Heatmap: Cluster_198 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_28780.1 (ATPA)	0.81	0.8	0.93	1.0	0.26	0.25	0.68	0.45	0.53	0.48	0.41	0.43	0.45	0.13	0.24	0.48	0.58	0.94	0.54	0.52	0.59	0.36	0.02	0.55	0.46	0.57	0.29	0.55	0.37	0.33	0.23
Lsat_1_v5_gn_0_29380.1 (AIC1)	0.6	0.64	0.82	0.95	0.24	0.25	0.99	0.65	0.75	0.75	0.51	0.58	0.62	0.1	0.32	0.55	0.62	0.61	0.46	0.78	1.0	0.6	0.03	0.66	0.61	0.56	0.56	0.66	0.34	0.27	0.13
Lsat_1_v5_gn_0_47661.1	0.52	0.63	0.76	0.77	0.29	0.32	1.0	0.51	0.63	0.59	0.42	0.39	0.4	0.12	0.31	0.42	0.47	0.72	0.32	0.58	0.82	0.5	0.05	0.51	0.46	0.45	0.46	0.47	0.4	0.29	0.2
Lsat_1_v5_gn_1_14180.1 (PSAC)	0.55	0.88	0.79	1.0	0.32	0.41	0.62	0.47	0.41	0.51	0.32	0.34	0.3	0.2	0.34	0.36	0.44	0.64	0.44	0.54	0.52	0.42	0.02	0.37	0.38	0.35	0.3	0.4	0.35	0.25	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_27981.1 (PSBE)	0.14	0.2	0.29	0.36	0.07	0.07	0.16	0.19	0.21	0.19	0.12	0.09	0.08	0.06	0.14	0.2	0.17	1.0	0.2	0.27	0.32	0.2	0.01	0.18	0.2	0.19	0.2	0.14	0.19	0.09	0.07
Lsat_1_v5_gn_1_38700.1 (ATPA)	0.81	0.8	0.93	1.0	0.26	0.25	0.68	0.45	0.53	0.48	0.41	0.43	0.45	0.13	0.24	0.48	0.58	0.94	0.54	0.52	0.59	0.36	0.02	0.55	0.46	0.57	0.29	0.55	0.37	0.33	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_38741.1 (PSBE)	0.14	0.2	0.29	0.36	0.07	0.07	0.16	0.19	0.21	0.19	0.12	0.09	0.08	0.06	0.14	0.2	0.17	1.0	0.2	0.27	0.32	0.2	0.01	0.18	0.2	0.19	0.2	0.14	0.19	0.09	0.07
Lsat_1_v5_gn_1_88060.1 (ATPA)	0.81	0.8	0.93	1.0	0.26	0.25	0.68	0.45	0.53	0.48	0.41	0.43	0.45	0.13	0.24	0.48	0.58	0.94	0.54	0.52	0.59	0.36	0.02	0.55	0.46	0.57	0.29	0.55	0.37	0.33	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_88080.1 (PSBD)	0.74	0.88	0.95	1.0	0.28	0.24	0.5	0.4	0.59	0.56	0.36	0.38	0.34	0.19	0.34	0.49	0.47	0.85	0.52	0.53	0.56	0.53	0.08	0.48	0.42	0.46	0.37	0.35	0.39	0.27	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_1621.1 (ATPH)	0.24	0.21	0.3	0.29	0.11	0.1	0.17	0.15	0.18	0.23	0.12	0.08	0.1	0.07	0.12	0.16	0.12	1.0	0.16	0.25	0.24	0.21	0.04	0.18	0.13	0.22	0.15	0.13	0.09	0.13	0.11
Lsat_1_v5_gn_2_1641.1 (ATPI)	0.16	0.26	0.28	0.3	0.13	0.13	0.17	0.16	0.13	0.14	0.11	0.08	0.07	0.09	0.11	0.15	0.12	1.0	0.14	0.11	0.17	0.15	0.01	0.12	0.1	0.14	0.16	0.12	0.12	0.11	0.07
