1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_273 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra001139 (ATL6)
 0.28 0.13 0.17 0.18 0.4 1.0 0.2 0.08 0.28 0.23 0.13 0.21 0.07 0.54 0.77 0.26 0.33 0.3 0.23 0.15 0.31 0.21 0.66 0.22 0.17 0.27 0.12 0.3 0.36 0.19 0.1
0.25 0.11 0.39 0.11 0.71 0.56 0.26 0.31 0.41 0.34 0.39 0.31 0.48 0.74 0.98 0.46 0.44 1.0 0.48 0.38 0.33 0.33 0.62 0.37 0.43 0.29 0.39 0.38 0.43 0.38 0.64
Bra001806 (NF-YA9)
 0.34 0.35 0.22 0.24 0.61 0.52 0.06 0.05 0.26 0.14 0.15 0.13 0.09 0.59 1.0 0.22 0.16 0.62 0.25 0.17 0.12 0.13 0.61 0.16 0.11 0.23 0.09 0.15 0.22 0.29 0.28
0.32 0.44 0.33 0.23 0.83 0.69 0.2 0.21 0.32 0.31 0.27 0.28 0.23 0.82 1.0 0.43 0.36 0.99 0.4 0.31 0.29 0.32 0.59 0.35 0.34 0.3 0.34 0.41 0.38 0.37 0.24
0.24 0.29 0.38 0.12 0.76 0.5 0.26 0.31 0.48 0.29 0.28 0.31 0.34 0.87 0.69 0.31 0.28 1.0 0.2 0.28 0.31 0.29 0.68 0.25 0.18 0.14 0.21 0.23 0.32 0.28 0.5
0.49 0.47 0.47 0.32 0.9 0.82 0.41 0.37 0.45 0.5 0.51 0.44 0.36 0.8 1.0 0.45 0.47 0.8 0.45 0.49 0.47 0.46 0.84 0.47 0.47 0.45 0.42 0.51 0.53 0.47 0.39
Bra004550 (GBF3)
 0.01 0.01 0.01 0.01 0.24 0.33 0.12 0.03 0.09 0.04 0.08 0.05 0.17 0.74 1.0 0.14 0.13 0.47 0.18 0.1 0.07 0.07 0.63 0.11 0.05 0.04 0.04 0.07 0.1 0.02 0.04
Bra004784 (MPK6)
 0.56 0.8 0.7 0.56 0.82 0.86 0.42 0.36 0.59 0.58 0.54 0.51 0.51 0.88 1.0 0.6 0.51 0.77 0.6 0.49 0.54 0.55 0.83 0.58 0.55 0.51 0.54 0.66 0.68 0.61 0.52
Bra006148 (MED19A)
 0.65 0.61 0.62 0.53 1.0 0.87 0.5 0.53 0.63 0.51 0.52 0.47 0.69 0.95 0.96 0.58 0.54 0.88 0.57 0.54 0.5 0.59 0.94 0.51 0.5 0.51 0.52 0.54 0.59 0.52 0.6
Bra006205 (KEG)
 0.56 0.55 0.6 0.47 0.87 0.82 0.41 0.44 0.54 0.5 0.49 0.52 0.45 1.0 0.95 0.63 0.52 0.84 0.57 0.53 0.44 0.5 0.66 0.52 0.56 0.53 0.54 0.65 0.65 0.61 0.67
Bra008447 (RAE1)
 0.5 0.45 0.47 0.37 0.93 0.81 0.45 0.42 0.59 0.51 0.5 0.51 0.55 0.83 1.0 0.62 0.58 0.75 0.66 0.52 0.52 0.54 0.67 0.54 0.55 0.52 0.59 0.6 0.63 0.48 0.52
0.53 0.63 0.49 0.39 0.8 0.71 0.4 0.34 0.53 0.43 0.42 0.43 0.45 0.85 1.0 0.49 0.43 0.66 0.49 0.49 0.46 0.46 0.93 0.48 0.51 0.42 0.45 0.5 0.56 0.5 0.57
