Heatmap: Cluster_169 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.09 0.27 -1.15 -1.17 1.37 0.55 -0.25 -0.14 -0.28 -0.14 -0.31 -0.44 -1.6 -0.03 0.54 -0.27 -0.76 1.11 -0.3 -0.72 -0.68 -0.49 -0.45 -0.72 -0.91 -0.84 -0.48 -0.13 1.38 1.11 -0.06
0.92 0.75 1.1 1.22 1.04 -0.47 -1.0 0.65 0.39 0.37 0.91 0.94 -0.81 -1.58 -1.27 -1.83 -1.0 -1.52 -0.83 -0.4 -0.83 -1.25 -3.6 -0.08 -0.88 -1.01 -1.21 -0.96 0.47 0.62 -0.0
-0.98 -1.46 -1.51 -0.58 1.23 0.36 -0.22 -0.14 0.11 0.25 0.21 0.15 -1.1 -0.74 0.47 0.35 0.04 0.07 -0.9 -0.46 -0.16 0.05 0.73 -0.25 0.04 0.0 0.09 0.15 0.26 0.53 -0.27
-0.15 -2.98 -1.97 -2.04 2.57 1.95 -0.94 -0.61 -0.8 -0.28 -1.28 -1.28 0.36 -0.41 0.61 -0.17 -1.64 0.73 -0.03 -0.72 -2.95 -0.42 -1.35 -0.08 -0.19 -3.05 -0.51 0.04 -0.45 0.05 0.62
-2.3 -2.39 -5.56 -3.19 2.5 1.79 -1.94 -3.38 -4.1 -3.99 -4.85 -2.66 -2.45 -2.64 0.05 -2.09 -2.36 1.04 0.38 -0.11 0.56 0.45 1.15 0.62 0.2 -0.05 0.33 0.69 0.29 0.29 -0.9
-1.8 -2.6 -0.9 -0.59 0.85 0.79 -0.85 0.6 0.5 0.43 0.19 -0.05 -1.93 0.57 0.86 -0.32 -0.72 -2.26 0.29 0.16 0.54 0.46 -2.5 -0.56 0.02 0.31 0.06 -0.57 0.75 0.59 -0.96
0.76 0.74 -0.66 -1.63 1.85 0.83 0.04 0.83 0.06 -0.13 0.29 0.44 -0.99 -1.46 -1.82 -0.93 -1.24 -2.3 -1.38 -1.38 -0.36 0.12 -4.71 -0.06 0.19 0.06 0.3 0.13 0.27 0.11 0.3
- 1.33 - - 2.67 - 1.34 - - - - 1.93 - - 2.7 - - - - - - - - 1.92 - - - - - 2.46 -
-0.46 0.34 0.54 0.58 0.16 0.43 0.55 0.6 -0.07 0.15 0.29 -0.3 -2.58 0.01 0.1 0.09 -0.28 -5.14 0.06 -0.19 0.28 -0.07 -6.41 -0.67 -0.48 0.06 -0.35 -0.84 0.57 0.82 0.35
-0.69 -0.19 -0.53 0.11 1.87 0.52 -1.22 -0.93 -0.18 -0.33 -0.11 -0.3 -1.32 -0.59 0.29 -0.29 -0.61 1.33 -0.84 -0.7 -0.66 -0.8 0.62 -0.98 -0.68 -0.63 -0.32 -0.49 0.8 0.9 0.26
-0.74 -0.28 -0.73 0.02 1.42 0.1 -1.65 -1.04 0.22 0.26 0.12 0.34 -1.57 -0.91 0.04 -0.5 -0.87 1.41 -1.35 -1.02 -0.89 -0.72 0.49 -0.76 -0.36 -0.66 -0.56 -0.51 0.99 1.44 0.47
-0.57 -0.24 -0.09 0.04 -0.21 0.6 0.78 0.96 0.04 -0.05 -0.27 -0.28 -0.12 0.53 0.17 -0.07 -0.0 -2.31 -0.43 -0.27 -0.09 -0.04 -2.45 -0.18 -0.04 0.12 0.13 -0.31 0.26 0.18 0.43