Lsat_1_v5_gn_2_20521.1 (RH10)	0.58	0.42	0.0	0.47	0.36	0.0	0.55	0.19	0.59	0.56	0.37	0.6	0.68	0.19	0.05	0.76	1.0	0.11	0.0	0.13	0.73	0.06	0.07	0.25	0.04	0.16	0.38	0.0	0.05	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_20561.1	0.41	0.74	0.73	0.8	0.28	0.28	0.7	0.32	1.0	0.58	0.75	0.35	0.42	0.41	0.37	0.78	0.77	0.3	0.33	0.43	0.41	0.32	0.03	0.31	0.37	0.27	0.24	0.31	0.28	0.2	0.13
Lsat_1_v5_gn_2_34800.1 (PSBC)	0.7	0.94	1.0	0.91	0.29	0.27	0.59	0.33	0.57	0.5	0.33	0.29	0.3	0.13	0.28	0.46	0.42	0.71	0.46	0.49	0.51	0.48	0.04	0.42	0.43	0.36	0.44	0.41	0.4	0.26	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_43901.1 (PSBE)	0.24	0.37	0.41	0.51	0.13	0.12	0.37	0.18	0.29	0.32	0.29	0.2	0.11	0.06	0.2	0.35	0.33	1.0	0.27	0.32	0.36	0.31	0.01	0.21	0.16	0.23	0.18	0.21	0.14	0.16	0.05
Lsat_1_v5_gn_2_50780.1 (PSBD)	0.74	0.88	0.95	1.0	0.28	0.24	0.5	0.4	0.59	0.56	0.36	0.38	0.34	0.19	0.34	0.49	0.47	0.85	0.52	0.53	0.56	0.53	0.08	0.48	0.42	0.46	0.37	0.35	0.39	0.27	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_50801.1 (PSBC)	0.43	0.63	0.79	0.75	0.2	0.24	1.0	0.31	0.24	0.34	0.14	0.31	0.1	0.07	0.32	0.22	0.19	0.85	0.33	0.32	0.39	0.37	0.0	0.31	0.27	0.28	0.61	0.55	0.32	0.09	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_89801.1 (RBCL)	0.42	0.69	0.84	1.0	0.13	0.14	0.66	0.34	0.37	0.43	0.24	0.23	0.19	0.06	0.2	0.37	0.39	0.4	0.43	0.55	0.7	0.4	0.03	0.38	0.36	0.36	0.35	0.31	0.29	0.21	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_97101.1	0.52	0.63	0.76	0.77	0.29	0.32	1.0	0.51	0.63	0.59	0.42	0.39	0.4	0.12	0.31	0.42	0.47	0.72	0.32	0.58	0.82	0.5	0.05	0.51	0.46	0.45	0.46	0.47	0.4	0.29	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_117960.1 (ATPF)	0.25	0.25	0.39	0.4	0.12	0.06	0.21	0.21	0.13	0.21	0.14	0.13	0.12	0.12	0.1	0.35	0.29	1.0	0.24	0.2	0.29	0.14	0.03	0.28	0.21	0.25	0.18	0.21	0.15	0.19	0.12
Lsat_1_v5_gn_3_139841.1 (CURT1A)	0.05	0.42	0.41	0.13	0.03	0.08	0.46	0.19	1.0	0.6	0.42	0.25	0.1	0.16	0.21	0.47	0.67	0.04	0.41	0.21	0.33	0.45	0.0	0.21	0.39	0.17	0.29	0.38	0.38	0.14	0.06
Lsat_1_v5_gn_3_85740.1 (RBCL)	0.59	0.83	0.88	1.0	0.15	0.09	0.7	0.39	0.54	0.47	0.25	0.25	0.22	0.03	0.23	0.41	0.49	0.75	0.27	0.45	0.67	0.44	0.01	0.38	0.35	0.41	0.25	0.33	0.23	0.13	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_102701.1 (RBCL)	0.42	0.69	0.84	1.0	0.13	0.14	0.66	0.34	0.37	0.43	0.24	0.23	0.19	0.06	0.2	0.37	0.39	0.4	0.43	0.55	0.7	0.4	0.03	0.38	0.36	0.36	0.35	0.31	0.29	0.21	0.16
