1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_227 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.42 0.41 0.36 0.31 0.52 0.5 0.32 0.31 0.28 0.28 0.27 0.25 0.26 0.44 0.41 0.27 0.25 1.0 0.37 0.28 0.32 0.34 0.88 0.31 0.3 0.29 0.31 0.3 0.35 0.32 0.33
0.23 0.3 0.25 0.19 0.44 0.25 0.17 0.13 0.19 0.21 0.2 0.24 0.29 0.53 0.41 0.26 0.28 0.99 0.26 0.21 0.19 0.21 1.0 0.21 0.21 0.22 0.23 0.24 0.27 0.25 0.31
0.23 0.16 0.14 0.18 0.53 0.41 0.1 0.1 0.11 0.08 0.12 0.08 0.1 0.54 0.43 0.17 0.1 0.83 0.19 0.08 0.1 0.11 1.0 0.09 0.09 0.12 0.13 0.1 0.16 0.13 0.14
0.05 0.04 0.03 0.03 0.39 0.17 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.05 0.08 0.3 0.2 0.08 0.05 0.75 0.07 0.03 0.04 0.05 1.0 0.05 0.05 0.05 0.06 0.04 0.09 0.08 0.11
0.18 0.19 0.16 0.15 0.54 0.32 0.18 0.22 0.19 0.17 0.21 0.21 0.22 0.64 0.53 0.23 0.17 0.87 0.23 0.18 0.17 0.19 1.0 0.17 0.19 0.17 0.2 0.16 0.23 0.24 0.21
0.32 0.33 0.31 0.27 0.43 0.37 0.16 0.15 0.15 0.16 0.14 0.14 0.26 0.33 0.32 0.18 0.16 0.86 0.39 0.2 0.18 0.16 1.0 0.2 0.19 0.17 0.2 0.15 0.25 0.26 0.29
0.23 0.35 0.23 0.25 0.43 0.34 0.16 0.18 0.21 0.21 0.21 0.21 0.29 0.43 0.38 0.21 0.19 1.0 0.21 0.16 0.19 0.22 0.98 0.19 0.19 0.21 0.25 0.19 0.28 0.27 0.46
0.55 0.46 0.4 0.32 0.51 0.46 0.33 0.32 0.3 0.31 0.33 0.34 0.42 0.68 0.56 0.43 0.37 0.94 0.38 0.31 0.34 0.36 1.0 0.3 0.32 0.34 0.36 0.32 0.42 0.43 0.45
0.22 0.17 0.21 0.2 0.4 0.19 0.11 0.13 0.17 0.12 0.19 0.12 0.18 0.36 0.33 0.17 0.18 0.84 0.17 0.17 0.16 0.15 1.0 0.13 0.14 0.17 0.19 0.16 0.16 0.17 0.16
0.2 0.29 0.22 0.18 0.52 0.39 0.18 0.19 0.15 0.14 0.18 0.16 0.19 0.48 0.41 0.22 0.16 1.0 0.21 0.14 0.15 0.16 0.84 0.16 0.15 0.16 0.19 0.13 0.27 0.25 0.26
0.16 0.17 0.15 0.16 0.47 0.32 0.11 0.09 0.15 0.14 0.17 0.14 0.2 0.27 0.27 0.19 0.14 0.8 0.16 0.14 0.16 0.16 1.0 0.13 0.14 0.15 0.17 0.17 0.22 0.19 0.16
0.5 0.45 0.43 0.38 0.7 0.56 0.33 0.29 0.34 0.32 0.37 0.35 0.42 0.71 0.66 0.44 0.38 0.89 0.38 0.33 0.34 0.37 1.0 0.31 0.35 0.37 0.37 0.35 0.42 0.41 0.43
0.2 0.13 0.16 0.16 0.38 0.18 0.07 0.04 0.1 0.12 0.16 0.1 0.1 0.29 0.32 0.12 0.1 0.84 0.14 0.08 0.12 0.1 1.0 0.1 0.12 0.1 0.09 0.1 0.17 0.16 0.19
0.43 0.39 0.36 0.34 0.46 0.32 0.25 0.26 0.24 0.25 0.26 0.24 0.32 0.48 0.43 0.31 0.27 0.87 0.28 0.22 0.23 0.24 1.0 0.22 0.23 0.25 0.26 0.21 0.35 0.34 0.42
0.09 0.11 0.08 0.07 0.36 0.22 0.08 0.06 0.07 0.11 0.14 0.11 0.14 0.27 0.31 0.12 0.06 0.77 0.11 0.07 0.07 0.08 1.0 0.08 0.06 0.07 0.13 0.07 0.15 0.13 0.17