0.29 0.41 0.32 0.26 0.7 0.68 0.25 0.29 0.41 0.39 0.36 0.37 0.4 0.58 0.94 0.5 0.39 0.83 0.53 0.37 0.35 0.32 1.0 0.41 0.51 0.26 0.41 0.45 0.39 0.35 0.42
0.76 0.77 0.84 0.58 0.92 0.79 0.38 0.45 0.55 0.46 0.46 0.46 0.47 0.93 1.0 0.5 0.5 0.78 0.61 0.51 0.5 0.46 0.86 0.47 0.46 0.49 0.44 0.58 0.64 0.6 0.65
0.47 0.48 0.59 0.43 0.76 0.82 0.37 0.36 0.47 0.41 0.48 0.46 0.42 0.98 1.0 0.48 0.37 0.68 0.52 0.38 0.44 0.44 0.64 0.43 0.45 0.34 0.43 0.47 0.61 0.51 0.43
0.56 0.61 0.57 0.46 0.75 0.66 0.33 0.35 0.46 0.4 0.4 0.38 0.4 0.93 1.0 0.5 0.51 0.74 0.48 0.44 0.39 0.5 0.62 0.48 0.52 0.34 0.43 0.53 0.58 0.46 0.44
Bra011333 (CAP1)
 0.66 0.77 0.61 0.58 0.92 0.84 0.56 0.55 0.49 0.57 0.48 0.49 0.48 0.9 1.0 0.73 0.61 0.98 0.65 0.52 0.58 0.59 0.75 0.6 0.6 0.59 0.63 0.56 0.55 0.61 0.54
Bra012833 (CAX3)
 0.14 0.18 0.14 0.2 0.4 0.46 0.11 0.14 0.23 0.21 0.18 0.17 0.16 0.82 0.98 0.23 0.27 1.0 0.26 0.18 0.17 0.27 0.96 0.43 0.28 0.27 0.22 0.39 0.44 0.2 0.26
Bra012879 (LPPepsilon1)
 0.43 0.47 0.46 0.44 0.63 0.71 0.28 0.21 0.46 0.43 0.37 0.44 0.25 0.68 0.87 0.39 0.35 0.58 0.44 0.43 0.45 0.5 1.0 0.34 0.18 0.22 0.22 0.32 0.43 0.44 0.26
Bra013187 (ZAP1)
 0.51 0.44 0.39 0.36 0.88 0.96 0.46 0.39 0.55 0.53 0.47 0.54 0.44 0.98 1.0 0.69 0.6 0.75 0.58 0.6 0.51 0.59 0.72 0.56 0.55 0.44 0.52 0.56 0.64 0.52 0.5
0.15 0.3 0.36 0.19 0.8 0.63 0.15 0.12 0.21 0.21 0.16 0.19 0.1 0.63 1.0 0.23 0.21 0.47 0.31 0.25 0.19 0.27 0.83 0.17 0.09 0.1 0.1 0.11 0.19 0.2 0.08
Bra014601 (FTIP3)
 0.29 0.31 0.33 0.31 0.72 0.53 0.27 0.26 0.39 0.34 0.33 0.37 0.42 0.78 0.88 0.4 0.29 1.0 0.49 0.26 0.24 0.28 0.73 0.41 0.42 0.4 0.37 0.45 0.48 0.4 0.39
0.54 0.62 0.6 0.39 0.72 0.62 0.37 0.39 0.53 0.45 0.54 0.54 0.42 0.75 1.0 0.56 0.43 0.77 0.65 0.54 0.57 0.49 0.96 0.56 0.53 0.48 0.58 0.49 0.66 0.68 0.65
0.08 0.12 0.11 0.05 0.54 0.73 0.04 0.05 0.19 0.23 0.14 0.16 0.45 0.62 0.98 0.29 0.35 0.69 0.31 0.24 0.15 0.18 1.0 0.14 0.13 0.09 0.11 0.19 0.08 0.12 0.33
Bra015433 (AtDOA1)
 0.13 0.07 0.17 0.06 0.67 0.72 0.18 0.09 0.34 0.17 0.2 0.19 0.56 0.57 0.68 0.32 0.23 1.0 0.36 0.27 0.29 0.28 0.97 0.1 0.13 0.08 0.1 0.04 0.11 0.13 0.26