-0.22 -0.27 -0.22 -0.03 0.3 0.16 0.5 0.55 0.32 0.38 0.28 0.27 -0.71 -0.5 0.05 0.07 -0.07 -2.72 0.18 0.3 0.11 0.18 -2.88 -0.12 -0.17 -0.08 0.05 0.34 0.34 0.14 -0.62
-1.53 -2.84 -0.85 0.93 1.28 0.49 -0.78 -0.21 0.63 0.31 0.79 0.09 -1.83 0.6 0.73 -0.5 -0.82 -0.16 0.13 0.09 -0.36 0.03 -4.56 -0.16 -0.19 -0.27 -0.16 -0.63 -0.31 0.04 0.65
- - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.36 4.08 -
0.79 -0.24 -2.53 -2.28 1.54 0.61 -1.03 -1.09 0.21 -0.23 0.04 -0.73 -2.59 -0.49 0.77 0.41 -0.45 -0.62 -0.63 -0.91 -0.37 -0.42 0.38 -0.63 -0.8 -0.85 -0.15 0.48 1.45 1.32 -1.28
-0.66 -1.3 -0.58 -0.43 0.51 0.93 0.93 0.68 0.19 -0.08 0.04 -0.5 -1.07 -0.16 0.17 -0.04 -0.55 -0.63 0.06 -0.24 -0.05 -0.02 -0.79 -0.04 0.04 -0.19 -0.02 -0.37 0.56 0.37 0.35
-0.86 -0.62 -0.13 0.02 0.24 -0.12 0.17 0.35 0.07 0.1 0.25 0.11 -0.34 0.13 0.28 0.1 0.0 -1.0 -0.02 -0.09 -0.08 -0.26 -6.66 0.27 0.17 0.22 0.09 -0.43 0.27 0.59 0.65
0.17 0.59 -0.0 0.05 0.36 0.23 0.46 0.61 0.21 0.28 0.29 0.26 -1.16 -0.37 -0.34 -0.24 -0.15 -2.68 0.03 -0.09 -0.17 0.04 -5.86 -0.04 0.04 0.14 0.25 0.35 0.38 -0.02 -0.94
-0.56 -0.69 -0.4 -0.08 0.28 0.07 0.26 0.55 0.48 0.28 0.29 0.08 -0.75 0.32 0.01 -0.32 -0.53 -1.74 -0.1 -0.28 -0.15 -0.16 -0.17 -0.16 -0.19 -0.33 -0.15 -0.48 0.64 0.82 0.68
-1.46 -2.68 -0.58 -0.67 0.83 1.14 0.93 0.82 0.35 0.16 -0.66 0.12 -0.79 -0.24 -0.27 -0.12 -1.2 0.55 0.03 -0.61 -0.32 0.1 -1.02 -0.38 -0.02 -0.35 -0.12 -0.02 0.73 0.42 -0.26
0.35 0.18 0.71 -0.15 1.13 0.47 -1.01 -0.16 0.38 0.55 0.8 0.59 -0.21 -2.16 -1.84 0.11 -0.19 -2.24 -0.91 -0.26 -0.5 -0.03 -5.42 -0.0 0.17 -0.23 0.25 -0.24 -0.63 -0.09 0.92
0.02 -0.02 0.02 0.11 0.43 0.48 0.29 0.15 0.12 0.2 0.26 0.18 -0.16 -0.09 0.04 0.09 -0.01 -0.95 -0.09 -0.12 -0.04 0.09 -1.13 -0.26 -0.07 0.03 -0.02 0.02 -0.01 -0.17 -0.35
-0.06 -0.67 -0.28 0.26 0.47 0.45 0.23 0.28 0.18 0.05 0.36 0.18 -0.15 -0.6 0.23 0.17 -0.08 -1.44 -0.43 -0.08 0.07 0.05 -1.77 0.11 0.04 0.23 0.27 -0.18 -0.04 0.13 0.01