0.27 0.34 0.2 0.2 0.49 0.36 0.13 0.12 0.19 0.17 0.18 0.18 0.18 0.35 0.37 0.21 0.18 1.0 0.2 0.16 0.2 0.2 0.79 0.18 0.17 0.17 0.19 0.15 0.27 0.25 0.3
0.27 0.44 0.25 0.2 0.34 0.2 0.13 0.11 0.15 0.15 0.17 0.15 0.18 0.55 0.46 0.16 0.14 0.75 0.21 0.13 0.14 0.15 1.0 0.12 0.12 0.14 0.13 0.11 0.22 0.18 0.23
0.44 0.31 0.32 0.32 0.75 0.45 0.27 0.23 0.29 0.26 0.31 0.25 0.28 0.68 0.65 0.35 0.28 0.99 0.37 0.27 0.3 0.32 1.0 0.23 0.29 0.3 0.3 0.34 0.38 0.36 0.31
0.2 0.27 0.13 0.09 0.36 0.37 0.18 0.12 0.12 0.08 0.11 0.08 0.12 0.4 0.33 0.17 0.14 1.0 0.16 0.11 0.11 0.13 0.88 0.12 0.14 0.15 0.14 0.1 0.2 0.15 0.2
0.4 0.39 0.39 0.29 0.48 0.52 0.29 0.3 0.26 0.22 0.25 0.24 0.37 0.57 0.46 0.36 0.3 0.92 0.32 0.25 0.26 0.27 1.0 0.3 0.27 0.3 0.29 0.22 0.34 0.4 0.43
0.09 0.1 0.02 0.04 0.31 0.16 0.07 0.05 0.08 0.06 0.09 0.07 0.06 0.17 0.18 0.08 0.05 0.94 0.17 0.11 0.04 0.08 1.0 0.04 0.08 0.05 0.08 0.06 0.1 0.11 0.13
0.15 0.22 0.14 0.11 0.37 0.28 0.09 0.08 0.14 0.1 0.12 0.12 0.14 0.39 0.35 0.16 0.11 0.84 0.18 0.11 0.13 0.13 1.0 0.11 0.1 0.15 0.11 0.11 0.16 0.14 0.19
0.51 0.45 0.47 0.43 0.68 0.64 0.4 0.41 0.39 0.4 0.43 0.38 0.56 0.8 0.64 0.42 0.41 0.92 0.47 0.39 0.41 0.42 1.0 0.4 0.4 0.44 0.45 0.38 0.51 0.48 0.58
0.25 0.28 0.26 0.21 0.51 0.27 0.11 0.09 0.2 0.21 0.24 0.2 0.21 0.34 0.35 0.24 0.23 1.0 0.21 0.18 0.18 0.19 0.96 0.16 0.18 0.19 0.23 0.16 0.26 0.26 0.28
0.4 0.42 0.43 0.45 0.63 0.53 0.32 0.34 0.33 0.33 0.35 0.33 0.44 0.69 0.6 0.4 0.35 0.88 0.35 0.3 0.3 0.34 1.0 0.29 0.31 0.33 0.35 0.32 0.39 0.39 0.44
0.21 0.18 0.19 0.19 0.41 0.38 0.19 0.19 0.19 0.19 0.2 0.21 0.26 0.36 0.31 0.21 0.19 1.0 0.2 0.19 0.19 0.19 0.72 0.19 0.22 0.2 0.2 0.23 0.26 0.25 0.27
0.15 0.16 0.21 0.19 0.38 0.28 0.14 0.13 0.11 0.1 0.14 0.12 0.19 0.48 0.37 0.17 0.11 1.0 0.17 0.11 0.1 0.12 0.68 0.12 0.13 0.13 0.14 0.15 0.15 0.14 0.14
0.42 0.42 0.45 0.43 0.65 0.55 0.34 0.35 0.3 0.31 0.34 0.31 0.39 0.65 0.56 0.35 0.32 1.0 0.36 0.3 0.3 0.33 0.91 0.29 0.31 0.31 0.35 0.33 0.41 0.38 0.42
0.27 0.28 0.16 0.08 0.55 0.45 0.18 0.19 0.18 0.12 0.16 0.15 0.31 0.55 0.53 0.32 0.19 0.88 0.26 0.15 0.17 0.17 1.0 0.15 0.15 0.24 0.15 0.16 0.19 0.2 0.21
0.26 0.23 0.31 0.32 0.46 0.45 0.25 0.23 0.26 0.28 0.27 0.24 0.33 0.46 0.45 0.28 0.26 1.0 0.31 0.27 0.26 0.29 0.77 0.28 0.3 0.27 0.27 0.3 0.32 0.31 0.29
0.3 0.37 0.35 0.27 0.38 0.35 0.22 0.2 0.25 0.27 0.28 0.25 0.38 0.49 0.38 0.35 0.35 0.83 0.35 0.27 0.25 0.32 1.0 0.27 0.27 0.28 0.31 0.27 0.35 0.39 0.49
