1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_273 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra001139 (ATL6)
 6.13 2.74 3.73 3.9 8.58 21.69 4.4 1.77 6.14 5.01 2.82 4.61 1.54 11.61 16.72 5.57 7.19 6.57 5.01 3.32 6.66 4.58 14.23 4.68 3.71 5.78 2.52 6.5 7.81 4.08 2.14
1.88 0.81 2.92 0.84 5.34 4.2 1.94 2.34 3.07 2.54 2.94 2.34 3.62 5.56 7.36 3.44 3.29 7.51 3.61 2.84 2.46 2.46 4.63 2.78 3.26 2.15 2.92 2.85 3.2 2.84 4.78
Bra001806 (NF-YA9)
 4.7 4.88 3.06 3.32 8.45 7.18 0.88 0.7 3.65 2.0 2.03 1.82 1.3 8.16 13.83 3.09 2.23 8.62 3.5 2.33 1.63 1.84 8.42 2.17 1.55 3.16 1.25 2.03 2.98 3.95 3.88
5.15 7.05 5.35 3.71 13.43 11.17 3.26 3.32 5.14 5.09 4.31 4.61 3.7 13.36 16.2 7.01 5.76 15.97 6.5 5.09 4.72 5.15 9.54 5.65 5.55 4.78 5.51 6.67 6.1 5.98 3.82
0.26 0.31 0.4 0.13 0.81 0.53 0.27 0.33 0.51 0.31 0.3 0.33 0.36 0.93 0.74 0.33 0.3 1.07 0.21 0.29 0.33 0.31 0.73 0.27 0.19 0.15 0.22 0.24 0.34 0.3 0.53
8.63 8.25 8.21 5.56 15.66 14.24 7.17 6.45 7.78 8.7 8.97 7.71 6.31 14.04 17.47 7.8 8.16 13.99 7.84 8.56 8.19 8.05 14.75 8.17 8.25 7.89 7.25 8.89 9.2 8.3 6.78
Bra004550 (GBF3)
 0.43 0.3 0.34 0.31 9.1 12.41 4.4 1.2 3.33 1.6 2.87 1.89 6.33 28.17 37.9 5.13 4.9 17.64 6.74 3.92 2.69 2.71 23.9 4.11 2.04 1.65 1.39 2.53 3.79 0.92 1.68
Bra004784 (MPK6)
 7.42 10.54 9.2 7.37 10.81 11.27 5.56 4.74 7.73 7.66 7.17 6.73 6.71 11.61 13.17 7.92 6.78 10.11 7.91 6.46 7.12 7.2 10.89 7.64 7.3 6.76 7.14 8.72 8.99 8.09 6.87
Bra006148 (MED19A)
 11.07 10.33 10.64 9.07 17.06 14.86 8.49 9.1 10.69 8.74 8.82 7.95 11.7 16.25 16.33 9.81 9.18 15.07 9.74 9.28 8.55 10.06 16.02 8.74 8.58 8.74 8.95 9.18 10.04 8.94 10.16
Bra006205 (KEG)
 7.69 7.66 8.31 6.5 12.01 11.32 5.64 6.05 7.41 6.96 6.81 7.14 6.17 13.81 13.11 8.69 7.22 11.62 7.86 7.25 6.12 6.93 9.17 7.24 7.75 7.37 7.52 8.96 9.01 8.42 9.19
Bra008447 (RAE1)
 15.9 14.29 15.1 11.67 29.43 25.84 14.41 13.48 18.67 16.36 15.78 16.18 17.53 26.4 31.82 19.87 18.38 24.01 21.03 16.65 16.63 17.29 21.39 17.18 17.57 16.48 18.67 19.02 19.93 15.36 16.59
52.19 62.22 48.05 38.54 78.46 69.28 39.29 33.75 51.88 42.37 41.62 42.35 44.01 83.54 98.09 47.71 41.8 64.9 48.22 48.46 45.53 45.31 90.84 46.74 49.67 40.96 43.94 49.13 54.84 49.25 56.29