-2.57 -3.23 -1.36 0.32 1.33 0.72 -0.51 -0.48 0.66 0.79 0.82 0.44 -1.28 0.14 0.31 -0.23 -0.65 -2.01 0.13 -0.0 0.02 0.18 -3.36 -0.28 -0.39 -0.44 -0.08 -0.02 0.79 0.46 -0.2
-0.78 -0.48 -0.2 0.37 0.47 0.14 -0.58 0.69 0.2 0.27 0.34 0.61 -1.04 0.69 0.63 -0.15 -0.1 -2.45 0.19 0.09 -0.29 -0.17 -2.52 -0.47 -0.53 -0.48 -0.33 -0.54 0.84 0.57 -0.06
- - - - 2.33 0.6 -0.43 - 2.03 -1.51 1.52 -1.26 - 0.95 0.76 - - - 0.1 - 0.1 -1.15 - -1.43 - -1.41 - - 2.01 1.69 0.82
-0.56 - - - 2.75 1.75 -3.65 - 0.95 0.51 -0.48 0.81 - -1.07 0.91 -0.02 -1.97 - -0.54 - 0.4 0.27 - -1.87 -1.3 0.5 0.21 - 0.1 1.18 -0.09
0.26 0.05 0.5 0.68 0.42 0.22 -0.53 -0.19 0.09 0.22 0.33 0.5 0.12 -0.75 -0.79 0.11 -0.03 -1.92 -0.51 -0.25 -0.27 -0.15 -2.06 -0.18 -0.08 -0.03 -0.03 0.03 0.11 0.42 0.54
-0.16 0.34 -1.34 -0.54 1.17 0.59 -0.47 -1.18 0.08 -0.04 0.12 -0.14 -0.96 0.47 0.66 0.12 -0.44 0.27 0.09 -0.67 -0.16 -0.18 -0.19 -0.7 -0.64 -0.23 -0.45 -0.41 0.65 0.54 0.42
-0.36 0.11 0.19 0.38 0.56 0.59 0.2 0.79 -0.07 0.05 0.29 0.13 -0.23 0.31 -0.16 -0.15 -0.52 -2.27 -0.35 -0.58 -0.21 -0.15 -1.54 -0.21 -0.14 -0.14 -0.19 -0.26 0.56 0.38 0.03
-0.91 -0.54 -0.52 0.0 0.4 0.55 0.36 0.57 0.06 0.02 0.18 0.06 -0.54 -0.24 -0.07 0.16 -0.16 -0.09 0.02 0.02 -0.15 0.05 -0.14 -0.09 -0.13 0.2 0.11 -0.24 0.15 0.0 -0.05
-0.34 0.06 -0.07 0.2 1.09 0.38 0.09 0.57 0.35 0.49 0.47 0.54 -1.42 -0.29 -0.71 -0.33 -0.39 -2.96 0.01 -0.11 -0.42 -0.24 -4.11 0.01 -0.18 -0.33 -0.11 -0.51 0.45 0.58 0.39
-1.03 -1.52 -0.71 -0.0 0.63 0.25 -0.54 -0.53 0.24 0.21 0.37 0.33 -0.87 0.41 0.55 0.18 0.06 -0.69 -0.4 -0.4 -0.15 0.25 -0.86 -0.32 0.04 0.23 0.32 -0.18 0.4 0.51 0.44
-1.86 -0.14 -1.55 -2.17 0.74 -0.06 -0.3 0.37 -0.26 -0.39 0.21 -0.25 0.12 0.83 1.1 0.08 -0.71 1.38 0.08 -0.03 -0.74 -1.04 -4.69 -0.0 -0.98 -0.64 -0.25 -1.0 0.91 0.88 0.38
-0.47 -0.03 -0.3 -0.05 -0.18 0.18 0.45 0.29 -0.15 -0.05 -0.01 -0.06 0.09 -0.13 0.12 0.32 0.32 -0.62 0.0 -0.1 -0.06 0.01 -0.44 -0.22 -0.08 0.07 -0.06 0.05 0.3 0.17 0.04
-0.53 -0.3 -0.43 -0.13 0.3 0.44 0.31 0.51 0.29 0.01 0.11 -0.01 -0.64 0.28 0.08 0.1 -0.04 -1.86 -0.27 -0.18 -0.1 -0.04 -0.51 -0.1 -0.24 -0.15 0.12 -0.56 0.62 0.67 0.25