Lsat_1_v5_gn_4_135460.1 (PSBA)	0.41	0.53	0.5	0.51	0.4	0.48	0.6	0.49	0.39	0.38	0.35	0.34	0.45	0.46	0.47	0.45	0.42	1.0	0.44	0.44	0.56	0.47	0.44	0.48	0.46	0.46	0.43	0.42	0.5	0.4	0.43
Lsat_1_v5_gn_4_145420.1 (ATP1)	0.39	0.65	0.7	0.72	0.3	0.32	0.83	0.38	1.0	0.72	0.42	0.4	0.44	0.32	0.44	0.68	0.8	0.16	0.27	0.39	0.5	0.38	0.05	0.36	0.34	0.32	0.35	0.33	0.32	0.2	0.15
Lsat_1_v5_gn_4_145441.1 (RH3)	0.29	0.5	0.55	0.6	0.2	0.22	0.58	0.3	1.0	0.77	0.33	0.37	0.38	0.29	0.34	0.55	0.66	0.17	0.29	0.44	0.46	0.37	0.05	0.4	0.35	0.31	0.32	0.33	0.27	0.21	0.2
Lsat_1_v5_gn_4_147721.1 (NDHB.2)	0.58	0.82	1.0	0.98	0.31	0.35	0.93	0.44	0.43	0.37	0.44	0.2	0.26	0.16	0.26	0.33	0.36	0.96	0.3	0.39	0.58	0.38	0.05	0.35	0.37	0.34	0.39	0.35	0.34	0.22	0.15
Lsat_1_v5_gn_4_174220.1 (BAGP1)	0.28	0.63	0.72	0.8	0.22	0.27	0.64	0.4	0.78	0.75	1.0	0.43	0.46	0.33	0.62	0.7	0.74	0.9	0.45	0.69	0.82	0.57	0.42	0.52	0.47	0.49	0.51	0.34	0.5	0.31	0.27
Lsat_1_v5_gn_4_174241.1 (TMS1)	0.34	0.75	0.85	1.0	0.21	0.25	0.59	0.37	0.57	0.55	0.34	0.34	0.35	0.26	0.42	0.44	0.48	0.59	0.37	0.55	0.69	0.49	0.3	0.48	0.45	0.47	0.47	0.36	0.5	0.29	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_63021.1 (DY1)	0.48	0.83	0.87	0.83	0.25	0.29	0.7	0.44	0.91	0.71	0.49	0.5	0.46	0.28	0.54	0.67	0.64	1.0	0.4	0.57	0.73	0.55	0.1	0.49	0.43	0.46	0.45	0.38	0.39	0.31	0.22
Lsat_1_v5_gn_4_99801.1 (DY1)	0.48	0.83	0.87	0.83	0.25	0.29	0.7	0.44	0.91	0.71	0.49	0.5	0.46	0.28	0.54	0.67	0.64	1.0	0.4	0.57	0.73	0.55	0.1	0.49	0.43	0.46	0.45	0.38	0.39	0.31	0.22
Lsat_1_v5_gn_5_176141.1 (PSBE)	0.14	0.2	0.29	0.36	0.07	0.07	0.16	0.19	0.21	0.19	0.12	0.09	0.08	0.06	0.14	0.2	0.17	1.0	0.2	0.27	0.32	0.2	0.01	0.18	0.2	0.19	0.2	0.14	0.19	0.09	0.07
Lsat_1_v5_gn_5_181820.1 (ATP1)	0.58	0.97	0.99	1.0	0.29	0.32	0.75	0.37	0.51	0.42	0.34	0.31	0.29	0.19	0.33	0.37	0.36	0.61	0.4	0.5	0.64	0.5	0.11	0.48	0.43	0.44	0.44	0.41	0.4	0.28	0.21
Lsat_1_v5_gn_5_181880.1 (RH10)	0.58	0.42	0.0	0.47	0.36	0.0	0.55	0.19	0.59	0.56	0.37	0.6	0.68	0.19	0.05	0.76	1.0	0.11	0.0	0.13	0.73	0.06	0.07	0.25	0.04	0.16	0.38	0.0	0.05	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_181901.1 (RAF36)	0.37	0.5	0.61	0.66	0.23	0.27	1.0	0.53	0.72	0.61	0.39	0.34	0.35	0.18	0.41	0.46	0.49	0.36	0.42	0.58	0.86	0.49	0.05	0.48	0.44	0.42	0.42	0.4	0.34	0.26	0.19
Lsat_1_v5_gn_6_14541.1	0.36	0.47	0.56	0.58	0.27	0.33	1.0	0.6	0.79	0.71	0.45	0.46	0.42	0.15	0.45	0.57	0.57	0.47	0.48	0.67	0.93	0.56	0.07	0.51	0.48	0.51	0.51	0.4	0.41	0.33	0.2