6.16 8.54 6.8 5.42 14.58 14.27 5.2 6.11 8.62 8.11 7.65 7.83 8.34 12.17 19.77 10.42 8.25 17.33 11.06 7.84 7.35 6.78 20.97 8.53 10.68 5.44 8.49 9.35 8.18 7.37 8.86
54.42 55.23 60.09 41.31 65.51 56.73 27.3 32.02 39.13 32.72 32.84 33.11 33.85 66.37 71.47 35.58 35.96 56.09 43.59 36.42 35.86 32.58 61.71 33.8 32.65 35.03 31.4 41.51 45.47 42.74 46.48
3.04 3.09 3.77 2.73 4.87 5.29 2.34 2.3 3.03 2.65 3.1 2.97 2.71 6.29 6.42 3.05 2.37 4.35 3.31 2.42 2.82 2.84 4.1 2.78 2.86 2.17 2.78 3.0 3.92 3.26 2.74
8.46 9.19 8.51 6.94 11.33 9.91 4.95 5.29 6.91 5.98 6.08 5.74 6.04 13.93 15.04 7.54 7.61 11.12 7.19 6.6 5.82 7.46 9.39 7.29 7.82 5.16 6.46 7.91 8.73 6.9 6.63
Bra011333 (CAP1)
 22.26 25.97 20.52 19.57 31.0 28.05 18.77 18.58 16.43 19.09 15.98 16.39 16.15 30.19 33.55 24.45 20.55 32.91 21.91 17.53 19.52 19.73 25.29 19.98 20.29 19.73 21.0 18.8 18.4 20.33 18.25
Bra012833 (CAX3)
 5.85 7.26 5.8 8.31 16.48 18.97 4.71 5.92 9.56 8.52 7.32 6.95 6.63 33.68 40.36 9.42 10.96 41.3 10.62 7.53 7.2 11.28 39.64 17.77 11.61 11.35 9.06 15.91 18.1 8.37 10.8
Bra012879 (LPPepsilon1)
 1.99 2.16 2.11 2.03 2.9 3.28 1.29 0.96 2.13 1.95 1.7 2.01 1.14 3.11 4.01 1.78 1.6 2.65 2.01 1.98 2.06 2.31 4.59 1.56 0.81 0.99 0.99 1.48 1.96 2.01 1.21
Bra013187 (ZAP1)
 16.65 14.39 12.72 11.83 28.62 31.33 14.87 12.81 17.93 17.27 15.17 17.62 14.13 31.8 32.47 22.44 19.37 24.26 18.7 19.34 16.48 19.28 23.43 18.17 17.94 14.26 16.81 18.16 20.74 16.84 16.18
5.44 10.66 12.59 6.63 28.14 22.36 5.34 4.18 7.28 7.23 5.51 6.87 3.47 22.27 35.26 7.97 7.42 16.61 10.85 8.93 6.79 9.37 29.31 5.85 3.13 3.51 3.64 3.73 6.7 7.15 2.88
Bra014601 (FTIP3)
 6.64 6.89 7.42 6.98 16.17 12.02 6.04 5.93 8.85 7.69 7.53 8.41 9.36 17.66 19.95 8.93 6.52 22.55 11.06 5.93 5.39 6.33 16.46 9.18 9.41 9.1 8.37 10.25 10.76 9.03 8.76
1.53 1.73 1.68 1.1 2.03 1.75 1.04 1.08 1.49 1.25 1.53 1.52 1.19 2.1 2.81 1.56 1.21 2.15 1.81 1.53 1.6 1.38 2.69 1.57 1.48 1.35 1.62 1.39 1.86 1.9 1.82
0.13 0.2 0.17 0.07 0.85 1.16 0.06 0.08 0.3 0.36 0.22 0.26 0.72 0.98 1.55 0.45 0.56 1.1 0.5 0.38 0.24 0.29 1.58 0.22 0.21 0.14 0.18 0.31 0.12 0.2 0.52
Bra015433 (AtDOA1)
 0.44 0.23 0.56 0.18 2.18 2.35 0.6 0.28 1.1 0.55 0.66 0.61 1.83 1.86 2.22 1.03 0.73 3.25 1.18 0.89 0.94 0.91 3.16 0.32 0.42 0.27 0.32 0.12 0.36 0.41 0.83
