Heatmap: Cluster_4 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10341.1 (WHY2)	-0.54	-0.54	-1.2	-1.15	-0.25	-0.15	-0.38	-0.04	-0.1	-0.25	-0.31	0.02	0.61	0.73	0.32	-0.18	-0.26	-0.04	-0.15	-0.37	-0.15	0.1	0.78	-0.03	-0.06	-0.01	-0.17	-0.31	0.14	0.31	1.14
Lsat_1_v5_gn_0_14661.1 (mtACP2)	-0.3	-0.59	-0.7	-0.62	-0.1	0.06	-0.21	-0.09	-0.27	-0.21	-0.1	0.08	0.67	0.33	0.14	0.1	0.04	0.35	-0.26	-0.04	0.01	-0.03	-0.12	0.28	0.03	0.01	0.02	0.21	-0.04	-0.02	0.47
Lsat_1_v5_gn_0_220.1 (ROC2)	-0.91	-0.92	-1.28	-1.62	-0.61	-0.14	-0.38	0.4	-0.8	-0.71	-0.73	0.0	0.84	1.06	0.53	-0.2	0.06	0.12	-0.07	-0.2	-0.06	0.0	-0.49	0.27	0.17	-0.07	-0.22	-0.11	0.59	0.31	1.1
Lsat_1_v5_gn_0_29081.1	-0.48	-0.54	-0.62	-0.85	0.04	0.22	-0.31	-0.06	-0.16	-0.06	0.04	0.01	0.63	0.59	0.29	0.2	0.17	-0.04	-0.32	-0.26	-0.09	0.05	-0.14	0.06	0.02	-0.01	0.07	0.02	-0.05	-0.01	0.5
Lsat_1_v5_gn_0_9241.1	-0.56	-0.66	-0.5	-0.39	-0.1	0.04	-0.16	-0.08	-0.14	-0.07	-0.07	0.06	0.71	0.62	0.29	0.2	0.17	0.05	-0.35	-0.12	-0.15	-0.11	-0.18	-0.0	-0.1	0.01	-0.16	-0.01	0.14	-0.05	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_103161.1 (SMC5)	-0.5	-0.46	-0.89	-1.07	0.28	0.19	-0.42	-0.25	-0.41	-0.44	-0.35	-0.33	0.89	0.73	0.47	-0.29	-0.46	0.29	-0.12	-0.61	-0.47	-0.3	1.07	-0.54	-0.33	-0.15	-0.14	-0.37	0.08	0.19	1.26
Lsat_1_v5_gn_1_115021.1 (FY)	-0.86	-0.64	-1.0	-0.52	-0.21	-0.19	-0.34	-0.36	-0.25	-0.36	-0.12	-0.11	0.8	0.56	0.41	0.14	0.11	0.12	-0.24	-0.15	-0.07	-0.12	0.75	-0.04	-0.09	0.03	-0.05	-0.12	0.16	0.17	0.73
Lsat_1_v5_gn_1_17620.1	-1.42	-1.17	-1.12	-1.25	-0.18	-0.22	-0.47	0.07	-0.49	-0.63	-0.69	-0.12	1.45	0.39	-0.07	0.0	-0.27	0.63	-0.59	-0.6	-0.3	-0.02	0.95	-0.35	-0.25	-0.36	-0.44	-0.29	0.2	0.18	1.68
Lsat_1_v5_gn_1_25341.1 (RPS26e)	-1.54	-1.48	-1.89	-1.01	-0.29	-0.02	-0.41	-0.08	-0.3	-0.22	-0.24	0.22	1.43	0.85	0.31	0.06	0.13	0.32	-1.13	-0.31	-0.18	-0.16	0.15	0.35	0.12	-0.02	-0.12	0.1	-0.2	-0.22	1.0
Lsat_1_v5_gn_1_25461.1 (TIC40)	-0.58	-0.6	-0.76	-0.7	-0.26	-0.07	-0.31	-0.3	-0.17	-0.08	0.02	0.21	0.61	0.49	0.18	0.08	0.03	-0.17	0.06	-0.12	-0.04	0.02	0.38	0.24	0.14	0.02	-0.09	0.0	0.02	0.1	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_2721.1	-0.35	-0.47	-0.39	-0.3	0.02	0.03	-0.35	-0.26	-0.25	-0.3	-0.18	-0.06	0.29	0.64	0.27	-0.05	-0.06	-0.42	-0.01	-0.22	-0.06	-0.05	0.57	0.22	0.1	0.04	0.03	-0.17	0.19	0.2	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_29280.1	-1.36	-0.66	-1.14	-1.02	-0.46	0.06	-0.17	0.63	-0.87	-0.66	-0.63	-0.02	0.93	0.78	0.2	-0.14	0.0	-0.04	-0.25	-0.18	-0.31	0.1	0.24	0.15	0.01	-0.33	-0.34	0.16	0.26	0.31	1.2
