Heatmap: Cluster_169 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.36 0.46 0.17 0.17 0.99 0.56 0.32 0.35 0.32 0.35 0.31 0.28 0.13 0.37 0.56 0.32 0.23 0.83 0.31 0.23 0.24 0.27 0.28 0.23 0.2 0.21 0.28 0.35 1.0 0.83 0.37
0.82 0.73 0.92 1.0 0.89 0.31 0.22 0.67 0.56 0.55 0.81 0.82 0.25 0.14 0.18 0.12 0.22 0.15 0.24 0.33 0.24 0.18 0.04 0.41 0.23 0.21 0.19 0.22 0.6 0.66 0.43
0.22 0.16 0.15 0.29 1.0 0.55 0.37 0.39 0.46 0.51 0.5 0.47 0.2 0.26 0.59 0.55 0.44 0.45 0.23 0.31 0.38 0.44 0.71 0.36 0.44 0.43 0.45 0.47 0.51 0.62 0.35
0.15 0.02 0.04 0.04 1.0 0.65 0.09 0.11 0.1 0.14 0.07 0.07 0.22 0.13 0.26 0.15 0.05 0.28 0.17 0.1 0.02 0.13 0.07 0.16 0.15 0.02 0.12 0.17 0.12 0.17 0.26
0.04 0.03 0.0 0.02 1.0 0.61 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.18 0.04 0.03 0.36 0.23 0.16 0.26 0.24 0.39 0.27 0.2 0.17 0.22 0.28 0.22 0.22 0.09
0.16 0.09 0.3 0.37 0.99 0.95 0.31 0.84 0.78 0.74 0.63 0.53 0.14 0.82 1.0 0.44 0.34 0.12 0.67 0.62 0.8 0.76 0.1 0.37 0.56 0.69 0.57 0.37 0.92 0.83 0.28
0.47 0.46 0.18 0.09 1.0 0.49 0.28 0.49 0.29 0.25 0.34 0.38 0.14 0.1 0.08 0.15 0.12 0.06 0.11 0.11 0.22 0.3 0.01 0.27 0.32 0.29 0.34 0.3 0.33 0.3 0.34
0.0 0.39 0.0 0.0 0.98 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0
0.41 0.71 0.82 0.84 0.63 0.76 0.83 0.86 0.54 0.63 0.69 0.46 0.09 0.57 0.6 0.6 0.46 0.02 0.59 0.5 0.69 0.54 0.01 0.36 0.41 0.59 0.44 0.32 0.84 1.0 0.72
0.17 0.24 0.19 0.3 1.0 0.39 0.12 0.14 0.24 0.22 0.25 0.22 0.11 0.18 0.33 0.22 0.18 0.69 0.15 0.17 0.17 0.16 0.42 0.14 0.17 0.18 0.22 0.2 0.47 0.51 0.33
0.22 0.3 0.22 0.38 0.99 0.4 0.12 0.18 0.43 0.44 0.4 0.47 0.12 0.2 0.38 0.26 0.2 0.98 0.15 0.18 0.2 0.22 0.52 0.22 0.29 0.23 0.25 0.26 0.73 1.0 0.51
0.34 0.44 0.48 0.53 0.44 0.78 0.88 1.0 0.53 0.5 0.43 0.42 0.47 0.74 0.58 0.49 0.51 0.1 0.38 0.43 0.48 0.5 0.09 0.45 0.5 0.56 0.56 0.41 0.61 0.58 0.69
0.59 0.57 0.58 0.67 0.84 0.76 0.96 1.0 0.85 0.89 0.83 0.82 0.42 0.48 0.7 0.72 0.65 0.1 0.77 0.84 0.74 0.77 0.09 0.63 0.61 0.65 0.71 0.87 0.86 0.75 0.44
0.14 0.06 0.23 0.78 1.0 0.58 0.24 0.36 0.63 0.51 0.71 0.44 0.12 0.62 0.68 0.29 0.23 0.37 0.45 0.44 0.32 0.42 0.02 0.37 0.36 0.34 0.37 0.27 0.33 0.42 0.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 1.0 0.0
0.59 0.29 0.06 0.07 1.0 0.52 0.17 0.16 0.4 0.29 0.35 0.21 0.06 0.24 0.59 0.45 0.25 0.22 0.22 0.18 0.27 0.26 0.45 0.22 0.2 0.19 0.31 0.48 0.94 0.86 0.14