7.01 10.67 9.19 4.85 14.66 13.21 3.56 5.68 7.13 11.41 7.0 7.28 14.15 14.12 17.33 10.12 7.06 19.03 10.05 7.84 10.12 5.01 22.65 8.68 7.81 4.05 6.04 6.57 4.64 4.92 7.79
Bra016409 (CHB4)
 6.17 5.39 5.34 4.85 7.31 7.36 4.57 4.15 4.95 5.3 5.31 5.19 5.98 7.98 8.49 6.44 5.67 6.37 5.48 4.89 4.98 4.8 7.27 5.08 4.6 4.31 4.78 5.04 5.87 4.97 6.3
Bra017134 (RCI4)
 60.57 93.49 172.28 75.83 73.87 233.47 70.26 38.25 101.45 74.47 82.2 75.8 50.87 335.03 394.34 101.54 116.35 229.27 106.16 96.38 114.85 140.52 492.18 208.51 142.35 122.11 94.57 184.36 131.86 43.53 60.88
12.04 13.59 11.57 9.65 27.52 30.05 5.76 5.46 19.89 13.82 17.67 13.85 8.59 40.21 53.9 17.83 13.71 18.63 22.12 20.66 16.66 22.64 43.18 10.95 8.67 10.28 9.62 11.54 17.09 13.27 12.29
Bra017221 (ACR10)
 2.26 2.57 2.44 1.22 3.97 3.79 1.51 1.28 2.19 1.61 1.71 1.51 1.83 4.93 5.99 1.68 1.65 4.32 1.96 2.31 1.64 1.97 3.42 1.34 1.55 1.73 1.36 2.08 2.22 1.7 2.41
Bra017317 (SRO1)
 9.59 11.58 10.7 7.87 17.37 20.62 10.75 8.77 11.35 9.96 10.01 9.62 9.01 17.63 21.38 12.45 10.38 14.91 12.1 11.89 10.24 10.79 16.95 9.56 9.26 9.07 9.89 11.66 12.93 8.78 8.25
Bra020607 (GT2L)
 0.87 0.26 0.67 0.22 3.63 1.59 0.76 0.82 1.22 0.97 1.14 0.76 1.98 4.13 4.48 2.06 1.16 5.02 2.43 1.27 1.31 1.05 3.24 1.0 1.03 0.87 0.82 1.33 1.1 0.86 1.05
Bra020988 (HSF A4A)
 2.44 3.01 2.42 0.98 6.88 7.48 0.51 1.11 1.71 1.92 1.07 1.94 0.81 7.1 8.7 1.51 1.82 6.23 3.07 2.04 1.38 3.51 6.63 1.7 1.32 3.27 1.3 2.77 3.06 4.65 2.07
Bra021245 (GPK1)
 0.65 0.56 0.77 0.57 2.02 1.23 0.65 0.55 0.95 0.75 1.02 0.98 1.28 2.56 2.64 0.71 0.78 2.55 1.37 1.01 0.76 0.63 1.82 1.0 0.94 0.73 0.76 0.92 0.92 0.64 1.55
Bra022501 (GTG1)
 8.31 8.56 8.08 7.34 11.87 11.14 6.49 7.28 7.01 7.15 6.59 6.29 8.6 12.48 14.15 8.46 8.28 11.72 6.82 6.96 6.12 7.23 11.57 6.57 6.47 5.52 6.23 6.59 7.34 7.75 8.76
1.25 1.44 1.57 0.67 3.0 2.45 0.88 0.79 1.16 1.01 1.13 1.32 2.17 2.84 3.06 1.64 1.15 3.92 1.7 1.14 1.34 1.02 3.35 0.99 1.09 0.62 0.89 1.47 1.06 1.6 1.88
20.61 24.14 25.56 20.59 28.11 23.24 8.66 10.6 12.89 11.67 11.77 9.95 18.31 29.21 32.15 16.64 13.18 18.08 12.22 12.38 9.75 11.18 32.05 12.39 11.48 9.6 9.39 11.26 14.79 12.18 13.96
59.25 61.44 67.98 49.97 95.21 87.71 48.33 42.84 61.11 45.76 50.35 51.17 63.34 88.55 103.39 55.43 47.06 82.7 55.72 55.03 52.84 59.83 103.2 53.99 51.01 50.4 49.7 52.38 61.47 50.3 52.06