Lsat_1_v5_gn_1_37961.1	-0.92	-0.97	-1.32	-0.85	-0.65	-0.19	-0.24	0.22	-0.47	-0.42	-0.35	-0.05	1.15	0.41	0.18	-0.13	0.08	0.74	-0.61	-0.01	-0.11	-0.03	0.01	0.44	0.24	0.07	0.0	0.2	-0.01	0.05	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_39481.1 (ONE2)	-0.53	-0.8	-1.28	-1.35	-0.06	0.53	-0.26	0.12	-0.65	-0.63	-0.38	-0.19	0.55	0.84	0.44	0.2	-0.01	-0.24	0.01	-0.14	-0.1	0.08	0.1	0.04	-0.03	-0.01	-0.0	-0.18	0.33	0.21	0.86
Lsat_1_v5_gn_1_52460.1	-0.77	-0.78	-0.72	-0.91	-0.13	0.11	-0.09	0.09	-0.33	-0.42	-0.32	-0.1	0.49	0.57	0.33	0.19	0.14	0.18	-0.01	-0.04	0.09	-0.13	0.41	0.06	-0.15	0.03	-0.04	-0.01	0.21	0.08	0.56
Lsat_1_v5_gn_1_66300.1 (RBP45d)	-0.73	-0.62	-0.7	-0.68	-0.18	-0.04	0.11	0.26	-0.41	-0.27	-0.24	-0.26	0.64	0.54	0.33	-0.05	-0.02	0.59	-0.08	-0.17	-0.21	-0.19	0.53	-0.19	-0.11	-0.11	-0.28	-0.3	0.1	0.21	0.83
Lsat_1_v5_gn_1_6740.1 (MEI1)	-1.26	-0.48	-1.65	-1.6	0.1	-0.49	-0.8	-0.53	-0.62	-0.49	-0.85	-0.32	1.77	0.97	0.3	-0.31	-0.65	0.35	-0.34	-0.25	-0.84	-0.43	0.88	0.02	-0.39	-0.8	-0.65	-0.38	0.14	0.15	1.76
Lsat_1_v5_gn_1_68341.1 (NSE1)	-0.82	-0.54	-1.16	-0.69	0.05	0.02	-0.31	0.0	-1.4	-1.27	-0.58	-0.51	1.19	0.72	0.24	-0.04	-0.2	0.87	0.03	-1.43	-0.72	-0.24	1.51	-0.47	-0.56	-0.55	-0.34	-0.49	-0.47	0.1	1.49
Lsat_1_v5_gn_1_74661.1	-0.76	-0.93	-1.24	-1.11	0.28	0.1	-0.23	-0.11	-0.54	-0.56	-0.53	-0.45	1.5	0.56	0.3	-0.34	-0.18	0.86	-0.58	-0.48	-0.39	-0.31	0.83	-0.21	0.02	-0.35	-0.31	-0.52	-0.22	-0.09	1.27
Lsat_1_v5_gn_1_75641.1 (PUB59)	-0.9	-0.62	-1.01	-0.8	0.13	0.23	-0.06	0.41	-0.46	-0.39	-0.31	-0.12	0.84	0.77	0.32	0.01	-0.01	0.14	-0.37	-0.36	-0.21	-0.2	0.5	-0.06	-0.1	-0.15	-0.25	-0.07	0.18	0.13	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_77581.1	-0.7	-0.67	-0.78	-0.71	0.05	0.06	-0.03	0.2	-0.51	-0.32	-0.3	-0.06	0.91	0.32	0.14	0.0	0.13	-0.01	-0.33	-0.11	-0.13	0.04	0.67	-0.12	-0.11	-0.06	-0.08	-0.04	0.09	0.07	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_111181.1	-0.44	-0.45	-0.42	-0.29	-0.05	0.2	-0.08	-0.12	-0.12	-0.06	-0.07	0.1	0.69	0.38	0.09	0.08	0.18	-0.44	-0.24	-0.14	-0.07	0.06	0.06	0.19	0.14	-0.04	-0.08	0.09	-0.17	-0.12	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_112001.1 (KTF1)	-0.19	-0.22	-0.21	-0.06	0.19	-0.02	-0.27	-0.36	-0.17	-0.09	-0.13	-0.16	0.59	0.67	0.31	-0.18	-0.13	-0.68	-0.25	-0.35	-0.45	-0.26	0.65	-0.23	-0.17	-0.18	-0.26	-0.31	0.23	0.31	0.91
Lsat_1_v5_gn_2_112741.1	-0.8	-1.38	-0.96	-0.92	-0.44	-0.04	-0.45	0.19	-0.63	-0.53	-0.58	-0.0	1.15	0.63	0.37	0.02	-0.01	0.23	-0.47	-0.22	-0.11	-0.1	0.08	0.39	0.15	-0.06	-0.08	0.09	0.2	0.11	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_115321.1 (PGP1)	-0.75	-0.72	-0.85	-0.33	-0.24	-0.05	-0.13	0.03	-0.12	0.03	-0.11	0.18	0.62	0.39	0.2	0.11	0.13	-0.92	-0.26	0.05	0.04	0.03	0.49	0.31	-0.11	0.1	-0.2	0.14	0.0	-0.01	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_124500.1 (APC1)	-0.7	-0.82	-1.6	-1.5	0.13	0.01	-0.83	-0.68	-0.5	-0.6	-0.52	-0.32	1.1	0.95	0.29	-0.17	-0.31	0.08	-0.18	-0.47	-0.47	-0.14	1.1	-0.22	-0.05	-0.21	-0.33	-0.29	0.06	0.39	1.54