0.31 0.47 0.41 0.21 0.65 0.58 0.16 0.25 0.31 0.5 0.31 0.32 0.62 0.62 0.77 0.45 0.31 0.84 0.44 0.35 0.45 0.22 1.0 0.38 0.34 0.18 0.27 0.29 0.21 0.22 0.34
Bra016409 (CHB4)
 0.73 0.64 0.63 0.57 0.86 0.87 0.54 0.49 0.58 0.62 0.63 0.61 0.71 0.94 1.0 0.76 0.67 0.75 0.65 0.58 0.59 0.56 0.86 0.6 0.54 0.51 0.56 0.59 0.69 0.59 0.74
Bra017134 (RCI4)
 0.12 0.19 0.35 0.15 0.15 0.47 0.14 0.08 0.21 0.15 0.17 0.15 0.1 0.68 0.8 0.21 0.24 0.47 0.22 0.2 0.23 0.29 1.0 0.42 0.29 0.25 0.19 0.37 0.27 0.09 0.12
0.22 0.25 0.21 0.18 0.51 0.56 0.11 0.1 0.37 0.26 0.33 0.26 0.16 0.75 1.0 0.33 0.25 0.35 0.41 0.38 0.31 0.42 0.8 0.2 0.16 0.19 0.18 0.21 0.32 0.25 0.23
Bra017221 (ACR10)
 0.38 0.43 0.41 0.2 0.66 0.63 0.25 0.21 0.37 0.27 0.29 0.25 0.31 0.82 1.0 0.28 0.28 0.72 0.33 0.39 0.27 0.33 0.57 0.22 0.26 0.29 0.23 0.35 0.37 0.28 0.4
Bra017317 (SRO1)
 0.45 0.54 0.5 0.37 0.81 0.96 0.5 0.41 0.53 0.47 0.47 0.45 0.42 0.82 1.0 0.58 0.49 0.7 0.57 0.56 0.48 0.5 0.79 0.45 0.43 0.42 0.46 0.55 0.6 0.41 0.39
Bra020607 (GT2L)
 0.17 0.05 0.13 0.04 0.72 0.32 0.15 0.16 0.24 0.19 0.23 0.15 0.39 0.82 0.89 0.41 0.23 1.0 0.48 0.25 0.26 0.21 0.64 0.2 0.21 0.17 0.16 0.26 0.22 0.17 0.21
Bra020988 (HSF A4A)
 0.28 0.35 0.28 0.11 0.79 0.86 0.06 0.13 0.2 0.22 0.12 0.22 0.09 0.82 1.0 0.17 0.21 0.72 0.35 0.23 0.16 0.4 0.76 0.2 0.15 0.38 0.15 0.32 0.35 0.54 0.24
Bra021245 (GPK1)
 0.25 0.21 0.29 0.22 0.76 0.46 0.25 0.21 0.36 0.28 0.39 0.37 0.48 0.97 1.0 0.27 0.3 0.96 0.52 0.38 0.29 0.24 0.69 0.38 0.36 0.28 0.29 0.35 0.35 0.24 0.59
Bra022501 (GTG1)
 0.59 0.61 0.57 0.52 0.84 0.79 0.46 0.51 0.5 0.51 0.47 0.44 0.61 0.88 1.0 0.6 0.58 0.83 0.48 0.49 0.43 0.51 0.82 0.46 0.46 0.39 0.44 0.47 0.52 0.55 0.62
0.32 0.37 0.4 0.17 0.77 0.63 0.23 0.2 0.3 0.26 0.29 0.34 0.55 0.73 0.78 0.42 0.29 1.0 0.43 0.29 0.34 0.26 0.85 0.25 0.28 0.16 0.23 0.38 0.27 0.41 0.48
0.64 0.75 0.79 0.64 0.87 0.72 0.27 0.33 0.4 0.36 0.37 0.31 0.57 0.91 1.0 0.52 0.41 0.56 0.38 0.38 0.3 0.35 1.0 0.39 0.36 0.3 0.29 0.35 0.46 0.38 0.43
0.57 0.59 0.66 0.48 0.92 0.85 0.47 0.41 0.59 0.44 0.49 0.49 0.61 0.86 1.0 0.54 0.46 0.8 0.54 0.53 0.51 0.58 1.0 0.52 0.49 0.49 0.48 0.51 0.59 0.49 0.5