0.23 0.27 0.29 0.21 0.38 0.29 0.12 0.11 0.13 0.12 0.15 0.13 0.18 0.62 0.45 0.17 0.15 0.91 0.18 0.11 0.13 0.13 1.0 0.11 0.12 0.14 0.14 0.11 0.22 0.19 0.24
0.38 0.28 0.34 0.2 0.49 0.34 0.12 0.1 0.16 0.16 0.18 0.16 0.21 0.41 0.37 0.21 0.16 1.0 0.21 0.15 0.18 0.18 0.97 0.14 0.17 0.17 0.21 0.15 0.24 0.23 0.26
0.34 0.37 0.36 0.38 0.58 0.62 0.33 0.29 0.31 0.33 0.38 0.31 0.37 0.64 0.51 0.38 0.31 0.83 0.4 0.3 0.32 0.33 1.0 0.32 0.33 0.36 0.33 0.31 0.39 0.39 0.4
0.37 0.4 0.36 0.43 0.68 0.64 0.37 0.4 0.35 0.39 0.4 0.35 0.46 0.72 0.6 0.45 0.37 0.96 0.33 0.33 0.37 0.42 1.0 0.34 0.35 0.4 0.41 0.36 0.51 0.47 0.45
0.25 0.34 0.2 0.2 0.39 0.55 0.19 0.22 0.09 0.07 0.12 0.06 0.12 0.41 0.34 0.17 0.1 1.0 0.21 0.09 0.12 0.15 0.89 0.12 0.13 0.16 0.13 0.11 0.2 0.16 0.15
0.37 0.41 0.37 0.44 0.57 0.49 0.32 0.32 0.32 0.31 0.37 0.33 0.38 0.7 0.55 0.35 0.29 1.0 0.35 0.29 0.32 0.32 0.96 0.28 0.33 0.33 0.35 0.31 0.44 0.4 0.45
0.39 0.25 0.31 0.22 0.35 0.37 0.14 0.13 0.15 0.13 0.2 0.15 0.14 0.34 0.24 0.16 0.14 1.0 0.18 0.12 0.14 0.18 0.77 0.15 0.16 0.17 0.17 0.13 0.22 0.19 0.15
0.28 0.33 0.26 0.21 0.51 0.33 0.19 0.21 0.16 0.16 0.19 0.16 0.21 0.44 0.33 0.22 0.18 0.95 0.22 0.16 0.16 0.18 1.0 0.14 0.17 0.19 0.19 0.15 0.22 0.2 0.17
0.32 0.34 0.31 0.32 0.59 0.54 0.29 0.3 0.24 0.25 0.27 0.22 0.38 0.62 0.51 0.37 0.3 0.86 0.29 0.23 0.24 0.25 1.0 0.22 0.25 0.27 0.27 0.28 0.34 0.29 0.31
0.13 0.11 0.11 0.12 0.51 0.29 0.07 0.06 0.11 0.14 0.17 0.16 0.15 0.7 0.42 0.18 0.13 0.93 0.18 0.13 0.18 0.15 1.0 0.13 0.15 0.12 0.16 0.13 0.32 0.27 0.17
0.22 0.22 0.26 0.26 0.62 0.44 0.12 0.15 0.17 0.18 0.21 0.19 0.29 0.73 0.51 0.23 0.17 1.0 0.23 0.16 0.17 0.19 0.86 0.19 0.17 0.18 0.18 0.19 0.28 0.23 0.25
0.15 0.24 0.16 0.14 0.41 0.35 0.13 0.12 0.14 0.17 0.13 0.11 0.19 0.32 0.32 0.19 0.13 0.67 0.19 0.14 0.13 0.13 1.0 0.12 0.13 0.15 0.14 0.13 0.19 0.21 0.26
0.21 0.23 0.22 0.26 0.57 0.54 0.2 0.16 0.22 0.21 0.25 0.17 0.22 0.64 0.48 0.3 0.19 0.84 0.38 0.2 0.2 0.22 1.0 0.19 0.19 0.23 0.24 0.19 0.33 0.26 0.23
0.05 0.02 0.02 0.02 0.34 0.26 0.03 0.02 0.05 0.03 0.07 0.03 0.08 0.27 0.19 0.07 0.07 0.84 0.05 0.03 0.05 0.07 1.0 0.05 0.06 0.04 0.07 0.06 0.07 0.08 0.08
0.2 0.23 0.19 0.18 0.5 0.45 0.23 0.22 0.21 0.22 0.21 0.19 0.26 0.58 0.52 0.35 0.27 0.96 0.34 0.25 0.27 0.26 1.0 0.21 0.25 0.25 0.28 0.23 0.37 0.3 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)