Lsat_1_v5_gn_2_16301.1	-0.35	-0.81	-0.74	-0.83	-0.22	0.04	-0.31	-0.11	-0.47	-0.42	-0.31	0.0	0.74	0.67	0.34	0.17	0.05	0.26	-0.36	-0.16	-0.04	0.05	0.49	0.07	-0.07	0.02	-0.16	0.04	-0.07	0.1	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_29981.1 (PREP2)	-1.06	-0.77	-1.41	-0.92	-0.24	-0.02	0.08	0.3	-0.34	-0.26	-0.14	-0.01	1.04	0.36	0.15	0.07	0.1	-0.18	-0.32	-0.1	-0.15	-0.04	0.17	0.05	0.0	0.06	-0.15	0.05	0.08	0.16	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_34620.1	-1.89	-1.16	-1.43	-0.82	-0.17	0.01	-0.12	0.38	-0.76	-0.63	-0.32	-0.11	0.81	0.82	0.4	-0.09	0.08	0.48	-0.16	-0.23	-0.0	-0.17	0.7	-0.07	-0.13	-0.01	-0.35	-0.23	0.32	0.06	0.98
Lsat_1_v5_gn_2_38021.1	-1.54	-0.84	-1.52	-1.82	0.1	0.4	0.11	0.78	-1.04	-1.2	-0.81	-0.33	1.16	0.97	0.08	0.15	-0.3	0.87	-0.73	-0.49	-0.29	-0.37	0.71	-0.15	-0.12	-0.35	-0.75	-0.34	0.02	0.15	1.22
Lsat_1_v5_gn_2_63681.1 (CPNA2)	-0.91	-0.77	-1.27	-1.42	-0.07	0.18	-0.81	-0.19	-0.65	-0.57	-0.44	-0.08	1.1	1.04	0.75	-0.29	-0.35	-1.04	-1.01	-0.74	-0.52	-0.62	1.17	-0.15	-0.26	-0.2	-0.42	-0.22	0.75	0.31	1.47
Lsat_1_v5_gn_2_67081.1	-0.95	-0.59	-1.04	-1.21	0.01	0.38	0.07	0.28	-0.35	-0.38	-0.17	-0.11	0.4	0.44	0.37	0.01	0.01	0.07	0.04	-0.09	-0.07	-0.06	0.11	0.11	0.03	-0.07	-0.0	-0.04	0.15	0.25	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_7780.1 (LARP1a)	-0.88	-0.78	-1.23	-0.58	-0.1	-0.01	-0.09	0.16	-0.29	-0.12	-0.13	0.02	0.96	0.33	0.22	0.2	0.2	-0.13	-0.37	-0.18	-0.17	0.02	0.17	0.02	-0.09	-0.01	-0.07	-0.11	0.25	0.05	0.86
Lsat_1_v5_gn_2_87640.1 (CBF5)	-1.56	-1.53	-1.89	-1.43	-0.28	-0.01	-0.14	0.37	-0.99	-0.86	-0.66	-0.24	1.25	0.88	0.51	0.02	0.1	0.42	-0.5	-0.35	-0.18	-0.05	0.67	0.17	-0.08	-0.1	-0.37	-0.12	0.21	0.0	1.17
Lsat_1_v5_gn_2_97861.1 (EF1alpha)	-0.67	-0.78	-0.98	-0.79	-0.15	0.13	-0.09	0.2	-0.3	-0.21	-0.19	0.14	0.6	0.63	0.21	0.07	0.11	-0.06	-0.33	-0.14	0.01	0.1	0.13	0.23	0.08	0.03	-0.09	0.06	0.09	-0.05	0.61
Lsat_1_v5_gn_3_103300.1	-1.89	-1.08	-1.42	-1.91	-0.42	-0.39	0.14	1.0	-1.15	-0.59	-1.01	-0.15	1.22	0.42	0.03	0.01	0.08	0.65	-0.41	-0.08	-0.12	-0.08	0.59	0.39	0.25	-0.11	-0.17	0.19	-0.08	-0.15	0.83
Lsat_1_v5_gn_3_126201.1 (CHR24)	-0.49	-0.52	-0.94	-1.06	0.21	0.28	-0.48	-0.12	-0.62	-0.58	-0.69	-0.49	1.52	0.62	-0.03	-0.3	-0.4	0.33	-0.6	-0.84	-0.47	-0.49	1.15	-0.35	-0.37	-0.44	-0.59	-0.25	0.12	0.07	1.54
Lsat_1_v5_gn_3_133281.1 (ARK2)	-0.75	-0.79	-0.96	-1.06	-0.03	0.15	-0.59	-0.79	-0.23	-0.14	-0.17	-0.26	0.8	0.84	0.49	0.01	-0.11	0.03	-0.04	-0.09	-0.39	-0.1	0.81	-0.23	-0.18	-0.31	-0.33	-0.27	0.23	0.41	1.07
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.