0.33 0.21 0.35 0.39 0.75 1.0 1.0 0.84 0.6 0.5 0.54 0.37 0.25 0.47 0.59 0.51 0.36 0.34 0.55 0.44 0.51 0.52 0.3 0.51 0.54 0.46 0.52 0.41 0.77 0.68 0.67
0.35 0.41 0.58 0.65 0.75 0.59 0.72 0.81 0.67 0.68 0.76 0.69 0.51 0.7 0.77 0.68 0.64 0.32 0.63 0.6 0.6 0.53 0.01 0.77 0.72 0.74 0.68 0.47 0.77 0.96 1.0
0.74 0.99 0.66 0.68 0.85 0.77 0.9 1.0 0.76 0.8 0.81 0.79 0.29 0.51 0.52 0.56 0.59 0.1 0.67 0.62 0.59 0.67 0.01 0.64 0.68 0.72 0.78 0.84 0.86 0.65 0.34
0.38 0.35 0.43 0.54 0.69 0.59 0.68 0.83 0.79 0.69 0.69 0.6 0.34 0.71 0.57 0.45 0.39 0.17 0.53 0.47 0.51 0.51 0.5 0.51 0.5 0.45 0.51 0.41 0.88 1.0 0.91
0.16 0.07 0.3 0.28 0.81 1.0 0.86 0.8 0.58 0.51 0.29 0.49 0.26 0.38 0.38 0.42 0.2 0.66 0.46 0.3 0.36 0.49 0.22 0.35 0.45 0.36 0.42 0.45 0.75 0.61 0.38
0.58 0.52 0.75 0.41 1.0 0.63 0.23 0.41 0.6 0.67 0.8 0.69 0.39 0.1 0.13 0.5 0.4 0.1 0.24 0.38 0.32 0.45 0.01 0.46 0.51 0.39 0.54 0.39 0.3 0.43 0.87
0.73 0.71 0.73 0.78 0.96 1.0 0.88 0.8 0.78 0.82 0.86 0.82 0.65 0.67 0.74 0.77 0.72 0.37 0.67 0.66 0.7 0.77 0.33 0.6 0.68 0.73 0.71 0.73 0.71 0.64 0.57
0.69 0.45 0.6 0.87 1.0 0.99 0.85 0.88 0.82 0.75 0.93 0.82 0.65 0.48 0.85 0.82 0.68 0.27 0.54 0.68 0.76 0.75 0.21 0.78 0.74 0.85 0.87 0.64 0.71 0.79 0.73
0.07 0.04 0.16 0.5 1.0 0.66 0.28 0.29 0.63 0.69 0.7 0.54 0.16 0.44 0.5 0.34 0.25 0.1 0.44 0.4 0.41 0.45 0.04 0.33 0.31 0.29 0.38 0.39 0.69 0.55 0.35
0.32 0.4 0.49 0.72 0.77 0.62 0.37 0.9 0.64 0.67 0.71 0.85 0.27 0.9 0.86 0.5 0.52 0.1 0.64 0.59 0.45 0.49 0.1 0.4 0.39 0.4 0.44 0.38 1.0 0.83 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.15 0.0 0.81 0.07 0.57 0.08 0.0 0.38 0.34 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.21 0.09 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.8 0.64 0.35
0.1 0.0 0.0 0.0 1.0 0.5 0.01 0.0 0.29 0.21 0.11 0.26 0.0 0.07 0.28 0.15 0.04 0.0 0.1 0.0 0.2 0.18 0.0 0.04 0.06 0.21 0.17 0.0 0.16 0.34 0.14
0.75 0.64 0.88 1.0 0.83 0.72 0.43 0.55 0.66 0.72 0.79 0.88 0.67 0.37 0.36 0.67 0.61 0.17 0.44 0.52 0.52 0.56 0.15 0.55 0.59 0.61 0.61 0.63 0.67 0.83 0.91
0.4 0.56 0.18 0.3 1.0 0.66 0.32 0.2 0.47 0.43 0.48 0.4 0.23 0.62 0.7 0.48 0.33 0.54 0.47 0.28 0.4 0.39 0.39 0.27 0.28 0.38 0.32 0.33 0.7 0.65 0.59
0.45 0.62 0.66 0.76 0.85 0.87 0.67 1.0 0.55 0.6 0.71 0.64 0.5 0.72 0.52 0.52 0.4 0.12 0.45 0.39 0.5 0.52 0.2 0.5 0.53 0.52 0.51 0.48 0.85 0.75 0.59
