72 0.68 0.76 0.62 0.78 0.84 0.91
Bra007201 (PLC7)
 0.0 0.15 0.12 0.05 0.0 0.19 0.29 0.5 0.46 1.0 0.73 0.66 0.47 0.48 0.99 0.54 0.42 0.49 0.57 0.55 0.27 0.54 0.53 0.45 0.27 0.24 0.28 0.47 0.42 0.38 0.37
0.3 0.39 0.32 0.24 0.5 0.49 0.63 0.83 0.61 0.46 0.53 0.52 0.85 0.77 0.77 0.58 0.58 0.57 0.56 0.54 0.54 0.74 0.68 0.77 0.78 0.73 0.82 0.79 0.81 0.73 1.0
Bra007566 (ARP7)
 0.13 0.17 0.15 0.16 0.14 0.24 0.44 0.62 0.38 0.56 0.6 0.67 0.46 0.67 0.37 0.56 0.83 0.51 0.62 0.56 0.46 0.41 1.0 0.66 0.74 0.74 0.61 0.59 0.68 0.56 0.92
0.3 0.18 0.17 0.22 0.45 0.56 0.49 0.4 0.44 0.66 0.53 0.41 0.71 0.51 0.76 0.72 0.69 0.56 0.4 0.69 0.62 0.91 1.0 0.83 0.9 0.73 1.0 0.38 0.34 0.58 0.93
0.52 0.52 0.54 0.42 0.56 0.34 0.58 0.53 0.37 0.6 0.47 0.38 0.9 0.24 0.23 0.77 0.86 0.98 0.36 0.48 0.54 0.52 0.49 0.81 0.72 0.88 0.73 0.91 0.82 0.69 1.0
0.13 0.17 0.13 0.16 0.14 0.62 0.89 0.56 0.32 0.44 0.46 0.34 0.45 0.48 0.59 0.89 0.84 0.16 0.65 1.0 0.79 0.72 0.46 0.78 0.85 0.77 0.7 0.47 0.67 0.27 0.7
Bra011437 (SPPL1)
 0.32 0.07 0.26 0.17 0.2 0.56 0.33 0.7 0.53 0.62 0.7 0.77 0.47 0.69 1.0 0.48 0.51 0.79 0.56 0.57 0.53 0.65 0.89 0.67 0.47 0.63 0.56 0.84 0.68 0.62 0.58
Bra012451 (CLE9)
 0.09 0.11 0.13 0.1 0.39 0.25 0.25 0.26 0.37 0.46 0.41 0.44 0.2 0.55 0.36 0.51 0.37 0.56 0.33 0.49 0.42 0.32 0.24 0.86 0.78 0.9 0.76 0.67 0.95 0.7 1.0
Bra014251 (SCL3)
 0.19 0.14 0.27 0.17 0.35 0.65 0.6 0.45 0.59 0.53 0.72 0.46 0.53 0.55 0.69 0.71 0.78 0.37 0.35 0.51 0.49 0.61 0.75 0.97 1.0 0.7 0.91 0.83 0.99 0.65 0.65
Bra014437 (PIP1)
 0.07 0.28 0.23 0.07 0.13 0.41 0.41 0.5 0.53 0.73 0.53 0.51 1.0 0.78 0.65 0.81 0.96 0.55 0.58 0.58 0.76 0.53 0.85 0.83 0.92 0.79 0.85 0.64 0.8 0.61 1.0
0.18 0.12 0.15 0.24 0.2 0.42 0.72 0.6 0.42 0.42 0.51 0.56 0.66 0.15 0.18 0.7 0.48 0.32 0.54 0.44 0.5 0.45 0.2 0.96 0.9 0.66 0.7 1.0 0.88 0.4 0.76
0.05 0.07 0.03 0.03 0.16 0.27 0.31 0.22 0.31 0.35 0.24 0.33 0.18 0.16 0.17 0.32 0.4 0.06 0.64 0.42 0.57 0.45 0.32 1.0 0.98 0.47 0.99 0.74 0.97 0.67 0.81
0.36 0.38 0.39 0.32 0.56 0.45 0.35 0.34 0.31 0.3 0.39 0.22 0.34 0.49 0.52 0.43 0.33 0.38 0.4 0.25 0.23 0.33 0.77 0.68 0.77 0.65 0.73 0.69 0.77 0.68 1.0
Bra016487 (APS2)