Bra026003 (UBP15)
 2.77 2.26 2.71 2.06 5.84 5.18 2.56 2.45 3.23 2.77 2.88 3.13 3.8 7.07 6.98 3.65 3.45 7.39 4.47 3.03 2.6 2.79 5.16 3.01 2.94 2.77 3.17 3.58 3.85 3.26 3.67
5.0 4.0 3.91 2.59 11.99 12.16 3.74 2.5 6.26 4.79 5.01 3.94 3.53 12.53 13.87 5.99 5.09 13.52 8.18 5.45 4.61 4.54 11.26 4.09 3.05 2.27 2.84 5.8 6.12 4.35 4.46
Bra027886 (TCP8)
 6.22 9.51 9.39 6.49 12.28 9.98 3.07 3.34 3.43 4.44 3.47 3.6 6.73 10.91 13.04 5.84 6.73 11.84 4.74 4.99 4.66 4.3 9.91 3.87 5.28 6.11 4.43 6.01 5.58 5.99 4.94
Bra028145 (DIP2)
 34.05 32.98 37.35 28.41 45.42 45.29 26.76 27.57 27.88 26.43 24.98 27.41 27.24 51.63 54.6 33.53 28.52 38.48 27.67 27.65 25.44 26.44 40.77 28.6 26.7 26.03 23.21 29.36 35.26 31.6 35.28
1.22 2.83 2.41 2.26 5.69 9.18 2.83 2.07 3.85 4.22 2.59 1.76 4.52 7.74 13.99 5.87 5.57 7.88 5.4 6.15 6.24 4.36 14.41 2.9 3.83 3.72 4.12 2.46 1.2 1.82 4.48
Bra029624 (PAP15)
 1.58 1.8 1.84 0.87 3.51 2.5 0.82 1.48 1.32 1.62 1.42 1.9 0.98 3.36 4.32 1.38 1.46 3.75 1.99 1.71 1.35 1.45 3.8 1.13 1.48 1.11 1.25 1.64 1.7 2.83 2.74
3.08 3.18 2.09 2.57 5.55 5.21 2.94 3.29 3.84 3.07 3.65 2.98 4.1 6.75 6.26 5.01 3.76 5.86 4.12 3.98 3.56 3.52 5.42 3.46 3.38 2.32 3.21 3.32 3.3 2.95 3.38
5.65 6.99 8.21 3.54 12.27 11.79 2.97 2.65 6.95 5.0 5.13 5.36 3.73 13.89 17.66 6.12 4.88 13.73 6.96 5.7 4.82 5.69 15.48 7.86 6.34 5.7 5.39 6.71 7.72 6.1 5.84
Bra031225 (RKP)
 8.96 8.15 8.12 6.68 13.8 15.72 7.94 6.69 8.01 6.87 6.88 6.73 5.44 13.62 17.1 9.91 8.53 12.42 9.55 8.91 7.8 8.11 12.03 6.86 7.17 6.44 7.41 9.55 10.85 7.61 7.25
21.42 25.6 29.75 15.61 43.61 46.16 14.88 16.06 22.37 16.91 16.24 25.8 15.35 38.38 49.44 25.68 20.62 32.42 24.14 21.56 21.24 25.21 53.77 21.72 18.97 19.58 20.05 25.2 26.95 22.29 17.49
Bra033254 (BPS1)
 159.36 150.47 130.11 129.01 202.82 277.77 122.98 88.54 153.89 131.62 144.03 138.36 90.74 233.76 287.33 161.46 132.45 137.41 155.15 144.01 144.37 153.75 264.45 135.54 131.54 147.05 124.26 141.89 166.28 124.15 102.04
0.58 0.68 0.91 0.62 3.2 2.49 0.82 0.64 1.02 0.72 1.02 0.95 1.74 3.51 4.33 1.62 1.02 3.26 2.05 1.17 1.27 0.99 2.35 1.7 1.42 0.76 1.01 2.03 2.04 1.0 1.3
5.75 5.29 4.27 4.89 10.3 11.81 5.04 4.36 6.68 4.52 5.3 4.56 4.64 12.27 14.67 4.97 4.04 9.19 8.07 5.11 5.12 5.73 8.91 4.17 3.99 1.77 3.78 4.99 5.52 6.6 6.71