0.36 0.46 0.47 0.68 0.89 0.99 0.87 1.0 0.71 0.68 0.76 0.7 0.46 0.57 0.64 0.75 0.6 0.63 0.68 0.68 0.61 0.7 0.61 0.63 0.62 0.77 0.73 0.57 0.75 0.67 0.65
0.37 0.49 0.45 0.54 1.0 0.61 0.5 0.7 0.6 0.66 0.65 0.68 0.18 0.38 0.29 0.37 0.36 0.06 0.47 0.44 0.35 0.4 0.03 0.47 0.42 0.37 0.43 0.33 0.64 0.7 0.62
0.32 0.22 0.39 0.65 1.0 0.77 0.45 0.45 0.76 0.75 0.84 0.81 0.35 0.86 0.95 0.73 0.67 0.4 0.49 0.49 0.58 0.77 0.36 0.52 0.66 0.76 0.81 0.57 0.85 0.92 0.88
0.11 0.35 0.13 0.09 0.64 0.37 0.31 0.5 0.32 0.29 0.44 0.32 0.42 0.69 0.83 0.41 0.23 1.0 0.41 0.38 0.23 0.19 0.01 0.38 0.2 0.25 0.32 0.19 0.72 0.71 0.5
0.53 0.72 0.6 0.71 0.64 0.83 1.0 0.89 0.66 0.71 0.73 0.7 0.78 0.67 0.8 0.92 0.92 0.48 0.73 0.68 0.7 0.74 0.54 0.63 0.69 0.77 0.7 0.76 0.9 0.82 0.75
0.43 0.51 0.47 0.58 0.77 0.85 0.78 0.9 0.77 0.64 0.68 0.63 0.4 0.76 0.66 0.68 0.61 0.17 0.52 0.56 0.59 0.61 0.44 0.59 0.53 0.57 0.68 0.43 0.96 1.0 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.43 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0
0.25 0.16 0.03 0.01 1.0 0.56 0.05 0.02 0.18 0.11 0.16 0.09 0.15 0.0 0.03 0.12 0.08 0.03 0.12 0.1 0.2 0.28 0.0 0.23 0.23 0.21 0.29 0.26 0.23 0.14 0.09
0.31 0.54 0.23 0.37 0.91 0.59 0.24 0.29 0.41 0.35 0.59 0.32 0.22 0.64 0.74 0.48 0.31 0.68 0.41 0.33 0.36 0.45 0.5 0.3 0.28 0.29 0.38 0.43 1.0 0.7 0.37
0.42 0.57 0.27 0.35 1.0 0.64 0.33 0.25 0.46 0.41 0.49 0.37 0.15 0.55 0.73 0.51 0.32 0.45 0.39 0.32 0.39 0.41 0.32 0.26 0.33 0.34 0.39 0.4 0.86 0.69 0.35
0.41 0.4 0.46 0.93 1.0 0.94 0.77 0.92 0.92 0.89 0.95 0.78 0.42 0.93 0.93 0.66 0.57 0.22 0.66 0.62 0.63 0.69 0.31 0.61 0.65 0.67 0.7 0.56 0.95 0.97 0.97
0.54 0.62 0.68 0.75 0.68 1.0 0.87 0.99 0.71 0.72 0.73 0.64 0.69 0.5 0.55 0.75 0.7 0.36 0.72 0.58 0.67 0.68 0.5 0.65 0.68 0.72 0.7 0.61 0.87 0.91 0.75
0.76 0.83 0.75 0.61 0.98 0.86 0.74 1.0 0.7 0.74 0.78 0.79 0.67 0.7 0.65 0.71 0.64 0.58 0.66 0.61 0.61 0.69 0.59 0.68 0.67 0.73 0.75 0.7 0.72 0.73 0.73
0.27 0.51 0.48 0.64 0.48 0.92 1.0 0.98 0.51 0.5 0.59 0.42 0.37 0.52 0.62 0.71 0.53 0.05 0.39 0.47 0.48 0.56 0.36 0.6 0.57 0.65 0.66 0.48 0.67 0.81 0.76
0.84 0.68 0.71 0.8 0.91 1.0 0.78 0.79 0.71 0.71 0.82 0.76 0.76 0.81 0.6 0.63 0.65 0.31 0.62 0.63 0.69 0.73 0.61 0.78 0.75 0.86 0.83 0.84 0.69 0.66 0.74