 0.06 0.07 0.03 0.03 0.21 0.17 0.29 0.34 0.4 0.35 0.38 0.48 0.28 0.61 0.59 0.7 0.33 0.34 0.39 0.36 0.6 0.55 0.44 0.98 1.0 0.78 0.98 0.9 0.97 0.7 0.93
0.5 0.36 0.45 0.41 0.56 0.47 0.53 0.48 0.51 0.6 0.68 0.49 0.56 0.38 0.33 0.55 0.56 0.38 0.43 0.6 0.62 0.55 0.37 0.89 0.91 0.71 0.81 0.83 0.76 0.78 1.0
0.08 0.08 0.08 0.05 0.14 0.3 0.12 0.38 0.33 0.32 0.76 0.13 0.35 0.22 0.15 0.43 0.51 0.46 0.17 0.5 0.31 0.39 0.44 0.87 0.86 0.72 0.95 0.52 0.55 1.0 0.91
0.37 0.33 0.31 0.57 0.54 0.72 0.89 0.84 0.39 0.53 0.59 0.42 0.7 0.63 0.54 0.76 0.79 0.45 0.52 0.9 0.88 0.66 0.47 0.92 0.96 0.85 0.87 1.0 0.71 0.51 0.77
Bra018386 (GSTU5)
 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.13 0.26 0.14 0.09 0.08 0.06 0.09 0.42 0.35 0.31 0.23 0.26 0.1 0.16 0.16 0.17 0.05 0.73 0.67 0.62 0.41 0.52 0.42 0.54 0.28 1.0
Bra018700 (mtLPD1)
 0.2 0.14 0.13 0.23 0.46 0.57 0.68 0.58 0.5 0.58 0.52 0.5 0.53 0.44 0.42 0.75 0.71 0.34 0.53 0.58 0.58 0.56 0.43 0.84 0.86 0.72 0.85 0.9 0.97 0.8 1.0
0.56 0.41 0.48 0.46 0.73 0.61 0.54 0.69 0.48 0.66 0.54 0.67 1.0 0.34 0.27 0.62 0.69 0.73 0.52 0.64 0.67 0.64 0.72 0.89 0.9 0.74 0.89 0.78 0.67 0.79 1.0
Bra019214 (PGI)
 0.34 0.36 0.21 0.38 0.5 0.66 0.87 0.97 0.53 0.65 0.62 0.57 0.59 0.67 0.65 0.71 0.68 0.68 0.74 0.59 0.65 0.62 0.23 0.79 0.79 0.71 0.84 1.0 0.81 0.94 0.93
Bra019532 (DALL2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.41 0.45 0.08 1.0 0.6 0.67 0.63 0.89 0.78 0.47 0.46 0.25 0.89 0.26 0.56 0.4 0.61 0.37 0.19 0.2 0.53 0.86 0.71 0.77
0.15 0.16 0.15 0.07 0.37 0.4 0.26 0.4 0.35 0.44 0.42 0.41 0.45 0.56 0.64 0.35 0.38 0.51 0.44 0.44 0.35 0.38 0.76 0.91 0.76 0.67 0.67 0.9 0.98 0.94 1.0
0.17 0.13 0.13 0.1 0.26 0.75 0.76 0.7 0.46 0.48 0.44 0.49 0.77 0.38 0.55 0.61 0.88 0.19 0.44 0.6 0.52 0.54 0.35 0.89 1.0 0.58 0.76 0.82 0.81 0.37 0.81
Bra020355 (DDB2)
 0.1 0.17 0.14 0.13 0.26 0.38 0.36 0.41 0.21 0.23 0.2 0.16 0.38 0.38 0.45 0.38 0.39 0.5 0.3 0.4 0.31 0.26 1.0 0.84 0.87 0.43 0.81 0.68 0.74 0.38 0.71
Bra021784 (DOR)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.05 0.02 0.14 0.1 0.14 0.03 0.01 0.18 0.23 0.19 0.14 0.14 0.29 0.23 0.08 0.1 0.41 0.37 0.41 0.35 0.43 0.39 0.5 0.59 1.0
0.01 0.03 0.02 0.02 0.05 0.16 0.14 0.21 0.21 0.16 0.18 0.09 0.08 0.35 0.59 0.3 0.11 0.29 0.26 0.23 0.03 0.09 0.78 0.66 0.6 0.39 0.61 0.81 1.0 0.81 0.88