Bra026003 (UBP15)
 0.37 0.31 0.37 0.28 0.79 0.7 0.35 0.33 0.44 0.38 0.39 0.42 0.51 0.96 0.94 0.49 0.47 1.0 0.6 0.41 0.35 0.38 0.7 0.41 0.4 0.37 0.43 0.48 0.52 0.44 0.5
0.36 0.29 0.28 0.19 0.86 0.88 0.27 0.18 0.45 0.35 0.36 0.28 0.25 0.9 1.0 0.43 0.37 0.97 0.59 0.39 0.33 0.33 0.81 0.29 0.22 0.16 0.2 0.42 0.44 0.31 0.32
Bra027886 (TCP8)
 0.48 0.73 0.72 0.5 0.94 0.77 0.24 0.26 0.26 0.34 0.27 0.28 0.52 0.84 1.0 0.45 0.52 0.91 0.36 0.38 0.36 0.33 0.76 0.3 0.4 0.47 0.34 0.46 0.43 0.46 0.38
Bra028145 (DIP2)
 0.62 0.6 0.68 0.52 0.83 0.83 0.49 0.5 0.51 0.48 0.46 0.5 0.5 0.95 1.0 0.61 0.52 0.7 0.51 0.51 0.47 0.48 0.75 0.52 0.49 0.48 0.43 0.54 0.65 0.58 0.65
0.08 0.2 0.17 0.16 0.39 0.64 0.2 0.14 0.27 0.29 0.18 0.12 0.31 0.54 0.97 0.41 0.39 0.55 0.37 0.43 0.43 0.3 1.0 0.2 0.27 0.26 0.29 0.17 0.08 0.13 0.31
Bra029624 (PAP15)
 0.37 0.42 0.43 0.2 0.81 0.58 0.19 0.34 0.3 0.38 0.33 0.44 0.23 0.78 1.0 0.32 0.34 0.87 0.46 0.4 0.31 0.34 0.88 0.26 0.34 0.26 0.29 0.38 0.39 0.65 0.63
0.46 0.47 0.31 0.38 0.82 0.77 0.44 0.49 0.57 0.45 0.54 0.44 0.61 1.0 0.93 0.74 0.56 0.87 0.61 0.59 0.53 0.52 0.8 0.51 0.5 0.34 0.48 0.49 0.49 0.44 0.5
0.32 0.4 0.46 0.2 0.69 0.67 0.17 0.15 0.39 0.28 0.29 0.3 0.21 0.79 1.0 0.35 0.28 0.78 0.39 0.32 0.27 0.32 0.88 0.44 0.36 0.32 0.31 0.38 0.44 0.35 0.33
Bra031225 (RKP)
 0.52 0.48 0.47 0.39 0.81 0.92 0.46 0.39 0.47 0.4 0.4 0.39 0.32 0.8 1.0 0.58 0.5 0.73 0.56 0.52 0.46 0.47 0.7 0.4 0.42 0.38 0.43 0.56 0.63 0.44 0.42
0.4 0.48 0.55 0.29 0.81 0.86 0.28 0.3 0.42 0.31 0.3 0.48 0.29 0.71 0.92 0.48 0.38 0.6 0.45 0.4 0.4 0.47 1.0 0.4 0.35 0.36 0.37 0.47 0.5 0.41 0.33
Bra033254 (BPS1)
 0.55 0.52 0.45 0.45 0.71 0.97 0.43 0.31 0.54 0.46 0.5 0.48 0.32 0.81 1.0 0.56 0.46 0.48 0.54 0.5 0.5 0.54 0.92 0.47 0.46 0.51 0.43 0.49 0.58 0.43 0.36
0.13 0.16 0.21 0.14 0.74 0.58 0.19 0.15 0.24 0.17 0.24 0.22 0.4 0.81 1.0 0.37 0.24 0.75 0.47 0.27 0.29 0.23 0.54 0.39 0.33 0.17 0.23 0.47 0.47 0.23 0.3
0.39 0.36 0.29 0.33 0.7 0.8 0.34 0.3 0.45 0.31 0.36 0.31 0.32 0.84 1.0 0.34 0.28 0.63 0.55 0.35 0.35 0.39 0.61 0.28 0.27 0.12 0.26 0.34 0.38 0.45 0.46