Lsat_1_v5_gn_6_14561.1	0.57	0.78	0.92	0.98	0.25	0.28	0.82	0.5	0.53	0.46	0.39	0.34	0.3	0.11	0.32	0.38	0.4	0.52	0.56	0.74	1.0	0.66	0.05	0.59	0.56	0.56	0.59	0.47	0.5	0.33	0.23
Lsat_1_v5_gn_6_94260.1	0.45	0.59	0.69	0.68	0.29	0.32	0.96	0.56	0.69	0.6	0.44	0.41	0.37	0.2	0.48	0.56	0.53	1.0	0.45	0.59	0.82	0.53	0.07	0.47	0.43	0.46	0.45	0.38	0.38	0.28	0.19
Lsat_1_v5_gn_6_94280.1 (PRK6)	0.39	0.72	0.7	0.81	0.32	0.32	0.71	0.41	0.2	0.21	0.18	0.11	0.17	0.09	0.1	0.18	0.25	1.0	0.3	0.38	0.53	0.34	0.06	0.41	0.35	0.33	0.26	0.27	0.27	0.25	0.18
Lsat_1_v5_gn_7_14980.1 (RBCL)	0.2	0.52	0.53	0.54	0.11	0.23	0.4	0.19	0.13	0.21	0.08	0.09	0.11	0.08	0.23	0.26	0.31	1.0	0.27	0.38	0.33	0.38	0.13	0.23	0.18	0.31	0.3	0.21	0.19	0.22	0.13
Lsat_1_v5_gn_7_68801.1 (ATPE)	0.79	0.78	1.0	1.0	0.34	0.22	0.83	0.67	0.77	0.86	0.79	0.73	0.48	0.07	0.35	0.85	0.82	0.89	0.76	0.83	0.85	0.72	0.05	0.67	0.59	0.56	0.5	0.74	0.32	0.24	0.12
Lsat_1_v5_gn_8_122301.1 (ATPA)	0.81	0.8	0.93	1.0	0.26	0.25	0.68	0.45	0.53	0.48	0.41	0.43	0.45	0.13	0.24	0.48	0.58	0.94	0.54	0.52	0.59	0.36	0.02	0.55	0.46	0.57	0.29	0.55	0.37	0.33	0.23
Lsat_1_v5_gn_8_133980.1 (PSBA)	0.37	0.66	0.6	0.7	0.18	0.22	0.68	0.39	0.32	0.27	0.2	0.14	0.12	0.08	0.21	0.28	0.24	1.0	0.32	0.34	0.51	0.34	0.12	0.25	0.26	0.28	0.27	0.22	0.29	0.16	0.1
Lsat_1_v5_gn_8_139840.1 (RAF36)	0.4	0.53	0.61	0.61	0.28	0.32	1.0	0.63	0.79	0.7	0.47	0.47	0.42	0.15	0.45	0.57	0.57	0.33	0.35	0.57	0.86	0.53	0.06	0.45	0.43	0.43	0.44	0.36	0.36	0.3	0.19
Lsat_1_v5_gn_8_139860.1	0.52	0.63	0.76	0.77	0.29	0.32	1.0	0.51	0.63	0.59	0.42	0.39	0.4	0.12	0.31	0.42	0.47	0.72	0.32	0.58	0.82	0.5	0.05	0.51	0.46	0.45	0.46	0.47	0.4	0.29	0.2
Lsat_1_v5_gn_8_161300.1 (PETD)	0.63	0.92	0.96	1.0	0.21	0.27	0.55	0.48	0.49	0.35	0.46	0.38	0.28	0.21	0.3	0.41	0.47	0.98	0.46	0.64	0.71	0.51	0.08	0.44	0.32	0.42	0.39	0.38	0.49	0.34	0.15
Lsat_1_v5_gn_8_19261.1 (ATPI)	0.15	0.28	0.24	0.27	0.11	0.06	0.13	0.09	0.08	0.09	0.08	0.05	0.04	0.02	0.07	0.07	0.1	1.0	0.06	0.11	0.12	0.06	0.02	0.1	0.06	0.09	0.11	0.1	0.08	0.06	0.02
Lsat_1_v5_gn_9_47020.1 (FKBP15-2)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_50921.1 (PSBE)	0.14	0.2	0.29	0.36	0.07	0.07	0.16	0.19	0.21	0.19	0.12	0.09	0.08	0.06	0.14	0.2	0.17	1.0	0.2	0.27	0.32	0.2	0.01	0.18	0.2	0.19	0.2	0.14	0.19	0.09	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)