- - - - 3.3 2.08 - - 2.02 - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - 3.01 -
0.53 -0.13 -2.76 -3.8 2.52 1.69 -1.77 -2.99 0.03 -0.7 -0.1 -0.93 -0.25 -6.91 -2.5 -0.55 -1.09 -2.48 -0.58 -0.77 0.21 0.68 -6.35 0.41 0.4 0.24 0.74 0.6 0.37 -0.35 -1.03
-0.53 0.27 -0.96 -0.29 1.0 0.39 -0.92 -0.65 -0.14 -0.39 0.39 -0.52 -1.04 0.5 0.7 0.08 -0.56 0.58 -0.14 -0.46 -0.33 0.0 0.14 -0.6 -0.68 -0.65 -0.25 -0.07 1.14 0.64 -0.27
-0.09 0.37 -0.69 -0.32 1.18 0.54 -0.4 -0.83 0.07 -0.1 0.14 -0.25 -1.59 0.3 0.72 0.2 -0.47 0.03 -0.2 -0.46 -0.17 -0.11 -0.49 -0.78 -0.43 -0.4 -0.17 -0.16 0.97 0.64 -0.34
-0.8 -0.83 -0.63 0.38 0.49 0.4 0.11 0.38 0.36 0.32 0.41 0.13 -0.77 0.38 0.38 -0.11 -0.33 -1.69 -0.1 -0.19 -0.17 -0.05 -1.2 -0.23 -0.14 -0.08 -0.03 -0.36 0.41 0.44 0.45
-0.35 -0.17 -0.03 0.1 -0.04 0.53 0.33 0.52 0.03 0.06 0.07 -0.11 -0.01 -0.48 -0.33 0.11 0.0 -0.94 0.04 -0.26 -0.05 -0.03 -0.48 -0.09 -0.03 0.05 0.02 -0.18 0.33 0.38 0.11
0.07 0.2 0.05 -0.23 0.44 0.26 0.04 0.47 -0.04 0.04 0.11 0.13 -0.1 -0.04 -0.16 -0.01 -0.17 -0.32 -0.13 -0.23 -0.23 -0.07 -0.28 -0.08 -0.11 0.01 0.05 -0.04 -0.0 0.02 0.01
-1.05 -0.16 -0.24 0.18 -0.23 0.7 0.82 0.79 -0.15 -0.18 0.07 -0.43 -0.62 -0.12 0.12 0.33 -0.1 -3.43 -0.55 -0.27 -0.22 -0.0 -0.66 0.09 0.01 0.19 0.21 -0.24 0.24 0.52 0.42
0.2 -0.11 -0.04 0.13 0.32 0.45 0.1 0.11 -0.04 -0.04 0.16 0.06 0.05 0.15 -0.29 -0.22 -0.17 -1.25 -0.24 -0.22 -0.08 0.0 -0.26 0.08 0.03 0.23 0.18 0.2 -0.09 -0.16 0.01
0.04 -1.12 -3.75 -3.14 3.2 1.17 -4.02 -2.86 -0.93 -1.64 -0.62 -2.71 0.07 -2.09 -1.89 -1.09 -3.23 1.96 -2.37 -1.46 -1.51 0.03 0.17 -0.08 -0.77 -1.83 -0.23 -0.07 -0.5 -0.48 0.94
0.1 0.29 -0.5 -0.4 1.26 0.62 -0.02 0.32 -0.05 -0.08 0.07 -0.01 -1.16 0.29 0.17 -0.01 -0.26 -0.97 0.08 -0.21 -0.04 0.18 -0.76 -0.54 -0.2 -0.09 -0.05 0.16 0.23 -0.03 -0.64
-2.97 -1.56 - -4.65 3.09 -0.13 -1.1 -1.16 0.57 -0.18 0.08 -0.02 -4.99 -2.99 -0.08 0.35 0.61 -2.57 -0.04 0.09 -0.2 -0.38 -0.66 -0.48 -0.29 -0.53 0.08 -2.03 1.19 0.28 -1.53