Bra035320 (AOS)
 5.77 3.84 8.99 3.74 13.76 12.83 5.88 5.32 8.5 8.36 5.8 5.7 7.49 20.54 21.81 9.62 7.19 19.1 10.64 7.11 7.52 7.23 12.03 10.51 8.55 6.81 6.87 7.08 8.78 7.94 12.87
Bra036289 (XDH1)
 1.9 2.35 2.31 1.77 3.45 3.84 0.74 0.84 2.0 2.49 1.96 1.28 1.03 4.1 6.14 2.96 1.85 2.87 1.66 1.92 1.36 2.35 5.47 1.05 1.09 0.97 1.3 1.25 1.43 1.83 1.68
Bra036899 (NET1B)
 0.72 0.46 0.53 0.45 1.74 1.43 0.85 0.8 1.16 0.86 0.9 0.76 1.46 2.36 2.01 0.99 0.85 2.71 1.21 0.84 0.73 0.69 1.46 1.02 0.98 0.76 0.88 0.94 1.02 0.78 0.85
Bra037533 (ABF4)
 11.72 10.42 10.79 11.19 17.54 15.73 6.35 6.53 10.71 8.43 9.02 8.92 6.86 21.2 23.0 12.06 8.41 18.36 11.87 9.94 9.78 10.89 14.19 8.95 8.61 8.06 7.81 9.89 9.65 9.15 9.53
Bra038355 (NUDX1)
 8.16 8.28 9.19 6.9 16.77 18.18 5.14 3.38 8.62 6.97 7.88 7.14 9.15 19.07 16.48 7.98 7.08 13.44 5.93 4.75 7.12 8.31 15.14 7.16 6.35 4.0 4.25 7.96 11.12 8.69 6.89
Bra038698 (EML1)
 11.69 11.25 10.91 8.19 14.98 16.16 6.4 5.61 10.67 8.55 9.13 8.65 7.76 14.67 20.77 9.58 8.5 12.8 9.52 9.65 7.51 10.25 13.11 7.74 7.69 8.54 6.98 7.38 8.25 6.86 7.43
Bra038807 (CTPS4)
 0.24 0.25 0.2 0.22 2.6 1.52 0.88 0.58 0.93 1.04 0.96 0.79 1.56 4.54 3.91 1.86 1.43 2.74 1.38 0.84 1.16 0.58 3.14 0.5 0.32 0.27 0.46 0.76 0.38 0.42 1.26
11.89 11.04 12.49 14.06 36.38 36.8 11.78 6.53 20.48 14.13 12.89 11.62 12.35 61.95 81.48 19.76 17.11 78.3 33.99 15.32 14.3 12.43 50.37 21.53 16.57 12.88 13.03 24.31 23.71 12.3 13.52
Bra039460 (GID1A)
 4.31 4.7 4.36 1.82 10.29 5.38 1.17 1.06 2.72 2.36 1.19 1.9 2.32 6.9 13.76 1.72 1.55 6.86 3.29 1.5 1.13 1.56 8.9 2.21 1.91 3.55 2.0 3.66 4.14 5.7 5.32
8.64 7.79 12.84 8.88 18.96 24.81 9.54 5.5 10.42 8.88 9.16 9.05 6.48 19.32 22.96 10.14 8.7 11.72 10.66 10.31 9.01 8.64 23.14 9.62 8.26 9.32 8.08 12.18 12.74 7.45 7.29
Bra040271 (GALT3)
 5.1 4.77 5.91 3.66 10.95 10.56 5.89 6.16 7.1 6.96 6.89 5.85 7.2 13.86 13.88 9.03 8.98 13.79 10.32 8.28 6.41 8.17 8.84 8.03 8.2 6.21 8.56 7.43 8.03 8.42 10.35
Bra040786 (LAZ1)
 12.85 13.92 13.75 10.3 18.59 19.55 9.81 8.96 12.47 12.48 11.61 13.16 9.0 20.51 24.28 12.07 12.91 14.15 13.42 13.02 12.71 15.91 20.16 13.91 13.16 12.34 13.61 11.51 14.07 12.78 12.13

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)