0.11 0.05 0.01 0.01 1.0 0.25 0.01 0.01 0.06 0.03 0.07 0.02 0.11 0.03 0.03 0.05 0.01 0.42 0.02 0.04 0.04 0.11 0.12 0.1 0.06 0.03 0.09 0.1 0.08 0.08 0.21
0.45 0.51 0.3 0.32 1.0 0.64 0.41 0.52 0.41 0.39 0.44 0.42 0.19 0.51 0.47 0.42 0.35 0.21 0.44 0.36 0.41 0.47 0.25 0.29 0.36 0.39 0.4 0.47 0.49 0.41 0.27
0.01 0.04 0.0 0.0 1.0 0.11 0.05 0.05 0.17 0.1 0.12 0.12 0.0 0.01 0.11 0.15 0.18 0.02 0.11 0.12 0.1 0.09 0.07 0.08 0.1 0.08 0.12 0.03 0.27 0.14 0.04
0.13 0.09 0.23 0.52 1.0 0.6 0.82 0.91 0.65 0.57 0.46 0.4 0.15 0.78 0.74 0.36 0.35 0.34 0.66 0.38 0.37 0.34 0.21 0.44 0.45 0.34 0.36 0.39 0.78 0.56 0.59
0.26 0.26 0.21 0.22 1.0 0.48 0.34 0.26 0.46 0.43 0.46 0.37 0.09 0.23 0.25 0.23 0.16 0.03 0.35 0.3 0.35 0.32 0.03 0.31 0.25 0.23 0.26 0.2 0.51 0.39 0.34
0.61 0.82 0.76 0.81 1.0 0.66 0.6 0.86 0.65 0.64 0.77 0.86 0.59 0.47 0.42 0.65 0.69 0.09 0.46 0.48 0.5 0.59 0.14 0.58 0.58 0.52 0.54 0.6 0.6 0.73 0.69
0.9 0.86 0.91 0.89 0.89 1.0 0.92 0.82 0.82 0.9 0.8 0.72 0.7 0.83 0.85 0.84 0.87 0.09 0.79 0.73 0.76 0.73 0.28 0.69 0.84 0.79 0.86 0.85 0.82 0.71 0.51
0.24 0.23 0.5 1.0 0.97 0.53 0.42 0.89 0.62 0.53 0.63 0.59 0.16 0.43 0.37 0.44 0.36 0.01 0.28 0.29 0.32 0.29 0.0 0.34 0.38 0.27 0.39 0.41 0.45 0.49 0.29
0.16 0.22 0.23 0.5 1.0 0.91 0.58 0.62 0.62 0.62 0.73 0.69 0.37 0.73 0.85 0.51 0.41 0.3 0.59 0.5 0.62 0.51 0.43 0.51 0.45 0.53 0.62 0.44 0.56 0.57 0.52
0.46 0.27 0.59 1.0 0.64 0.59 0.57 0.48 0.73 0.71 0.6 0.56 0.39 0.3 0.38 0.43 0.39 0.16 0.4 0.45 0.49 0.46 0.09 0.4 0.5 0.53 0.54 0.42 0.58 0.55 0.41
0.63 0.32 0.29 0.5 0.83 0.38 0.18 0.1 0.39 0.37 0.43 0.33 0.04 0.25 0.4 0.28 0.19 0.19 0.21 0.15 0.16 0.19 0.09 0.19 0.14 0.19 0.21 0.35 1.0 0.92 0.29
0.81 0.7 0.67 0.68 0.92 1.0 0.78 0.86 0.67 0.69 0.71 0.73 0.77 0.73 0.63 0.7 0.66 0.33 0.64 0.6 0.64 0.65 0.75 0.68 0.69 0.72 0.7 0.73 0.8 0.74 0.71
0.43 0.52 0.27 0.31 1.0 0.57 0.56 0.28 0.5 0.49 0.39 0.38 0.25 0.19 0.51 0.47 0.33 0.04 0.42 0.31 0.45 0.45 0.14 0.26 0.29 0.34 0.31 0.35 0.88 0.71 0.33
0.42 0.48 0.62 0.88 1.0 0.38 0.27 0.52 0.62 0.63 0.69 0.76 0.18 0.03 0.04 0.24 0.23 0.05 0.17 0.28 0.34 0.37 0.03 0.37 0.35 0.37 0.39 0.31 0.4 0.49 0.32
0.54 0.58 0.47 0.6 1.0 0.68 0.56 0.8 0.64 0.62 0.63 0.6 0.39 0.49 0.57 0.53 0.45 0.15 0.51 0.44 0.52 0.52 0.07 0.47 0.47 0.5 0.56 0.45 0.71 0.67 0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)