-1.88 -2.46 -1.1 0.11 1.05 0.3 0.76 0.91 0.43 0.25 -0.08 -0.27 -1.72 0.69 0.61 -0.41 -0.46 -0.5 0.45 -0.36 -0.39 -0.52 -1.21 -0.12 -0.1 -0.49 -0.41 -0.32 0.7 0.23 0.29
-0.27 -0.26 -0.56 -0.49 1.69 0.65 0.12 -0.24 0.58 0.47 0.58 0.27 -1.78 -0.43 -0.3 -0.4 -0.91 -3.62 0.18 -0.04 0.18 0.06 -3.39 -0.01 -0.28 -0.44 -0.26 -0.59 0.71 0.33 0.12
0.0 0.43 0.31 0.4 0.71 0.1 -0.03 0.49 0.09 0.07 0.32 0.49 -0.06 -0.37 -0.54 0.1 0.18 -2.84 -0.4 -0.34 -0.29 -0.05 -2.14 -0.07 -0.08 -0.24 -0.19 -0.02 -0.04 0.26 0.18
0.22 0.16 0.23 0.2 0.21 0.37 0.25 0.08 0.08 0.22 0.05 -0.1 -0.13 0.1 0.13 0.12 0.18 -3.1 0.02 -0.08 -0.02 -0.08 -1.44 -0.17 0.12 0.03 0.15 0.13 0.08 -0.12 -0.61
-0.85 -0.86 0.22 1.24 1.19 0.32 -0.01 1.07 0.55 0.33 0.56 0.48 -1.4 0.03 -0.19 0.06 -0.26 -4.94 -0.58 -0.53 -0.41 -0.53 -6.45 -0.33 -0.15 -0.67 -0.12 -0.04 0.1 0.22 -0.55
-1.73 -1.28 -1.23 -0.13 0.87 0.73 0.09 0.19 0.19 0.19 0.41 0.33 -0.57 0.41 0.65 -0.11 -0.4 -0.85 0.12 -0.13 0.18 -0.11 -0.36 -0.11 -0.28 -0.04 0.18 -0.3 0.05 0.07 -0.07
-0.09 -0.82 0.27 1.04 0.4 0.27 0.22 -0.02 0.59 0.55 0.3 0.2 -0.32 -0.7 -0.35 -0.18 -0.31 -1.57 -0.27 -0.1 0.0 -0.09 -2.43 -0.29 0.05 0.14 0.14 -0.21 0.25 0.18 -0.24
0.94 -0.03 -0.18 0.62 1.34 0.2 -0.85 -1.76 0.25 0.17 0.39 -0.0 -3.11 -0.42 0.29 -0.22 -0.81 -0.79 -0.67 -1.14 -1.06 -0.8 -1.94 -0.75 -1.22 -0.81 -0.65 0.12 1.61 1.49 -0.18
0.19 -0.02 -0.1 -0.07 0.36 0.49 0.14 0.27 -0.1 -0.04 -0.0 0.03 0.12 0.03 -0.18 -0.02 -0.11 -1.11 -0.15 -0.24 -0.16 -0.13 0.07 -0.07 -0.06 0.02 -0.02 0.04 0.16 0.06 0.0
0.07 0.34 -0.59 -0.38 1.29 0.48 0.45 -0.54 0.28 0.26 -0.07 -0.12 -0.74 -1.08 0.3 0.21 -0.33 -3.26 0.03 -0.42 0.14 0.13 -1.59 -0.64 -0.52 -0.29 -0.41 -0.24 1.1 0.8 -0.32
0.09 0.29 0.66 1.16 1.34 -0.06 -0.56 0.4 0.65 0.67 0.81 0.95 -1.15 -3.91 -3.16 -0.7 -0.78 -2.91 -1.25 -0.51 -0.23 -0.09 -3.72 -0.1 -0.16 -0.11 -0.02 -0.34 0.01 0.32 -0.3
0.01 0.1 -0.19 0.16 0.9 0.34 0.06 0.57 0.26 0.2 0.23 0.16 -0.46 -0.13 0.09 -0.03 -0.25 -1.89 -0.06 -0.3 -0.04 -0.04 -2.98 -0.2 -0.2 -0.09 0.07 -0.26 0.39 0.31 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.