Bra035320 (AOS)
 0.26 0.18 0.41 0.17 0.63 0.59 0.27 0.24 0.39 0.38 0.27 0.26 0.34 0.94 1.0 0.44 0.33 0.88 0.49 0.33 0.35 0.33 0.55 0.48 0.39 0.31 0.32 0.32 0.4 0.36 0.59
Bra036289 (XDH1)
 0.31 0.38 0.38 0.29 0.56 0.62 0.12 0.14 0.33 0.41 0.32 0.21 0.17 0.67 1.0 0.48 0.3 0.47 0.27 0.31 0.22 0.38 0.89 0.17 0.18 0.16 0.21 0.2 0.23 0.3 0.27
Bra036899 (NET1B)
 0.26 0.17 0.19 0.17 0.64 0.53 0.31 0.3 0.43 0.32 0.33 0.28 0.54 0.87 0.74 0.37 0.32 1.0 0.45 0.31 0.27 0.25 0.54 0.38 0.36 0.28 0.33 0.35 0.38 0.29 0.31
Bra037533 (ABF4)
 0.51 0.45 0.47 0.49 0.76 0.68 0.28 0.28 0.47 0.37 0.39 0.39 0.3 0.92 1.0 0.52 0.37 0.8 0.52 0.43 0.43 0.47 0.62 0.39 0.37 0.35 0.34 0.43 0.42 0.4 0.41
Bra038355 (NUDX1)
 0.43 0.43 0.48 0.36 0.88 0.95 0.27 0.18 0.45 0.37 0.41 0.37 0.48 1.0 0.86 0.42 0.37 0.7 0.31 0.25 0.37 0.44 0.79 0.38 0.33 0.21 0.22 0.42 0.58 0.46 0.36
Bra038698 (EML1)
 0.56 0.54 0.53 0.39 0.72 0.78 0.31 0.27 0.51 0.41 0.44 0.42 0.37 0.71 1.0 0.46 0.41 0.62 0.46 0.46 0.36 0.49 0.63 0.37 0.37 0.41 0.34 0.36 0.4 0.33 0.36
Bra038807 (CTPS4)
 0.05 0.06 0.04 0.05 0.57 0.33 0.19 0.13 0.2 0.23 0.21 0.17 0.34 1.0 0.86 0.41 0.32 0.6 0.3 0.18 0.26 0.13 0.69 0.11 0.07 0.06 0.1 0.17 0.08 0.09 0.28
0.15 0.14 0.15 0.17 0.45 0.45 0.14 0.08 0.25 0.17 0.16 0.14 0.15 0.76 1.0 0.24 0.21 0.96 0.42 0.19 0.18 0.15 0.62 0.26 0.2 0.16 0.16 0.3 0.29 0.15 0.17
Bra039460 (GID1A)
 0.31 0.34 0.32 0.13 0.75 0.39 0.09 0.08 0.2 0.17 0.09 0.14 0.17 0.5 1.0 0.12 0.11 0.5 0.24 0.11 0.08 0.11 0.65 0.16 0.14 0.26 0.15 0.27 0.3 0.41 0.39
0.35 0.31 0.52 0.36 0.76 1.0 0.38 0.22 0.42 0.36 0.37 0.36 0.26 0.78 0.93 0.41 0.35 0.47 0.43 0.42 0.36 0.35 0.93 0.39 0.33 0.38 0.33 0.49 0.51 0.3 0.29
Bra040271 (GALT3)
 0.37 0.34 0.43 0.26 0.79 0.76 0.42 0.44 0.51 0.5 0.5 0.42 0.52 1.0 1.0 0.65 0.65 0.99 0.74 0.6 0.46 0.59 0.64 0.58 0.59 0.45 0.62 0.54 0.58 0.61 0.75
Bra040786 (LAZ1)
 0.53 0.57 0.57 0.42 0.77 0.8 0.4 0.37 0.51 0.51 0.48 0.54 0.37 0.84 1.0 0.5 0.53 0.58 0.55 0.54 0.52 0.66 0.83 0.57 0.54 0.51 0.56 0.47 0.58 0.53 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)