Bra022764 (AtHMP52)
 0.25 0.14 0.15 0.15 0.51 0.31 0.62 0.81 0.56 0.62 0.74 0.67 0.86 0.3 0.27 0.78 0.63 0.44 0.45 0.73 0.7 0.61 0.33 0.91 0.85 0.71 0.85 1.0 0.79 0.69 0.94
Bra023372 (LRP1)
 0.04 0.02 0.01 0.0 0.07 0.14 0.15 0.14 0.28 0.19 0.29 0.26 0.57 0.37 0.38 0.38 0.05 0.38 0.22 0.16 0.15 0.05 0.35 0.47 0.55 0.39 0.49 0.61 0.85 0.62 1.0
Bra023597 (ENH1)
 0.46 0.42 0.47 0.55 0.62 0.71 0.84 0.9 0.45 0.57 0.58 0.49 0.72 0.49 0.53 0.86 0.81 0.5 0.62 0.76 0.71 0.6 0.41 0.9 0.91 0.81 0.89 0.71 0.73 0.8 1.0
Bra023897 (GBP)
 0.29 0.31 0.38 0.4 0.48 0.51 0.47 0.61 0.34 0.45 0.5 0.37 0.59 0.45 0.55 0.64 0.68 0.58 0.5 0.47 0.46 0.5 1.0 0.86 0.8 0.68 0.77 0.75 0.64 0.58 0.84
Bra023915 (PBL29)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.03 0.01 0.28 0.65 0.28 0.0 0.0 0.01 0.2 1.0 0.68 0.51 0.4 0.76 0.41 0.53 0.51 0.8
Bra024001 (CYP71B2)
 0.05 0.01 0.0 0.01 0.34 0.43 0.33 0.04 0.21 0.08 0.28 0.17 0.27 0.32 0.09 0.53 0.17 0.1 0.34 0.26 0.24 0.27 0.16 0.75 0.8 0.72 0.85 0.5 1.0 0.79 0.95
Bra024939 (PME5)
 0.03 0.0 0.01 0.06 0.04 0.07 0.27 0.24 0.27 0.48 0.66 0.34 0.51 0.04 0.08 0.19 0.38 0.14 0.21 0.31 0.18 0.2 0.31 0.88 0.72 0.71 0.72 0.63 1.0 0.63 0.66
0.57 0.62 0.53 0.67 0.64 0.84 0.88 0.81 0.65 0.59 0.69 0.64 0.67 0.65 0.61 0.8 0.7 0.48 0.59 0.84 0.71 0.67 0.47 0.89 0.94 0.91 0.95 0.94 1.0 0.75 0.87
0.28 0.23 0.23 0.3 0.47 0.62 0.65 0.61 0.43 0.44 0.44 0.44 0.62 0.62 0.66 0.66 0.62 0.51 0.51 0.58 0.5 0.58 0.85 0.89 0.85 0.68 0.85 0.74 0.86 0.72 1.0
Bra028025 (OHP2)
 0.59 0.58 0.56 0.64 0.47 0.81 0.85 0.82 0.8 0.76 0.88 0.89 0.78 0.7 0.77 0.78 0.84 0.62 0.86 0.83 0.75 0.84 0.55 0.95 0.93 0.87 1.0 0.97 0.91 0.8 0.86
Bra028032 (CEK3)
 0.03 0.03 0.01 0.04 0.03 0.19 0.45 0.86 0.54 0.41 0.53 0.49 0.59 0.61 0.74 0.79 0.72 0.37 0.5 0.38 0.4 0.73 0.3 0.99 0.86 0.64 0.69 0.95 1.0 0.75 0.69
0.4 0.54 0.55 0.53 0.6 0.45 0.67 0.71 0.43 0.67 0.59 0.56 0.84 0.54 0.54 0.74 0.71 0.6 0.54 0.66 0.61 0.64 1.0 0.93 0.92 0.86 0.96 0.86 0.75 0.75 0.82
Bra030219 (IAA8)
 0.49 0.45 0.36 0.43 0.82 0.72 0.81 0.65 0.69 0.8 0.84 0.7 0.79 0.6 0.61 0.98 0.82 0.58 0.71 0.77 0.84 0.79 0.32 0.96 1.0 0.86 1.0 0.97 0.8 0.76 0.76
Bra030544 (GBPL1)
 0.5 0.4 0.46 0.35 0.69 0.47 0.34 0.5 0.38 0.38 0.37 0.25 0.61 0.36 0.49 0.44 0.37 0.48 0.34 0.37 0.41 0.33 0.94 0.73 0.78 0.73 0.69 0.78 0.84 0.82 1.0
Bra031244 (ORRM1)
 0.3 0.19 0.22 0.39 0.53 0.45 0.46 0.86 0.24 0.33 0.39 0.32 0.69 0.52 0.7 0.55 0.45 0.48 0.31 0.45 0.36 0.33 0.73 0.61 0.59 0.47 0.67 0.58 0.4 0.37 1.0
0.54 0.45 0.51 0.56 0.58 0.61 0.75 0.77 0.54 0.62 0.53 0.45 0.72 0.49 0.43 0.65 0.68 0.49 0.7 1.0 0.98 0.9 0.47 0.81 0.84 0.74 0.82 0.85 0.86 0.64 0.78
Bra031739 (TMN1)
 0.45 0.52 0.47 0.45 0.63 0.54 0.47 0.45 0.36 0.44 0.38 0.52 0.46 0.7 0.62 0.53 0.41 0.72 0.46 0.46 0.43 0.4 1.0 0.76 0.76 0.73 0.87 0.8 0.72 0.74 0.96
0.07 0.0 0.02 0.05 0.09 0.25 0.43 0.62 0.54 0.4 0.42 0.36 0.18 0.38 0.2 0.44 0.6 0.2 0.4 0.27 0.4 0.4 0.1 0.89 0.67 0.51 0.68 0.68 1.0 0.92 0.7
0.23 0.24 0.65 0.31 0.41 0.38 0.35 0.52 0.6 0.55 0.54 0.57 0.61 0.94 0.75 0.6 0.56 0.5 0.38 0.63 0.55 0.45 0.95 0.59 0.54 0.54 0.66 0.85 0.78 1.0 0.6
Bra032956 (PES2)
 0.36 0.18 0.19 0.09 0.41 0.26 0.53 0.43 0.47 0.7 0.33 0.5 0.36 0.31 0.16 0.55 0.57 0.12 0.31 0.44 0.42 0.52 0.28 0.88 0.91 0.9 0.8 1.0 0.76 0.55 0.59
Bra033902 (RAF36)
 0.18 0.0 0.02 0.06 0.15 0.17 0.1 0.09 0.14 0.17 0.21 0.19 0.06 0.12 0.23 0.41 0.16 0.07 0.24 0.19 0.14 0.07 0.27 0.69 0.95 0.71 0.73 0.38 0.48 0.41 1.0
0.18 0.09 0.06 0.33 0.36 0.51 0.61 0.33 0.53 0.41 0.46 0.51 0.34 0.12 0.21 0.33 0.24 0.23 0.58 0.68 0.41 0.47 0.21 1.0 0.94 0.66 0.95 0.82 0.88 0.51 0.52
0.17 0.36 0.33 0.23 0.27 0.22 0.18 0.21 0.26 0.19 0.31 0.32 0.64 0.42 0.33 0.29 0.29 0.37 0.18 0.27 0.13 0.32 0.53 0.69 0.77 0.6 0.63 0.75 0.71 0.65 1.0
Bra036844 (PLP3a)
 0.22 0.33 0.24 0.15 0.34 0.22 0.43 0.37 0.61 0.67 0.48 0.61 1.0 0.87 0.54 0.79 0.52 0.68 0.4 0.68 0.49 0.59 0.68 0.66 0.78 0.63 0.68 0.81 0.71 0.65 0.74
Bra038054 (NUC)
 0.0 0.11 0.06 0.06 0.09 0.18 0.4 0.49 0.63 0.26 0.46 0.71 0.44 0.65 0.79 0.48 0.46 0.4 0.13 0.64 0.37 0.55 1.0 0.6 0.61 0.54 0.6 0.63 0.7 0.97 0.66
0.47 0.22 0.14 0.35 0.7 0.53 0.66 0.62 0.46 0.65 0.63 0.39 0.6 0.34 0.32 0.8 1.0 0.35 0.52 0.77 0.8 0.68 0.09 0.94 0.72 0.67 0.79 0.84 0.72 0.51 0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)